More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_27601 on replicon NC_009368
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009368  OSTLU_27601  Plastid ribosomal protein L6 large ribosomal subunit  100 
 
 		 213 aa  435  1e-121  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.935341  normal  0.110543 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2318  ribosomal protein L6  52.84 
 
 		 179 aa  195  5.000000000000001e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000220779  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0235  50S ribosomal protein L6  54.24 
 
 		 179 aa  194  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.89178 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0238  50S ribosomal protein L6  54.24 
 
 		 179 aa  194  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2163  ribosomal protein L6  54.24 
 
 		 179 aa  192  3e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0225942  normal  0.802348 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1816  50S ribosomal protein L6  52.54 
 
 		 178 aa  189  2e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.997854  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3717  50S ribosomal protein L6  51.41 
 
 		 179 aa  189  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0122  50S ribosomal protein L6  53.67 
 
 		 178 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1264  50S ribosomal protein L6  51.43 
 
 		 177 aa  187  1e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0989629  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23320  LSU ribosomal protein L6P  51.98 
 
 		 181 aa  186  2e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000190859  hitchhiker  0.00000113192 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4783  50S ribosomal protein L6  51.43 
 
 		 177 aa  184  7e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0251165  hitchhiker  0.0000000834141 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2309  ribosomal protein L6  49.71 
 
 		 177 aa  183  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.232895  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09850  LSU ribosomal protein L6P  51.98 
 
 		 180 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.012035  hitchhiker  0.0000169605 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3323  50S ribosomal protein L6  49.14 
 
 		 177 aa  182  3e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00060748  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0126  50S ribosomal protein L6  52.54 
 
 		 178 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0705  50S ribosomal protein L6  51.19 
 
 		 182 aa  181  6e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000289089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2262  50S ribosomal protein L6  51.41 
 
 		 178 aa  181  7e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00376277  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1509  ribosomal protein L6  49.43 
 
 		 182 aa  181  7e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.84211  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2303  50S ribosomal protein L6  51.41 
 
 		 178 aa  181  7e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0125142  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1369  50S ribosomal protein L6  48 
 
 		 177 aa  181  9.000000000000001e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.622971  normal  0.0841779 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2918  50S ribosomal protein L6P  55.03 
 
 		 183 aa  181  9.000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000181969  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3652  50S ribosomal protein L6  50 
 
 		 180 aa  180  2e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000101089  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0163  50S ribosomal protein L6  52 
 
 		 177 aa  180  2e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000387746  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0774  50S ribosomal protein L6  51.43 
 
 		 177 aa  179  2e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.498464  normal  0.859655 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0509  50S ribosomal protein L6  51.7 
 
 		 175 aa  179  2.9999999999999997e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.910827  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2751  ribosomal protein L6  52.27 
 
 		 177 aa  179  4e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.22493  normal  0.2065 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1338  50S ribosomal protein L6  49.71 
 
 		 177 aa  179  4e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.152453 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1169  ribosomal protein L6  50.85 
 
 		 179 aa  178  5.999999999999999e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.324291  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2309  ribosomal protein L6  50 
 
 		 178 aa  177  8e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000583709  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2803  50S ribosomal protein L6  50.57 
 
 		 177 aa  177  8e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.536694  normal  0.461526 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0301  ribosomal protein L6  49.72 
 
 		 180 aa  177  9e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000179167  normal  0.16006 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0294  50S ribosomal protein L6P  50.29 
 
 		 177 aa  177  1e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000550047  hitchhiker  0.00000213592 
 
 
 
NC_007954  Sden_0185  50S ribosomal protein L6  51.43 
 
 		 177 aa  176  2e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000922994  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0209  LSU ribosomal protein L6P  47.46 
 
 		 178 aa  177  2e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.077075  normal  0.533407 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0843  50S ribosomal protein L6  50.29 
 
 		 177 aa  176  2e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.602028  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0199  50S ribosomal protein L6  50.86 
 
 		 176 aa  176  3e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000586968  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1146  ribosomal protein L6  51.41 
 
