60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0152 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0152  hypothetical protein  100 
 
 
508 aa  1005    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00345793  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00980  hypothetical protein  90.24 
 
 
319 aa  429  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0278124  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00970  hypothetical protein  95 
 
 
180 aa  347  3e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00615809  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2320  FHA domain-containing protein  78.97 
 
 
480 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00351705  hitchhiker  0.00389608 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2377  FHA domain-containing protein  27.36 
 
 
458 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3127  FHA domain-containing protein  31.66 
 
 
409 aa  160  6e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00194716  normal  0.0847804 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0544  FHA domain containing protein  43.59 
 
 
554 aa  154  5e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2449  FHA domain-containing protein  41.59 
 
 
411 aa  141  1.9999999999999998e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.01697  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0208  FHA domain containing protein  39.29 
 
 
645 aa  135  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3841  FHA domain-containing protein  38.28 
 
 
681 aa  134  3.9999999999999996e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00388095  normal  0.114033 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1468  FHA domain-containing protein  38.42 
 
 
777 aa  130  6e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.637253  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4064  FHA domain-containing protein  36.76 
 
 
580 aa  124  6e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000372597 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2456  FHA domain containing protein  34.44 
 
 
604 aa  123  7e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.204622  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26770  hypothetical protein  34.6 
 
 
565 aa  121  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00253  FHA domain protein  38.75 
 
 
470 aa  117  3.9999999999999997e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3483  hypothetical protein  33.23 
 
 
409 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.181491  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1588  FHA domain-containing protein  34.18 
 
 
478 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.786308  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0442  FHA domain-containing protein  34.18 
 
 
478 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1773  FHA domain-containing protein  34.18 
 
 
478 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.701606  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0393  FHA domain-containing protein  34.18 
 
 
478 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.280068  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2846  FHA domain-containing protein  33.67 
 
 
478 aa  110  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.353955  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2971  FHA domain-containing protein  33.67 
 
 
477 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1210  FHA domain-containing protein  33.67 
 
 
478 aa  110  9.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0249  FHA domain-containing protein  32.38 
 
 
460 aa  108  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000012  uncharacterized protein ImpI/VasC  26.29 
 
 
397 aa  107  7e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0100  FHA domain-containing protein  33.2 
 
 
398 aa  105  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1597  FHA domain-containing protein  32.37 
 
 
485 aa  103  9e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.177216  normal  0.583797 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2092  FHA domain-containing protein  33.76 
 
 
463 aa  102  1e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3006  FHA domain-containing protein  35.05 
 
 
572 aa  102  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42950  hypothetical protein  33.18 
 
 
397 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.171842 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5422  FHA domain protein  37.33 
 
 
398 aa  93.6  8e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5581  FHA domain-containing protein  36.67 
 
 
397 aa  91.7  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.756831  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3607  hypothetical protein  34.84 
 
 
400 aa  87  8e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2355  FHA domain containing protein  27.69 
 
 
453 aa  82.8  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.177803 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2883  FHA domain containing protein  38.68 
 
 
541 aa  79.3  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0993678 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05854  hypothetical protein  22.09 
 
 
504 aa  75.5  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2335  FHA domain-containing protein  36.46 
 
 
108 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0026  hypothetical protein  21.25 
 
 
495 aa  71.6  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.498715  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3045  FHA domain containing protein  37.74 
 
 
433 aa  70.5  0.00000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.415293  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3250  putative FHA domain containing protein  25.97 
 
 
406 aa  70.1  0.00000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2802  FHA domain containing protein  25.24 
 
 
409 aa  69.7  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.824503  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1117  putative type VI secretion protein VasC  25.88 
 
 
453 aa  68.9  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000432  uncharacterized protein ImpI/VasC  22.11 
 
 
497 aa  69.3  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3728  FHA domain-containing protein  28.82 
 
 
436 aa  66.6  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1201  FHA domain-containing protein  19.16 
 
 
503 aa  65.9  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0233  hypothetical protein  20.04 
 
 
426 aa  63.9  0.000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6044  forkhead-type phosphopeptide-binding protein  32.02 
 
 
419 aa  63.2  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0318  FHA domain-containing protein  23.64 
 
 
438 aa  62.8  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0391  FHA domain-containing protein  23.64 
 
 
438 aa  62.8  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0235  hypothetical protein  20.04 
 
 
426 aa  62  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0241  hypothetical protein  23.2 
 
 
426 aa  61.2  0.00000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1225  hypothetical protein  23.2 
 
 
428 aa  60.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.980382  normal  0.728798 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1106  hypothetical protein  23.2 
 
 
428 aa  60.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1075  FHA domain containing protein  25.41 
 
 
406 aa  60.1  0.00000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.555961  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2524  FHA domain-containing protein  22.7 
 
 
424 aa  59.3  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.587196  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3386  FHA domain-containing protein  36.96 
 
 
230 aa  49.3  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0029589  normal  0.0414259 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  30.83 
 
 
1888 aa  48.9  0.0002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3935  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  39.29 
 
 
899 aa  45.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.410503  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0459  serine/threonine protein kinase  53.23 
 
 
519 aa  44.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.14812  normal  0.0434619 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0446  serine/threonine protein kinase  53.23 
 
 
519 aa  44.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>