More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0004 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG0004  NAD-dependent deacetylase  100 
 
 
234 aa  483  1e-136  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0079912 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1968  Silent information regulator protein Sir2  59.91 
 
 
229 aa  262  3e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00937822  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0371  silent information regulator protein Sir2  58.15 
 
 
226 aa  256  2e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.157699 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1211  Silent information regulator protein Sir2  57.21 
 
 
230 aa  254  9e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000184843  hitchhiker  0.000443834 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2032  Silent information regulator protein Sir2  50.88 
 
 
235 aa  251  1e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.375007  normal  0.693202 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08031  hypothetical protein  55.46 
 
 
233 aa  249  2e-65  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.580054  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5013  silent information regulator protein Sir2  54.94 
 
 
233 aa  243  1e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.408464  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5448  Silent information regulator protein Sir2  55 
 
 
229 aa  242  4e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.664721  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2345  NAD-dependent deacetylase  55.84 
 
 
230 aa  230  1e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.870282 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2817  silent information regulator protein Sir2  53.39 
 
 
225 aa  223  3e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2892  silent information regulator protein Sir2  50.44 
 
 
242 aa  214  7e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0531  Silent information regulator protein Sir2  45.41 
 
 
227 aa  204  1e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  1.37862e-10 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1406  5,6-dimethylbenzimidazole phosphoribosyltransferase  47.42 
 
 
251 aa  189  4e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2473  NAD-dependent deacetylase  46.49 
 
 
276 aa  180  2e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.126045  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2781  NAD-dependent deacetylase  46.05 
 
 
276 aa  180  2e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0690424  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1635  NAD-dependent deacetylase  50.75 
 
 
273 aa  179  3e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1585  NAD-dependent deacetylase  50.26 
 
 
237 aa  175  6e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.118792  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0202  Silent information regulator protein Sir2  47.69 
 
 
245 aa  174  1e-42  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000903537  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1466  NAD-dependent deacetylase  44.49 
 
 
235 aa  173  2e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2203  NAD-dependent deacetylase  49.25 
 
 
273 aa  173  2e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1500  NAD-dependent deacetylase  48.76 
 
 
273 aa  172  3e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000250063  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2481  NAD-dependent deacetylase  48.76 
 
 
279 aa  172  3e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142081  normal  0.162011 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1242  NAD-dependent deacetylase  48.76 
 
 
279 aa  172  3e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00135045  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01126  hypothetical protein  48.76 
 
 
279 aa  172  3e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2006  NAD-dependent deacetylase  48.76 
 
 
273 aa  172  3e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.423996  normal  0.175546 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2527  Silent information regulator protein Sir2  48.76 
 
 
279 aa  172  3e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  4.8723e-05  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01118  NAD-dependent deacetylase  48.76 
 
 
279 aa  172  3e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02284  NAD-dependent deacetylase  48.99 
 
 
243 aa  172  4e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1116  NAD-dependent deacetylase  46.91 
 
 
259 aa  171  1e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4420  silent information regulator protein Sir2  47.72 
 
 
226 aa  169  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.910761  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1622  NAD-dependent deacetylase  42.92 
 
 
276 aa  169  3e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2058  NAD-dependent deacetylase  47.62 
 
 
242 aa  169  3e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1711  NAD-dependent deacetylase  48.24 
 
 
278 aa  169  4e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1604  NAD-dependent deacetylase  48.24 
 
 
278 aa  168  6e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.422799  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1963  NAD-dependent deacetylase  46.27 
 
 
273 aa  168  8e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.696827  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2147  NAD-dependent deacetylase  46.27 
 
 
273 aa  168  8e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.180937  hitchhiker  0.00193472 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1298  NAD-dependent deacetylase  46.27 
 
 
273 aa  168  8e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1321  NAD-dependent deacetylase  46.27 
 
 
273 aa  168  8e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0350313  hitchhiker  0.00447864 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1336  NAD-dependent deacetylase  46.27 
 
 
273 aa  168  8e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0564369 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2859  NAD-dependent deacetylase  48.24 
 
 
278 aa  167  9e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1843  NAD-dependent deacetylase  44.21 
 
 
254 aa  167  1e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  8.6586e-07  normal  0.0231014 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2005  NAD-dependent deacetylase  47.98 
 
 
278 aa  167  1e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0489143 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003486  NAD-dependent protein deacetylase of SIR2 family  47.98 
 
 
243 aa  165  4e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.657573  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02072  NAD-dependent deacetylase  45.96 
 
 
243 aa  164  1e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0578005  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2809  NAD-dependent deacetylase  43.68 
 
 
258 aa  163  2e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.713265  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1777  silent information regulator protein Sir2  40.28 
 
 
242 aa  162  3e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1904  silent information regulator protein Sir2  45.15 
 
 
258 aa  162  6e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0865072 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2337  NAD-dependent deacetylase  45.26 
 
 
240 aa  161  7e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3213  NAD-dependent deacetylase  42.24 
 
 
230 aa  161  7e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1662  NAD-dependent deacetylase  43.16 
 
