More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1091 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_1091  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 216 aa  440  1e-123  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.598204 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0642  radical SAM domain-containing protein  77.78 
 
 		 216 aa  352  2e-96  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0949  radical SAM domain-containing protein  69.91 
 
 		 216 aa  314  8e-85  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00254529  hitchhiker  0.000124279 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0034  radical SAM domain-containing protein  70.37 
 
 		 216 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0707  Radical SAM domain protein  41.63 
 
 		 227 aa  144  1e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.654115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1974  radical SAM domain-containing protein  42.31 
 
 		 210 aa  144  1e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1687  Radical SAM domain protein  39.23 
 
 		 208 aa  137  1e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2847  radical SAM family protein  35.9 
 
 		 247 aa  132  3e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.512992  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1753  radical SAM family protein  38.3 
 
 		 251 aa  120  9.999999999999999e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.55771 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1450  Radical SAM domain protein  35.16 
 
 		 209 aa  120  9.999999999999999e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2226  putative radical activating enzyme  40 
 
 		 227 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0779  Radical SAM domain protein  40.09 
 
 		 223 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141038  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2837  radical SAM domain-containing protein  35.24 
 
 		 243 aa  109  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0862  radical SAM domain-containing protein  35.59 
 
 		 231 aa  109  3e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1098  radical SAM domain-containing protein  35.86 
 
 		 246 aa  107  9.000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4124  radical SAM domain-containing protein  31.9 
 
 		 230 aa  107  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0952  radical SAM domain-containing protein  35.19 
 
 		 217 aa  105  4e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0717091  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2016  queuosine biosynthesis protein  34.08 
 
 		 213 aa  105  6e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.708443  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0178  radical SAM domain-containing protein  34.08 
 
 		 213 aa  105  6e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.866793  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2336  radical SAM family protein  32.41 
 
 		 212 aa  102  3e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650219  normal  0.0607632 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01567  radical activating enzyme  35.4 
 
 		 213 aa  102  5e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1071  radical activating enzyme  34.26 
 
 		 217 aa  101  8e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0749004  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2203  radical activating enzyme  36.11 
 
 		 216 aa  100  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000727675 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3116  Radical SAM domain protein  35.06 
 
 		 233 aa  98.6  7e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.353505  normal  0.670144 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1392  Radical SAM domain protein  32.51 
 
 		 274 aa  98.6  7e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2024  hypothetical protein  33.18 
 
 		 217 aa  98.2  8e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4643  radical SAM family Fe-S protein  36.14 
 
 		 226 aa  98.2  9e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.726839  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1943  Radical SAM domain protein  31.62 
 
 		 260 aa  97.4  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228441  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3058  Radical SAM domain protein  31.47 
 
 		 258 aa  97.8  1e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4050  radical SAM family protein  34.51 
 
 		 212 aa  97.4  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0591  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 		 258 aa  97.4  1e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2209  radical SAM domain-containing protein  40.24 
 
 		 202 aa  97.1  2e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2526  putative radical activating enzyme  34.86 
 
 		 216 aa  97.4  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0292086  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3969  radical SAM domain protein  33.63 
 
 		 215 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0978763  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2019  hypothetical protein  32.72 
 
 		 217 aa  94.7  1e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1232  radical activating enzyme family protein  34.08 
 
 		 215 aa  92.8  3e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.248382  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2341  Radical SAM domain protein  31.15 
 
 		 280 aa  93.2  3e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1418  radical SAM family protein  32.74 
 
 		 215 aa  92.4  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0538  Radical SAM domain protein  34.55 
 
 		 227 aa  92.8  4e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0128544  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0736  radical activating enzyme  31.88 
 
 		 244 aa  91.7  8e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.114676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1617  hypothetical protein  35.24 
 
 		 202 aa  91.7  8e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0896  radical SAM domain-containing protein  31.44 
 
 		 245 aa  91.7  8e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116029 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0724  radical SAM family protein  31 
 
 		 244 aa  91.3  9e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2711  radical SAM family protein  33.79 
 
 		 234 aa  91.3  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1917  radical activating enzyme  31.12 
 
 		 222 aa  91.3  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0152798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0175  radical SAM domain-containing protein  27.31 
 
 		 247 aa  90.5  2e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0148  radical SAM domain-containing protein  34.1 
 
 		 213 aa  90.5  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4399  radical SAM family protein  31.36 
 
 		 215 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.102594  normal  0.8927 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2163  radical activating enzyme  37.93 
 
 		 222 aa  90.1  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00224373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3632  Radical SAM domain protein  34.1 
 
