More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_1799 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007577  PMT9312_1799  30S ribosomal protein S6  100 
 
 		 152 aa  313  6e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19161  30S ribosomal protein S6  87.25 
 
 		 174 aa  276  5e-74  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18971  30S ribosomal protein S6  85.23 
 
 		 153 aa  269  9e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.637198  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18971  30S ribosomal protein S6  80 
 
 		 155 aa  228  2e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18431  30S ribosomal protein S6  61.22 
 
 		 172 aa  179  1e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.800944 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1316  30S ribosomal protein S6  58.33 
 
 		 138 aa  172  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21891  30S ribosomal protein S6  63.49 
 
 		 138 aa  168  3e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2306  30S ribosomal protein S6  63.11 
 
 		 126 aa  167  7e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2677  30S ribosomal protein S6  72.12 
 
 		 124 aa  166  1e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30071  30S ribosomal protein S6  67.31 
 
 		 124 aa  160  5.0000000000000005e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.319395 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0012  30S ribosomal protein S6  57.14 
 
 		 107 aa  119  9.999999999999999e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.142702  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3887  30S ribosomal protein S6  55.67 
 
 		 117 aa  110  5e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.311083  normal  0.0162728 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2072  30S ribosomal protein S6  56.04 
 
 		 108 aa  109  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.994303  hitchhiker  0.00328308 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4893  30S ribosomal protein S6  52.17 
 
 		 108 aa  104  4e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1682  ribosomal protein S6  49.46 
 
 		 106 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0713  30S ribosomal protein S6  48.35 
 
 		 124 aa  100  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0742  30S ribosomal protein S6  47.25 
 
 		 124 aa  99  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.035409  normal  0.774483 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4806  ribosomal protein S6  41.46 
 
 		 176 aa  97.4  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4936  30S ribosomal protein S6  35.16 
 
 		 95 aa  77.4  0.00000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000645168  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3308  30S ribosomal protein S6  35.56 
 
 		 95 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000490454  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2930  ribosomal protein S6  42.7 
 
 		 95 aa  75.1  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.448494  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2138  ribosomal protein S6  36.26 
 
 		 95 aa  73.9  0.0000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000043387  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4504  ribosomal protein S6  37.89 
 
 		 210 aa  73.2  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0128  30S ribosomal protein S6  34.07 
 
 		 98 aa  73.2  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000443622  normal  0.826671 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3417  30S ribosomal protein S6  38.46 
 
 		 95 aa  72.8  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000905863  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2916  ribosomal protein S6  34.07 
 
 		 96 aa  72  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000156289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4537  30S ribosomal protein S6  33.7 
 
 		 147 aa  71.2  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.287316  normal  0.325201 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0007  30S ribosomal protein S6  39.36 
 
 		 98 aa  71.2  0.000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000132561  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3546  30S ribosomal protein S6  37.36 
 
 		 95 aa  71.2  0.000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2394  30S ribosomal protein S6  39.33 
 
 		 95 aa  70.5  0.000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000046004  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0010  30S ribosomal protein S6  37.5 
 
 		 168 aa  69.7  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.490507  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5625  30S ribosomal protein S6  35.16 
 
 		 96 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000119733  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5584  30S ribosomal protein S6  35.16 
 
 		 96 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.72731e-16 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5334  30S ribosomal protein S6  35.16 
 
 		 96 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000242081  hitchhiker  0.000000688979 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5327  30S ribosomal protein S6  35.16 
 
 		 96 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000278233  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5155  30S ribosomal protein S6  35.16 
 
 		 96 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000255569  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5171  30S ribosomal protein S6  35.16 
 
 		 96 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000742686  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0127  30S ribosomal protein S6  35.87 
 
 		 96 aa  70.1  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0286248 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5723  30S ribosomal protein S6  35.16 
 
 		 96 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000611758  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5662  30S ribosomal protein S6  35.16 
 
 		 96 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5601  30S ribosomal protein S6  35.16 
 
 		 96 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00075847  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2216  ribosomal protein S6  35.16 
 
 		 94 aa  69.3  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5267  30S ribosomal protein S6  35.16 
 
 		 96 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000406973  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3188  ribosomal protein S6  36.67 
 
 		 147 aa  68.9  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.514903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4014  30S ribosomal protein S6  34.07 
 
 		 95 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.208118  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0600  ribosomal protein S6  32.99 
 
 		 144 aa  68.2  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1131  30S ribosomal protein S6  35.87 
 
 		 128 aa  68.2  0.00000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.999974  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0413  30S ribosomal protein S6  34.78 
 
 		 98 aa  67.8  0.00000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000259691  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0424  30S ribosomal protein S6  34.78 
 
 		 98 aa  67.8  0.00000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000892295  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0241  30S ribosomal protein S6  32.61 
 
 		 145 aa  67  0.00000000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1900  30S ribosomal protein S6  34.69 
 
