More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0497 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0497  putative cation efflux system protein  100 
 
 
299 aa  593  1e-169  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05200  putative cation efflux system protein  96.66 
 
 
299 aa  550  1e-155  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1761  cation diffusion facilitator family transporter  63.27 
 
 
316 aa  341  8e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0169574  normal  0.529338 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5979  cation diffusion facilitator CzcD  63.27 
 
 
316 aa  341  8e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000910181  normal  0.0784096 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0026  CDF family cobalt/cadmium/zinc transporter  56.51 
 
 
301 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000390702 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0040  cation diffusion facilitator family transporter  56.51 
 
 
301 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000142458 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2584  cation diffusion facilitator family transporter  55.86 
 
 
312 aa  321  9.999999999999999e-87  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0043  cation diffusion facilitator family transporter  56.51 
 
 
301 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.381731  normal  0.307096 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0040  cation diffusion facilitator family transporter  56.51 
 
 
301 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3473  cation diffusion facilitator family transporter  63.61 
 
 
319 aa  305  7e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1912  cation diffusion facilitator family transporter  54.79 
 
 
300 aa  301  1e-80  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.114222  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1983  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  54.79 
 
 
300 aa  301  1e-80  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.644974  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1196  cation diffusion facilitator family transporter  53.24 
 
 
326 aa  298  9e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.114985 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01708  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  54.12 
 
 
304 aa  292  4e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.193736  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0498  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  56.61 
 
 
297 aa  290  1e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0501  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  56.61 
 
 
297 aa  290  3e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0340413  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2218  cation diffusion facilitator family transporter  53.9 
 
 
297 aa  288  9e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0353679 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1074  cation diffusion facilitator family transporter  50.71 
 
 
305 aa  276  2e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.106022  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4086  cation diffusion facilitator family transporter  51.21 
 
 
313 aa  271  7e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.07629  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7268  cation efflux system protein czcD  51.32 
 
 
305 aa  268  5.9999999999999995e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.571769  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3642  cation diffusion facilitator family transporter  46.78 
 
 
299 aa  242  5e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5042  normal  0.259615 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0215  cation diffusion facilitator family transporter  51.74 
 
 
299 aa  241  1e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2131  cation diffusion facilitator family transporter  44.56 
 
 
305 aa  238  8e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.127518  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2286  cation diffusion facilitator family transporter  44.56 
 
 
305 aa  238  8e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.76035  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3389  cation diffusion facilitator family transporter  42.18 
 
 
305 aa  237  2e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.400984 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25900  cation diffusion facilitator family transporter  43 
 
 
304 aa  235  5.0000000000000005e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1832  cation efflux family protein  41.46 
 
 
299 aa  233  3e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2211  cation diffusion facilitator family transporter  43.28 
 
 
302 aa  233  3e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.284177 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6782  cation diffusion facilitator family transporter  42.4 
 
 
305 aa  232  5e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337377  normal  0.84699 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1771  cation efflux family protein  40.74 
 
 
299 aa  232  6e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3571  cation efflux family protein  41.11 
 
 
299 aa  226  2e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0171  cation diffusion facilitator family transporter  43.52 
 
 
307 aa  226  3e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4034  cation diffusion facilitator family transporter  39.79 
 
 
326 aa  226  3e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0471983  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0184  cation diffusion facilitator family transporter  44.9 
 
 
304 aa  225  6e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.421209  hitchhiker  0.000751962 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1630  cation diffusion facilitator family transporter  40.77 
 
 
299 aa  225  7e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1889  cation efflux family protein  41.46 
 
 
299 aa  223  3e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0368031  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3496  cation diffusion facilitator family transporter  45.86 
 
 
300 aa  223  3e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.844675 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1581  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  41.46 
 
 
299 aa  219  3e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1629  cation efflux family protein  41.46 
 
 
299 aa  219  5e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1607  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  41.11 
 
 
299 aa  219  5e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0977421  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1756  cation efflux family protein  41.46 
 
 
299 aa  219  5e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0464766  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3631  cation diffusion facilitator family transporter  43.67 
 
 
305 aa  219  6e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.492249  decreased coverage  0.00000526062 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0545  cation diffusion facilitator family transporter  39.51 
 
 
315 aa  219  6e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3071  cation efflux protein  40.28 
 
 
334 aa  218  7e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000325451  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1806  cation efflux family protein  41.61 
 
 
295 aa  218  7e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0595  cation efflux protein  40.5 
 
 
298 aa  218  1e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1136  cation diffusion facilitator family transporter  39.51 
 
 
342 aa  218  1e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0487  cation efflux family protein  41.67 
 
 
331 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0525  cation diffusion facilitator family transporter  45.56 
 
 
306 aa  216  5e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30010  cation diffusion facilitator family transporter  45.88 
 
 
307 aa  215  8e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000713084  normal  0.287518 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4903  cation diffusion facilitator family transporter  44.22 
 
