More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0029 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0029  ABC transporter related  100 
 
 		 239 aa  466  9.999999999999999e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1937  ABC transporter related  70.34 
 
 		 242 aa  286  2e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2185  ABC transporter related  63.29 
 
 		 249 aa  280  1e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.254877 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1850  ABC transporter related  62.87 
 
 		 249 aa  279  3e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.854299 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2586  ABC multidrug efflux transporter, ATPase subunit  68.64 
 
 		 242 aa  278  4e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1244  ABC transporter related  68.22 
 
 		 242 aa  278  7e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.184068  normal  0.743108 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2717  ABC transporter related  62.03 
 
 		 249 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.559689  normal  0.274453 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1801  ABC transporter related  62.87 
 
 		 249 aa  265  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.703769  normal  0.43923 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5313  ABC transporter related  61.18 
 
 		 249 aa  264  1e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.442029  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5009  ABC transporter related  60 
 
 		 253 aa  259  4e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.107476  normal  0.110297 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0009  ABC transporter related  58.44 
 
 		 256 aa  257  9e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0026  ABC transporter related  61.61 
 
 		 265 aa  244  9e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0009  ABC transporter related  57.81 
 
 		 264 aa  238  5e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0065566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3932  ABC transporter related  53.22 
 
 		 242 aa  233  3e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2667  ABC transporter  53.81 
 
 		 239 aa  231  7.000000000000001e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.075945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0248  ABC transporter related  58.47 
 
 		 269 aa  223  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.112673 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1946  ABC transporter related  54.43 
 
 		 272 aa  219  3e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.236467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5947  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.92 
 
 		 259 aa  218  6e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.212868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2849  ABC transporter related  50.63 
 
 		 250 aa  211  9e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.372779  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1893  ABC transporter, ATP-binding protein  46.61 
 
 		 251 aa  199  3e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.128546  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4976  ABC transporter related  47.9 
 
 		 255 aa  198  6e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.351219  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1280  ABC transporter, ATP-binding protein  51.48 
 
 		 247 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.881493  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2260  ABC transporter related  42.98 
 
 		 239 aa  191  1e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.502065  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2668  efflux ABC transporter ATP-binding protein  49.58 
 
 		 246 aa  188  5e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3095  ABC transporter related  49.58 
 
 		 246 aa  188  5e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3135  ABC transporter related  49.58 
 
 		 246 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3039  ABC transporter related  45.37 
 
 		 237 aa  186  3e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.250558  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1793  ABC transporter-related protein  45.34 
 
 		 239 aa  186  3e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000464177 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0719  ABC transporter related  44.12 
 
 		 247 aa  186  4e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.380288 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1860  ABC transporter related  44.54 
 
 		 285 aa  185  5e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2589  ABC efflux transporter, ATP-binding protein  45.19 
 
 		 249 aa  181  9.000000000000001e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.486722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0427  ATPase  42.47 
 
 		 282 aa  162  3e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.965922 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3246  ABC transporter, ATP-binding protein  37.08 
 
 		 266 aa  162  6e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.478641  normal  0.0776231 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0418  ABC transporter-like  41.54 
 
 		 300 aa  160  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.307879  normal  0.0288734 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0686  ABC transporter, ATP-binding protein  33.63 
 
 		 345 aa  160  2e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.541745  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0428  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.16 
 
 		 326 aa  154  1e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.160514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2894  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.74 
 
 		 323 aa  153  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1788  ABC transporter related protein  41.28 
 
 		 317 aa  149  3e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.703394  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3573  ABC transporter, ATP-binding protein  38.97 
 
 		 330 aa  148  7e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.366392  normal  0.0689174 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1208  ABC transporter related  39.74 
 
 		 339 aa  148  7e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.697219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0222  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  37.67 
 
 		 330 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.834743  normal  0.816705 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4576  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.35 
 
 		 343 aa  147  1.0000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0885138  normal  0.505174 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5104  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40 
 
 		 324 aa  147  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.0010745  normal  0.559357 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1036  ABC transporter related  39.82 
 
 		 328 aa  147  2.0000000000000003e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0243  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.82 
 
 		 316 aa  146  3e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0708774  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03556  ABC transporter, ATP-binding protein  40.09 
 
 		 310 aa  145  5e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.333209  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2117  ABC transporter related  34.18 
 
