25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3229 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_3229  FHA domain-containing protein  100 
 
 		 189 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2619  FHA domain-containing protein  72.49 
 
 		 189 aa  266  2e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.396897 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2122  FHA domain-containing protein  72.49 
 
 		 189 aa  265  2e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.47433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1201  FHA domain-containing protein  38.26 
 
 		 503 aa  87  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0026  hypothetical protein  31.58 
 
 		 495 aa  84.7  7e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.498715  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2802  FHA domain containing protein  35.12 
 
 		 409 aa  83.6  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.824503  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3728  FHA domain-containing protein  29.41 
 
 		 436 aa  77  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3250  putative FHA domain containing protein  35.34 
 
 		 406 aa  70.9  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1075  FHA domain containing protein  30.54 
 
 		 406 aa  68.9  0.00000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.555961  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2524  FHA domain-containing protein  28.57 
 
 		 424 aa  68.9  0.00000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.587196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0050  FHA domain-containing protein  32.09 
 
 		 236 aa  60.8  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.824119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2883  FHA domain containing protein  35.51 
 
 		 541 aa  54.7  0.0000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0993678 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1106  hypothetical protein  26.11 
 
 		 428 aa  50.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1225  hypothetical protein  26.11 
 
 		 428 aa  50.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.980382  normal  0.728798 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0391  FHA domain-containing protein  23.2 
 
 		 438 aa  49.7  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0318  FHA domain-containing protein  23.2 
 
 		 438 aa  49.7  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0241  hypothetical protein  24.08 
 
 		 426 aa  47.8  0.00009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0233  hypothetical protein  24.23 
 
 		 426 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0235  hypothetical protein  24.23 
 
 		 426 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0100  FHA domain-containing protein  23.85 
 
 		 398 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2092  FHA domain-containing protein  26.85 
 
 		 463 aa  43.9  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1117  putative type VI secretion protein VasC  26.77 
 
 		 453 aa  43.5  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3045  FHA domain containing protein  30.88 
 
 		 433 aa  42.7  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.415293  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0544  FHA domain containing protein  32.53 
 
 		 554 aa  42.4  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2355  FHA domain containing protein  29.41 
 
 		 453 aa  41.6  0.007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.177803 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>