288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E0615 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00605  hypothetical protein  100 
 
 		 155 aa  318  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000332715  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2990  protein of unknown function DUF163  100 
 
 		 155 aa  318  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000047133  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3009  rRNA large subunit methyltransferase  100 
 
 		 155 aa  318  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000239477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0725  rRNA large subunit methyltransferase  100 
 
 		 155 aa  318  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000708993  normal  0.106325 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0688  rRNA large subunit methyltransferase  100 
 
 		 155 aa  318  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000154252  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00594  hypothetical protein  100 
 
 		 155 aa  318  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000243444  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0656  rRNA large subunit methyltransferase  100 
 
 		 155 aa  318  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000108281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0615  rRNA large subunit methyltransferase  100 
 
 		 155 aa  318  1.9999999999999998e-86  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000121913  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0662  rRNA large subunit methyltransferase  100 
 
 		 155 aa  318  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000637947  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0743  rRNA large subunit methyltransferase  98.71 
 
 		 155 aa  314  4e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000786877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0683  rRNA large subunit methyltransferase  98.71 
 
 		 155 aa  314  4e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000302367  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0801  rRNA large subunit methyltransferase  98.71 
 
 		 155 aa  314  4e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000227115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0757  rRNA large subunit methyltransferase  98.71 
 
 		 155 aa  314  4e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00922876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0697  rRNA large subunit methyltransferase  98.71 
 
 		 155 aa  314  4e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00566103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1171  rRNA large subunit methyltransferase  97.42 
 
 		 155 aa  310  3.9999999999999997e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.195021  normal  0.132715 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1847  rRNA large subunit methyltransferase  91.67 
 
 		 156 aa  290  3e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3020  rRNA large subunit methyltransferase  91.67 
 
 		 156 aa  290  3e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000384125  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2948  rRNA large subunit methyltransferase  91.67 
 
 		 156 aa  290  3e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0113814  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1093  rRNA large subunit methyltransferase  89.1 
 
 		 156 aa  289  8e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3149  rRNA large subunit methyltransferase  90.38 
 
 		 156 aa  289  1e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.788661  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1182  rRNA large subunit methyltransferase  90.38 
 
 		 156 aa  289  1e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.159956  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1202  hypothetical protein  90.38 
 
 		 156 aa  289  1e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2963  rRNA large subunit methyltransferase  89.1 
 
 		 156 aa  286  1e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0322  rRNA large subunit methyltransferase  80.65 
 
 		 155 aa  268  2e-71  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.072258  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01218  rRNA large subunit methyltransferase  81.41 
 
 		 156 aa  265  2e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0986  rRNA large subunit methyltransferase  82.69 
 
 		 156 aa  263  5.999999999999999e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2934  rRNA large subunit methyltransferase  82.05 
 
 		 156 aa  263  8.999999999999999e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000178909  decreased coverage  0.00747753 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3707  rRNA large subunit methyltransferase  80.13 
 
 		 156 aa  263  8.999999999999999e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000116859  decreased coverage  0.000000222893 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0474  rRNA large subunit methyltransferase  81.41 
 
 		 156 aa  261  2e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0372612  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0856  rRNA large subunit methyltransferase  80.13 
 
 		 156 aa  258  2e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000031317  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0700  rRNA large subunit methyltransferase  79.49 
 
 		 156 aa  258  2e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000000637083  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2587  rRNA large subunit methyltransferase  80.13 
 
 		 156 aa  258  2e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000227435  normal  0.158924 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3484  rRNA large subunit methyltransferase  78.85 
 
 		 156 aa  257  3e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000336055  unclonable  0.0000000000393257 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1169  rRNA large subunit methyltransferase  78.21 
 
 		 156 aa  257  5.0000000000000005e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1093  rRNA large subunit methyltransferase  79.49 
 
 		 156 aa  256  7e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000256643  hitchhiker  0.000000000516486 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3274  rRNA large subunit methyltransferase  79.49 
 
 		 156 aa  256  7e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000453128  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3452  rRNA large subunit methyltransferase  79.49 
 
 		 156 aa  256  7e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000535521  hitchhiker  0.00271543 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3316  rRNA large subunit methyltransferase  79.49 
 
 		 156 aa  256  7e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000308815  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0992  rRNA large subunit methyltransferase  78.21 
 
 		 156 aa  256  7e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000354968  normal  0.0933085 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0996  rRNA large subunit methyltransferase  78.21 
 
 		 156 aa  256  7e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000270066  normal  0.150944 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2868  rRNA large subunit methyltransferase  78.21 
 
 		 156 aa  255  1e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000163704  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1057  rRNA large subunit methyltransferase  77.56 
 
 		 156 aa  254  2e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000490967  hitchhiker  0.00601071 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01658  rRNA large subunit methyltransferase  75 
 
 		 156 aa  251  2.0000000000000002e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000106355  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3148  rRNA large subunit methyltransferase  77.56 
 
 		 156 aa  249  7e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000132782  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004221  hypothetical protein  82.76 
 
 		 145 aa  247  4e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000988168  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1561  rRNA large subunit methyltransferase  71.79 
 
 		 156 aa  246  6e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1716  rRNA large subunit methyltransferase  72.44 
 
 		 156 aa  243  9e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.962175  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1136  rRNA large subunit methyltransferase  70.51 
 
 		 156 aa  232  1.0000000000000001e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00404994  normal  0.955793 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2414  hypothetical protein  58.06 
 