 
248 aa  161  1e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00629212  normal  0.0795648 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1435  NAD-dependent deacetylase  45.26 
 
 
248 aa  160  2e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  8.23864e-06  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3645  NAD-dependent deacetylase  46.15 
 
 
243 aa  160  2e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.755561  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1797  NAD-dependent deacetylase  42.11 
 
 
241 aa  160  2e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0401788  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0790  silent information regulator protein Sir2  44.59 
 
 
235 aa  160  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.706815  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2501  NAD-dependent deacetylase  43.68 
 
 
243 aa  159  3e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  2.75677e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0265  silent information regulator protein Sir2  47.15 
 
 
232 aa  159  4e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.708691  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1843  NAD-dependent deacetylase  43.68 
 
 
243 aa  158  5e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  5.85877e-06  hitchhiker  0.0048436 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0003  NAD-dependent deacetylase  43.04 
 
 
239 aa  159  5e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1642  NAD-dependent deacetylase  44.21 
 
 
246 aa  158  6e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  9.07169e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1717  NAD-dependent deacetylase  44.21 
 
 
246 aa  158  7e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000104436  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2173  Silent information regulator protein Sir2  45.83 
 
 
239 aa  158  7e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1717  NAD-dependent deacetylase  43.16 
 
 
247 aa  158  9e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000712347  normal  0.253477 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2748  NAD-dependent deacetylase  45.55 
 
 
233 aa  157  9e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.608759 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2508  NAD-dependent deacetylase  43.16 
 
 
243 aa  157  1e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  9.26732e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2621  NAD-dependent deacetylase  42.63 
 
 
243 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  6.17513e-07  normal  0.0318623 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1314  Silent information regulator protein Sir2  42.8 
 
 
273 aa  156  2e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.170903  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0674  NAD-dependent deacetylase  45.74 
 
 
232 aa  157  2e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0243774  normal  0.233904 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0457  silent information regulator protein Sir2  43.69 
 
 
266 aa  156  2e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.489877  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2262  NAD-dependent deacetylase  42.63 
 
 
244 aa  156  3e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1992  Silent information regulator protein Sir2  42.47 
 
 
264 aa  155  6e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0264  Silent information regulator protein Sir2  43.88 
 
 
246 aa  154  8e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0601  silent information regulator protein Sir2  42.86 
 
 
249 aa  153  3e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.496175  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1938  NAD-dependent deacetylase  40.61 
 
 
243 aa  152  4e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0872  NAD-dependent deacetylase  38.91 
 
 
251 aa  150  2e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0793  NAD-dependent deacetylase  45.08 
 
 
251 aa  149  3e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.000283822 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1652  NAD-dependent deacetylase  42.42 
 
 
276 aa  148  7e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.730778  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3938  silent information regulator protein Sir2  43.88 
 
 
237 aa  148  7e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.137348 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1594  NAD-dependent deacetylase  43.98 
 
 
253 aa  148  7e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  7.56784e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1074  Silent information regulator protein Sir2  38.91 
 
 
249 aa  147  9e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.269668  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11175  NAD-dependent deacetylase  43.75 
 
 
237 aa  147  1e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2070  silent information regulator protein Sir2  40.48 
 
 
260 aa  147  1e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5854  silent information regulator protein Sir2  41.85 
 
 
241 aa  147  1e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.589842  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1166  Silent information regulator protein Sir2  38.46 
 
 
249 aa  147  1e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00563616  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2090  silent information regulator protein Sir2  39.13 
 
 
244 aa  147  2e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.34038  normal  0.342768 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4025  silent information regulator protein Sir2  41.04 
 
 
284 aa  145  4e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.235336 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3017  silent information regulator protein Sir2  40.76 
 
 
245 aa  145  5e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.234408 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3964  NAD-dependent deacetylase  42.67 
 
 
230 aa  145  7e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3226  NAD-dependent deacetylase  42.67 
 
 
230 aa  145  7e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0207  NAD-dependent deacetylase  45.13 
 
 
234 aa  144  9e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.338339  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1230  hypothetical protein  38.91 
 
 
246 aa  144  9e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00965516  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1963  NAD-dependent deacetylase  40.82 
 
 
246 aa  144  1e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0910  Silent information regulator protein Sir2  43.48 
 
 
248 aa  144  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.44654  hitchhiker  0.00105872 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6362  Silent information regulator protein Sir2  39.91 
 
 
237 aa  142  5e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.177781  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1959  NAD-dependent deacetylase  37.02 
 
 
269 aa  141  7e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1487  Silent information regulator protein Sir2  44.44 
 
 
230 aa  141  9e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.72672  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3171  silent information regulator protein Sir2  45.21 
 
 
249 aa  140  2e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33150  transcriptional regulator Sir2 family protein  42.13 
 
 
243 aa  139  5e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.419253  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2612  NAD-dependent deacetylase  42.61 
 
 
228 aa  139  5e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000726932 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06290  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  43.63 
 
 
306 aa  138  6e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0975292  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2323  Silent information regulator protein Sir2  41.58 
 
 
256 aa  138  6e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.687351  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>