 		 244 aa  145  6e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.101378  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0215  ABC transporter-related protein  35.09 
 
 		 310 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.314538  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0907  ABC transporter related  36.75 
 
 		 260 aa  144  9e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000299465 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1126  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.86 
 
 		 326 aa  144  1e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0772  ABC transporter, ATP-binding protein  42.05 
 
 		 319 aa  143  2e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2327  ABC transporter, ATP-binding protein  42.06 
 
 		 328 aa  142  4e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0477326  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1780  multidrug ABC transporter  35.96 
 
 		 337 aa  142  5e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1207  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.45 
 
 		 279 aa  142  5e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1213  ABC transporter related  40.99 
 
 		 309 aa  141  7e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.715047  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4160  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.99 
 
 		 339 aa  141  7e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.144366 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0036  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.27 
 
 		 325 aa  142  7e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8872  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.37 
 
 		 321 aa  141  8e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.892714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1019  ABC transporter related  37.91 
 
 		 590 aa  141  8e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0754  ABC transporter related  43.59 
 
 		 245 aa  141  8e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05031  putative multidrug efflux ABC transporter  35.53 
 
 		 337 aa  141  8e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.123969 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1594  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.3 
 
 		 323 aa  141  8e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.658594  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8157  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.86 
 
 		 314 aa  141  9e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0614  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.25 
 
 		 374 aa  141  9e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.668059 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0874  ABC transporter related  42.11 
 
 		 312 aa  141  9.999999999999999e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.468306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4032  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.56 
 
 		 338 aa  140  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.631221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0339  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.79 
 
 		 351 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.261155  hitchhiker  0.00121447 
 
 
-
 
NC_002936  DET0813  ABC transporter, ATP-binding protein  36.77 
 
 		 248 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05111  putative multidrug efflux ABC transporter  33.48 
 
 		 338 aa  140  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2158  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.97 
 
 		 325 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0328  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.17 
 
 		 339 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.328549  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1427  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.04 
 
 		 327 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.154202  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0529  ABC transporter related  41.74 
 
 		 307 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0717858  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1167  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.05 
 
 		 324 aa  140  3e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3122  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.81 
 
 		 334 aa  139  3e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2562  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.15 
 
 		 328 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.518295 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1381  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.59 
 
 		 327 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000774362  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0783  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.33 
 
 		 324 aa  139  4.999999999999999e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1304  ABC transporter related  37.44 
 
 		 590 aa  138  6e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3673  ABC transporter related protein  40.6 
 
 		 339 aa  139  6e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0936  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40 
 
 		 332 aa  138  7e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2148  ATPase  39.3 
 
 		 340 aa  138  7e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.96125  normal  0.315511 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1019  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.91 
 
 		 328 aa  138  7.999999999999999e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.35766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0460  ABC transporter related  40.31 
 
 		 315 aa  138  7.999999999999999e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0955975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4762  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.81 
 
 		 309 aa  138  7.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000000635501  hitchhiker  0.0000711162 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0799  ABC transporter related protein  44.44 
 
 		 314 aa  138  8.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0640073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0553  ABC transporter related  38.99 
 
 		 279 aa  138  8.999999999999999e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3105  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  43.72 
 
 		 310 aa  138  8.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3165  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.72 
 
 		 310 aa  138  8.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337194  normal  0.603146 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0376  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.18 
 
 		 318 aa  137  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.139774  normal  0.0152344 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0120  ABC transporter, ATP-binding protein  38.97 
 
 		 305 aa  137  1e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.695477  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2408  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.45 
 
 		 325 aa  137  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000647943  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1452  ABC transporter-like  34.4 
 
 		 297 aa  137  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.218663  hitchhiker  0.00673378 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2587  ABC transporter related  38.43 
 
 		 339 aa  137  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0448  multidrug ABC transporter  33.04 
 
 		 338 aa  138  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.380616  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1514  ABC transporter related  33.33 
 
 		 205 aa  137  1e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1172  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.22 
 
 		 323 aa  137  1e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0056  ABC transporter related  39.19 
 
 		 311 aa  137  1e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.576476 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0279  ABC transporter related protein  38.56 
 
 		 262 aa  138  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.619097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3519  ABC transporter related  38.43 
 
 		 339 aa  137  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>