More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1467 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1467  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 		 210 aa  402  1e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4133  lysine exporter protein LysE/YggA  96.19 
 
 		 210 aa  387  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4264  lysine exporter protein LysE/YggA  96.19 
 
 		 210 aa  387  1e-107  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.269909  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4180  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  45.54 
 
 		 207 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4465  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  46.01 
 
 		 207 aa  177  7e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3227  lysine exporter protein LysE/YggA  48.56 
 
 		 206 aa  166  2e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2401  lysine exporter protein LysE/YggA  46.7 
 
 		 206 aa  162  3e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00829988 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0349  lysine exporter protein LysE/YggA  52.15 
 
 		 209 aa  161  7e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0744  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  42.36 
 
 		 213 aa  143  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.295219  normal  0.475947 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4075  LysE family efflux protein  40.64 
 
 		 221 aa  125  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02476  hypothetical protein  35.85 
 
 		 211 aa  123  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2562  lysine exporter protein LysE/YggA  38.28 
 
 		 211 aa  119  3.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003627  putative threonine efflux protein  33.18 
 
 		 231 aa  117  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3582  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  45.95 
 
 		 210 aa  116  3e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.165726  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2043  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.33 
 
 		 208 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000125036  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1031  hypothetical protein  34.48 
 
 		 212 aa  113  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.332162  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1333  lysine exporter protein LysE/YggA  35.61 
 
 		 212 aa  113  2.0000000000000002e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2500  lysine exporter protein LysE/YggA  34.63 
 
 		 213 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.106725  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0286  lysine exporter protein LysE/YggA  33.66 
 
 		 211 aa  107  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0029  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.77 
 
 		 214 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2383  lysine exporter protein LysE/YggA  32.54 
 
 		 217 aa  105  6e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.77882  normal  0.612853 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2786  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.67 
 
 		 206 aa  104  9e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1798  amino acid transport protein, LysE type  31.31 
 
 		 213 aa  103  2e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.701098  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2059  LysE family amino acid efflux protein  32.69 
 
 		 217 aa  102  3e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.513091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4719  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.38 
 
 		 212 aa  101  9e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1388  amino acid transporter LysE  36.23 
 
 		 228 aa  99.8  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0501572  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1442  lysine exporter protein LysE/YggA  32.68 
 
 		 217 aa  97.1  2e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.754857 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2381  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.5 
 
 		 210 aa  97.1  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000868866  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0277  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.89 
 
 		 208 aa  97.1  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2495  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.5 
 
 		 211 aa  97.1  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000331121  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3063  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.22 
 
 		 210 aa  95.1  6e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3931  amino acid transporter LysE  29.95 
 
 		 213 aa  94  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2985  lysine exporter protein LysE/YggA  40.54 
 
 		 208 aa  94  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120871  normal  0.440031 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1483  lysine exporter protein LysE/YggA  31.05 
 
 		 215 aa  93.2  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2162  lysine exporter protein LysE/YggA  30.69 
 
 		 209 aa  92.8  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0727412  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6476  lysine exporter protein LysE/YggA  34.31 
 
 		 211 aa  90.5  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.772782 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2321  putative homoserine/threonine efflux protein  31.19 
 
 		 210 aa  90.1  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2456  putative homoserine/threonine efflux protein  30.85 
 
 		 210 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.506268  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3865  lysine exporter protein LysE/YggA  31.58 
 
 		 210 aa  90.1  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.149729 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3122  lysine exporter protein LysE/YggA  36.18 
 
 		 213 aa  89.7  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.188461 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1728  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.71 
 
 		 208 aa  89.4  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000259292  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2131  homoserine/threonine efflux protein  30.85 
 
 		 210 aa  89.4  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000187844  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2374  putative homoserine/threonine efflux protein  30.85 
 
 		 210 aa  89.4  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2355  LysE family translocator protein  32.55 
 
 		 211 aa  89  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2194  homoserine/threonine efflux protein  30.85 
 
 		 210 aa  89  5e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534032  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0144  homoserine/threonine efflux protein, putative  32.55 
 
 		 211 aa  89  5e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2291  lysine exporter protein LysE/YggA  30.05 
 
 		 213 aa  89  5e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.888062 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2355  homoserine/threonine efflux protein  30.85 
 
 		 210 aa  89  5e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2277  LysE family translocator protein  32.55 
 
 		 211 aa  89  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3676  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.58 
 
 		 218 aa  89  5e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2803  LysE family translocator protein  32.55 
 
 		 211 aa  89  5e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1731  lysine exporter protein LysE/YggA  29.06 
 
