288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG2087 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG2087  rRNA large subunit methyltransferase  100 
 
 
157 aa  320  5e-87  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08411  hypothetical protein  54.14 
 
 
157 aa  192  1e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3495  rRNA large subunit methyltransferase  51.59 
 
 
157 aa  179  1e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0587384  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2090  rRNA large subunit methyltransferase  52.87 
 
 
157 aa  179  1e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0655  protein of unknown function DUF163  50.32 
 
 
157 aa  174  5e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2788  rRNA large subunit methyltransferase  47.44 
 
 
155 aa  154  4e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3770  protein of unknown function DUF163  41.4 
 
 
157 aa  136  9e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0717595 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3859  protein of unknown function DUF163  42.41 
 
 
154 aa  123  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.161132 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0254  hypothetical protein  40.65 
 
 
153 aa  122  2e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3775  protein of unknown function DUF163  41.77 
 
 
154 aa  120  5e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  4.55884e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4128  hypothetical protein  38.85 
 
 
153 aa  117  6e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  1.67091e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4914  rRNA large subunit methyltransferase  37.34 
 
 
160 aa  115  2e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  6.73176e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2610  rRNA large subunit methyltransferase  35.44 
 
 
159 aa  115  2e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2927  rRNA large subunit methyltransferase  35.44 
 
 
159 aa  115  2e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0233  hypothetical protein  40.38 
 
 
153 aa  114  4e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.585462  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0244  protein of unknown function DUF163  39.74 
 
 
153 aa  114  5e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.998147  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3202  hypothetical protein  42.41 
 
 
154 aa  114  6e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  2.69553e-19  unclonable  6.7014e-24 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3630  protein of unknown function DUF163  37.82 
 
 
153 aa  114  7e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  1.33759e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0255  protein of unknown function DUF163  39.1 
 
 
153 aa  113  1e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0353542  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0291  protein of unknown function DUF163  36.48 
 
 
160 aa  113  1e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0186032  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0845  protein of unknown function DUF163  40.13 
 
 
155 aa  112  2e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0190186 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2340  hypothetical protein  39.24 
 
 
159 aa  111  4e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.663621 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0024  rRNA large subunit methyltransferase  38.61 
 
 
159 aa  111  4e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  2.87275e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0024  rRNA large subunit methyltransferase  38.61 
 
 
159 aa  111  4e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000337367  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3402  protein of unknown function DUF163  39.62 
 
 
159 aa  109  2e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  1.53536e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0027  rRNA large subunit methyltransferase  37.34 
 
 
159 aa  108  4e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000611129  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0677  hypothetical protein  37.97 
 
 
158 aa  107  8e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2529  rRNA large subunit methyltransferase  37.34 
 
 
159 aa  106  1e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  2.24859e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2291  hypothetical protein  37.66 
 
 
155 aa  106  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1809  hypothetical protein  34.64 
 
 
156 aa  105  2e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.454132  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19420  hypothetical protein  36.13 
 
 
156 aa  105  2e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  1.14035e-07 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3208  hypothetical protein  38.22 
 
 
153 aa  104  4e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0200038  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2576  hypothetical protein  35.9 
 
 
156 aa  104  5e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  7.09351e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3387  rRNA large subunit methyltransferase  36.08 
 
 
159 aa  104  6e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_2001  rRNA large subunit methyltransferase  34.81 
 
 
159 aa  103  8e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.554964  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5708  rRNA large subunit methyltransferase  36.71 
 
 
159 aa  103  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5582  rRNA large subunit methyltransferase  36.71 
 
 
159 aa  103  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3612  hypothetical protein  39.1 
 
 
152 aa  103  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  5.47821e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5353  rRNA large subunit methyltransferase  36.71 
 
 
159 aa  103  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000123546  hitchhiker  7.68925e-17 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5252  rRNA large subunit methyltransferase  36.08 
 
 
159 aa  103  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2894  protein of unknown function DUF163  35 
 
 
159 aa  103  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.577579  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5156  rRNA large subunit methyltransferase  36.71 
 
 
159 aa  103  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0136607  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5312  rRNA large subunit methyltransferase  36.71 
 
 
159 aa  103  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2438  rRNA large subunit methyltransferase  38.12 
 
 
159 aa  102  1e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  7.43067e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5608  rRNA large subunit methyltransferase  36.71 
 
 
159 aa  102  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.91271  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3293  hypothetical protein  33.54 
 
 
160 aa  102  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2326  rRNA large subunit methyltransferase  37.97 
 
 
159 aa  102  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  8.81248e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3531  rRNA large subunit methyltransferase  38.22 
 
 
177 aa  102  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34446  predicted protein  40.29 
 
 
194 aa  102  3e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.693948  normal  0.0400957 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5140  rRNA large subunit methyltransferase  36.08 
 
 
159 aa  101  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0439038  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5643  rRNA large subunit methyltransferase  36.08 
 
 
167 aa  100  5e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00520396  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5565  rRNA large subunit methyltransferase  36.08 
 
 
167 aa  100  5e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5705e-39 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2659  hypothetical protein  34.19 
 
 
157 aa  101  5e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0267321  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0118  protein of unknown function DUF163  37.42 
 
