66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0734 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_0734  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 
1022 aa  2087    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.983175  normal  0.257164 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0770  glycoside hydrolase family 57  35.91 
 
 
829 aa  299  1e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0675  glycoside hydrolase family 57  35.66 
 
 
1042 aa  297  7e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0856  glycoside hydrolase family protein  34.9 
 
 
732 aa  281  5e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0149  glycoside hydrolase family 57  34.45 
 
 
726 aa  278  5e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00221085  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0138  glycoside hydrolase family 57  35.01 
 
 
726 aa  277  6e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.806114  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0131  glycoside hydrolase family protein  33.95 
 
 
726 aa  276  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0840945  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0027  glycoside hydrolase family protein  33.15 
 
 
731 aa  273  2e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0408  glycoside hydrolase family 57  32.79 
 
 
729 aa  272  2.9999999999999997e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3255  hypothetical protein  33.52 
 
 
729 aa  268  5e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.36573  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2957  alpha-mannosidase  32.95 
 
 
695 aa  263  1e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0803  glycoside hydrolase family protein  33.78 
 
 
1162 aa  263  2e-68  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0135  glycoside hydrolase family protein  32.79 
 
 
722 aa  259  2e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000920685  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1616  glycoside hydrolase family protein  34.46 
 
 
1006 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3440  family 57 glycoside hydrolase  32.97 
 
 
744 aa  253  9.000000000000001e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3401  glycoside hydrolase family 57  32.1 
 
 
728 aa  252  2e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3177  glycoside hydrolase family protein  31.88 
 
 
734 aa  252  2e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.392002 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3464  glycoside hydrolase family 57  32.1 
 
 
728 aa  251  4e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2965  glycoside hydrolase family 57  32.55 
 
 
749 aa  250  1e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.993077  normal  0.662325 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3153  glycoside hydrolase family 57  32.37 
 
 
749 aa  249  2e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3035  glycoside hydrolase family protein  31.75 
 
 
744 aa  244  5e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1866  glycoside hydrolase family protein  33.57 
 
 
1000 aa  244  5e-63  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0933  hypothetical protein  49.39 
 
 
544 aa  239  1e-61  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.522776  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4047  glycoside hydrolase family 57  31.68 
 
 
747 aa  238  5.0000000000000005e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.422577 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0999  glycoside hydrolase family 57  30.31 
 
 
674 aa  236  2.0000000000000002e-60  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0985  glycoside hydrolase family protein  31.56 
 
 
994 aa  235  3e-60  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.369995  normal  0.376092 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1516  glycoside hydrolase family protein  29.69 
 
 
759 aa  224  4.9999999999999996e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.757577  normal  0.533903 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4927  glycoside hydrolase family 57  30.77 
 
 
743 aa  218  5.9999999999999996e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.269999  normal  0.543005 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1369  glycoside hydrolase family protein  28.11 
 
 
582 aa  196  1e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0584  glycoside hydrolase family protein  29.39 
 
 
551 aa  196  2e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2839  glycosyl hydrolase, family 57  28.6 
 
 
568 aa  195  3e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2460  glycoside hydrolase family 57  28.6 
 
 
568 aa  195  3e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0719  glycoside hydrolase family protein  28.65 
 
 
566 aa  190  9e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2072  glycoside hydrolase, family 57  27.12 
 
 
577 aa  180  2e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0777  glycoside hydrolase family 57  27.24 
 
 
566 aa  175  3.9999999999999995e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1528  glycoside hydrolase family 57  26.53 
 
 
580 aa  175  5e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000278955 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0960  glycoside hydrolase family protein  27.04 
 
 
584 aa  171  5e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.285068 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1432  glycoside hydrolase family protein  26.76 
 
 
570 aa  167  1.0000000000000001e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1107  glycoside hydrolase family protein  26.03 
 
 
580 aa  165  4.0000000000000004e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.185203  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0509  glycoside hydrolase family protein  27.39 
 
 
575 aa  164  1e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2060  glycosy hydrolase family protein  25.88 
 
 
574 aa  152  2e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.725097  normal  0.224311 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2138  glycoside hydrolase family 57  27.54 
 
 
902 aa  87.4  0.000000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.205932  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0932  glycoside hydrolase family protein  27.27 
 
 
1187 aa  81.3  0.0000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.26895  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1371  glycoside hydrolase family protein  28.88 
 
 
606 aa  68.9  0.0000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0210  glycoside hydrolase family protein  28.8 
 
 
609 aa  65.5  0.000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.044129  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0199  glycoside hydrolase family protein  28.8 
 
 
485 aa  62.8  0.00000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.400833 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0672  glycoside hydrolase family protein  29.21 
 
 
485 aa  55.8  0.000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.565437 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0183  glycoside hydrolase family protein  27.33 
 
 
471 aa  53.9  0.00001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00355516  normal  0.949853 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2712  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  34.11 
 
 
2156 aa  51.6  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1236  glycoside hydrolase family protein  27.33 
 
 
472 aa  50.8  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2734  glycoside hydrolase family protein  28.17 
 
 
394 aa  50.4  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11701  hypothetical protein  31.82 
 
 
527 aa  49.3  0.0004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0208787  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0687  hypothetical protein  34.48 
 
 
521 aa  48.9  0.0005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.034103  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15211  hypothetical protein  34.48 
 
 
521 aa  48.9  0.0005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.270721  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11711  hypothetical protein  31.58 
 
 
527 aa  48.9  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0021  glycoside hydrolase family protein  29.53 
 
 
786 aa  48.1  0.0009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0433  glycoside hydrolase family 57  22.54 
 
 
514 aa  48.1  0.0009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.188798  hitchhiker  0.0014488 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4705  glycoside hydrolase family protein  28.86 
 
 
820 aa  47.8  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1810  glycoside hydrolase family protein  29.05 
 
 
811 aa  47  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1766  glycoside hydrolase family protein  28.19 
 
 
823 aa  46.6  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0138478  normal  0.386412 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2359  hypothetical protein  27.03 
 
 
794 aa  45.8  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.780918  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11551  hypothetical protein  32.17 
 
 
527 aa  45.8  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.512762  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0812  glycoside hydrolase family protein  26.51 
 
 
811 aa  45.4  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0121928 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0544  glycoside hydrolase family 57  24 
 
 
790 aa  45.4  0.005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11251  hypothetical protein  21.43 
 
 
520 aa  44.7  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.448443  normal  0.521011 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0038  glycoside hydrolase family 57  26.67 
 
 
807 aa  44.7  0.01  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>