More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0456 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0456  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 415 aa  822    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.317164  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04071  Hexuronate transporter  31.04 
 
 		 425 aa  225  1e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04033  hypothetical protein  31.04 
 
 		 425 aa  225  1e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1766  major facilitator transporter  32.6 
 
 		 424 aa  223  4.9999999999999996e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.601014  normal  0.308968 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3116  major facilitator superfamily MFS_1  35.47 
 
 		 430 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000115925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0610  major facilitator transporter  32.4 
 
 		 430 aa  219  6e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.400877  normal  0.0253848 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4247  major facilitator transporter  29.69 
 
 		 429 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2219  major facilitator superfamily MFS_1  33.86 
 
 		 441 aa  213  7e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.200056 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1023  major facilitator superfamily MFS_1  31.73 
 
 		 431 aa  211  2e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0652623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4383  major facilitator superfamily MFS_1  31.71 
 
 		 420 aa  209  9e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00326845  normal  0.997814 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0404  major facilitator superfamily MFS_1  32.45 
 
 		 432 aa  209  1e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.90763  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0834  hexuronate transporter transmembrane protein  31.82 
 
 		 435 aa  208  2e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00560856 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3479  hexuronate transporter  29.26 
 
 		 434 aa  206  7e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.474263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3380  hexuronate transporter  29.26 
 
 		 434 aa  206  8e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.586322  normal  0.6284 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3306  hexuronate transporter  29.26 
 
 		 434 aa  206  8e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.123622  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3316  hexuronate transporter  29.26 
 
 		 434 aa  206  8e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.433687  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4579  major facilitator superfamily MFS_1  29.71 
 
 		 433 aa  205  2e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.571903 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4445  major facilitator superfamily MFS_1  29.71 
 
 		 433 aa  205  2e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0453314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4307  major facilitator transporter  30.35 
 
 		 430 aa  204  3e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3386  hexuronate transporter  29.02 
 
 		 434 aa  203  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.333246  normal  0.392835 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3670  major facilitator transporter  30.79 
 
 		 411 aa  203  4e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3956  major facilitator superfamily MFS_1  30.62 
 
 		 449 aa  203  6e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621866  normal  0.612872 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3510  major facilitator transporter  32.08 
 
 		 427 aa  202  9.999999999999999e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.935373  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03865  hexuranate transporter  30.24 
 
 		 433 aa  200  3e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0935  major facilitator transporter  30.86 
 
 		 427 aa  200  3.9999999999999996e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.881993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5749  major facilitator superfamily MFS_1  31.17 
 
 		 436 aa  199  1.0000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3282  putative hexuronate transporter  29.81 
 
 		 424 aa  197  2.0000000000000003e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0854544  normal  0.252683 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5166  major facilitator transporter  30.19 
 
 		 429 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.733081 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0528  d-galactonate transporter  30.07 
 
 		 433 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.888492  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1017  major facilitator superfamily MFS_1  30.79 
 
 		 431 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.451459  normal  0.743333 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1244  major facilitator superfamily MFS_1  30.45 
 
 		 439 aa  197  3e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.477377  normal  0.0341715 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0745  d-galactonate transporter  29.9 
 
 		 433 aa  197  3e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4070  major facilitator transporter  29.08 
 
 		 430 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5234  major facilitator transporter  29.38 
 
 		 430 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3451  major facilitator transporter  29.08 
 
 		 430 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.225334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3400  major facilitator transporter  29.95 
 
 		 430 aa  196  7e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1871  major facilitator transporter  29.76 
 
 		 423 aa  196  7e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00153919  normal  0.351915 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2718  major facilitator transporter  29.38 
 
 		 430 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3106  major facilitator transporter  29.88 
 
 		 428 aa  194  2e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5675  major facilitator transporter  29.45 
 
 		 429 aa  194  3e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02962  hexuronate transporter  29.12 
 
 		 472 aa  191  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3561  putative hexuronate transporter  29.12 
 
 		 432 aa  191  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02913  hypothetical protein  29.12 
 
 		 472 aa  191  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3529  hexuronate transporter  29.12 
 
 		 432 aa  190  4e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4127  major facilitator superfamily MFS_1  33.81 
 
 		 432 aa  190  4e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1012  major facilitator superfamily MFS_1  28.88 
 
 		 430 aa  189  5.999999999999999e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.318414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6829  major facilitator superfamily MFS_1  29.65 
 
 		 454 aa  189  5.999999999999999e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2068  major facilitator superfamily MFS_1  29.19 
 
 		 434 aa  189  7e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6194  major facilitator superfamily MFS_1  29.59 
 
 		 453 aa  188  1e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3128  major facilitator transporter  29.1 
 
