135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_1908 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_1908  hypothetical protein  100 
 
 
212 aa  427  1e-119  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.807781  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1284  hypothetical protein  89.62 
 
 
212 aa  380  1e-105  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.40204  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1247  hypothetical protein  89.15 
 
 
212 aa  379  1e-104  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.274349  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2527  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  32.47 
 
 
206 aa  87.8  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.442194 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1282  putative outer membrane protein  33.52 
 
 
207 aa  87  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.494917  normal  0.183567 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1363  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  32.82 
 
 
207 aa  85.9  4e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.76499  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1178  outer membrane protein  34.87 
 
 
207 aa  85.5  5e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.557551  normal  0.0838188 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3147  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  32.47 
 
 
206 aa  82.8  3e-15  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0657581  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5652  porin  35.75 
 
 
207 aa  79  5e-14  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.303382  normal  0.313957 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0900  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  31.84 
 
 
207 aa  75.1  8e-13  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.801875  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0701  outer-membrane protein Omp25  25.82 
 
 
213 aa  74.3  1e-12  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1622  outer membrane protein Omp31  26.69 
 
 
261 aa  73.9  2e-12  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1561  outer membrane protein  31.76 
 
 
212 aa  71.2  1e-11  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0096  outer membrane protein, 31 kDa  31.25 
 
 
237 aa  70.9  1e-11  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2587  porin  25.35 
 
 
213 aa  71.2  1e-11  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1729  putative outer membrane protein precursor  28.89 
 
 
206 aa  70.5  2e-11  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.259515 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4378  putative outer-membrane protein, putative secreted protein  31.38 
 
 
212 aa  70.5  2e-11  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.71482  normal  0.0231919 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1234  porin  30.6 
 
 
211 aa  68.9  5e-11  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.248035  hitchhiker  1.66827e-05 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0784  porin  29.49 
 
 
212 aa  68.9  5e-11  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.275504  normal  0.0786165 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0423  outer membrane protein, 31 kDa  29.03 
 
 
240 aa  68.9  5e-11  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.91759  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0889  porin  29.27 
 
 
254 aa  67.8  1e-10  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.115506 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0115  putative outer membrane protein  28.26 
 
 
230 aa  67.8  1e-10  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0118  outer membrane protein, putative  28.26 
 
 
230 aa  67.8  1e-10  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.350872  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0366  outer membrane protein Omp31  28.23 
 
 
240 aa  67.8  1e-10  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.658451  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0188  outer membrane protein  30.84 
 
 
453 aa  67  2e-10  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0566764  normal  0.419379 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0419  porin  31.31 
 
 
225 aa  67  2e-10  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.647021 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3853  porin  30.7 
 
 
240 aa  66.2  4e-10  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0932  hypothetical protein  30.23 
 
 
205 aa  66.2  4e-10  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.544275  normal  0.834774 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1088  porin  28.89 
 
 
211 aa  65.1  7e-10  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  4.0892e-05 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0748  putative outer membrane protein  30.51 
 
 
447 aa  65.1  7e-10  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.272117 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3103  OmpA-like transmembrane region  32.3 
 
 
236 aa  64.3  1e-09  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.309907  normal  0.21357 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0890  porin  28.08 
 
 
255 aa  64.7  1e-09  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113086 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0692  outer-membrane protein Omp25  24.88 
 
 
201 aa  63.9  2e-09  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3234  putative outer membrane protein  27.93 
 
 
237 aa  63.5  2e-09  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3142  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  30.54 
 
 
240 aa  63.5  2e-09  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4523  putative outer-membrane protein precursor  29.46 
 
 
237 aa  63.9  2e-09  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0819  porin  29.3 
 
 
204 aa  62  6e-09  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0719605  normal  0.506038 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0072  outer membrane immunogenic protein  27.16 
 
 
225 aa  62.4  6e-09  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  4.17135e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3083  putative outer membrane protein  30.77 
 
 
203 aa  61.6  7e-09  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.186031 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1567  putative outer-membrane protein precursor  32.16 
 
 
258 aa  61.2  1e-08  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.109724  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1699  hypothetical protein  29.14 
 
 
198 aa  60.5  2e-08  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.013391  normal  0.0555253 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0239  putative outer membrane protein  29.69 
 
 
452 aa  60.5  2e-08  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2756  putative outer membrane protein  30.29 
 
 
241 aa  60.5  2e-08  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1238  outer membrane protein, 31 kDa  31.33 
 
 
234 aa  60.8  2e-08  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1941  outer membrane protein  27.69 
 
 
254 aa  59.3  4e-08  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0132  porin  27.04 
 
 
229 aa  58.9  5e-08  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0873  porin  27.32 
 
 
449 aa  58.9  5e-08  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0140955  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0108  porin  26.97 
 
 
244 aa  58.9  6e-08  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.243352  normal  0.0665959 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7453  OmpA-like transmembrane domain-containing protein  31.44 
 
 
710 aa  58.5  7e-08  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0722321  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0133  porin  26.37 
 
