More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_0823 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009667  Oant_0823  Asp/Glu racemase  100 
 
 		 278 aa  562  1.0000000000000001e-159  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0060  glutamate racemase  33.8 
 
 		 251 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1240  glutamate racemase  34.6 
 
 		 282 aa  115  8.999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4214  glutamate racemase  28.52 
 
 		 254 aa  107  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1755  glutamate racemase  30.95 
 
 		 266 aa  103  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000954192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0518  glutamate racemase  33.02 
 
 		 276 aa  99  8e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000716913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3675  glutamate racemase  26.54 
 
 		 258 aa  97.8  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00345939  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0275  glutamate racemase  31.13 
 
 		 278 aa  97.4  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.147503  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1797  glutamate racemase  29.6 
 
 		 278 aa  96.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0588  glutamate racemase  30.28 
 
 		 281 aa  96.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1411  glutamate racemase  30.33 
 
 		 272 aa  95.9  6e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.093968  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0603  glutamate racemase  30.28 
 
 		 281 aa  95.9  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3790  glutamate racemase  29.68 
 
 		 270 aa  95.5  8e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0490998  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3204  glutamate racemase  31.03 
 
 		 267 aa  95.5  8e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.685477  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1257  glutamate racemase  28.87 
 
 		 256 aa  95.1  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.402225  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1403  glutamate racemase  28 
 
 		 271 aa  94.7  1e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.011176  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0590  glutamate racemase  26.46 
 
 		 253 aa  95.1  1e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.348712  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0541  glutamate racemase  27.1 
 
 		 267 aa  94.7  2e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000256058  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2249  glutamate racemase  27.62 
 
 		 333 aa  93.6  4e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.062681  normal  0.257999 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1063  glutamate racemase  30.2 
 
 		 263 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41440  glutamate racemase  31.68 
 
 		 263 aa  93.2  5e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.420201  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0161  glutamate racemase  29.22 
 
 		 270 aa  93.2  5e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0534068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1848  glutamate racemase  29.82 
 
 		 281 aa  92.4  7e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000532867  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0764  glutamate racemase  31.73 
 
 		 265 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0479  glutamate racemase  28.38 
 
 		 265 aa  91.7  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.553791  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2724  glutamate racemase  28.84 
 
 		 266 aa  92  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0260  glutamate racemase  31.6 
 
 		 278 aa  91.7  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00172375 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0624  glutamate racemase  29.65 
 
 		 270 aa  92  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000306047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2085  glutamate racemase  31.47 
 
 		 271 aa  91.7  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0848  glutamate racemase  30.69 
 
 		 264 aa  91.7  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0487  glutamate racemase  30.52 
 
 		 288 aa  91.7  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4589  glutamate racemase  30.05 
 
 		 269 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.547606  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4623  glutamate racemase  30.05 
 
 		 269 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000438915  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4379  glutamate racemase  30.05 
 
 		 269 aa  91.3  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.119134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4220  glutamate racemase  30.05 
 
 		 269 aa  91.3  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.328787  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4603  glutamate racemase  30.05 
 
 		 269 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.171271  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4717  glutamate racemase  30.05 
 
 		 269 aa  91.3  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000252581  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0632  glutamate racemase  30.05 
 
 		 269 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000756048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0987  glutamate racemase  27.71 
 
 		 260 aa  90.9  2e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.507565  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1295  glutamate racemase  28.96 
 
 		 276 aa  91.3  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0764463 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4573  glutamate racemase  30.05 
 
 		 269 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1140  glutamate racemase  27.6 
 
 		 268 aa  90.5  3e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4328  glutamate racemase  29.56 
 
 		 267 aa  90.1  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0754  glutamate racemase  27.05 
 
 		 268 aa  90.5  3e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3247  glutamate racemase  28.79 
 
 		 266 aa  90.5  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0073  glutamate racemase  31.63 
 
 		 286 aa  89.7  4e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1467  glutamate racemase  28.44 
 
 		 292 aa  90.1  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0107271  normal  0.23474 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2103  glutamate racemase  31.12 
 
 		 282 aa  89.7  5e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.447396  normal  0.629875 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0777  glutamate racemase  31.68 
 
 		 265 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4236  glutamate racemase  29.56 
 
 		 269 aa  89  7e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4453  glutamate racemase  29.7 
 
 		 265 aa  89.4  7e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1521  glutamate racemase  32.66 
 
