More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3825 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_3825  Triose-phosphate isomerase  100 
 
 
256 aa  515  1e-145  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0712505  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1122  triosephosphate isomerase  57.83 
 
 
251 aa  295  5e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  2.74179e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1476  triosephosphate isomerase  54.88 
 
 
249 aa  282  4e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0794  triosephosphate isomerase  54.94 
 
 
252 aa  277  1e-73  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1509  triosephosphate isomerase  54.25 
 
 
248 aa  276  3e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1299  triosephosphate isomerase  54.25 
 
 
248 aa  276  3e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.734425  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1882  triosephosphate isomerase  54.66 
 
 
251 aa  273  2e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2338  triosephosphate isomerase  54.66 
 
 
251 aa  273  2e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  2.15074e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0264  triosephosphate isomerase  56 
 
 
249 aa  272  3e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2960  triosephosphate isomerase  53.23 
 
 
253 aa  270  1e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00129734  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2989  Triose-phosphate isomerase  55.69 
 
 
250 aa  269  4e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.292891  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2874  triosephosphate isomerase  52.23 
 
 
248 aa  268  6e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00316882  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0499  Triose-phosphate isomerase  51.97 
 
 
251 aa  265  4e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  51 
 
 
655 aa  265  6e-70  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1923  triosephosphate isomerase  54.66 
 
 
250 aa  265  7e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2059  triosephosphate isomerase  50.81 
 
 
251 aa  265  7e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  1.60979e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0927  triosephosphate isomerase  52.63 
 
 
250 aa  261  5e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.908857 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0151  Triose-phosphate isomerase  50 
 
 
252 aa  261  5e-69  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1333  triosephosphate isomerase  51.63 
 
 
252 aa  261  8e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.54673e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3135  triosephosphate isomerase  51.61 
 
 
253 aa  261  9e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1568  triosephosphate isomerase  51 
 
 
254 aa  261  1e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.384591  normal  0.243152 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0304  Triose-phosphate isomerase  54.25 
 
 
257 aa  260  1e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2544  triosephosphate isomerase  51.21 
 
 
250 aa  260  2e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0134  Triose-phosphate isomerase  51.01 
 
 
250 aa  259  3e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1618  triosephosphate isomerase  52.89 
 
 
251 aa  259  3e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000123397  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1308  triosephosphate isomerase  50.2 
 
 
248 aa  259  4e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3277  triosephosphate isomerase  52.63 
 
 
251 aa  259  4e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0241  Triose-phosphate isomerase  55.74 
 
 
243 aa  259  4e-68  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1464  triosephosphate isomerase  53.01 
 
 
250 aa  258  6e-68  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.11594  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1405  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  50.4 
 
 
650 aa  258  7e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00167236  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1615  triosephosphate isomerase  52.89 
 
 
255 aa  257  1e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0239  Triose-phosphate isomerase  55.32 
 
 
243 aa  257  1e-67  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1885  triosephosphate isomerase  53.52 
 
 
255 aa  256  2e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000744734  normal  0.534473 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2280  triosephosphate isomerase  52.78 
 
 
253 aa  256  3e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815023  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15810  Triose-phosphate isomerase  51.22 
 
 
250 aa  254  9e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.187277  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1133  triosephosphate isomerase  46.77 
 
 
249 aa  253  2e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2059  Triose-phosphate isomerase  52 
 
 
254 aa  253  2e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1779  triosephosphate isomerase  51.39 
 
 
251 aa  253  2e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.906694  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3680  triosephosphate isomerase  51.21 
 
 
251 aa  253  3e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  2.93066e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1852  triosephosphate isomerase  52.8 
 
 
249 aa  252  4e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10130  triosephosphate isomerase  51.98 
 
 
256 aa  251  5e-66  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.734824  hitchhiker  5.44988e-07 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0139  triosephosphate isomerase  52.05 
 
 
251 aa  251  8e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0241686  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1695  triosephosphate isomerase  52.23 
 
 
251 aa  251  1e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00252562  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4987  triosephosphate isomerase  50.81 
 
 
251 aa  251  1e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0363802  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1948  triosephosphate isomerase  49.6 
 
 
251 aa  251  1e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  5.40949e-14  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5366  triosephosphate isomerase  50.81 
 
 
251 aa  251  1e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000572833  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5240  triosephosphate isomerase  50.81 
 
 
251 aa  250  2e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0117313  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5222  triosephosphate isomerase  50.81 
 
 
251 aa  250  2e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5286  triosephosphate isomerase  50.81 
 
 
251 aa  250  2e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  2.548e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3935  triosephosphate isomerase  51.21 
 
 
251 aa  249  3e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00010757  normal  0.914781 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5701  triosephosphate isomerase  50.81 
 
