More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2234 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2234  alanine racemase  100 
 
 		 378 aa  770    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3850  alanine racemase  53.78 
 
 		 384 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2594  alanine racemase  52.43 
 
 		 433 aa  373  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.127753  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2908  alanine racemase  48.92 
 
 		 379 aa  362  5.0000000000000005e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.184968  normal  0.271691 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3461  alanine racemase  50.54 
 
 		 379 aa  357  9.999999999999999e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3527  alanine racemase  50.27 
 
 		 379 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2762  alanine racemase  49.19 
 
 		 380 aa  354  2e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00587004  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0606  alanine racemase  49.73 
 
 		 382 aa  347  2e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01680  alanine racemase  45.68 
 
 		 379 aa  329  6e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0964  alanine racemase  41.69 
 
 		 388 aa  315  9e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0862  alanine racemase  40.93 
 
 		 403 aa  303  3.0000000000000004e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0307  alanine racemase  38.32 
 
 		 390 aa  301  2e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4221  alanine racemase  44.12 
 
 		 411 aa  300  3e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.53018  normal  0.063385 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3770  alanine racemase  43.78 
 
 		 373 aa  296  6e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.646539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0905  alanine racemase  42.39 
 
 		 389 aa  294  2e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00165979  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0897  alanine racemase  40.98 
 
 		 403 aa  288  8e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0923  alanine racemase  40.98 
 
 		 403 aa  287  2e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0365906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0171  alanine racemase  40.44 
 
 		 371 aa  282  6.000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2167  alanine racemase  41.69 
 
 		 373 aa  281  2e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196511  decreased coverage  0.0000176162 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2865  alanine racemase  41.19 
 
 		 370 aa  277  2e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000333192  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1160  alanine racemase  38.15 
 
 		 373 aa  276  5e-73  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1484  alanine racemase  43.92 
 
 		 390 aa  276  6e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.770988  hitchhiker  0.000000845672 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0063  alanine racemase  38.42 
 
 		 373 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.131019  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0390  alanine racemase  40.05 
 
 		 395 aa  274  2.0000000000000002e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.185126  normal  0.667441 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1758  alanine racemase  40.98 
 
 		 369 aa  273  3e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2201  alanine racemase  40.22 
 
 		 406 aa  273  4.0000000000000004e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.419731 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0758  alanine racemase  37.87 
 
 		 373 aa  272  7e-72  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1132  alanine racemase  41.89 
 
 		 380 aa  271  1e-71  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0562  alanine racemase  42.3 
 
 		 375 aa  268  8e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.629716  normal  0.711821 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0412  alanine racemase  38.42 
 
 		 395 aa  266  7e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.650932  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1342  alanine racemase  41.24 
 
 		 370 aa  265  8e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0650824  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1563  alanine racemase  37.03 
 
 		 392 aa  265  8.999999999999999e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.985538  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0861  alanine racemase  39.35 
 
 		 386 aa  265  1e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0852  alanine racemase  39.08 
 
 		 386 aa  264  2e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1903  alanine racemase  36.8 
 
 		 390 aa  263  3e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0696204  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0057  alanine racemase  41.71 
 
 		 390 aa  263  3e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2170  alanine racemase  36.51 
 
 		 398 aa  263  4e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.598884  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0824  alanine racemase  36.15 
 
 		 380 aa  262  6e-69  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.664033  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2926  alanine racemase  38.08 
 
 		 389 aa  261  1e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.839244  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1547  alanine racemase  43.2 
 
 		 388 aa  260  3e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0014745  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1882  alanine racemase  39.78 
 
 		 377 aa  260  3e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2110  alanine racemase  36.68 
 
 		 391 aa  258  9e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2178  alanine racemase  36.68 
 
 		 391 aa  256  3e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3236  alanine racemase  36.68 
 
 		 391 aa  257  3e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.560123  normal  0.143826 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1884  alanine racemase  36.41 
 
 		 391 aa  256  5e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4765  alanine racemase  42.19 
 
 		 851 aa  256  5e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1894  alanine racemase  36.14 
 
 		 391 aa  255  7e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.695419  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2070  alanine racemase  36.41 
 
 		 391 aa  255  8e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.773595  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1932  alanine racemase  36.14 
 
 		 391 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2079  alanine racemase  36.14 
 
 		 391 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2163  alanine racemase  35.92 
 
 		 391 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0259  alanine racemase  39.79 
 
 		 396 aa  253  3e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.060575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0472  alanine racemase  43.13 
 