 		 272 aa  89  7e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00432739  normal  0.0343831 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1508  glutamate racemase  31.31 
 
 		 273 aa  89  8e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1687  glutamate racemase  25.12 
 
 		 259 aa  88.6  9e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0736  glutamate racemase  29.7 
 
 		 265 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1276  glutamate racemase  26.36 
 
 		 295 aa  88.6  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2038  glutamate racemase  28.04 
 
 		 267 aa  88.2  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00710975  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2602  glutamate racemase  27.14 
 
 		 264 aa  88.2  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0860  glutamate racemase  28.57 
 
 		 284 aa  88.6  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000213664  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0449  glutamate racemase  29.23 
 
 		 267 aa  88.6  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0609  glutamate racemase  28.86 
 
 		 291 aa  88.6  1e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.765975  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0664  glutamate racemase  29.66 
 
 		 259 aa  87.8  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1752  glutamate racemase  31.82 
 
 		 276 aa  87.8  2e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4404  glutamate racemase  28.36 
 
 		 295 aa  87.8  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2884  glutamate racemase  26.63 
 
 		 272 aa  87.4  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.297231 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0638  glutamate racemase  21.78 
 
 		 256 aa  87.8  2e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0278  glutamate racemase  28.28 
 
 		 264 aa  87  3e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.424849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2265  glutamate racemase  30.53 
 
 		 288 aa  87  3e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4709  glutamate racemase  29.74 
 
 		 266 aa  87  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000583223  normal  0.0898893 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0538  glutamate racemase  32.31 
 
 		 261 aa  86.7  4e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000109629  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1779  glutamate racemase  29.69 
 
 		 280 aa  86.3  5e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.63205 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2517  glutamate racemase  27.57 
 
 		 269 aa  86.3  5e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2361  glutamate racemase  26.07 
 
 		 289 aa  86.3  5e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.566119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0698  glutamate racemase  31.22 
 
 		 259 aa  85.9  6e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0699  glutamate racemase  31.22 
 
 		 259 aa  85.9  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1276  glutamate racemase  29 
 
 		 271 aa  85.9  7e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.696646  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4745  glutamate racemase  30.24 
 
 		 263 aa  85.9  7e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.13389  normal  0.141854 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1954  glutamate racemase  27.32 
 
 		 330 aa  85.5  9e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.998132 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0547  glutamate racemase  29.72 
 
 		 276 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.77942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2832  glutamate racemase  28.86 
 
 		 275 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0609148  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1992  glutamate racemase  23.32 
 
 		 266 aa  84  0.000000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1956  glutamate racemase  29.44 
 
 		 277 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.201101  normal  0.864089 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1112  glutamate racemase  26.24 
 
 		 275 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2274  glutamate racemase  29.17 
 
 		 270 aa  83.6  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0643046  hitchhiker  0.00406767 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5384  glutamate racemase  28.24 
 
 		 265 aa  84  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.571769  normal  0.572623 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0126  glutamate racemase  28.87 
 
 		 259 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000000153552  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2377  glutamate racemase  31.25 
 
 		 280 aa  84  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.629157  normal  0.65613 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0952  glutamate racemase  25.74 
 
 		 271 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.44485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2251  glutamate racemase  29.52 
 
 		 290 aa  83.6  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0194593  normal  0.0243965 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4337  glutamate racemase  30.61 
 
 		 282 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000357145  hitchhiker  0.00000147212 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2156  glutamate racemase  27.23 
 
 		 275 aa  83.2  0.000000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.185114  normal  0.250573 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2509  glutamate racemase  28.64 
 
 		 291 aa  82.4  0.000000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.194908 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0302  glutamate racemase  26.63 
 
 		 271 aa  82.4  0.000000000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0194  glutamate racemase  27.83 
 
 		 266 aa  82.4  0.000000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000010481  normal  0.0134241 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04380  Glutamate racemase  24.64 
 
 		 263 aa  82.4  0.000000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1955  glutamate racemase  29.19 
 
 		 303 aa  82.4  0.000000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00243974  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2923  glutamate racemase  29.25 
 
 		 272 aa  82  0.000000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1296  glutamate racemase  25 
 
 		 259 aa  82  0.000000000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0179  glutamate racemase  27.44 
 
 		 272 aa  82  0.000000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000377093  normal  0.781333 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3509  glutamate racemase  27.12 
 
 		 268 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00151792  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>