 
165 aa  100  6e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.825891  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0073  protein of unknown function DUF163  34.18 
 
 
159 aa  100  6e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00804321  normal  0.0154947 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0647  rRNA large subunit methyltransferase  38.27 
 
 
160 aa  100  7e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0130752 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3999  rRNA large subunit methyltransferase  35.44 
 
 
159 aa  100  8e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0185  hypothetical protein  37.11 
 
 
152 aa  100  1e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1807  rRNA large subunit methyltransferase  35.9 
 
 
157 aa  99.4  2e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1884  rRNA large subunit methyltransferase  35.9 
 
 
157 aa  99  2e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.616736  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0360  rRNA large subunit methyltransferase  36.08 
 
 
159 aa  97.8  4e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.615006  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1412  hypothetical protein  38.06 
 
 
145 aa  97.8  4e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.493866  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0070  rRNA large subunit methyltransferase  33.54 
 
 
159 aa  97.4  6e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  1.7339e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1654  hypothetical protein  37.74 
 
 
153 aa  97.4  7e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2587  rRNA large subunit methyltransferase  32.48 
 
 
156 aa  97.1  8e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  2.27435e-06  normal  0.158924 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2907  rRNA large subunit methyltransferase  35.26 
 
 
156 aa  97.1  8e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0910  rRNA large subunit methyltransferase  34.81 
 
 
159 aa  97.1  9e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  7.42092e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20240  conserved hypothetical protein TIGR00246  34.18 
 
 
159 aa  97.1  9e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2934  rRNA large subunit methyltransferase  32.48 
 
 
156 aa  95.9  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  1.78909e-07  decreased coverage  0.00747753 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01660  hypothetical protein  35.44 
 
 
150 aa  95.5  3e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.134339  hitchhiker  7.74135e-12 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0856  rRNA large subunit methyltransferase  33.76 
 
 
156 aa  95.1  3e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  3.1317e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0544  protein of unknown function DUF163  31.61 
 
 
155 aa  94.7  4e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2933  rRNA large subunit methyltransferase  33.54 
 
 
170 aa  94.4  5e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2273  SPOUT methyltransferase superfamily protein  35.44 
 
 
156 aa  94.4  5e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.246773  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01881  rRNA large subunit methyltransferase  34.62 
 
 
156 aa  94.4  6e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0790169  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1057  rRNA large subunit methyltransferase  31.21 
 
 
156 aa  94  8e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  4.90967e-05  hitchhiker  0.00601071 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1105  rRNA large subunit methyltransferase  32.26 
 
 
155 aa  93.6  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.909306  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0747  protein of unknown function DUF163  34.67 
 
 
157 aa  93.2  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3799  rRNA large subunit methyltransferase  30.97 
 
 
155 aa  93.6  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1306  protein of unknown function DUF163  33.97 
 
 
152 aa  92.8  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.820189  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12050  rRNA large subunit methyltransferase  32.26 
 
 
155 aa  92  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0613288  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1093  rRNA large subunit methyltransferase  31.85 
 
 
156 aa  92  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  2.56643e-10  hitchhiker  5.16486e-10 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3274  rRNA large subunit methyltransferase  31.85 
 
 
156 aa  92  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  4.53128e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3452  rRNA large subunit methyltransferase  31.85 
 
 
156 aa  92  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  5.35521e-05  hitchhiker  0.00271543 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3316  rRNA large subunit methyltransferase  31.85 
 
 
156 aa  92  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  3.08815e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0377  rRNA large subunit methyltransferase  32.26 
 
 
155 aa  92.4  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1945  rRNA large subunit methyltransferase  32.28 
 
 
159 aa  92.8  2e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0305883  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3484  rRNA large subunit methyltransferase  31.21 
 
 
156 aa  92  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  3.36055e-08  unclonable  3.93257e-11 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5626  rRNA large subunit methyltransferase  33.97 
 
 
156 aa  91.7  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1169  rRNA large subunit methyltransferase  30.57 
 
 
156 aa  91.7  4e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0656  rRNA large subunit methyltransferase  33.12 
 
 
155 aa  91.3  5e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  1.08281e-10  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3009  rRNA large subunit methyltransferase  33.12 
 
 
155 aa  91.3  5e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  2.39477e-07  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00594  hypothetical protein  33.12 
 
 
155 aa  91.3  5e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000243444  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0662  rRNA large subunit methyltransferase  33.12 
 
 
155 aa  91.3  5e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  6.37947e-11  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2990  protein of unknown function DUF163  33.12 
 
 
155 aa  91.3  5e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  4.7133e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2216  rRNA large subunit methyltransferase  33.97 
 
 
156 aa  91.3  5e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0688  rRNA large subunit methyltransferase  33.12 
 
 
155 aa  91.3  5e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.54252e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0725  rRNA large subunit methyltransferase  33.12 
 
 
155 aa  91.3  5e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  7.08993e-07  normal  0.106325 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00605  hypothetical protein  33.12 
 
 
155 aa  91.3  5e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000332715  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0615  rRNA large subunit methyltransferase  33.12 
 
 
155 aa  91.3  5e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  1.21913e-14  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>