 		 380 aa  253  4.0000000000000004e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2520  alanine racemase  42.74 
 
 		 811 aa  253  4.0000000000000004e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2697  alanine racemase  37.16 
 
 		 391 aa  252  7e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2981  alanine racemase  45.48 
 
 		 844 aa  252  8.000000000000001e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1931  alanine racemase  36.68 
 
 		 408 aa  251  1e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0176201  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0681  alanine racemase  39.63 
 
 		 387 aa  248  9e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00412928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23341  alanine racemase  39.74 
 
 		 398 aa  248  9e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0609  alanine racemase  41.6 
 
 		 381 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.561464  normal  0.417929 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1898  alanine racemase  44.38 
 
 		 849 aa  244  1.9999999999999999e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0368912 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3508  alanine racemase  39.89 
 
 		 395 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3576  alanine racemase  40.16 
 
 		 395 aa  243  3e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1583  alanine racemase  37.16 
 
 		 395 aa  241  1e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.545163 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3427  alanine racemase  39.34 
 
 		 395 aa  240  2.9999999999999997e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.764084  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1245  alanine racemase  38.13 
 
 		 384 aa  238  1e-61  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2011  alanine racemase  39.67 
 
 		 368 aa  237  2e-61  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.146422  normal  0.0449726 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3487  alanine racemase  39.89 
 
 		 393 aa  237  2e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2785  alanine racemase  37.97 
 
 		 441 aa  236  4e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0448051 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1337  alanine racemase  34.88 
 
 		 369 aa  236  7e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000100581  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19731  alanine racemase  35.45 
 
 		 402 aa  234  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1986  alanine racemase  37.17 
 
 		 375 aa  233  3e-60  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.371384  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2084  alanine racemase  37.23 
 
 		 375 aa  233  3e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.261095 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1098  alanine racemase  34.92 
 
 		 402 aa  233  4.0000000000000004e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1095  alanine racemase  35.28 
 
 		 379 aa  232  7.000000000000001e-60  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.885061  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3857  alanine racemase  39.1 
 
 		 372 aa  232  8.000000000000001e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.859951  normal  0.532248 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01510  alanine racemase  37.43 
 
 		 421 aa  232  9e-60  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0441968 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0233  putative bifunctional UDP-N-acetylmuramoyl-tripeptide:D-alanyl-D-alanine ligase/alanine racemase  36.8 
 
 		 834 aa  231  1e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0994  alanine racemase  40.11 
 
 		 382 aa  231  1e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0345  alanine racemase  38.9 
 
 		 376 aa  230  2e-59  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.605258  normal  0.144303 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0990  alanine racemase  38.24 
 
 		 397 aa  228  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.876046  hitchhiker  0.00306709 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4267  alanine racemase  40.64 
 
 		 375 aa  228  2e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4247  alanine racemase  39.89 
 
 		 372 aa  227  3e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.170203  hitchhiker  0.00478121 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1026  alanine racemase  34.96 
 
 		 364 aa  225  1e-57  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.43119  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0934  alanine racemase  37.9 
 
 		 376 aa  224  2e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17191  alanine racemase  33.42 
 
 		 399 aa  224  2e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16471  alanine racemase  38.99 
 
 		 381 aa  223  4e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.950833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0622  alanine racemase  38.2 
 
 		 384 aa  222  8e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0376668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0326  alanine racemase  35.33 
 
 		 369 aa  222  8e-57  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.442092  normal  0.535526 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1025  alanine racemase  35.87 
 
 		 364 aa  222  9e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6011  alanine racemase  40.63 
 
 		 380 aa  221  9.999999999999999e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0222771  normal  0.167789 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17091  alanine racemase  33.6 
 
 		 399 aa  221  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13457  alanine racemase  39.35 
 
 		 408 aa  220  3e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0132184  hitchhiker  0.000185138 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1885  alanine racemase  42.9 
 
 		 397 aa  220  3.9999999999999997e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.849261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07700  alanine racemase  36.1 
 
 		 434 aa  219  5e-56  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.282075 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5321  alanine racemase  38.71 
 
 		 357 aa  219  6e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.274538 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4045  alanine racemase  39.3 
 
 		 376 aa  219  6e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.43554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1173  alanine racemase  38.77 
 
 		 383 aa  219  7.999999999999999e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49691  normal  0.0522528 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1146  alanine racemase  38.77 
 
 		 383 aa  219  7.999999999999999e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1163  alanine racemase  38.77 
 
 		 383 aa  219  7.999999999999999e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.434451 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>