More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_2966 on replicon NC_011687
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011687  PHATRDRAFT_2966  selenocysteine lyase  100 
 
 		 386 aa  798    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16873  predicted protein  44.22 
 
 		 405 aa  306  3e-82  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0124247  normal  0.537362 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2243  aminotransferase class V  45.22 
 
 		 380 aa  294  2e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2179  cysteine desulfurase  40.31 
 
 		 373 aa  270  2.9999999999999997e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1225  cysteine desulfurase  43.15 
 
 		 414 aa  265  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.738138  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  39.59 
 
 		 398 aa  265  1e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  39.59 
 
 		 398 aa  265  1e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2865  cysteine desulfurase  43.15 
 
 		 373 aa  265  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0379  cysteine desulfurase  43.15 
 
 		 373 aa  264  2e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1755  cysteine desulfurase  43.15 
 
 		 373 aa  264  2e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.983783  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1568  cysteine desulfurase  43.15 
 
 		 373 aa  264  2e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0422  cysteine desulfurase  43.15 
 
 		 373 aa  264  2e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  40.62 
 
 		 392 aa  259  4e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0100  cysteine desulfurase NifS  41.49 
 
 		 400 aa  258  9e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.873822 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  41.24 
 
 		 384 aa  258  1e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2808  aminotransferase, class V  41.18 
 
 		 379 aa  257  2e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  40.1 
 
 		 382 aa  256  5e-67  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  42.01 
 
 		 400 aa  256  7e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  38.87 
 
 		 400 aa  255  8e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  41.39 
 
 		 404 aa  255  8e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1343  aminotransferase class V  38.24 
 
 		 389 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2683  aminotransferase, class V  40.21 
 
 		 393 aa  252  8.000000000000001e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0397114 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  39.59 
 
 		 396 aa  249  4e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  39.95 
 
 		 396 aa  249  7e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  39.19 
 
 		 394 aa  249  8e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1507  cysteine desulfurase  41.18 
 
 		 402 aa  248  1e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0546  aminotransferase class V  42.05 
 
 		 400 aa  248  1e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0396718  hitchhiker  0.00519262 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  36.67 
 
 		 392 aa  246  6.999999999999999e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  38.46 
 
 		 382 aa  245  8e-64  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1225  cysteine desulfurase NifS  41.03 
 
 		 397 aa  245  9e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000944956 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0188  aminotransferase class V  40.4 
 
 		 382 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.431625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4134  aminotransferase, class V  41.75 
 
 		 400 aa  244  9.999999999999999e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0486971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0624  aminotransferase, class V  41.37 
 
 		 385 aa  244  9.999999999999999e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292698 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  40.1 
 
 		 398 aa  244  1.9999999999999999e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  39.64 
 
 		 392 aa  244  1.9999999999999999e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21090  cysteine desulfurase family protein  40.57 
 
 		 392 aa  243  3e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.822345  normal  0.14044 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0108  aminotransferase class V  39.69 
 
 		 400 aa  243  3.9999999999999997e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.702313 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  37.02 
 
 		 414 aa  243  3.9999999999999997e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  39.19 
 
 		 379 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  37.6 
 
 		 384 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  37.85 
 
 		 384 aa  243  5e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  38.05 
 
 		 404 aa  242  7e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  37.89 
 
 		 407 aa  242  1e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  37.69 
 
 		 394 aa  240  2.9999999999999997e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1833  aminotransferase, class V  38.62 
 
 		 389 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0175075  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2122  cysteine desulfurase NifS  40.72 
 
 		 401 aa  240  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31758 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4245  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  41.69 
 
 		 398 aa  240  4e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0592  cysteine desulfurase  39.85 
 
 		 404 aa  240  4e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0627  cysteine desulfurase  39.85 
 
 		 404 aa  239  5e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1025  cysteine desulfurase  39.18 
 
 		 406 aa  239  6.999999999999999e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00998384  normal  0.30784 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0716  aminotransferase class V  41.49 
 
 		 387 aa  239  8e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1356  cysteine desulfurase NifS  39.03 
 
 		 402 aa  239  8e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3062  cysteine desulfurase IscS  38.21 
 
