139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2668 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_2668  GDSL family lipase  100 
 
 
424 aa  862    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1166  lipolytic protein G-D-S-L family  57.84 
 
 
447 aa  481  1e-135  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2125  GDSL family lipase  38.1 
 
 
261 aa  140  3e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.849583  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0718  putative platelet-activating factor acetylhydrolase IB gamma subunit  34.74 
 
 
255 aa  119  9e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.279585  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2563  lipolytic protein G-D-S-L family  36.71 
 
 
261 aa  99.4  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2497  exo-1,4-beta-glucosidase  29.61 
 
 
1072 aa  94.7  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2912  1-alkyl-2-acetylglycerophosphocholine esterase  32.49 
 
 
268 aa  94.4  3e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3728  lipolytic protein G-D-S-L family  33.01 
 
 
257 aa  93.6  6e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0881256  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3112  lipolytic enzyme, G-D-S-L  32.21 
 
 
287 aa  85.1  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0670  GDSL family lipase  27.85 
 
 
226 aa  82  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0355  hypothetical protein  27.78 
 
 
248 aa  79.3  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.352  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3780  lipolytic enzyme, G-D-S-L  29.74 
 
 
221 aa  76.6  0.0000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0125  lipolytic protein G-D-S-L family  28.31 
 
 
249 aa  75.9  0.000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.299252  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0578  lipolytic protein G-D-S-L family  33.52 
 
 
228 aa  74.7  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.695462  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4478  lipolytic enzyme, G-D-S-L  28.16 
 
 
265 aa  73.9  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.301699 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3012  lipolytic protein  28.74 
 
 
383 aa  72.8  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5066  lipolytic protein G-D-S-L family  24.28 
 
 
217 aa  72.4  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0170642  normal  0.012377 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1746  GDSL family lipase  29.44 
 
 
238 aa  71.2  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.761874 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2193  lipolytic protein G-D-S-L family  27.04 
 
 
252 aa  70.1  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.689608  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2134  GDSL family lipase  29.72 
 
 
248 aa  69.7  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.306238  normal  0.090181 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2205  G-D-S-L family lipolytic protein  31.58 
 
 
372 aa  68.6  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0392417  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1258  G-D-S-L family lipolytic protein  29.27 
 
 
274 aa  68.6  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2682  lipolytic protein G-D-S-L family  26.87 
 
 
593 aa  68.9  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.825886 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0344  lipolytic protein G-D-S-L family  29.63 
 
 
243 aa  67.8  0.0000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00761179  normal  0.124029 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1951  GDSL family lipase  28.24 
 
 
268 aa  67.4  0.0000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00720297 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01237  acetylhydrolase  32.11 
 
 
479 aa  67.4  0.0000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.507757  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2957  lipolytic protein  28.95 
 
 
275 aa  66.2  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.903412  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1716  lipolytic protein  31.11 
 
 
194 aa  65.1  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000204836  normal  0.492944 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2123  GDSL family lipase  28.25 
 
 
216 aa  65.9  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2921  cyclic nucleotide-binding protein  25.14 
 
 
871 aa  63.9  0.000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0046  protein of unknown function DUF1080  25.78 
 
 
451 aa  63.9  0.000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1544  lipolytic protein G-D-S-L family  26.79 
 
 
260 aa  63.9  0.000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.158238  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44063  predicted protein  30.93 
 
 
348 aa  63.9  0.000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.213778  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2205  lipolytic protein G-D-S-L family  31.5 
 
 
241 aa  63.2  0.000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0428962 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3977  lipolytic protein G-D-S-L family  29.03 
 
 
593 aa  63.2  0.000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.410599  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1546  lipolytic protein G-D-S-L family  25 
 
 
262 aa  62.8  0.00000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.563827  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2175  lipolytic protein G-D-S-L family  25.71 
 
 
249 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.045511 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3119  lipolytic protein G-D-S-L family  24.08 
 
 
227 aa  61.6  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0965245  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1104  platelet activating factor, putative  27.03 
 
 
204 aa  61.6  0.00000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1022  lipolytic protein G-D-S-L family  24.41 
 
 
321 aa  59.3  0.0000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2575  lipolytic protein G-D-S-L family  26.82 
 
 
280 aa  59.3  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0022  lipolytic protein G-D-S-L family  26.83 
 
 
236 aa  58.5  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.954295 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0654  lipolytic protein G-D-S-L family  26.29 
 
 
233 aa  58.2  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.428767  normal  0.946493 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3371  GDSL family lipase  26.34 
 
 
648 aa  57.8  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.754827  normal  0.777259 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0772  GDSL family lipase  27.57 
 
 
201 aa  57  0.0000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2112  lipolytic protein G-D-S-L family  27.57 
 
 
218 aa  57  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.835545 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1526  GDSL family lipase  29.17 
 
 
206 aa  57  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0224358  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4475  lipolytic protein G-D-S-L family  28.36 
 