 
229 aa  57.8  1e-07  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.679493  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0795  putative outer membrane protein  31.07 
 
 
454 aa  57.8  1e-07  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.755835 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2080  putative outer-membrane protein precursor  33.92 
 
 
251 aa  57.8  1e-07  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.366829  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4375  putative outer-membrane protein  32.7 
 
 
251 aa  57.8  1e-07  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.434769  normal  0.0632497 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2815  outer membrane insertion C-terminal signal  31.34 
 
 
997 aa  57.8  1e-07  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.71405  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2199  putative outer membrane protein  28.21 
 
 
237 aa  57.8  1e-07  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_004310  BR0971  outer membrane protein, putative  29.61 
 
 
236 aa  57  2e-07  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2343  porin  27.81 
 
 
207 aa  56.6  3e-07  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0733  outer membrane protein  31.28 
 
 
209 aa  56.2  4e-07  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.130321  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2780  hypothetical protein  28.03 
 
 
570 aa  55.8  4e-07  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.531202  normal  0.746954 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4615  outer membrane protein  28.3 
 
 
449 aa  55.8  4e-07  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2714  outer membrane protein  30.1 
 
 
243 aa  55.8  5e-07  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.155382  normal  0.61221 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7486  OmpA domain-containing protein  29.35 
 
 
662 aa  55.5  6e-07  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.661615  normal  0.200783 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3614  putative outer membrane protein  32.38 
 
 
235 aa  55.5  6e-07  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4826  OmpA-like transmembrane region  30.77 
 
 
251 aa  54.7  9e-07  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.997688  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2342  porin  29.35 
 
 
232 aa  54.7  1e-06  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0423  carbohydrate-selective porin OprB  28.93 
 
 
692 aa  54.7  1e-06  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4377  putative outer-membrane protein  28.44 
 
 
245 aa  54.3  1e-06  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.222597  normal  0.062323 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5167  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  28.99 
 
 
236 aa  54.7  1e-06  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165594  normal  0.271837 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0244  outer membrane protein  31.11 
 
 
241 aa  53.5  2e-06  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0888  porin  27.46 
 
 
239 aa  53.9  2e-06  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0164958 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7274  hypothetical protein  32.46 
 
 
693 aa  53.1  3e-06  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2567  hypothetical protein  26.4 
 
 
234 aa  53.1  3e-06  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2756  putative outer membrane protein  26.5 
 
 
247 aa  53.1  3e-06  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0841875  normal  0.703235 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4312  porin  26.47 
 
 
228 aa  52.4  5e-06  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2763  putative outer-membrane protein precursor  30.98 
 
 
251 aa  52.4  5e-06  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.285911 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3232  OmpA domain-containing protein  26.21 
 
 
230 aa  52.4  6e-06  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  2.09958e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3155  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  27.78 
 
 
246 aa  52  7e-06  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0119  outer membrane protein, putative  24.5 
 
 
228 aa  52  7e-06  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.109473  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0116  putative outer membrane protein  25.5 
 
 
228 aa  51.6  9e-06  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2467  porin  27.27 
 
 
250 aa  51.6  9e-06  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0722012 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4374  putative outer-membrane protein  27.85 
 
 
248 aa  50.8  1e-05  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0950016 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2146  porin  26.96 
 
 
255 aa  51.2  1e-05  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.368485 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2294  porin  27.72 
 
 
250 aa  51.2  1e-05  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1552  OmpA-like transmembrane domain-containing protein  26.67 
 
 
598 aa  50.8  2e-05  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0187168  normal  0.160619 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2468  porin  26.87 
 
 
248 aa  50.4  2e-05  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.750857  normal  0.029017 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2735  hypothetical protein  27.27 
 
 
570 aa  50.1  3e-05  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3175  hypothetical protein  26.04 
 
 
566 aa  49.7  3e-05  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.424838  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0841  putative outer membrane protein  31.37 
 
 
242 aa  49.7  3e-05  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.227029 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2145  outer membrane protein  29.34 
 
 
274 aa  49.7  3e-05  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.225218  normal  0.619069 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2469  porin  29.07 
 
 
258 aa  49.7  3e-05  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.583463  decreased coverage  0.00325147 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0415  outer membrane protein  28.74 
 
 
255 aa  50.1  3e-05  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4249  Carbohydrate-selective porin OprB  33.02 
 
 
670 aa  50.1  3e-05  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3564  carbohydrate-selective porin OprB  26.39 
 
 
724 aa  49.3  5e-05  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1454  hypothetical protein  29.57 
 
 
665 aa  48.5  6e-05  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.236827  normal 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7000  hypothetical protein  28 
 
 
583 aa  48.5  7e-05  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  1.22606e-07  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3299  porin  29.61 
 
 
287 aa  48.5  7e-05  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.466189  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1666  OmpA-like transmembrane region  29.52 
 
 
238 aa  47.4  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.316651  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6124  porin  31.25 
 
 
288 aa  47  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3005  porin  26.91 
 
 
290 aa  47  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7235  putative outer membrane protein  25.13 
 
 
193 aa  46.6  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.791611  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>