 		 209 aa  88.6  6e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.820642  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3385  lysine exporter protein LysE/YggA  33.18 
 
 		 214 aa  88.6  7e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00201071 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0992  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.82 
 
 		 232 aa  88.2  8e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0092  lysine exporter protein LysE/YggA  32.7 
 
 		 211 aa  88.2  9e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2108  lysine exporter protein LysE/YggA  30.52 
 
 		 213 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.451447 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0348  homoserine/homoserine lactone efflux protein  32.55 
 
 		 211 aa  87.8  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0074  LysE family amino acid efflux protein  33.65 
 
 		 274 aa  87.4  1e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0162  LysE family translocator protein  32.55 
 
 		 211 aa  87.8  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2266  lysine exporter protein LysE/YggA  33.94 
 
 		 211 aa  87.8  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000228935  hitchhiker  0.000000285135 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2512  LysE family efflux protein  32.38 
 
 		 209 aa  87.8  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.77155  normal  0.629376 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3097  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.82 
 
 		 206 aa  87.8  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000000179524  hitchhiker  0.00000160159 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3353  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.18 
 
 		 218 aa  87.8  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0153  LysE family translocator protein  32.08 
 
 		 211 aa  87  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3625  amino acid transporter LysE  30.52 
 
 		 213 aa  87  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.277347  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2383  homoserine/threonine efflux protein, putative  30.53 
 
 		 210 aa  87  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.168172  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1730  amino acid transporter LysE  28.71 
 
 		 208 aa  87  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000126843  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2583  hypothetical protein  35.44 
 
 		 208 aa  87  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.258371  normal  0.140618 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2220  lysine exporter protein LysE/YggA  28.5 
 
 		 213 aa  87  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000181241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0784  amino acid efflux/transport protein  30.39 
 
 		 208 aa  87  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4247  putative homoserine/threonine efflux protein  28.43 
 
 		 208 aa  87  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000239469 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1045  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.13 
 
 		 211 aa  86.3  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0088  lysine exporter protein LysE/YggA  32.85 
 
 		 219 aa  85.9  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2117  homoserine/threonine efflux protein  30.35 
 
 		 210 aa  85.9  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.045272  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4520  lysine exporter protein LysE/YggA  38.22 
 
 		 211 aa  85.9  4e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.286419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0100  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.18 
 
 		 234 aa  85.5  5e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0023  lysine exporter protein LysE/YggA  32.68 
 
 		 209 aa  85.1  6e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1363  LysE family translocator protein  29.86 
 
 		 213 aa  84.7  8e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.640513  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1191  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.86 
 
 		 211 aa  84.7  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.217594  normal  0.390598 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3003  putative homoserine/threonine efflux protein  29.35 
 
 		 210 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.132575 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1925  putative homoserine/threonine efflux protein  28.43 
 
 		 208 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.82308e-38 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0073  transporter transmembrane protein  33.66 
 
 		 215 aa  83.6  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163554  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1701  amino acid transporter LysE  28.43 
 
 		 208 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0912104  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2019  lysine exporter protein LysE/YggA  34.76 
 
 		 248 aa  84  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.318946 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3040  lysine exporter protein LysE/YggA  35.05 
 
 		 208 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.408857  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6863  efflux protein  35.32 
 
 		 218 aa  83.6  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.286077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2862  lysine exporter protein LysE/YggA  31.53 
 
 		 213 aa  83.6  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4942  lysine exporter protein LysE/YggA  35.05 
 
 		 208 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.774081  normal  0.20679 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5326  lysine exporter protein LysE/YggA  35.05 
 
 		 208 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.692371  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2925  amino acid transporter LysE  29.61 
 
 		 209 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0920317  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02483  hypothetical protein  32.84 
 
 		 209 aa  83.2  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2300  lysine exporter protein LysE/YggA  31.39 
 
 		 208 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.735083  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2313  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.39 
 
 		 208 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00564099  hitchhiker  0.00590082 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3434  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.43 
 
 		 218 aa  83.2  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4318  lysine exporter protein LysE/YggA  32.99 
 
 		 203 aa  82.4  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0592644  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1752  homoserine/threonine efflux protein  28.71 
 
 		 208 aa  82.4  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000289008  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1890  homoserine/threonine efflux protein  28.71 
 
 		 208 aa  82.4  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.131548  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4206  lysine exporter protein LysE/YggA  31.58 
 
 		 237 aa  82.8  0.000000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000158668 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2459  lysine exporter protein LysE/YggA  29.63 
 
 		 215 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.593208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2025  lysine exporter protein LysE/YggA  31.39 
 
 		 208 aa  82.4  0.000000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.464731  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>