 
251 aa  249  4e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  6.44486e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5251  triosephosphate isomerase  50.4 
 
 
251 aa  248  7e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00148512  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4826  triosephosphate isomerase  50.4 
 
 
251 aa  248  7e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000474663  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4816  triosephosphate isomerase  50.4 
 
 
251 aa  248  7e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1562  triosephosphate isomerase  52.8 
 
 
252 aa  248  9e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  6.11161e-06  hitchhiker  0.000778836 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3504  triosephosphate isomerase  47.98 
 
 
250 aa  247  1e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.449389  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4929  triosephosphate isomerase  50.81 
 
 
251 aa  248  1e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  8.63193e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13483  triosephosphate isomerase  45.16 
 
 
250 aa  247  1e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.943567  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3813  triosephosphate isomerase  49.8 
 
 
254 aa  246  2e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.491163 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0562  Triose-phosphate isomerase  50.2 
 
 
254 aa  246  2e-64  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.525761 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5608  triosephosphate isomerase  48.81 
 
 
254 aa  245  4e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07150  triosephosphate isomerase  50.6 
 
 
256 aa  246  4e-64  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0209504  normal  0.846197 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0991  triosephosphate isomerase  49.8 
 
 
254 aa  245  5e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0100  triosephosphate isomerase  47.98 
 
 
249 aa  245  6e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0497  triosephosphate isomerase  52.59 
 
 
252 aa  245  6e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2260  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  52.05 
 
 
646 aa  244  7e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0908  triosephosphate isomerase  49.61 
 
 
250 aa  244  8e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.842553  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1628  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  53.72 
 
 
654 aa  244  1e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00657054  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0623  triosephosphate isomerase  49 
 
 
251 aa  243  2e-63  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.524933 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0875  triosephosphate isomerase  48.81 
 
 
253 aa  243  3e-63  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  4.76682e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1532  triosephosphate isomerase  52.78 
 
 
253 aa  242  5e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.743336  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1264  Triose-phosphate isomerase  51.49 
 
 
240 aa  242  5e-63  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0815  triosephosphate isomerase  52.8 
 
 
253 aa  241  7e-63  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  2.44559e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2049  triosephosphate isomerase  49.8 
 
 
257 aa  241  8e-63  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0738  Triose-phosphate isomerase  49.79 
 
 
243 aa  240  1e-62  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  1.47069e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2065  triosephosphate isomerase  47.84 
 
 
270 aa  240  1e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2216  triosephosphate isomerase  52.21 
 
 
248 aa  239  2e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.596842 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1670  triosephosphate isomerase  50.99 
 
 
251 aa  239  2e-62  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.895843  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1550  triosephosphate isomerase  47.1 
 
 
261 aa  240  2e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0056  triosephosphate isomerase  49.4 
 
 
253 aa  240  2e-62  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0767  triosephosphate isomerase  49.39 
 
 
250 aa  239  3e-62  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0303972  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1893  triosephosphate isomerase  52.21 
 
 
248 aa  238  5e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0274896  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3869  triosephosphate isomerase  46.22 
 
 
253 aa  238  6e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15890  triosephosphate isomerase  48.82 
 
 
261 aa  238  7e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.388365  normal  0.839835 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1777  triosephosphate isomerase  47.64 
 
 
257 aa  238  7e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.464846  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0922  triosephosphate isomerase  49.41 
 
 
255 aa  237  1e-61  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.282683 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2335  triosephosphate isomerase  51.98 
 
 
253 aa  237  2e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.549293  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2423  triosephosphate isomerase  51.98 
 
 
253 aa  237  2e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00789739  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0763  triosephosphate isomerase  46.99 
 
 
252 aa  235  5e-61  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0077962  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3323  Triose-phosphate isomerase  49.6 
 
 
263 aa  235  5e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  9.45528e-05 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49910  triosephosphate isomerase  51.81 
 
 
246 aa  235  5e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.258147  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0925  triosephosphate isomerase  51.81 
 
 
245 aa  235  5e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0737109  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2199  triosephosphate isomerase  49.8 
 
 
250 aa  234  7e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.468925  normal  0.243836 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2064  triosephosphate isomerase  51.81 
 
 
248 aa  234  7e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0168982  normal  0.648241 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3268  triosephosphate isomerase  50 
 
 
257 aa  234  8e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0193189 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1356  triosephosphate isomerase  46.61 
 
 
246 aa  234  8e-61  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.688667  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0959  triosephosphate isomerase  50.4 
 
 
245 aa  234  8e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138148  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_649  triose-phosphate isomerase  46.43 
 
 
251 aa  234  1e-60  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1153  triosephosphate isomerase  48.21 
 
 
250 aa  233  2e-60  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0525  triosephosphate isomerase  46.99 
 
 
252 aa  233  2e-60  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>