More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_40690 on replicon NC_009369
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009369  OSTLU_40690  Plastid ribosomal protein L4 large ribosomal subunit  100 
 
 		 251 aa  504  9.999999999999999e-143  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0251  50S ribosomal protein L4  46.53 
 
 		 211 aa  195  6e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0248  50S ribosomal protein L4  46.53 
 
 		 211 aa  195  6e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.890563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16771  50S ribosomal protein L4  45.45 
 
 		 211 aa  195  7e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3011  50S ribosomal protein L4  46.63 
 
 		 212 aa  195  7e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00787083 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1293  50S ribosomal protein L4  48.76 
 
 		 210 aa  193  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000205733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0375  50S ribosomal protein L4  46.31 
 
 		 211 aa  192  3e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2560  50S ribosomal protein L4/L1e  47.5 
 
 		 210 aa  192  3e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0559575  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2231  50S ribosomal protein L4  47.12 
 
 		 210 aa  192  3e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.402946 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17641  50S ribosomal protein L4  46.34 
 
 		 210 aa  192  4e-48  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23031  50S ribosomal protein L4  44.83 
 
 		 211 aa  192  4e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1649  50S ribosomal protein L4  46.83 
 
 		 210 aa  192  5e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0692  50S ribosomal protein L4  48.5 
 
 		 210 aa  191  8e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000477042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17481  50S ribosomal protein L4  45.85 
 
 		 210 aa  191  1e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.533381  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3704  50S ribosomal protein L4  48.02 
 
 		 210 aa  190  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1956  50S ribosomal protein L4  44.83 
 
 		 211 aa  189  4e-47  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17391  50S ribosomal protein L4  45.37 
 
 		 210 aa  188  7e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20021  50S ribosomal protein L4  42.44 
 
 		 212 aa  183  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1128  50S ribosomal protein L4  41.95 
 
 		 211 aa  181  9.000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2398  50S ribosomal protein L4  41.71 
 
 		 204 aa  146  3e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000730975  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2713  50S ribosomal protein L4  41.21 
 
 		 204 aa  144  9e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3666  50S ribosomal protein L4  44.62 
 
 		 206 aa  142  7e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000305367  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0423  50S ribosomal protein L4  45.93 
 
 		 207 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000203712  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0226  ribosomal protein L4/L1e  42.46 
 
 		 207 aa  140  1.9999999999999998e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2332  ribosomal protein L4/L1e  43.09 
 
 		 207 aa  140  1.9999999999999998e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000847375  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0195  LSU ribosomal protein L4P  39.3 
 
 		 207 aa  140  1.9999999999999998e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00135777  normal  0.0747506 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1573  ribosomal protein L4/L1e  39.71 
 
 		 207 aa  139  3.9999999999999997e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000791532  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0216  50S ribosomal protein L4  44.69 
 
 		 206 aa  138  7e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000320704  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1183  ribosomal protein L4/L1e  41.35 
 
 		 208 aa  135  9e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000599505  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0596  50S ribosomal protein L4P  39.11 
 
 		 207 aa  134  9.999999999999999e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000475036  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0112  50S ribosomal protein L4  41.3 
 
 		 207 aa  132  6e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000123482  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1523  ribosomal protein L4/L1e  42.22 
 
 		 207 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.790483  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0868  50S ribosomal protein L4  41.34 
 
 		 206 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000685593  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0848  50S ribosomal protein L4P  43.4 
 
 		 207 aa  130  2.0000000000000002e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000392239  decreased coverage  0.0000122182 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0111  50S ribosomal protein L4  41.99 
 
 		 207 aa  130  3e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000572324  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0111  50S ribosomal protein L4  41.99 
 
 		 207 aa  130  3e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000900585  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0107  50S ribosomal protein L4  41.99 
 
 		 207 aa  130  3e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.56557e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0105  50S ribosomal protein L4  41.99 
 
 		 207 aa  130  3e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000256275  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0106  50S ribosomal protein L4  41.9 
 
 		 207 aa  130  3e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000544936  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0111  50S ribosomal protein L4  41.99 
 
 		 207 aa  130  3e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000163463  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0123  50S ribosomal protein L4  41.99 
 
 		 207 aa  130  3e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.21989e-61 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0132  50S ribosomal protein L4  41.99 
 
 		 207 aa  130  3e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000136863  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0142  50S ribosomal protein L4  41.99 
 
 		 207 aa  130  3e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000690155  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5194  50S ribosomal protein L4  41.99 
 
 		 207 aa  130  3e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000834057  unclonable  1.98377e-25 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0197  50S ribosomal protein L4  39.8 
 
 		 207 aa  129  6e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00203095  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0225  ribosomal protein L4/L1e  40.51 
 
 		 210 aa  128  7.000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0108  50S ribosomal protein L4  41.3 
 
 		 207 aa  128  7.000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2276  50S ribosomal protein L4  38.1 
 
 		 207 aa  128  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000009811  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2459  50S ribosomal protein L4P  38.5 
 
 		 207 aa  127  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0863955 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2317  50S ribosomal protein L4  38.1 
 