 		 156 aa  207  6e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000142803  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4971  rRNA large subunit methyltransferase  58.06 
 
 		 155 aa  203  8e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170653  normal  0.369961 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3799  rRNA large subunit methyltransferase  57.42 
 
 		 155 aa  202  1e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0613  rRNA large subunit methyltransferase  56.77 
 
 		 155 aa  198  3e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4861  rRNA large subunit methyltransferase  56.77 
 
 		 155 aa  197  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.394825  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4826  hypothetical protein  56.77 
 
 		 155 aa  197  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.715352  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4366  rRNA large subunit methyltransferase  56.77 
 
 		 155 aa  197  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712545  normal  0.959916 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1105  rRNA large subunit methyltransferase  56.13 
 
 		 155 aa  197  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.909306  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4808  rRNA large subunit methyltransferase  56.77 
 
 		 155 aa  197  5e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.24458 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4683  rRNA large subunit methyltransferase  56.77 
 
 		 155 aa  197  5e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0377  rRNA large subunit methyltransferase  58.71 
 
 		 155 aa  194  3e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12050  rRNA large subunit methyltransferase  55.48 
 
 		 155 aa  194  5.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0613288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2849  hypothetical protein  54.19 
 
 		 155 aa  192  1e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.158377  hitchhiker  0.0000000861677 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1544  hypothetical protein  56.13 
 
 		 155 aa  189  9e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00441553  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0406  hypothetical protein  56.49 
 
 		 155 aa  189  2e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.57756  normal  0.24642 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3342  rRNA large subunit methyltransferase  52.26 
 
 		 155 aa  178  2e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000127948  normal  0.0166889 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1512  rRNA large subunit methyltransferase  54.19 
 
 		 155 aa  175  2e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0000386318  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08380  rRNA large subunit methyltransferase  57.42 
 
 		 155 aa  175  2e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0699075  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2273  SPOUT methyltransferase superfamily protein  52.56 
 
 		 156 aa  173  9.999999999999999e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.246773  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01881  rRNA large subunit methyltransferase  52.26 
 
 		 156 aa  165  2e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0790169  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2907  rRNA large subunit methyltransferase  50.97 
 
 		 156 aa  162  1.0000000000000001e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2069  rRNA large subunit methyltransferase  52.26 
 
 		 156 aa  160  6e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.608211  normal  0.214177 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3264  rRNA large subunit methyltransferase  52.9 
 
 		 156 aa  158  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1296  rRNA large subunit methyltransferase  52.26 
 
 		 156 aa  157  4e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.433807  normal  0.073248 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0592  rRNA large subunit methyltransferase  47.1 
 
 		 155 aa  157  5e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.338399 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1889  rRNA large subunit methyltransferase  50.97 
 
 		 156 aa  155  2e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.841126  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1379  rRNA large subunit methyltransferase  50.97 
 
 		 156 aa  155  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.588338  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0797  rRNA large subunit methyltransferase  50.97 
 
 		 156 aa  155  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0353  rRNA large subunit methyltransferase  50.97 
 
 		 156 aa  155  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.389517  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1235  rRNA large subunit methyltransferase  50.97 
 
 		 156 aa  155  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1226  rRNA large subunit methyltransferase  50.97 
 
 		 156 aa  155  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0780  rRNA large subunit methyltransferase  48.73 
 
 		 159 aa  155  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.329962  normal  0.230436 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1070  rRNA large subunit methyltransferase  50.97 
 
 		 156 aa  155  2e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.503879  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1010  rRNA large subunit methyltransferase  50.97 
 
 		 156 aa  154  6e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0433  rRNA large subunit methyltransferase  49.38 
 
 		 166 aa  153  6e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1331  rRNA large subunit methyltransferase  45.81 
 
 		 156 aa  152  1e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2126  protein of unknown function DUF163  49.68 
 
 		 156 aa  152  2e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.933959  normal  0.0354668 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1884  rRNA large subunit methyltransferase  49.68 
 
 		 157 aa  152  2e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.616736  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1327  rRNA large subunit methyltransferase  45.81 
 
 		 156 aa  152  2e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1807  rRNA large subunit methyltransferase  49.68 
 
 		 157 aa  151  2.9999999999999998e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2216  rRNA large subunit methyltransferase  49.68 
 
 		 156 aa  148  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1764  rRNA large subunit methyltransferase  47.5 
 
 		 162 aa  148  3e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.190607 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1738  protein of unknown function DUF163  46.15 
 
 		 156 aa  148  3e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0979  rRNA large subunit methyltransferase  49.68 
 
 		 156 aa  147  5e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0495213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5626  rRNA large subunit methyltransferase  49.03 
 
 		 156 aa  147  5e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2337  rRNA large subunit methyltransferase  49.68 
 
 		 156 aa  147  5e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.390809  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0486  hypothetical protein  46.9 
 
 		 145 aa  147  6e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000178654  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1342  rRNA large subunit methyltransferase  48.08 
 
 		 156 aa  146  8e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2322  rRNA large subunit methyltransferase  49.03 
 
 		 156 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.810756  normal  0.749932 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1687  rRNA large subunit methyltransferase  49.03 
 
 		 156 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2299  rRNA large subunit methyltransferase  49.03 
 
 		 156 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2080  rRNA large subunit methyltransferase  48.39 
 
 		 155 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>