81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_28819 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009068  PICST_28819  predicted protein  100 
 
 
505 aa  1025  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00143526 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08768  conserved hypothetical protein  25.59 
 
 
433 aa  184  3e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0863373  normal  0.186532 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_11209  hypothetical protein  26.74 
 
 
440 aa  166  1e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.873381  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07147  MFS tranporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G06830)  29.34 
 
 
474 aa  162  1e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.745622 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31239  predicted protein  25.96 
 
 
507 aa  142  2e-32  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.144771  normal  0.813098 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45095  conserved hypothetical membrane protein  25.89 
 
 
433 aa  128  3e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.562888 
 
 
-
 
NC_006686  CND01310  conserved hypothetical protein  22.77 
 
 
529 aa  121  3e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58946  predicted protein  26.18 
 
 
419 aa  115  1e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.314593 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01506  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G05090)  23.87 
 
 
417 aa  112  2e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.898615 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59269  predicted protein  23.62 
 
 
444 aa  110  5e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.245498  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1163  hypothetical protein  25.51 
 
 
391 aa  102  2e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.38877  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_59900  predicted protein  26.37 
 
 
274 aa  94  6e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.787504  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07240  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G17270)  20.05 
 
 
411 aa  89  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1480  major facilitator transporter  22.88 
 
 
395 aa  87  7e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13440  major facilitator superfamily MFS_1  22.89 
 
 
425 aa  78.2  4e-13  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1293  major facilitator superfamily MFS_1  20.77 
 
 
407 aa  76.6  1e-12  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.180985  normal  0.234354 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1068  major facilitator transporter  21.17 
 
 
395 aa  74.7  4e-12  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.355091 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3989  major facilitator transporter  23.61 
 
 
406 aa  74.7  4e-12  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0137476  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05760  fucose permease  24.39 
 
 
414 aa  71.6  3e-11  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0598938  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0062  major facilitator transporter  23.24 
 
 
406 aa  69.3  1e-10  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.7183  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0067  major facilitator transporter  23.24 
 
 
406 aa  67.4  5e-10  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.37883  hitchhiker  0.00294151 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4287  major facilitator transporter  23.47 
 
 
406 aa  66.6  9e-10  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  5.04378e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2115  major facilitator transporter  23.13 
 
 
386 aa  66.6  1e-09  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0066  major facilitator superfamily MFS_1  23.24 
 
 
406 aa  66.2  1e-09  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.574631  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0962  major facilitator transporter  21.79 
 
 
415 aa  65.9  2e-09  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3689  major facilitator transporter  22.73 
 
 
395 aa  64.3  5e-09  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.890108  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0130  major facilitator transporter  23.8 
 
 
398 aa  62.4  2e-08  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.453953  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0299  fucose permease  21.84 
 
 
408 aa  62  3e-08  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.482849  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00677  transporter, putative  21.55 
 
 
405 aa  61.2  4e-08  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00179637  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0063  major facilitator transporter  21.88 
 
 
406 aa  60.8  5e-08  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0580428  unclonable  3.12687e-05 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0067  major facilitator transporter  21.88 
 
 
406 aa  60.8  6e-08  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.700351  unclonable  8.55622e-11 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2967  major facilitator transporter  22.75 
 
 
392 aa  60.5  7e-08  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0065  major facilitator transporter  21.65 
 
 
406 aa  60.1  9e-08  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.596651  decreased coverage  7.29069e-08 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0534  major facilitator transporter  27.27 
 
 
391 aa  58.9  2e-07  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.479778 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0694  transporter, major facilitator family protein  22.69 
 
 
393 aa  59.3  2e-07  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1174  major facilitator transporter  24.1 
 
 
389 aa  58.9  2e-07  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1304  major facilitator transporter  22.33 
 
 
390 aa  58.2  3e-07  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0419  major facilitator transporter  22.04 
 
 
394 aa  58.2  3e-07  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.664236  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1662  major facilitator superfamily MFS_1  21 
 
 
388 aa  58.2  3e-07  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3819  major facilitator transporter  20.69 
 
 
425 aa  56.2  1e-06  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  5.6973e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0439  major facilitator transporter  22.51 
 
