More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1659 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_3409  TonB-dependent receptor  58.67 
 
 		 698 aa  824    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.19526  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1930  TonB-dependent receptor  59.94 
 
 		 702 aa  848    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3276  TonB-dependent receptor  58.67 
 
 		 698 aa  824    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1659  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 714 aa  1448    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000365717  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0806  TonB-dependent receptor  48.08 
 
 		 743 aa  639    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3128  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  57.66 
 
 		 695 aa  825    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1357  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  57.5 
 
 		 696 aa  822    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0456407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0938  TonB-dependent receptor  58.67 
 
 		 698 aa  824    Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00410623  normal  0.440689 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0899  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  57.5 
 
 		 696 aa  822    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5052  TonB-dependent receptor  42.36 
 
 		 726 aa  520  1e-146  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0923716  normal  0.422268 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0988  TonB-dependent receptor plug  37.79 
 
 		 806 aa  454  1.0000000000000001e-126  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.124203 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0469  iron-regulated outer membrane virulence protein, TonB receptor CfrA  34.78 
 
 		 698 aa  407  1.0000000000000001e-112  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.442515  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1261  ferric receptor CfrA  34.11 
 
 		 702 aa  404  1e-111  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3636  TonB-dependent receptor  36.01 
 
 		 804 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000134979  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0847  ferric receptor CfrA  35.16 
 
 		 696 aa  397  1e-109  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1648  ferric receptor CfrA  33.89 
 
 		 696 aa  393  1e-108  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.1522  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0028  enterobactin receptor protein  36.33 
 
 		 652 aa  375  1e-102  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000507235  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0934  putative outer membrane receptor  35.78 
 
 		 655 aa  349  1e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2666  putative outer membrane receptor  35.02 
 
 		 665 aa  348  2e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2678  enterobactin receptor protein  34.17 
 
 		 653 aa  348  2e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1541  putative outer membrane receptor  35.02 
 
 		 665 aa  348  2e-94  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2748  putative outer membrane receptor  35.02 
 
 		 665 aa  348  2e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0784  TonB-dependent siderophore receptor, putative  34.12 
 
 		 656 aa  344  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002470  TonB-dependent receptor  34.33 
 
 		 652 aa  344  2.9999999999999997e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.337593  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4281  hypothetical protein  33.52 
 
 		 700 aa  340  4e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2046  TonB-dependent receptor  34.65 
 
 		 713 aa  340  4e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00183904 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3220  putative outer membrane receptor  34.07 
 
 		 665 aa  335  1e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190191 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4120  enterobactin receptor protein  32 
 
 		 666 aa  334  4e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000897059  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3929  enterobactin receptor protein  32.27 
 
 		 663 aa  333  9e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.881798 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4241  enterobactin receptor protein  31.72 
 
 		 666 aa  331  3e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112255  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0217  enterobactin receptor protein  31.54 
 
 		 666 aa  330  4e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000171736  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0219  enterobactin receptor protein  31.59 
 
 		 666 aa  330  7e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0246836  normal  0.0975103 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3795  TonB-dependent receptor  33.47 
 
 		 740 aa  326  7e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.837422  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4523  enterobactin receptor protein  31.66 
 
 		 663 aa  326  1e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  34.61 
 
 		 656 aa  324  3e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3503  enterobactin receptor protein  31.79 
 
 		 666 aa  324  4e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00217636  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  33.56 
 
 		 663 aa  314  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  33.56 
 
 		 663 aa  314  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  33.56 
 
 		 663 aa  314  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  33.47 
 
 		 663 aa  314  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  33.42 
 
 		 663 aa  313  6.999999999999999e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  33.42 
 
 		 663 aa  313  6.999999999999999e-84  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  32.61 
 
 		 650 aa  313  7.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  33.56 
 
 		 659 aa  312  1e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  32.61 
 
 		 650 aa  312  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  32.61 
 
 		 650 aa  311  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  32.61 
 
 		 650 aa  311  4e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.107934 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  33.88 
 
 		 641 aa  310  5.9999999999999995e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.010442 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  33.01 
 
 		 650 aa  310  8e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.198809 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3815  TonB-dependent receptor  32.51 
 
 		 658 aa  309  1.0000000000000001e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0471  TonB-dependent receptor, putative, degenerate  31.73 
 
 		 704 aa  309  1.0000000000000001e-82  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1493  putative TonB-dependent receptor  31.72 
 
 		 697 aa  305  2.0000000000000002e-81  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.404893  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3962  TonB-dependent receptor  33.94 
 
