More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1817 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1817  exodeoxyribonuclease III  100 
 
 		 275 aa  560  1e-158  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.170882  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05411  exodeoxyribonuclease III  98.55 
 
 		 275 aa  551  1e-156  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.186769 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06981  exodeoxyribonuclease III  58.03 
 
 		 279 aa  332  3e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1699  exodeoxyribonuclease III xth  56.13 
 
 		 282 aa  324  9e-88  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0398069  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0661  exodeoxyribonuclease III  52.73 
 
 		 288 aa  318  7.999999999999999e-86  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.984285  normal  0.57398 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04851  exodeoxyribonuclease III  55.23 
 
 		 277 aa  317  1e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.416527  normal  0.309597 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05111  exodeoxyribonuclease III  54.01 
 
 		 281 aa  296  2e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05401  exodeoxyribonuclease III  53.65 
 
 		 281 aa  295  6e-79  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.889276  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05481  exodeoxyribonuclease III  53.82 
 
 		 281 aa  291  6e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0485  exodeoxyribonuclease III  53.99 
 
 		 281 aa  290  2e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.229415  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2607  exodeoxyribonuclease III  52.09 
 
 		 265 aa  284  1.0000000000000001e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0881671 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3564  exodeoxyribonuclease III  50.96 
 
 		 261 aa  265  5e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0988  exodeoxyribonuclease III  49.81 
 
 		 262 aa  263  3e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1017  exodeoxyribonuclease III  49.81 
 
 		 262 aa  263  3e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.869599 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2559  exodeoxyribonuclease III  49.62 
 
 		 260 aa  261  6e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4594  exodeoxyribonuclease III Xth  47.37 
 
 		 268 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.136344  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5112  exodeoxyribonuclease III  48.28 
 
 		 260 aa  253  2.0000000000000002e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.130446  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0172  exodeoxyribonuclease III  44.66 
 
 		 255 aa  242  3.9999999999999997e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000298085 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1637  exodeoxyribonuclease III Xth  44.57 
 
 		 261 aa  240  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0703  hypothetical protein  43.85 
 
 		 256 aa  238  5.999999999999999e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2435  exodeoxyribonuclease III  44.11 
 
 		 255 aa  238  5.999999999999999e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.147349  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0685  hypothetical protein  43.85 
 
 		 256 aa  238  1e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2418  exodeoxyribonuclease III  42.21 
 
 		 277 aa  236  3e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2071  exodeoxyribonuclease III  42.86 
 
 		 256 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.663777 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3648  exodeoxyribonuclease III  42.21 
 
 		 254 aa  232  4.0000000000000004e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2765  exodeoxyribonuclease III  42.64 
 
 		 322 aa  232  5e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1820  exodeoxyribonuclease III  42.16 
 
 		 267 aa  232  5e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.458905  hitchhiker  0.00350077 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1738  exodeoxyribonuclease III  42.64 
 
 		 258 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1520  exodeoxyribonuclease III  42.64 
 
 		 258 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.746689  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2687  exodeoxyribonuclease III  42.64 
 
 		 258 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2631  exodeoxyribonuclease III  42.64 
 
 		 258 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.223347  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2247  exodeoxyribonuclease III  42.64 
 
 		 258 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3071  exodeoxyribonuclease III  42.64 
 
 		 258 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3070  exodeoxyribonuclease III  43.35 
 
 		 256 aa  230  2e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1847  exodeoxyribonuclease III  42.26 
 
 		 258 aa  230  2e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1952  exodeoxyribonuclease III Xth  43.01 
 
 		 269 aa  228  9e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.520652  normal  0.0243221 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1460  exodeoxyribonuclease III Xth  44.66 
 
 		 254 aa  226  2e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.178949  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0007  exodeoxyribonuclease III  43.51 
 
 		 255 aa  226  2e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.454244  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1189  exodeoxyribonuclease III  41.79 
 
 		 265 aa  226  4e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.642421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2776  exodeoxyribonuclease III Xth  42.7 
 
 		 260 aa  226  4e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0418103 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1624  exodeoxyribonuclease III Xth  42.28 
 
 		 269 aa  225  7e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2484  exodeoxyribonuclease III (xth)  38.4 
 
 		 254 aa  224  1e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.616331  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5932  exodeoxyribonuclease III (xth)  41.92 
 
 		 258 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.342329  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2145  exodeoxyribonuclease III Xth  41.92 
 
 		 258 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.447148  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2163  exodeoxyribonuclease III Xth  41.44 
 
 		 258 aa  223  2e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.924471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1126  exodeoxyribonuclease III Xth  41.51 
 
 		 272 aa  223  3e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00222533  normal  0.38819 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5454  exodeoxyribonuclease III  40.68 
 
 		 258 aa  223  4e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2782  exodeoxyribonuclease III  40.98 
 
 		 258 aa  222  4e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.554158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2467  exodeoxyribonuclease III  41.15 
 
 		 257 aa  222  4e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184552 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1246  exodeoxyribonuclease III Xth  40.53 
 
 		 254 aa  221  9.999999999999999e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0137674 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1297  exodeoxyribonuclease III  41.04 
 
 		 275 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.295102  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0007  exodeoxyribonuclease III Xth  43.41 
 
