80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0298 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007577  PMT9312_0298  Ycf48-like protein  100 
 
 		 338 aa  686    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03191  Ycf48-like protein  95.27 
 
 		 338 aa  659    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03201  Ycf48-like protein  95.56 
 
 		 338 aa  658    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03291  Ycf48-like protein  78.64 
 
 		 337 aa  559  1e-158  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.307197  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03761  Ycf48-like protein  62.8 
 
 		 338 aa  452  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.156925 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1662  Ycf48-like protein  62.2 
 
 		 338 aa  450  1e-125  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.243445  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03221  Ycf48-like protein  62.61 
 
 		 339 aa  441  1e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0201  Ycf48-like protein  54.76 
 
 		 333 aa  389  1e-107  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.345386  normal  0.296046 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25281  Ycf48-like protein  58.23 
 
 		 335 aa  384  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0228  Ycf48-like protein  56.85 
 
 		 333 aa  361  1e-98  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3503  Ycf48-like protein  38.53 
 
 		 337 aa  262  4.999999999999999e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.422454 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1856  Ycf48-like protein  40.85 
 
 		 339 aa  259  3e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1178  Ycf48-like protein  41.27 
 
 		 349 aa  254  1.0000000000000001e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2227  Ycf48-like protein  39.63 
 
 		 333 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0537914  normal  0.190318 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4148  Ycf48-like protein  40.98 
 
 		 336 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4188  Ycf48-like protein  40.98 
 
 		 336 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0816  Ycf48-like protein  37.76 
 
 		 334 aa  248  9e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.300039 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1238  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  38.17 
 
 		 340 aa  245  9e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_47343  predicted protein  34.64 
 
 		 363 aa  194  2e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0770421  hitchhiker  0.000226051 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47413  predicted protein  32.44 
 
 		 408 aa  181  2e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2022  hypothetical protein  23.69 
 
 		 897 aa  73.9  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1578  hypothetical protein  33.61 
 
 		 341 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0613836  normal  0.221478 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6391  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  29.77 
 
 		 323 aa  63.2  0.000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2018  BNR domain-containing protein  32.79 
 
 		 319 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.108216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2258  hypothetical protein  24 
 
 		 329 aa  61.6  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.750001  hitchhiker  0.0000258604 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1364  BNR/Asp-box repeat-containing protein  26.7 
 
 		 359 aa  61.6  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.27216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3724  hypothetical protein  32.79 
 
 		 346 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4345  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  32.62 
 
 		 325 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.60812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4866  hypothetical protein  31.15 
 
 		 329 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1550  hypothetical protein  31.97 
 
 		 342 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.716101 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4436  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.61 
 
 		 323 aa  60.1  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.501856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4326  glycosyl hydrolase, BNR repeat  27.61 
 
 		 323 aa  60.1  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.237541  normal  0.0660823 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2936  hypothetical protein  33.05 
 
 		 363 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.608835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2059  hypothetical protein  29.66 
 
 		 361 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0816093  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3230  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  33.05 
 
 		 342 aa  57  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.448997  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3319  Uncharacterized photosystem II stability/assembly factor-like protein  29.84 
 
 		 1120 aa  56.2  0.0000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1700  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  32.2 
 
 		 369 aa  56.2  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.601286  normal  0.606865 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6841  hypothetical protein  26.26 
 
 		 321 aa  55.8  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.109659  normal  0.118835 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3778  BNR/Asp-box repeat protein  31.36 
 
 		 340 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24310  BNR/Asp-box repeat-containing protein  29.66 
 
 		 365 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3201  BNR domain-containing protein  26.05 
 
 		 353 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.305002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2271  hypothetical protein  25.93 
 
 		 313 aa  52.4  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.160712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0132  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.42 
 
 		 359 aa  52.4  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.77317 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0944  hypothetical protein  33.33 
 
 		 336 aa  52  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2813  BNR domain-containing protein  26.56 
 
 		 320 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0172684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4357  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.7 
 
 		 322 aa  50.4  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1590  BNR repeat-containing protein  28.46 
 
 		 336 aa  50.8  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0623  hypothetical protein  25.77 
 
 		 614 aa  50.1  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000504443  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2138  BNR repeat-containing protein  23.1 
 
 		 342 aa  50.1  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.154438 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2810  glycosyl hydrolase  25.09 
 
 		 331 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.119183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2000  BNR repeat-containing protein  28.36 
 
 		 332 aa  49.7  0.00006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.177626  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3165  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.24 
 
 		 299 aa  49.7  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.401684  normal  0.916816 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2164  glycosyl hydrolase  29.41 
 
 		 368 aa  49.7  0.00007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0722696 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2970  hypothetical protein  26.73 
 
 		 343 aa  49.3  0.00009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2748  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  32.33 
 
 		 314 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000496778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5038  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.14 
 
 		 322 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5822  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.14 
 
 		 322 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2804  BNR repeat-containing protein  20.69 
 
 		 344 aa  49.3  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.354775  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6780  glycosyl hydrolase  32.5 
 
 		 324 aa  48.9  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2245  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  24.19 
 
 		 352 aa  48.9  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000222416  hitchhiker  0.00000000000000277962 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2128  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.53 
 
 		 334 aa  48.1  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.437316  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2468  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  21.78 
 
 		 371 aa  48.1  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.000564935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1940  BNR repeat-containing protein  23.21 
 
 		 338 aa  47.8  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.242255  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2197  BNR repeat-containing protein  22.78 
 
 		 337 aa  47.8  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.284418  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2065  uncharacterized protein related to photosystem II stability/assembly factor  33.77 
 
 		 382 aa  47.4  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0887  hypothetical protein  23.84 
 
 		 350 aa  47  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0720354  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2595  BNR repeat-containing protein  22.22 
 
 		 336 aa  47  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0966  hypothetical protein  26.61 
 
 		 363 aa  47  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.254365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4692  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  24.18 
 
 		 324 aa  47  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.665458  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3779  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  24.86 
 
 		 321 aa  46.6  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00208447  decreased coverage  0.000226347 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0399  photosystem II stability/assembly factor-like protein  23.4 
 
 		 335 aa  45.8  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1727  BNR repeat-containing protein  38.36 
 
 		 335 aa  45.1  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3425  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  22.42 
 
 		 352 aa  44.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000735114  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1678  BNR repeat-containing protein  21.86 
 
 		 336 aa  45.1  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0439463  normal  0.180589 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2003  glycosyl hydrolase, BNR protein  24.25 
 
 		 661 aa  43.9  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.075614  normal  0.402986 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6866  glycosyl hydrolase  22.11 
 
 		 354 aa  43.9  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0347916  normal  0.0962421 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2478  BNR repeat-containing protein  23.98 
 
 		 341 aa  43.9  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0183941  normal  0.0107385 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1349  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.6 
 
 		 366 aa  43.5  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  5.86783e-22  decreased coverage  0.0000013848 
 
 
 
NC_008577  Shewana3_1783  BNR repeat-containing protein  21.15 
 
 		 336 aa  43.1  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0329524  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1753  BNR repeat-containing protein  29.03 
 
 		 336 aa  42.4  0.01  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0888292  normal  0.639516 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>