 		 435 aa  188  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0947  major facilitator superfamily MFS_1  28.88 
 
 		 430 aa  188  1e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.35328  normal  0.0858315 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1710  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  30.69 
 
 		 446 aa  186  5e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0437115 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4010  major facilitator transporter  30.42 
 
 		 446 aa  186  7e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.835742  normal  0.379616 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4322  d-galactonate transporter  28.57 
 
 		 432 aa  186  8e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.743401 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6282  major facilitator superfamily MFS_1  30.3 
 
 		 429 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3386  d-galactonate transporter  28.23 
 
 		 434 aa  184  3e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3512  d-galactonate transporter  28.99 
 
 		 433 aa  182  7e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3547  d-galactonate transporter  28.29 
 
 		 474 aa  182  9.000000000000001e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.48586 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1080  putative hexuronate transporter transmembrane protein  29.19 
 
 		 432 aa  182  1e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.503694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2843  major facilitator superfamily MFS_1  28.49 
 
 		 426 aa  182  1e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.088157  normal  0.111913 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0258  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 440 aa  182  1e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3566  major facilitator transporter  29.51 
 
 		 443 aa  181  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000684429  normal  0.364964 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3385  hexuronate transporter  29.12 
 
 		 432 aa  182  1e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4048  major facilitator transporter  29.51 
 
 		 423 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0187179  normal  0.633628 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0608  d-galactonate transporter  29.12 
 
 		 432 aa  181  2e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4408  hexuronate transporter  29.12 
 
 		 432 aa  181  2e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.591703 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0607  d-galactonate transporter  29.12 
 
 		 432 aa  181  2e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3357  major facilitator transporter  29.17 
 
 		 423 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0473601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3276  putative hexuronate transporter  29.12 
 
 		 432 aa  181  2e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0553  d-galactonate transporter  27.8 
 
 		 434 aa  181  2.9999999999999997e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.351291  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1105  putative hexuronate MFS transporter ExuT  27.8 
 
 		 434 aa  181  2.9999999999999997e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000998284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2236  general substrate transporter  29.89 
 
 		 449 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0490  putative hexuronate MFS transporter ExuT  27.8 
 
 		 433 aa  180  4e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.40951e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4207  major facilitator transporter  30.15 
 
 		 423 aa  180  4e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0961062  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4159  major facilitator transporter  30.15 
 
 		 423 aa  180  4e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.718979  decreased coverage  0.00263409 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1170  major facilitator superfamily MFS_1  33.42 
 
 		 425 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5219  MFS transporter, phthalate permease family  29.66 
 
 		 436 aa  179  1e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  29.79 
 
 		 448 aa  178  2e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11473  putative hexuronate transport protein (MFS family)  29.02 
 
 		 424 aa  177  2e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.485615  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4857  major facilitator superfamily MFS_1  28.1 
 
 		 430 aa  178  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0133188  normal  0.643957 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1806  major facilitator superfamily metabolite(phthalate/hexuronate)/H(+) symporter  27.97 
 
 		 433 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0119934 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5810  major facilitator transporter  31.85 
 
 		 436 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.491735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1990  D-galactonate transporter  32.73 
 
 		 436 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0023647  normal  0.0470104 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1357  major facilitator transporter  31.85 
 
 		 436 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0684607 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3875  major facilitator transporter  31.85 
 
 		 436 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4494  major facilitator transporter  31.85 
 
 		 436 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1058  major facilitator superfamily MFS_1  29.9 
 
 		 449 aa  172  9e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.494018  normal  0.557281 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4271  major facilitator transporter  29.88 
 
 		 468 aa  172  1e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0659968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4153  major facilitator transporter  31.59 
 
 		 436 aa  172  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.25615  normal  0.56292 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0325  general substrate transporter:TonB box, N-terminal  29.66 
 
 		 436 aa  171  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0000282343  normal  0.265981 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2910  major facilitator transporter  31.35 
 
 		 441 aa  170  4e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2627  major facilitator superfamily MFS_1  27.83 
 
 		 436 aa  169  1e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4592  major facilitator transporter  31.86 
 
 		 440 aa  168  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947939 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1313  major facilitator transporter  27.94 
 
 		 433 aa  168  2e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.720769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5154  major facilitator transporter  32.82 
 
 		 428 aa  166  5e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.379393  normal  0.385289 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3239  major facilitator transporter  29.29 
 
 		 441 aa  166  5e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.935103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5030  major facilitator transporter  27.88 
 
 		 441 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.580497  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4288  major facilitator transporter  29.78 
 
 		 457 aa  166  5.9999999999999996e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2353  major facilitator superfamily MFS_1  27.83 
 
 		 436 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2776  major facilitator transporter  32.02 
 
 		 461 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>