More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0301 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0301  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
305 aa  628  1e-179  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0783167 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5810  short chain dehydrogenase  35.69 
 
 
278 aa  165  1e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930868  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2629  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.76 
 
 
317 aa  164  1e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0909  short chain dehydrogenase  34.89 
 
 
273 aa  160  3e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.34519  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.41 
 
 
276 aa  159  7e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  2.24332e-12 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1655  hypothetical protein  33.33 
 
 
283 aa  157  2e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1648  hypothetical protein  33.33 
 
 
283 aa  157  2e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1560  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  33.86 
 
 
272 aa  157  2e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1352  oxidoreductase  37.5 
 
 
275 aa  155  8e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.904457  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0040  short chain dehydrogenase  33.89 
 
 
283 aa  154  1e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.262261  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0029  short chain dehydrogenase  35.47 
 
 
278 aa  155  1e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.148269  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1126  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.19 
 
 
338 aa  152  8e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0964  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.67 
 
 
306 aa  150  2e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1249  short chain dehydrogenase  34.71 
 
 
279 aa  150  3e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03890  short chain dehydrogenase  34.89 
 
 
276 aa  149  4e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.606349 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2448  short chain dehydrogenase  35.09 
 
 
277 aa  149  6e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4288  short chain dehydrogenase  34.77 
 
 
287 aa  149  8e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.861996 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3849  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.57 
 
 
314 aa  148  9e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0687851  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2479  short chain dehydrogenase  32.89 
 
 
279 aa  148  1e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.39 
 
 
291 aa  148  1e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1367  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.91 
 
 
300 aa  147  2e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0898899  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0465  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.04 
 
 
286 aa  147  2e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10740  short chain dehydrogenase  34.89 
 
 
278 aa  147  3e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.896736  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2717  short chain dehydrogenase  32.64 
 
 
276 aa  147  3e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4006  short chain dehydrogenase  32.65 
 
 
277 aa  147  3e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2581  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.76 
 
 
285 aa  146  5e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.300574 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2231  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.16 
 
 
290 aa  145  8e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.33 
 
 
258 aa  144  3e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1406  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.6 
 
 
267 aa  143  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0615665  normal  0.271714 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0169  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.4 
 
 
289 aa  142  6e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.88 
 
 
300 aa  141  1e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.67964 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6701  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.18 
 
 
271 aa  141  1e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0144  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.99 
 
 
272 aa  140  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0069  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  30.63 
 
 
277 aa  140  4e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.367303  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.88 
 
 
284 aa  139  5e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0715  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.38 
 
 
269 aa  139  6e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.965054  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.65 
 
 
268 aa  137  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.392753  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1001  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.93 
 
 
285 aa  137  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.14 
 
 
278 aa  137  3e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.719818  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2186  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.6 
 
 
248 aa  137  3e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0361624 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6366  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.99 
 
 
280 aa  136  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.152344 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2968  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.6 
 
 
272 aa  136  4e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.118258  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2186  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.91 
 
 
281 aa  136  4e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4702  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.73 
 
 
272 aa  135  1e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.315563  normal  0.0714958 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0065  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  32.28 
 
 
274 aa  135  1e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0805  short chain dehydrogenase  32.13 
 
 
275 aa  134  2e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004148  putative oxidoreductase  31.67 
 
 
275 aa  133  3e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3557  short chain dehydrogenase  33.98 
 
 
277 aa  134  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.18665  normal  0.726998 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3745  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41 
 
 
279 aa  133  3e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1004  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.91 
 
 
286 aa  132  6e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.93 
 
 
260 aa  132  7e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01319  short chain dehydrogenase  31.43 
 
 
275 aa  132  8e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0086  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
272 aa  132  8e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3850  short chain dehydrogenase  33.46 
 
 
277 aa  132  8e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.854868 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.35 
 
 
244 aa  131  1e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0101  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.15 
 
 
272 aa  131  1e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4381  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.96 
 
 
248 aa  132  1e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.297747  hitchhiker  0.00314525 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0501  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.35 
 
 
244 aa  131  1e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00365065 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3154  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.04 
 
 
286 aa  132  1e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.79 
 
 
252 aa  132  1e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1902  short chain dehydrogenase  35.43 
 
 
280 aa  131  2e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1977  short chain dehydrogenase  35.43 
 
 
280 aa  131  2e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4578  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.87 
 
 
264 aa  131  2e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0878  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.3 
 
 
277 aa  130  2e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.191089 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4853  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.35 
 
 
248 aa  130  2e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154391  normal  0.241568 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1005  short chain dehydrogenase  35.57 
 
 
284 aa  130  3e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2528  short chain dehydrogenase  34.1 
 
 
277 aa  130  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.589688 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3194  short chain dehydrogenase  39.32 
 
 
256 aa  130  3e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.234456  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1025  short chain dehydrogenase  38.92 
 
 
274 aa  130  3e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.150864  normal  0.667254 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1248  short chain dehydrogenase  38.22 
 
 
282 aa  130  3e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3481  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.34 
 
 
282 aa  130  3e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5892  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.74 
 
 
240 aa  129  4e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.197583  normal  0.684579 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1121  short chain dehydrogenase  38.54 
 
 
256 aa  129  4e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0921359  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5897  short chain dehydrogenase  32.86 
 
 
328 aa  130  4e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4482  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.46 
 
 
244 aa  129  5e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  1.23251e-09 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4042  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.17 
 
 
264 aa  129  6e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4268  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  34.17 
 
 
264 aa  129  6e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0757  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  33.18 
 
 
282 aa  129  6e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0227485  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3333  short chain dehydrogenase  36.13 
 
 
280 aa  129  6e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4357  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.17 
 
 
264 aa  129  6e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4158  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  34.17 
 
 
264 aa  129  7e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1140  short-chain dehydrogenase/reductase  31.41 
 
 
279 aa  129  7e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3901  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.84 
 
 
280 aa  129  7e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.962145  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3881  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase  34.17 
 
 
264 aa  129  7e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6182  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.14 
 
 
271 aa  129  7e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0362247 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.32 
 
 
273 aa  129  8e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.180623  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4138  short chain dehydrogenase  36.14 
 
 
303 aa  128  9e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.452621  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0498  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.27 
 
 
273 aa  129  9e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  4.06118e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5502  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.96 
 
 
282 aa  128  1e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0604  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.68 
 
 
268 aa  128  1e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.710903  normal  0.301955 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0500  short chain dehydrogenase  31.77 
 
 
275 aa  128  1e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1014  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.78 
 
 
336 aa  128  1e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.264982  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0458  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.32 
 
 
257 aa  128  1e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.706164 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4205  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.67 
 
 
264 aa  128  1e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.82 
 
 
267 aa  128  1e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.282255  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.84 
 
 
261 aa  128  1e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2590  short chain dehydrogenase  32.3 
 
 
291 aa  128  1e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3889  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.67 
 
 
264 aa  128  1e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.674087  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0983  short chain dehydrogenase  41.21 
 
 
277 aa  128  1e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.622863  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0736  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.89 
 
 
272 aa  128  1e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>