More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0046 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG0046  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 
284 aa  559  1e-158  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2598  phosphatidate cytidylyltransferase  35.29 
 
 
296 aa  159  4e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0358  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthetase)  34.38 
 
 
282 aa  123  3e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1019  CDP-diglyceride synthase  33.8 
 
 
282 aa  120  2e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  4.80748e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1072  CDP-diglyceride synthase  33.8 
 
 
282 aa  120  2e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00432402  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3429  CDP-diglyceride synthase  33.8 
 
 
282 aa  120  2e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00445067  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0793  hypothetical protein  35.11 
 
 
712 aa  119  4e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0551425 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3159  Phosphatidate cytidylyltransferase  46.09 
 
 
285 aa  119  4e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0555993  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07921  phosphatidate cytidylyltransferase  41.94 
 
 
246 aa  119  5e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.111396  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  33.09 
 
 
280 aa  119  5e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0828  phosphatidate cytidylyltransferase  48.76 
 
 
260 aa  119  6e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00232392  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1321  phosphatidate cytidylyltransferase  48.76 
 
 
260 aa  118  9e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1347  phosphatidate cytidylyltransferase  48.76 
 
 
260 aa  118  9e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00448682  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1613  phosphatidate cytidylyltransferase  31.13 
 
 
280 aa  117  2e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1540  phosphatidate cytidylyltransferase  49.59 
 
 
268 aa  117  3e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3584  phosphatidate cytidylyltransferase  48.46 
 
 
281 aa  116  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0613  phosphatidate cytidylyltransferase  49.59 
 
 
272 aa  117  3e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3784  CDP-diglyceride synthase  45.38 
 
 
282 aa  116  4e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0388384  hitchhiker  0.0021179 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2974  phosphatidate cytidylyltransferase  45.74 
 
 
285 aa  115  7e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3650  phosphatidate cytidylyltransferase  47.69 
 
 
281 aa  115  1e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3724  Phosphatidate cytidylyltransferase  48.85 
 
 
281 aa  115  1e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3704  phosphatidate cytidylyltransferase  47.29 
 
 
260 aa  115  1e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0101996  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0168  CDP-diglyceride synthase  44.62 
 
 
285 aa  114  2e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00227409  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0177  CDP-diglyceride synthase  44.62 
 
 
285 aa  114  2e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.61651e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3485  CDP-diglyceride synthase  44.62 
 
 
285 aa  114  2e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00144411  normal  0.0353407 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0980  CDP-diglyceride synthetase  37.57 
 
 
265 aa  114  2e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0459166  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0179  CDP-diglyceride synthase  44.62 
 
 
285 aa  114  2e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  2.36154e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0479  phosphatidate cytidylyltransferase  36.33 
 
 
279 aa  114  2e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0185  CDP-diglyceride synthase  44.62 
 
 
285 aa  114  2e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000611994  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3428  Phosphatidate cytidylyltransferase  44.62 
 
 
285 aa  114  2e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000894621  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00173  CDP-diglyceride synthase  44.62 
 
 
285 aa  114  2e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0579105  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0020  phosphatidate cytidylyltransferase  38.14 
 
 
269 aa  114  2e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10900  CDP-diglyceride synthetase  33.68 
 
 
303 aa  113  3e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.176404  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0530  phosphatidate cytidylyltransferase  44.96 
 
 
279 aa  113  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00172  hypothetical protein  44.62 
 
 
249 aa  113  3e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0666446  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0260  CDP-diglyceride synthase  44.62 
 
 
285 aa  113  4e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.451367 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0244  CDP-diglyceride synthase  44.62 
 
 
285 aa  113  4e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384885  normal  0.739542 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0713  CDP-diglyceride synthase  45.04 
 
 
285 aa  113  4e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00713923  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0186  CDP-diglyceride synthase  44.62 
 
 
285 aa  113  4e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00459839  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0244  CDP-diglyceride synthase  44.62 
 
 
285 aa  113  4e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.306198 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0262  CDP-diglyceride synthase  44.62 
 
 
285 aa  113  4e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0277384  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0247  CDP-diglyceride synthase  44.62 
 
 
285 aa  113  4e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.748652 
 
 
-
 
NC_002936  DET0372  phosphatidate cytidylyltransferase  33.69 
 
 
267 aa  112  6e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_316  phosphatidate cytidylyltransferase  33.69 
 
 
267 aa  110  2e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0354  phosphatidate cytidylyltransferase  32.28 
 
 
267 aa  109  4e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0485  phosphatidate cytidylyltransferase  40.14 
 
 
296 aa  109  5e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.468496  normal  0.270434 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0664  phosphatidate cytidylyltransferase  44.62 
 
 
295 aa  109  6e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1039  phosphatidate cytidylyltransferase  48.8 
 
 
262 aa  108  8e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00281126  unclonable  1.16593e-08 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0360  phosphatidate cytidylyltransferase  31.47 
 
 
281 aa  108  9e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.73669  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2993  phosphatidate cytidylyltransferase  30 
 
 
277 aa  108  9e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1182  phosphatidate cytidylyltransferase  31.51 
 