 
218 aa  57  0.0000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0721  hypothetical protein  28.19 
 
 
249 aa  56.2  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_40919  predicted protein  27.14 
 
 
422 aa  55.8  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1357  lipolytic protein G-D-S-L family  25.58 
 
 
257 aa  55.5  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0467272  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4894  hypothetical protein  24 
 
 
231 aa  54.7  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.323139 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1162  lipolytic enzyme, G-D-S-L  27.98 
 
 
183 aa  54.3  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.232056  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0430  acyl-CoA thioesterase I  29.19 
 
 
189 aa  54.3  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000157795  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0219  hypothetical protein  26.47 
 
 
197 aa  53.1  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0736207  normal  0.977558 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4982  lipolytic enzyme, G-D-S-L  30.48 
 
 
186 aa  53.1  0.000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00107469 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3994  GDSL family lipase  28.42 
 
 
216 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0481069  normal  0.616956 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2847  GDSL family lipase  30 
 
 
230 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0175808  normal  0.606951 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4335  hypothetical protein  24.72 
 
 
230 aa  51.6  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.400802 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1045  hypothetical protein  26.8 
 
 
152 aa  52.4  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.517401  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0817  lipolytic protein G-D-S-L family  28.06 
 
 
331 aa  52  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00788434 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2115  lipolytic protein G-D-S-L family  25.47 
 
 
329 aa  52  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0686  acyl-CoA thioesterase I precursor  26.07 
 
 
206 aa  51.2  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.354369 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04655  hypothetical protein  32.32 
 
 
167 aa  51.2  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.157636  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2606  lipolytic protein G-D-S-L family  34.72 
 
 
457 aa  51.6  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00170788  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2111  lipolytic protein G-D-S-L family  27.62 
 
 
223 aa  51.2  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0446  lipolytic protein G-D-S-L family  23.6 
 
 
243 aa  50.8  0.00004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3828  GDSL family lipase  25.13 
 
 
375 aa  51.2  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0958  protein of unknown function DUF1080  26.49 
 
 
212 aa  51.2  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2107  lipolytic protein G-D-S-L family  28.1 
 
 
223 aa  51.2  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2618  Carbohydrate binding family 6  28.68 
 
 
522 aa  51.2  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0533616 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4695  GDSL family lipase  27.84 
 
 
232 aa  50.8  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.609852  normal  0.580603 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2692  lipolytic protein G-D-S-L family  27.6 
 
 
217 aa  50.4  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2149  putative lipase  28.57 
 
 
203 aa  50.4  0.00006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.208079 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0057  lipolytic protein G-D-S-L family  25.4 
 
 
212 aa  49.3  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2141  GDSL family lipase  39.73 
 
 
189 aa  49.3  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.953926  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5471  GDSL family lipase  28.11 
 
 
257 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.750957  normal  0.0594421 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0019  putative acetylhydrolase  27.31 
 
 
262 aa  49.3  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.211042 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4363  lipolytic protein G-D-S-L family  27.13 
 
 
216 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.837785  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0405  Carbohydrate binding family 6  25 
 
 
749 aa  49.3  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.85643 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5725  protein of unknown function DUF1080  21.93 
 
 
198 aa  48.5  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0208334 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2269  GDSL family lipase  27.43 
 
 
235 aa  48.9  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.544779  normal  0.0100927 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2990  cellulose-binding family II protein  27.46 
 
 
366 aa  48.1  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.826139  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0097  GDSL family lipase  28.35 
 
 
239 aa  47.8  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.221693  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0443  GDSL family lipase  38.1 
 
 
213 aa  47.8  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.665716  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0308  GDSL family lipase  25.52 
 
 
207 aa  47.8  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.449597  normal  0.278541 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0043  GDSL family lipase  25.53 
 
 
202 aa  47.8  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000938694  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2959  arylesterase  30.36 
 
 
202 aa  47.4  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0714479 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2310  GDSL family lipase  30.09 
 
 
307 aa  47.8  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1014  GDSL family lipase  28.49 
 
 
255 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.271835  normal  0.127972 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1776  lipolytic protein G-D-S-L family  27.03 
 
 
240 aa  47  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0711  lipolytic protein G-D-S-L family  29.57 
 
 
241 aa  47  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0078  Carbohydrate binding family 6  25.83 
 
 
1234 aa  47  0.0007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.511687 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0520  GDSL family lipase  26.7 
 
 
212 aa  46.6  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0143  lipolytic protein G-D-S-L family  26.2 
 
 
305 aa  46.6  0.0008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3650  lipolytic protein  25.91 
 
 
201 aa  46.6  0.0009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1648  hypothetical protein  27.56 
 
 
193 aa  46.2  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.761562  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0074  GDSL family lipase  28.72 
 
 
234 aa  45.8  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0776828 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47870  predicted protein  21.64 
 
 
402 aa  46.2  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.504417  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1829  esterase  37.5 
 
 
188 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0305538  normal  0.13667 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>