17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1038 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_1038  integral membrane protein  100 
 
 
196 aa  376  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.655647  normal  0.0177657 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7119  hypothetical protein  32.95 
 
 
196 aa  89.4  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6693  hypothetical protein  40.12 
 
 
191 aa  89.4  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6458  hypothetical protein  40.12 
 
 
191 aa  89.4  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0252294  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0837  hypothetical protein  40.7 
 
 
210 aa  89  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.180181  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1377  hypothetical protein  37.64 
 
 
195 aa  79  0.00000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.848105 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5864  putative transmembrane protein  36.21 
 
 
192 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2373  hypothetical protein  39.89 
 
 
185 aa  71.6  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.569946  normal  0.17387 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1451  hypothetical protein  40.83 
 
 
192 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.327616 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3598  hypothetical protein  35.8 
 
 
186 aa  63.2  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0985  putative transmembrane protein  43.18 
 
 
102 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7129  integral membrane protein  34.78 
 
 
193 aa  60.1  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00415291  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6194  hypothetical protein  36.78 
 
 
193 aa  57  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.814966  normal  0.751646 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4366  hypothetical protein  41.76 
 
 
192 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4842  hypothetical protein  44.3 
 
 
192 aa  51.6  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71390  hypothetical protein  36.73 
 
 
186 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6196  hypothetical protein  34.67 
 
 
186 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>