 
290 aa  108  1e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2470  phosphatidate cytidylyltransferase  32.88 
 
 
310 aa  108  1e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1916  phosphatidate cytidylyltransferase  36.04 
 
 
233 aa  107  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0806  CDP-diglyceride synthetase  45.38 
 
 
263 aa  108  1e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  3.46941e-09  hitchhiker  5.45456e-08 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10160  CDP-diglyceride synthetase  44.07 
 
 
301 aa  107  2e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07710  phosphatidate cytidylyltransferase  47.46 
 
 
266 aa  107  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.726155  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  43.2 
 
 
261 aa  107  2e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  5.58794e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  36.67 
 
 
271 aa  107  2e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  1.1055e-09  unclonable  2.72637e-19 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0947  CDP-diglyceride synthase  45.61 
 
 
285 aa  107  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00468877  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0710  phosphatidate cytidylyltransferase  31.9 
 
 
341 aa  107  2e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0296449  hitchhiker  6.14335e-07 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1008  phosphatidate cytidylyltransferase  32.86 
 
 
289 aa  107  2e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0998  phosphatidate cytidylyltransferase  34.87 
 
 
276 aa  107  3e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.371374  normal  0.808071 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1845  phosphatidate cytidylyltransferase  41.22 
 
 
242 aa  106  4e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153368  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1972  phosphatidate cytidylyltransferase  33.21 
 
 
261 aa  106  4e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01126  phosphatidate cytidylyltransferase  45.04 
 
 
270 aa  106  6e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188617  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3354  CDP-diglyceride synthase  45.61 
 
 
285 aa  105  6e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0141568  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3930  phosphatidate cytidylyltransferase  35.91 
 
 
282 aa  105  7e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.567007  normal  0.131428 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1818  phosphatidate cytidylyltransferase  34.02 
 
 
332 aa  105  7e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.955485  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1675  phosphatidate cytidylyltransferase  35.16 
 
 
296 aa  105  9e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23590  CDP-diglyceride synthetase  31.43 
 
 
280 aa  105  1e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0168367 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1403  phosphatidate cytidylyltransferase  42.86 
 
 
254 aa  104  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.589617  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0533  CDP-diglyceride synthase  46.43 
 
 
284 aa  105  1e-21  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.117905  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03232  phosphatidate cytidylyltransferase  42.97 
 
 
280 aa  104  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0245  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthase)  44.8 
 
 
264 aa  104  2e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2049  phosphatidate cytidylyltransferase  41.54 
 
 
252 aa  104  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.536953  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1747  phosphatidate cytidylyltransferase  41.03 
 
 
276 aa  104  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1449  phosphatidate cytidylyltransferase  46.4 
 
 
271 aa  104  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1916  putative phosphatidate cytidylyltransferase  52.54 
 
 
236 aa  104  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.55473e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1165  phosphatidate cytidylyltransferase  46.4 
 
 
271 aa  104  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1260  phosphatidate cytidylyltransferase  49.58 
 
 
278 aa  103  3e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.655167 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1783  phosphatidate cytidylyltransferase  38.58 
 
 
274 aa  103  4e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23570  CDP-diglyceride synthetase  44.53 
 
 
284 aa  103  4e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.300811 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1125  phosphatidate cytidylyltransferase  44.14 
 
 
269 aa  102  6e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2173  phosphatidate cytidylyltransferase  40.65 
 
 
273 aa  102  6e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.379583  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1275  phosphatidate cytidylyltransferase  43.88 
 
 
285 aa  102  6e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.118666  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1146  Phosphatidate cytidylyltransferase  42.86 
 
 
264 aa  102  6e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00301357  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0395  phosphatidate cytidylyltransferase  32.42 
 
 
277 aa  102  6e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0393623  normal  0.704946 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1558  phosphatidate cytidylyltransferase  45.38 
 
 
287 aa  102  8e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17407  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1184  phosphatidate cytidylyltransferase  40.85 
 
 
302 aa  102  1e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0686  CDP-diglyceride synthetase  45 
 
 
264 aa  101  1e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.047403  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2014  phosphatidate cytidylyltransferase  34.07 
 
 
280 aa  102  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132755  hitchhiker  0.00415273 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2971  phosphatidate cytidylyltransferase  37.64 
 
 
283 aa  101  1e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.309867  normal  0.92756 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0982  phosphatidate cytidylyltransferase  30.91 
 
 
287 aa  102  1e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.375192  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3645  phosphatidate cytidylyltransferase  41.94 
 
 
263 aa  101  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.177516  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1846  phosphatidate cytidylyltransferase  32.53 
 
 
280 aa  101  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  9.59931e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3705  phosphatidate cytidylyltransferase  48.06 
 
 
277 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1492  phosphatidate cytidylyltransferase  36.56 
 
 
275 aa  101  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.199134  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1277  phosphatidate cytidylyltransferase  29.81 
 
 
267 aa  101  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.159257  normal  0.533898 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3239  phosphatidate cytidylyltransferase  42.64 
 
 
308 aa  100  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1291  phosphatidate cytidylyltransferase  46.67 
 
 
293 aa  100  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.180543 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>