 		 255 aa  221  9.999999999999999e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.669681 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2622  exodeoxyribonuclease III Xth  39.39 
 
 		 254 aa  218  7.999999999999999e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.128111  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1526  exodeoxyribonuclease III  42.21 
 
 		 258 aa  217  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541899  normal  0.12165 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1593  exodeoxyribonuclease III protein  41.76 
 
 		 269 aa  215  8e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.224473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2055  exodeoxyribonuclease III Xth  40 
 
 		 271 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2182  exodeoxyribonuclease III Xth  40 
 
 		 271 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0357  exodeoxyribonuclease III Xth  40.46 
 
 		 257 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.462834  normal  0.596536 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0178  exodeoxyribonuclease III  40.46 
 
 		 257 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0209  exodeoxyribonuclease III xth  42.74 
 
 		 237 aa  211  1e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4997  exodeoxyribonuclease III  38.95 
 
 		 258 aa  210  2e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.541642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2611  exodeoxyribonuclease III Xth  41.44 
 
 		 258 aa  210  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.458401 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2983  exodeoxyribonuclease III  41.6 
 
 		 274 aa  209  5e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.385795  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0913  exodeoxyribonuclease III Xth  38.78 
 
 		 264 aa  209  6e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1194  exodeoxyribonuclease III Xth  40.15 
 
 		 258 aa  208  6e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.118144  normal  0.796496 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1114  exodeoxyribonuclease III Xth  40.15 
 
 		 258 aa  208  7e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1180  exodeoxyribonuclease III  40.61 
 
 		 264 aa  208  8e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.346551  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1037  exodeoxyribonuclease III  38.4 
 
 		 264 aa  207  1e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2283  exodeoxyribonuclease III Xth  36.74 
 
 		 267 aa  207  1e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.703686  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3970  exodeoxyribonuclease III  40.53 
 
 		 258 aa  207  2e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0701  exodeoxyribonuclease III Xth  41.73 
 
 		 288 aa  207  2e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.60209 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03249  exodeoxyribonuclease III  38.72 
 
 		 259 aa  206  3e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4446  exodeoxyribonuclease III Xth  40.52 
 
 		 258 aa  205  5e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.499589 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1478  exodeoxyribonuclease III Xth  38.85 
 
 		 258 aa  206  5e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.391852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1252  exodeoxyribonuclease III Xth  42.55 
 
 		 282 aa  205  6e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0010877  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1447  exodeoxyribonuclease III  39.78 
 
 		 258 aa  203  2e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.529853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1886  putative Exodeoxyribonuclease III  38.11 
 
 		 259 aa  201  9.999999999999999e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0111436  normal  0.144129 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1993  exodeoxyribonuclease III (xth)  37.12 
 
 		 260 aa  196  3e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0563751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4240  exodeoxyribonuclease III Xth  36.64 
 
 		 262 aa  195  6e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.381888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0007  exodeoxyribonuclease III Xth  37.26 
 
 		 257 aa  191  8e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.645227  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0929  exodeoxyribonuclease III Xth  35.07 
 
 		 261 aa  191  1e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3018  exodeoxyribonuclease III Xth  36.12 
 
 		 261 aa  191  1e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176682  normal  0.802869 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1749  exodeoxyribonuclease III  37.02 
 
 		 259 aa  191  1e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3202  exodeoxyribonuclease III Xth  35.74 
 
 		 263 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.840556  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1736  exodeoxyribonuclease III Xth  34.46 
 
 		 265 aa  190  2e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.956019  normal  0.890937 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1755  exodeoxyribonuclease III (xth)  36.12 
 
 		 266 aa  190  2e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4608  exodeoxyribonuclease III Xth  37.55 
 
 		 261 aa  189  5.999999999999999e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110693  hitchhiker  0.0000204361 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2496  exodeoxyribonuclease III  36.5 
 
 		 267 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.0083215  normal  0.338343 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3127  exodeoxyribonuclease III Xth  34.72 
 
 		 262 aa  188  8e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.427624 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2815  exodeoxyribonuclease III  33.97 
 
 		 261 aa  188  9e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0879261  normal  0.730816 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3153  exodeoxyribonuclease III Xth  35.61 
 
 		 264 aa  187  2e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000272901  hitchhiker  0.000542598 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4438  exodeoxyribonuclease III  36.88 
 
 		 263 aa  186  3e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1079  exodeoxyribonuclease III  35.98 
 
 		 262 aa  186  5e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2331  exodeoxyribonuclease III Xth  37.79 
 
 		 265 aa  185  6e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.231658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2804  exodeoxyribonuclease III  35.34 
 
 		 263 aa  185  8e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.96481  normal  0.323562 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3810  exodeoxyribonuclease III Xth  38.29 
 
 		 293 aa  184  1.0000000000000001e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15770  Exodeoxyribonuclease III  36.74 
 
 		 259 aa  184  1.0000000000000001e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.587593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1721  exodeoxyribonuclease III Xth  33.71 
 
 		 265 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.678022  decreased coverage  0.000653482 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2758  exodeoxyribonuclease III  34.98 
 
 		 276 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.139698  normal  0.30939 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0415  exodeoxyribonuclease III  39.69 
 
 		 265 aa  183  2.0000000000000003e-45  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>