More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1704 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2974  radical SAM family protein  78.36 
 
 		 477 aa  806    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1704  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 485 aa  1005    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.347799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2476  radical SAM domain-containing protein  56.36 
 
 		 476 aa  561  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.187942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2944  radical SAM domain-containing protein  56.93 
 
 		 476 aa  558  1e-158  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.388692  normal  0.122709 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3461  radical SAM domain protein  55.93 
 
 		 476 aa  556  1e-157  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.361209 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2308  radical SAM domain-containing protein  56.14 
 
 		 476 aa  556  1e-157  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.195773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0762  Radical SAM domain protein  54.83 
 
 		 476 aa  541  9.999999999999999e-153  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.502838  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2981  Radical SAM domain protein  55.91 
 
 		 477 aa  532  1e-150  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0847138  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3029  radical SAM family protein  41.24 
 
 		 484 aa  303  3.0000000000000004e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0038885  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6677  radical SAM family protein  34.19 
 
 		 470 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.444981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4492  Radical SAM domain protein  33.06 
 
 		 460 aa  218  2e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.153991  normal  0.0565392 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2423  radical SAM family protein  31.06 
 
 		 473 aa  198  2.0000000000000003e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000017109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1008  Radical SAM domain protein  26.91 
 
 		 460 aa  185  1.0000000000000001e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2473  radical SAM domain-containing protein  32.23 
 
 		 458 aa  184  2.0000000000000003e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000751779  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1460  radical SAM domain-containing protein  29.86 
 
 		 461 aa  179  7e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000686349  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0029  Radical SAM domain protein  32.85 
 
 		 452 aa  178  2e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3298  radical SAM domain-containing protein  27.33 
 
 		 450 aa  177  3e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000268991  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0679  Radical SAM domain protein  32.32 
 
 		 462 aa  177  4e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0906  radical SAM family protein  25.12 
 
 		 450 aa  177  4e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000066146  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2198  radical SAM domain-containing protein  28.23 
 
 		 457 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1909  radical SAM domain-containing protein  31.23 
 
 		 450 aa  173  5e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00558063  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0534  Radical SAM domain protein  26.67 
 
 		 447 aa  173  5.999999999999999e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00011095  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0623  Radical SAM domain protein  25.61 
 
 		 453 aa  169  8e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000646743  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2206  radical SAM domain-containing protein  28.91 
 
 		 456 aa  167  2.9999999999999998e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000327652  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0871  radical SAM domain-containing protein  25.48 
 
 		 489 aa  166  5.9999999999999996e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.128121  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1786  Radical SAM domain protein  29.26 
 
 		 489 aa  163  8.000000000000001e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0257396  hitchhiker  0.00364528 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0946  Radical SAM domain protein  32.58 
 
 		 492 aa  161  3e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.21013  normal  0.166002 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2372  Radical SAM domain protein  29.92 
 
 		 463 aa  158  2e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.545422  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0109  Radical SAM domain protein  29.06 
 
 		 465 aa  155  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0069  Radical SAM domain protein  28.65 
 
 		 452 aa  155  2e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000122492  hitchhiker  0.00745391 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4919  Radical SAM domain protein  27.49 
 
 		 476 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000220499  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0409  radical SAM domain-containing protein  28.57 
 
 		 439 aa  145  1e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1754  Radical SAM domain protein  28.69 
 
 		 447 aa  139  1e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0305986  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4047  Radical SAM domain protein  27.44 
 
 		 403 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0945  Radical SAM domain protein  26.19 
 
 		 453 aa  134  5e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00793831  normal  0.0982171 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4137  Radical SAM domain protein  27.09 
 
 		 430 aa  131  3e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2677  radical SAM domain-containing protein  27.67 
 
 		 464 aa  125  3e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.773927  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0328  Radical SAM domain protein  25 
 
 		 468 aa  120  3.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2370  Radical SAM domain protein  25.76 
 
 		 462 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1837  Radical SAM domain protein  23.98 
 
 		 518 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.654863  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0678  radical SAM domain-containing protein  25.82 
 
 		 464 aa  107  6e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.628302  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2600  Radical SAM domain protein  24.71 
 
 		 486 aa  105  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1741  Radical SAM domain protein  25.68 
 
 		 728 aa  105  3e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0185422  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1962  radical SAM domain-containing protein  27.83 
 
 		 436 aa  103  9e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0417  radical SAM family protein  27.01 
 
 		 457 aa  102  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1961  radical SAM domain-containing protein  27.03 
 
 		 440 aa  101  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0687  radical SAM domain-containing protein  23.41 
 
 		 481 aa  100  4e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1246  radical SAM family protein  26.56 
 
 		 432 aa  97.1  7e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0936067  normal  0.0177716 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0575  Radical SAM domain protein  25.88 
 
 		 434 aa  95.9  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3364  radical SAM domain-containing protein  28.77 
 
 		 484 aa  96.3  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.155713  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2425  radical SAM domain-containing protein  26.72 
 