 
394 aa  56.2  1e-06  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.116076  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0309  major facilitator superfamily MFS_1  20.36 
 
 
394 aa  55.5  2e-06  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.265647  normal  0.0116051 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1115  major facilitator superfamily MFS_1  21.63 
 
 
393 aa  54.7  4e-06  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.948444  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0247  sn-glycerol-3-phosphate transporter  22.17 
 
 
450 aa  54.7  4e-06  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0274937  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0005  major facilitator transporter  19.81 
 
 
421 aa  54.3  5e-06  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0753564  normal  0.228788 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3077  major facilitator transporter  17.27 
 
 
456 aa  53.9  7e-06  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.374174  normal  0.0107759 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1438  major facilitator transporter  22.33 
 
 
415 aa  53.5  9e-06  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0068  transporter, putative  23.08 
 
 
391 aa  53.5  1e-05  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2468  sn-glycerol-3-phosphate transporter  22.02 
 
 
452 aa  52.4  2e-05  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0862405 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2419  sn-glycerol-3-phosphate transporter  22.02 
 
 
452 aa  52.4  2e-05  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2627  sn-glycerol-3-phosphate transporter  22.02 
 
 
452 aa  52.4  2e-05  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.588856 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2523  sn-glycerol-3-phosphate transporter  22.02 
 
 
452 aa  52.4  2e-05  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.791252 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0065  major facilitator family transporter  22.44 
 
 
388 aa  52.8  2e-05  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2511  sn-glycerol-3-phosphate transporter  22.02 
 
 
452 aa  52.4  2e-05  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3964  transporter, putative  21.74 
 
 
407 aa  50.8  5e-05  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  5.23123e-10  normal  0.125467 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2392  sn-glycerol-3-phosphate transporter  21.48 
 
 
452 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3505  major facilitator transporter  21.18 
 
 
412 aa  49.7  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3377  sn-glycerol-3-phosphate transporter  21.48 
 
 
452 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0981  hypothetical protein  22.58 
 
 
415 aa  50.1  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1419  glycerol-3-phosphate transporter  21.48 
 
 
452 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.833771  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1411  sn-glycerol-3-phosphate transporter  21.48 
 
 
452 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.476503 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2537  sn-glycerol-3-phosphate transporter  21.48 
 
 
452 aa  49.3  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02166  sn-glycerol-3-phosphate transporter  21.48 
 
 
452 aa  49.3  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2622  sn-glycerol-3-phosphate transporter  21.48 
 
 
452 aa  49.3  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2380  sn-glycerol-3-phosphate transporter  21.48 
 
 
452 aa  49.3  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02125  hypothetical protein  21.48 
 
 
452 aa  49.3  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1824  major facilitator transporter  27.23 
 
 
415 aa  48.1  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.582867  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3958  sn-glycerol-3-phosphate transporter  21.02 
 
 
449 aa  46.6  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00220837  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1576  major facilitator superfamily MFS_1  22.35 
 
 
483 aa  46.2  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2963  major facilitator superfamily MFS_1  20.92 
 
 
421 aa  46.6  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  1.21972e-05  normal  0.284618 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5978  sn-glycerol-3-phosphate transporter  21.79 
 
 
448 aa  46.2  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.207284  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69130  sn-glycerol-3-phosphate transporter  21.64 
 
 
448 aa  45.8  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1994  L-fucose transporter  22.39 
 
 
432 aa  45.1  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.486095 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4128  L-fucose transporter  23.05 
 
 
431 aa  45.1  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0901  major facilitator transporter  31.97 
 
 
376 aa  45.1  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01229  glucose-galactose transporter  27.8 
 
 
427 aa  45.4  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0194609  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2076  major facilitator superfamily MFS_1  19.87 
 
 
419 aa  45.1  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1241  glucose/galactose transporter  25.33 
 
 
426 aa  44.3  0.005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.184837  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1273  glucose/galactose transporter  25.76 
 
 
426 aa  44.7  0.005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0275  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 
371 aa  44.3  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1615  hypothetical protein  23.19 
 
 
383 aa  43.1  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>