 		 403 aa  239  8e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.635367  unclonable  0.000000859331 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2655  cysteine desulfurase  39.18 
 
 		 407 aa  238  9e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1515  aminotransferase, class V:aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  39.69 
 
 		 404 aa  238  1e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.894831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1058  cysteine desulfurase  38.05 
 
 		 405 aa  238  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0834623  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2733  cysteine desulfurase  38.92 
 
 		 407 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2599  cysteine desulfurase  38.92 
 
 		 407 aa  237  2e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129174  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0341  cysteine desulfurase  35.99 
 
 		 388 aa  237  2e-61  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0618  cysteine desulfurase  39.85 
 
 		 404 aa  238  2e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2143  cysteine desulfurase  38.01 
 
 		 407 aa  237  3e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.950908 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5951  cysteine desulfurase  38.01 
 
 		 407 aa  237  3e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.350283  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2126  cysteine desulfurase  38.01 
 
 		 407 aa  237  3e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2362  cysteine desulfurase NifS  40.36 
 
 		 399 aa  236  4e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2036  cysteine desulfurase  37.76 
 
 		 407 aa  236  4e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.639443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2163  cysteine desulfurase  37.76 
 
 		 407 aa  236  4e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.675105  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1489  cysteine desulfurase  39.18 
 
 		 407 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.71249  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1708  cysteine desulfurase  39.18 
 
 		 407 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3103  cysteine desulfurase  39.18 
 
 		 407 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.412431  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2217  cysteine desulfurase  39.18 
 
 		 407 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1144  cysteine desulfurase  38.01 
 
 		 407 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.282524  normal  0.237339 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0637  cysteine desulfurase  40.62 
 
 		 404 aa  236  6e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.273964 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1558  cysteine desulfurase NifS  40.46 
 
 		 400 aa  236  6e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0572612  normal  0.890663 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  37.69 
 
 		 388 aa  236  7e-61  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01630  Nitrogen fixation cysteine desulfurase, nifS  39.18 
 
 		 402 aa  235  8e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1875  cysteine desulfurase  38.92 
 
 		 407 aa  235  8e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.795233  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2011  cysteine desulfurase  38.11 
 
 		 391 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.079673  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2205  cysteine desulfurase IscS  36.86 
 
 		 403 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00230458  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1551  aminotransferase class V  39.23 
 
 		 383 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0884  cysteine desulfurase IscS  37.63 
 
 		 405 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.293282  normal  0.187166 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6331  cysteine desulfurase IscS  38.66 
 
 		 405 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.134755  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5432  cysteine desulfurase  37.76 
 
 		 407 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.116144  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0949  cysteine desulfurase IscS  37.63 
 
 		 405 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0399375 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2275  aminotransferase, class V  39.49 
 
 		 386 aa  234  3e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2015  aminotransferase, class V  38.62 
 
 		 391 aa  233  3e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0118596  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1811  cysteine desulfurase NifS  41.09 
 
 		 401 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1783  cysteine desulfurase NifS  41.09 
 
 		 401 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2296  aminotransferase, class V  40.26 
 
 		 394 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  37.63 
 
 		 398 aa  233  4.0000000000000004e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  37.53 
 
 		 402 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1569  cysteine desulfurase NifS  37.37 
 
 		 389 aa  233  5e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00349258  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  37.08 
 
 		 403 aa  233  6e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1458  cysteine desulfurase  37.24 
 
 		 407 aa  233  6e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2647  cysteine desulfurase NifS  37.89 
 
 		 389 aa  232  7.000000000000001e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00311085 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1019  pyridoxal-phosphate-dependent aminotransferase (NIFS protein)  37.5 
 
 		 405 aa  232  1e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.103423  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3627  cysteine desulfurase  38.93 
 
 		 404 aa  232  1e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0168495  normal  0.888851 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1063  aminotransferase class V  38.52 
 
 		 388 aa  231  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  37.24 
 
 		 396 aa  231  2e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0992  cysteine desulfurase  36.67 
 
 		 391 aa  231  2e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00026474  normal  0.256714 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3063  aminotransferase, class V  39.07 
 
 		 383 aa  231  2e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0588987  unclonable  0.000000817205 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>