 		 434 aa  95.5  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.200383  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3365  arylsulfatase-activating protein AtsB  26.85 
 
 		 394 aa  94  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.812959 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3467  arylsulfatase-activating protein AtsB  26.65 
 
 		 394 aa  93.6  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.904338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3372  arylsulfatase-activating protein AtsB  26.65 
 
 		 394 aa  93.2  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3298  arylsulfatase-activating protein AtsB  26.37 
 
 		 394 aa  91.3  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1520  radical SAM domain-containing protein  23.24 
 
 		 351 aa  90.9  5e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1441  Radical SAM domain protein  25.46 
 
 		 474 aa  89.4  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0147  radical SAM domain-containing protein  25.44 
 
 		 507 aa  87.4  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6916  hypothetical protein  27.81 
 
 		 399 aa  85.9  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1446  radical SAM domain-containing protein  26.89 
 
 		 443 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2456  radical SAM domain-containing protein  25.23 
 
 		 470 aa  85.9  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6683  Radical SAM domain protein  25.52 
 
 		 428 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.630813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3080  arylsulfatase regulator  26.52 
 
 		 438 aa  85.9  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.482835  normal  0.0699226 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0580  radical SAM domain-containing protein  25.28 
 
 		 389 aa  85.5  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.185035  normal  0.0438607 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2899  Radical SAM domain protein  32.88 
 
 		 281 aa  85.1  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0685  radical SAM domain-containing protein  25.5 
 
 		 499 aa  85.1  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00827758 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0616  anaerobic sulfatase-maturase  23.73 
 
 		 370 aa  84.3  0.000000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.512735  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0433  radical SAM domain-containing protein  26.72 
 
 		 365 aa  84  0.000000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.293902  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4972  putative arylsulfatase regulatory protein  28.66 
 
 		 370 aa  84  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4244  Radical SAM domain protein  24.78 
 
 		 369 aa  83.6  0.000000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3391  radical SAM domain-containing protein  24.93 
 
 		 800 aa  83.2  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.228566 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1364  radical SAM domain-containing protein  23.49 
 
 		 460 aa  82.8  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.458082  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1507  radical SAM domain-containing protein  25.54 
 
 		 381 aa  83.2  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.385023 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1008  Radical SAM domain protein  25 
 
 		 370 aa  82  0.00000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2031  radical SAM family protein  35.33 
 
 		 481 aa  81.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1683  radical SAM family protein  26.67 
 
 		 460 aa  81.3  0.00000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.24704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2359  radical SAM domain-containing protein  25.5 
 
 		 450 aa  80.9  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.288415  hitchhiker  0.00183234 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3367  putative sulfatase regulator  26 
 
 		 408 aa  80.5  0.00000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.917343 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1340  radical SAM domain-containing protein  26.82 
 
 		 467 aa  80.5  0.00000000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.768611  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3234  radical SAM domain-containing protein  37.84 
 
 		 397 aa  79.7  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0093  radical SAM domain-containing protein  26.3 
 
 		 356 aa  79.7  0.0000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.488444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1561  radical SAM domain-containing protein  23.1 
 
 		 455 aa  79.7  0.0000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1502  radical SAM domain-containing protein  25.47 
 
 		 442 aa  79.7  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0399675  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1457  radical SAM domain-containing protein  25.47 
 
 		 442 aa  79.7  0.0000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000310  arylsulfatase regulator  24.39 
 
 		 433 aa  79.3  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0932  putative sulfatase regulator  25.86 
 
 		 408 aa  79.3  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0985  radical SAM domain-containing protein  25.86 
 
 		 408 aa  79.3  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1676  radical SAM domain-containing protein  25.15 
 
 		 385 aa  77.8  0.0000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0376  Radical SAM domain protein  21.93 
 
 		 368 aa  77.8  0.0000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0073  radical SAM domain-containing protein  25.15 
 
 		 356 aa  77.8  0.0000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3930  hypothetical protein  26.28 
 
 		 414 aa  77.4  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.298545  normal  0.584174 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2700  arylsulfatase regulator  25.77 
 
 		 380 aa  77  0.0000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00619293  normal  0.114693 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2734  radical SAM family protein  27.88 
 
 		 446 aa  77.4  0.0000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2110  radical SAM domain protein  25.15 
 
 		 385 aa  77  0.0000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.73629  normal  0.549751 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2090  Radical SAM domain protein  24.86 
 
 		 387 aa  76.6  0.0000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1098  arylsulfatase regulator (Fe-S oxidoreductase)-like protein  25.54 
 
 		 275 aa  76.6  0.0000000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.852177  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2595  Radical SAM domain protein  30.97 
 
 		 397 aa  76.6  0.0000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0848982 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2149  Radical SAM domain protein  25.15 
 
 		 385 aa  76.3  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.967723  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1582  radical SAM domain-containing protein  25.15 
 
 		 385 aa  76.3  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.28073  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01468  hypothetical protein  25.15 
 
 		 385 aa  76.3  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>