 
308 aa  215  9e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0909  cation diffusion facilitator family transporter  42.75 
 
 
327 aa  214  9.999999999999999e-55  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0096451  hitchhiker  0.0000000000204317 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1191  cation diffusion facilitator family transporter  42.29 
 
 
309 aa  212  4.9999999999999996e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0389  cation diffusion facilitator family transporter  40.73 
 
 
308 aa  211  7.999999999999999e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0395  cation diffusion facilitator family transporter  43.53 
 
 
327 aa  211  1e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.309924  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4570  cation diffusion facilitator family transporter  43.01 
 
 
340 aa  211  2e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1802  cation diffusion facilitator family transporter  38.73 
 
 
298 aa  209  4e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2216  cation diffusion facilitator family transporter  43.62 
 
 
305 aa  209  4e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2626  cation diffusion facilitator family transporter  39.48 
 
 
313 aa  209  7e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.208162  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4582  cation diffusion facilitator family transporter  40.07 
 
 
311 aa  207  1e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1243  zinc transporter ZitB  42.18 
 
 
312 aa  206  3e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00653762  normal  0.610782 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0594  cation diffusion facilitator family transporter  41.84 
 
 
314 aa  206  3e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.987975  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1148  cation diffusion facilitator family transporter  39.86 
 
 
340 aa  206  4e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.280865  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4544  cation diffusion facilitator family transporter  44.52 
 
 
356 aa  203  3e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.586592 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0610  cation diffusion facilitator family transporter  42.86 
 
 
306 aa  202  4e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00049806 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1370  cation diffusion facilitator family transporter  37.88 
 
 
333 aa  202  5e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1830  cation diffusion facilitator family transporter  38.98 
 
 
320 aa  201  9e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.13063 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2300  cation efflux protein  44.65 
 
 
300 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6162  cation diffusion facilitator family transporter  43.21 
 
 
309 aa  201  9.999999999999999e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3763  cation efflux family protein  39.72 
 
 
315 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2198  cation diffusion facilitator family transporter  39.02 
 
 
307 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0712  cation diffusion facilitator family transporter  40.28 
 
 
301 aa  200  3e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0328  cation diffusion facilitator family transporter  39.72 
 
 
298 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1405  zinc transporter ZitB  39.79 
 
 
312 aa  199  5e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2863  zinc transporter ZitB  39.79 
 
 
312 aa  199  5e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00819873  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2951  zinc transporter ZitB  40.35 
 
 
312 aa  199  6e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.278393  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3783  cation diffusion facilitator family transporter  40 
 
 
341 aa  198  7.999999999999999e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4059  cation diffusion facilitator family transporter  43.06 
 
 
305 aa  198  7.999999999999999e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.552828  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0673  cation diffusion facilitator family transporter  42.47 
 
 
299 aa  198  7.999999999999999e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.822863  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2008  cation diffusion facilitator family transporter  35.76 
 
 
398 aa  197  2.0000000000000003e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0398491 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1284  zinc transporter ZitB  42.03 
 
 
316 aa  196  5.000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000026139  hitchhiker  0.00172679 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4666  CDF family cation efflux system protein  42.34 
 
 
320 aa  195  7e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0868  cation diffusion facilitator family transporter  39.5 
 
 
309 aa  195  8.000000000000001e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13910  cation diffusion facilitator family transporter  40.4 
 
 
303 aa  194  1e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3011  cation diffusion facilitator family transporter  38.18 
 
 
347 aa  194  1e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1452  zinc transporter ZitB  39.25 
 
 
378 aa  194  2e-48  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00926601  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0999  cation diffusion facilitator family transporter  38.81 
 
 
316 aa  193  4e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3080  zinc transporter ZitB  40.41 
 
 
310 aa  193  4e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.448896  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0425  cation diffusion facilitator family transporter  42.71 
 
 
308 aa  192  5e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2839  cation diffusion facilitator family transporter  37.37 
 
 
306 aa  192  6e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00226166 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1900  cation efflux family protein  39.57 
 
 
314 aa  191  9e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.137192  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0039  cation efflux protein  35.1 
 
 
312 aa  191  9e-48  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.747433  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0452  cation diffusion facilitator family transporter  41.38 
 
 
309 aa  190  2e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0402588  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3226  cation diffusion facilitator family transporter  38.65 
 
 
352 aa  190  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3688  cation diffusion facilitator family transporter  37.89 
 
 
335 aa  189  4e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0974105  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2420  cation diffusion facilitator family transporter  39.33 
 
 
333 aa  189  5.999999999999999e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.870744  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2050  cation diffusion facilitator family transporter  39.33 
 
 
333 aa  189  5.999999999999999e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.347484  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1430  cation diffusion facilitator family transporter  40.22 
 
 
322 aa  188  7e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1147  cation diffusion facilitator family transporter  40.22 
 
 
322 aa  188  7e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3672  cation diffusion facilitator family transporter  39.85 
 
 
329 aa  187  1e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.170561 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>