 		 211 aa  90.1  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.597891 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02724  radical activating enzyme  28.38 
 
 		 224 aa  89.4  4e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0569  Radical SAM domain protein  34.22 
 
 		 232 aa  89  5e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.241409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3229  radical SAM domain-containing protein  30.84 
 
 		 223 aa  89  5e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000000624181  normal  0.126781 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3107  radical SAM family protein  31.96 
 
 		 210 aa  89  6e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2116  radical activating enzyme  28.76 
 
 		 222 aa  88.6  6e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.054229  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0267  radical SAM domain-containing protein  33.49 
 
 		 202 aa  88.6  7e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.953431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1855  radical activating enzyme  30.3 
 
 		 222 aa  88.6  7e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.328449  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0156  radical SAM domain-containing protein  26.69 
 
 		 247 aa  88.2  8e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.491243  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0569  Radical SAM domain protein  29.44 
 
 		 220 aa  88.2  9e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2061  radical SAM domain-containing protein  30.4 
 
 		 222 aa  87.4  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2501  radical activating enzyme  36.11 
 
 		 222 aa  87.8  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0196  radical SAM domain-containing protein  26.29 
 
 		 247 aa  87.4  1e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0856  hypothetical protein  32.75 
 
 		 224 aa  86.7  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0069  radical SAM domain protein  33.33 
 
 		 214 aa  87.4  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2162  radical activating enzyme  30.46 
 
 		 222 aa  87  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.221208  normal  0.837279 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1280  radical SAM domain-containing protein  32.47 
 
 		 226 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.281332  normal  0.805859 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0070  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 		 214 aa  87.4  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.457092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3313  radical SAM domain-containing protein  29.07 
 
 		 223 aa  86.3  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.566212  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0977  radical SAM domain-containing protein  29.07 
 
 		 223 aa  86.3  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0978  hypothetical protein  30.47 
 
 		 245 aa  86.3  3e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3444  radical SAM domain-containing protein  29.07 
 
 		 223 aa  86.3  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4193  radical SAM domain-containing protein  31.36 
 
 		 215 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1783  putative organic radical activating protein  31.76 
 
 		 225 aa  86.3  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.644545  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1460  radical SAM domain-containing protein  29.83 
 
 		 238 aa  85.9  5e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.387588  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1396  radical SAM domain protein  29.83 
 
 		 238 aa  85.5  6e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0288655  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1298  radical SAM family protein  35.89 
 
 		 210 aa  85.5  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18811  putative organic radical activating protein  31.76 
 
 		 223 aa  85.5  6e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.533025  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2058  radical activating enzyme  29.59 
 
 		 222 aa  85.5  6e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00725057  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1425  radical SAM domain protein  28.85 
 
 		 249 aa  85.1  8e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1332  hypothetical protein  34.9 
 
 		 206 aa  85.1  8e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3265  radical SAM domain-containing protein  30.57 
 
 		 223 aa  84.7  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000025013  normal  0.189038 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3148  radical SAM domain-containing protein  30.57 
 
 		 223 aa  84.7  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000734892  normal  0.311004 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3084  radical SAM domain protein  30.57 
 
 		 223 aa  84.7  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.000000000000255818  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3990  radical SAM domain-containing protein  31.36 
 
 		 215 aa  84.7  9e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3167  hypothetical protein  30.57 
 
 		 223 aa  84.7  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000157264  normal  0.548962 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0912  conserved hypothetical protein  31 
 
 		 223 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000203902  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2918  hypothetical protein  31 
 
 		 223 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  3.7449199999999994e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2268  radical activating enzyme  30.46 
 
 		 222 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00320351  normal  0.189151 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3947  radical SAM domain protein  29.41 
 
 		 238 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0197707  normal  0.0210663 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3080  hypothetical protein  31 
 
 		 223 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000477114  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1254  radical SAM domain-containing protein  30.91 
 
 		 215 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.04187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4033  hypothetical protein  31 
 
 		 223 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000000488158  normal  0.75822 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3099  hypothetical protein  31 
 
 		 223 aa  84.3  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000109551  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2067  Radical SAM domain protein  37.13 
 
 		 207 aa  84.3  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0974345  normal  0.133919 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2254  radical activating enzyme  30.46 
 
 		 222 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.499803  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02584  hypothetical protein  31 
 
 		 223 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000638386  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0896  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  29.58 
 
 		 245 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4540  hypothetical protein  30.46 
 
 		 222 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3109  radical SAM domain protein  30.13 
 
 		 223 aa  84.3  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000108893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51680  radical activating enzyme  32.62 
 
 		 264 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000920323  hitchhiker  0.00150868 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>