 		 698 aa  301  2e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1628  TonB-dependent receptor, plug  33.18 
 
 		 680 aa  301  4e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3294  TonB-dependent receptor, plug  31.64 
 
 		 676 aa  283  8.000000000000001e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3535  TonB-dependent receptor  32.64 
 
 		 681 aa  279  1e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.243459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3494  TonB-dependent receptor  32.41 
 
 		 715 aa  275  2.0000000000000002e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1803  ribosome-binding factor A  29.67 
 
 		 656 aa  275  3e-72  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4368  TonB-dependent receptor  30.73 
 
 		 799 aa  275  3e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4161  TonB-dependent receptor  30.56 
 
 		 799 aa  274  4.0000000000000004e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4233  TonB-dependent receptor  30.45 
 
 		 799 aa  271  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39650  putative TonB-dependent receptor  31.43 
 
 		 653 aa  271  4e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3364  putative TonB-dependent receptor  31.77 
 
 		 635 aa  269  1e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.346597  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1691  TonB-dependent receptor, plug  32.73 
 
 		 732 aa  266  1e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.524758  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01120  iron-regulated outer membrane virulence protein  31.73 
 
 		 572 aa  263  1e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3738  TonB-dependent receptor  32.82 
 
 		 665 aa  255  2.0000000000000002e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.430842  normal  0.0543439 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1631  TonB-dependent receptor, plug  30.33 
 
 		 739 aa  251  4e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.371565 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1513  TonB-dependent receptor  28.53 
 
 		 649 aa  243  1e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000309269  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0460  TonB-dependent receptor  29.93 
 
 		 648 aa  239  1e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0558  TonB-dependent receptor  29.64 
 
 		 657 aa  239  1e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01404  hypothetical protein  29.61 
 
 		 640 aa  230  7e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2423  TonB-dependent receptor  29.96 
 
 		 662 aa  227  6e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.075703  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1861  TonB-dependent receptor  29.59 
 
 		 653 aa  227  6e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0473101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1935  TonB-dependent receptor  29.96 
 
 		 662 aa  226  1e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00717608  normal  0.914131 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1826  TonB-dependent receptor  29.63 
 
 		 661 aa  226  1e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0922924  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2412  TonB-dependent receptor  29.81 
 
 		 662 aa  226  1e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.115111  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2531  TonB-dependent receptor  29.81 
 
 		 680 aa  225  2e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.276329 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1806  TonB-dependent receptor  29.42 
 
 		 649 aa  224  4e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2171  TonB-dependent receptor  29.12 
 
 		 649 aa  223  7e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0667  outer membrane receptor FepA  28.42 
 
 		 746 aa  200  6e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00550  iron-enterobactin outer membrane transporter  28.29 
 
 		 746 aa  199  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000104738  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3061  outer membrane receptor FepA  28.29 
 
 		 746 aa  199  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00912473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0633  outer membrane receptor FepA  28.29 
 
 		 746 aa  199  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00539  hypothetical protein  28.29 
 
 		 746 aa  199  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000136629  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0743  outer membrane receptor FepA  28.66 
 
 		 751 aa  199  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.100086  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3043  TonB-dependent siderophore receptor  28.17 
 
 		 746 aa  198  3e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0305175  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0681  outer membrane receptor FepA  28.39 
 
 		 751 aa  198  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.757968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0603  outer membrane receptor FepA  28.17 
 
 		 746 aa  198  3e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0485  outer membrane receptor FepA  28.42 
 
 		 746 aa  198  3e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0624  outer membrane receptor FepA  28.39 
 
 		 751 aa  197  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1716  outer membrane receptor FepA  29.3 
 
 		 746 aa  197  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0697  outer membrane receptor FepA  28.5 
 
 		 751 aa  197  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0602  outer membrane receptor FepA  28.04 
 
 		 746 aa  196  1e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0638  outer membrane receptor FepA  28.65 
 
 		 751 aa  196  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3430  outer membrane receptor FepA  28.57 
 
 		 759 aa  195  3e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101807 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3496  outer membrane receptor FepA  29.03 
 
 		 744 aa  194  4e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2242  outer membrane receptor FepA  28.77 
 
 		 744 aa  194  7e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.620188 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1116  outer membrane receptor FepA  29.43 
 
 		 750 aa  192  1e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1870  outer membrane receptor FepA  28.78 
 
 		 744 aa  188  3e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2686  TonB-dependent receptor plug  28.57 
 
 		 650 aa  186  1.0000000000000001e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.262602  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>