 		 207 aa  128  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000134967  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0681  50S ribosomal protein L4  38.67 
 
 		 207 aa  126  3e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.486374  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0193  ribosomal protein L4/L1e  36.49 
 
 		 214 aa  125  7e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3023  ribosomal protein L4/L1e  39.34 
 
 		 222 aa  125  8.000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.443321  normal  0.0189884 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1341  ribosomal protein L4/L1e  41.01 
 
 		 210 aa  124  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0105  50S ribosomal protein L4  40.78 
 
 		 207 aa  124  1e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000104823  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0789  50S ribosomal protein L4  33.78 
 
 		 221 aa  124  1e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1347  50S ribosomal protein L4  38.55 
 
 		 206 aa  123  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2904  50S ribosomal protein L4  38.16 
 
 		 208 aa  123  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000879055  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1830  50S ribosomal protein L4  38.81 
 
 		 207 aa  123  3e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0478396  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2228  50S ribosomal protein L4  39.04 
 
 		 208 aa  123  3e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000169782  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2064  50S ribosomal protein L4  36.92 
 
 		 206 aa  123  4e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000000384651  normal  0.231159 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1744  50S ribosomal protein L4  39.66 
 
 		 208 aa  122  5e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000318286  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1850  50S ribosomal protein L4  39.46 
 
 		 208 aa  122  6e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.264817  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0287  50S ribosomal protein L4  39.13 
 
 		 206 aa  121  8e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0371511  hitchhiker  0.00627174 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0759  50S ribosomal protein L4  40.76 
 
 		 207 aa  121  9e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000566858  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3327  50S ribosomal protein L4  36.14 
 
 		 207 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.78315e-16 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0934  50S ribosomal protein L4  36.14 
 
 		 207 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000521211  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4916  ribosomal protein L4/L1e  36.97 
 
 		 209 aa  120  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.1186  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5786  ribosomal protein L4/L1e  38.89 
 
 		 209 aa  119  3.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.116422 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0181  50S ribosomal protein L4  37.63 
 
 		 208 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000196789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0954  50S ribosomal protein L4  36.04 
 
 		 221 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000111144  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2422  50S ribosomal protein L4  37.3 
 
 		 208 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00578828  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0720  50S ribosomal protein L4  37.78 
 
 		 201 aa  119  6e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000427281  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_418  ribosomal protein L4  38.12 
 
 		 210 aa  119  7e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00538527  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2856  50S ribosomal protein L4  36.23 
 
 		 207 aa  118  7.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.400345  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0059  50S ribosomal protein L4  38 
 
 		 207 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0599605  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0490  50S ribosomal protein L4  40.34 
 
 		 200 aa  118  9.999999999999999e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000109229  normal  0.0102301 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0080  50S ribosomal protein L4  38.42 
 
 		 206 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.186923 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0627  50S ribosomal protein L4  37.02 
 
 		 220 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000530014  hitchhiker  0.00000000000031805 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0290  50S ribosomal protein L4  39.04 
 
 		 212 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0475  50S ribosomal protein L4  38.12 
 
 		 210 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00700158  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0399  ribosomal protein L4/L1e  40.88 
 
 		 214 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0982  ribosomal protein L4/L1e  37.32 
 
 		 209 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.532922  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0452  50S ribosomal protein L4  37.57 
 
 		 210 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000515236  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0485  50S ribosomal protein L4  40.34 
 
 		 200 aa  117  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000238586  normal  0.0299035 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0716  ribosomal protein L4/L1e  39.66 
 
 		 223 aa  116  3e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3994  ribosomal protein L4/L1e  36.62 
 
 		 212 aa  116  3e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2401  50S ribosomal protein L4  36.32 
 
 		 208 aa  115  6e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000036372  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4275  50S ribosomal protein L4  36.14 
 
 		 201 aa  115  6e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000159231  unclonable  0.00000000000448849 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0961  50S ribosomal protein L4  35.96 
 
 		 204 aa  115  8.999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000392469  hitchhiker  0.00000164794 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001741  LSU ribosomal protein L4p (L1e)  38.04 
 
 		 200 aa  114  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000116803  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0427  50S ribosomal protein L4  38.64 
 
 		 200 aa  114  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000154423  decreased coverage  0.00000614317 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1764  50S ribosomal protein L4  37.13 
 
 		 206 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00135584  normal  0.669415 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0603  ribosomal protein L4/L1e  36.26 
 
 		 209 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05720  50S ribosomal protein L4  37.64 
 
 		 208 aa  114  2.0000000000000002e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.316206  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1906  50S ribosomal protein L4  37.5 
 
 		 207 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000335339  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2063  50S ribosomal protein L4  36.65 
 
 		 208 aa  113  3e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000340203  normal  0.385687 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0303  ribosomal protein L4/L1e  36.93 
 
 		 202 aa  113  3e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0138909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01180  ribosomal protein L4/L1e  38.59 
 
 		 209 aa  113  4.0000000000000004e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000715314  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0661  50S ribosomal protein L4  39.18 
 
 		 210 aa  112  5e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000586581  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>