34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2524 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_2524  FHA domain-containing protein  100 
 
 
424 aa  877    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.587196  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0026  hypothetical protein  41.29 
 
 
495 aa  353  4e-96  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.498715  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1201  FHA domain-containing protein  39.71 
 
 
503 aa  322  9.999999999999999e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3728  FHA domain-containing protein  37.44 
 
 
436 aa  260  3e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2802  FHA domain containing protein  39.06 
 
 
409 aa  251  1e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.824503  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3250  putative FHA domain containing protein  35.36 
 
 
406 aa  233  3e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0318  FHA domain-containing protein  36.03 
 
 
438 aa  227  2e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0391  FHA domain-containing protein  36.03 
 
 
438 aa  227  3e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1075  FHA domain containing protein  35.78 
 
 
406 aa  223  6e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.555961  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1225  hypothetical protein  31.82 
 
 
428 aa  192  8e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.980382  normal  0.728798 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1106  hypothetical protein  31.82 
 
 
428 aa  192  8e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0241  hypothetical protein  47.26 
 
 
426 aa  187  4e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0235  hypothetical protein  47.26 
 
 
426 aa  187  4e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0233  hypothetical protein  47.26 
 
 
426 aa  187  4e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000012  uncharacterized protein ImpI/VasC  21.79 
 
 
397 aa  69.3  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3229  FHA domain-containing protein  28.57 
 
 
189 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00253  FHA domain protein  32.56 
 
 
470 aa  65.5  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0050  FHA domain-containing protein  30.2 
 
 
236 aa  64.7  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.824119  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2377  FHA domain-containing protein  20.87 
 
 
458 aa  61.2  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42950  hypothetical protein  22.75 
 
 
397 aa  60.8  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.171842 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0152  hypothetical protein  21.08 
 
 
508 aa  60.5  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00345793  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5422  FHA domain protein  22.2 
 
 
398 aa  60.1  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00970  hypothetical protein  22.22 
 
 
180 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00615809  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2122  FHA domain-containing protein  30.93 
 
 
189 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.47433  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2619  FHA domain-containing protein  30.93 
 
 
189 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.396897 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2320  FHA domain-containing protein  22.28 
 
 
480 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00351705  hitchhiker  0.00389608 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3607  hypothetical protein  27.06 
 
 
400 aa  49.7  0.00009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0544  FHA domain containing protein  24.42 
 
 
554 aa  49.7  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5581  FHA domain-containing protein  25.93 
 
 
397 aa  47  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.756831  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4064  FHA domain-containing protein  22.29 
 
 
580 aa  46.6  0.0008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000372597 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0208  FHA domain containing protein  25 
 
 
645 aa  45.8  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2883  FHA domain containing protein  31.91 
 
 
541 aa  45.8  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0993678 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2092  FHA domain-containing protein  22.36 
 
 
463 aa  44.3  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2456  FHA domain containing protein  24.41 
 
 
604 aa  43.1  0.009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.204622  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>