67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_71390 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_71390  hypothetical protein  100 
 
 
186 aa  350  8e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6196  hypothetical protein  96.77 
 
 
186 aa  336  9.999999999999999e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00883  hypothetical protein  47.95 
 
 
186 aa  142  3e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0347503  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7679  hypothetical protein  46.2 
 
 
185 aa  141  6e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3322  hypothetical protein  46.41 
 
 
208 aa  140  8e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.552455  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5301  hypothetical protein  46.11 
 
 
186 aa  138  4.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3375  protein of unknown function DUF308 membrane  48.26 
 
 
192 aa  136  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00523019  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0213  hypothetical protein  48.04 
 
 
179 aa  136  1e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0641  hypothetical protein  40.44 
 
 
182 aa  131  5e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.110827  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3980  hypothetical protein  46.24 
 
 
186 aa  128  4.0000000000000003e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5490  hypothetical protein  41.76 
 
 
191 aa  117  7e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1416  hypothetical protein  41.9 
 
 
219 aa  114  6e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.336817 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1255  hypothetical protein  41.9 
 
 
219 aa  114  6e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.390712 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1205  hypothetical protein  42.08 
 
 
208 aa  114  7.999999999999999e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.39038  normal  0.418544 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1963  hypothetical protein  41.71 
 
 
212 aa  114  7.999999999999999e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.153133 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1519  hypothetical protein  47.7 
 
 
194 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0311  hypothetical protein  40.8 
 
 
207 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.773139  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2447  hypothetical protein  40.12 
 
 
193 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.632564  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5913  hypothetical protein  40.35 
 
 
190 aa  112  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.897248  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3835  hypothetical protein  39.88 
 
 
190 aa  110  8.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6893  hypothetical protein  40.59 
 
 
191 aa  108  6e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.39706  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4409  hypothetical protein  41.01 
 
 
283 aa  105  4e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0410  hypothetical protein  41.18 
 
 
206 aa  102  4e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.144489  normal  0.754821 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2295  hypothetical protein  36.72 
 
 
207 aa  100  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.357303  normal  0.0308402 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2302  hypothetical protein  36.07 
 
 
203 aa  98.6  5e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36110  hypothetical protein  38.2 
 
 
254 aa  98.2  6e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.386443  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1163  hypothetical protein  35.45 
 
 
203 aa  98.2  7e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.242998  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3822  hypothetical protein  39.89 
 
 
183 aa  97.8  8e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.108994  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0620  hypothetical protein  35.45 
 
 
203 aa  97.4  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.286873 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3612  hypothetical protein  37.99 
 
 
220 aa  97.4  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.173241  hitchhiker  0.00194962 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7805  hypothetical protein  37.14 
 
 
204 aa  92.8  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0167986  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4468  hypothetical protein  42.54 
 
 
215 aa  92.8  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.075562  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5386  hypothetical protein  40.41 
 
 
207 aa  87  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4892  hypothetical protein  28.16 
 
 
194 aa  78.6  0.00000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4031  protein of unknown function DUF308 membrane  32.07 
 
 
196 aa  73.2  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2952  hypothetical protein  33.15 
 
 
192 aa  69.3  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0711734  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2206  hypothetical protein  31.62 
 
 
175 aa  63.2  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.224771  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0444  hypothetical protein  32.5 
 
 
184 aa  60.1  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2804  hypothetical protein  27.03 
 
 
190 aa  55.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.104063  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2298  hypothetical protein  26.4 
 
 
193 aa  55.8  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2504  hypothetical protein  30.91 
 
 
244 aa  54.7  0.0000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0379278  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1269  hypothetical protein  26.79 
 
 
185 aa  54.3  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.637458  normal  0.552236 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0763  hypothetical protein  26.16 
 
 
177 aa  52.4  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0552714  normal  0.074634 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0440  hypothetical protein  28.21 
 
 
180 aa  51.2  0.000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0507632  normal  0.460019 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1038  integral membrane protein  36.73 
 
 
196 aa  50.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.655647  normal  0.0177657 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2796  hypothetical protein  29.55 
 
 
196 aa  49.3  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.514284  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3035  protein of unknown function DUF308, membrane  29.87 
 
 
193 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.255317  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3051  protein of unknown function DUF308, membrane  29.87 
 
 
193 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.339087 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3094  protein of unknown function DUF308, membrane  29.87 
 
 
193 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.170004  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2508  hypothetical protein  28.81 
 
 
191 aa  48.9  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.305533 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0585  protein of unknown function DUF308 membrane  26.9 
 
 
228 aa  48.1  0.00007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0149  hypothetical protein  32 
 
 
185 aa  47.8  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.222637  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2831  protein of unknown function DUF308, membrane  26.92 
 
 
197 aa  47  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1195  hypothetical protein  32.06 
 
 
196 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0332  hypothetical protein  27.75 
 
 
177 aa  47  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1559  hypothetical protein  26.95 
 
 
183 aa  45.4  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0136598  normal  0.813664 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04730  hypothetical protein  27.27 
 
 
177 aa  45.1  0.0007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.184626  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0679  hypothetical protein  28.42 
 
 
198 aa  44.7  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.398543  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1061  hypothetical protein  30.14 
 
 
187 aa  43.9  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.521066  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7119  hypothetical protein  35.44 
 
 
196 aa  43.5  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1322  hypothetical protein  31.88 
 
 
187 aa  43.5  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1336  hypothetical protein  25 
 
 
196 aa  42.7  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.416394  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4019  hypothetical protein  25.95 
 
 
195 aa  42.7  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.886213  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0131  hypothetical protein  25.99 
 
 
186 aa  42.4  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.391144  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0999  hypothetical protein  29.66 
 
 
255 aa  42  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36250  hypothetical protein  27.92 
 
 
417 aa  41.6  0.006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.324604  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2336  hypothetical protein  37.5 
 
 
164 aa  41.2  0.009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>