 		 122 aa  67  0.00000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4637  30S ribosomal protein S6  31.91 
 
 		 134 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.329942  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1585  30S ribosomal protein S6  32.61 
 
 		 142 aa  65.9  0.0000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2097  ribosomal protein S6  37.36 
 
 		 96 aa  66.2  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000774697  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0951  30S ribosomal protein S6  33.7 
 
 		 124 aa  65.9  0.0000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.77513  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2540  ribosomal protein S6  32.61 
 
 		 97 aa  65.9  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000126793  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0595  30S ribosomal protein S6  35.16 
 
 		 117 aa  65.1  0.0000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1998  30S ribosomal protein S6  32.61 
 
 		 139 aa  65.1  0.0000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0494  30S ribosomal protein S6  34.41 
 
 		 136 aa  65.1  0.0000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0653  30S ribosomal protein S6  33.7 
 
 		 125 aa  64.7  0.0000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1481  ribosomal protein S6  36.84 
 
 		 93 aa  64.7  0.0000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2607  30S ribosomal protein S6  36.36 
 
 		 122 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00172521  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1088  30S ribosomal protein S6  33.7 
 
 		 125 aa  64.7  0.0000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0863  ribosomal protein S6  31.3 
 
 		 132 aa  64.3  0.0000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1970  ribosomal protein S6  34.41 
 
 		 98 aa  64.3  0.0000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00222496  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0044  30S ribosomal protein S6  33.7 
 
 		 98 aa  63.5  0.0000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4355  30S ribosomal protein S6  31.87 
 
 		 95 aa  63.9  0.0000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0007  30S ribosomal protein S6  38.89 
 
 		 98 aa  63.5  0.0000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000068559  hitchhiker  0.0000000000002413 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03778  30S ribosomal protein S6  25.76 
 
 		 133 aa  63.2  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0414  30S ribosomal protein S6  34.41 
 
 		 160 aa  63.2  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2590  30S ribosomal protein S6  30.77 
 
 		 134 aa  62.8  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0306533 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0758  30S ribosomal protein S6  33.98 
 
 		 129 aa  63.2  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000104725  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0315  30S ribosomal protein S6  32.97 
 
 		 128 aa  62.4  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000108359  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5421  30S ribosomal protein S6  35.16 
 
 		 154 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0549173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3942  30S ribosomal protein S6  34.07 
 
 		 151 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.262713 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4310  30S ribosomal protein S6  34.07 
 
 		 151 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0751589 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4417  30S ribosomal protein S6  34.07 
 
 		 151 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.316855 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2503  30S ribosomal protein S6  34.04 
 
 		 97 aa  62.4  0.000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000597267  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1728  30S ribosomal protein S6  34.41 
 
 		 96 aa  62.4  0.000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00000419207  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1213  30S ribosomal protein S6  32.61 
 
 		 125 aa  62  0.000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.58007  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1216  30S ribosomal protein S6  31.07 
 
 		 127 aa  62  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.402535 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4740  ribosomal protein S6  31.87 
 
 		 93 aa  62  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1212  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 117 aa  61.6  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.134172  normal  0.709191 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2764  30S ribosomal protein S6  33 
 
 		 134 aa  61.6  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2186  30S ribosomal protein S6  31.96 
 
 		 117 aa  61.6  0.000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1689  ribosomal protein S6  31 
 
 		 104 aa  61.6  0.000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1772  30S ribosomal protein S6  31.31 
 
 		 135 aa  60.8  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.468472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0139  30S ribosomal protein S6  31.31 
 
 		 132 aa  60.8  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39390  SSU ribosomal protein S6P  30.85 
 
 		 111 aa  60.8  0.000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.549892 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3361  ribosomal protein S6  30.11 
 
 		 155 aa  60.8  0.000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0741  30S ribosomal protein S6  31.31 
 
 		 145 aa  60.8  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.429444  normal  0.125363 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3774  ribosomal protein S6  35.48 
 
 		 95 aa  60.8  0.000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000336802  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2978  30S ribosomal protein S6  31.87 
 
 		 95 aa  60.8  0.000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000894429  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2656  30S ribosomal protein S6  31.87 
 
 		 95 aa  60.8  0.000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000485291  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2462  SSU ribosomal protein S6P  29.79 
 
 		 144 aa  60.8  0.000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.309208 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2133  SSU ribosomal protein S6P  31.18 
 
 		 96 aa  60.8  0.000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1476  30S ribosomal protein S6  33 
 
 		 134 aa  60.5  0.000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0100588 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0333  30S ribosomal protein S6  32.97 
 
 		 128 aa  60.5  0.000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000995265  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23360  ribosomal protein S6  27.47 
 
 		 95 aa  60.5  0.000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.28748e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5068  30S ribosomal protein S6  32.61 
 
 		 96 aa  60.5  0.000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000139658 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>