 		 178 aa  176  3e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000104709  hitchhiker  0.00466337 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0310  50S ribosomal protein L6  49.14 
 
 		 177 aa  176  3e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000340261  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0215  50S ribosomal protein L6  49.71 
 
 		 177 aa  176  3e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000103444  hitchhiker  0.000114271 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0211  50S ribosomal protein L6  49.71 
 
 		 177 aa  176  3e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000116546  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1361  50S ribosomal protein L6  51.69 
 
 		 179 aa  176  3e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000776648  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1081  50S ribosomal protein L6  49.72 
 
 		 179 aa  176  3e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.253024  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4041  50S ribosomal protein L6  49.71 
 
 		 177 aa  176  3e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000805939  unclonable  0.00000000000307302 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4155  50S ribosomal protein L6  49.71 
 
 		 177 aa  176  3e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000600192  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0996  50S ribosomal protein L6  49.44 
 
 		 180 aa  175  4e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.156125  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0448  50S ribosomal protein L6  50 
 
 		 175 aa  175  4e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.935491  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0230  50S ribosomal protein L6  49.4 
 
 		 182 aa  175  5e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000764662  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0228  50S ribosomal protein L6  50.29 
 
 		 177 aa  175  5e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000431714  unclonable  0.00000804298 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0734  50S ribosomal protein L6  49.14 
 
 		 177 aa  175  6e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000390696  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0565  50S ribosomal protein L6  47.43 
 
 		 177 aa  174  8e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3980  ribosomal protein L6  49.72 
 
 		 177 aa  174  8e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0473  50S ribosomal protein L6  49.71 
 
 		 177 aa  174  8e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0773  ribosomal protein L6 signature 1  53.85 
 
 		 183 aa  174  9e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000853841  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5064  50S ribosomal protein L6  49.14 
 
 		 177 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000965255  normal  0.133122 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2573  50S ribosomal protein L6  50 
 
 		 182 aa  174  9.999999999999999e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0469  50S ribosomal protein L6  49.71 
 
 		 177 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0000206818  hitchhiker  0.00000293736 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1001  50S ribosomal protein L6  48 
 
 		 177 aa  173  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.372687  normal  0.0102466 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0642  ribosomal protein L6  49.15 
 
 		 178 aa  173  1.9999999999999998e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0688878  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5055  50S ribosomal protein L6  48 
 
 		 177 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.468069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3652  50S ribosomal protein L6  49.14 
 
 		 177 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0499  50S ribosomal protein L6  49.71 
 
 		 177 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000356471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0502  50S ribosomal protein L6  49.71 
 
 		 177 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000123092  normal  0.096722 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4261  50S ribosomal protein L6  49.14 
 
 		 177 aa  173  1.9999999999999998e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000121964  unclonable  0.00000000000281926 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1138  ribosomal protein L6  48.59 
 
 		 178 aa  172  1.9999999999999998e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.891595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1780  50S ribosomal protein L6P  51.43 
 
 		 177 aa  173  1.9999999999999998e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0224285  normal  0.119374 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1037  50S ribosomal protein L6  49.14 
 
 		 177 aa  173  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000958163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4734  50S ribosomal protein L6  49.71 
 
 		 177 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000597715  normal  0.617382 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0276  ribosomal protein L6  49.71 
 
 		 181 aa  172  2.9999999999999996e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.017278  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4302  50S ribosomal protein L6  50.29 
 
 		 176 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000025349  unclonable  0.0000000000636307 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1836  50S ribosomal protein L6  47.13 
 
 		 179 aa  172  2.9999999999999996e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.532668  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3744  50S ribosomal protein L6  49.14 
 
 		 177 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000000640948  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0490  50S ribosomal protein L6  49.7 
 
 		 177 aa  172  2.9999999999999996e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00133523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3169  50S ribosomal protein L6  49.71 
 
 		 177 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.351306  normal  0.462877 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2842  50S ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 179 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00681087  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0246  50S ribosomal protein L6  49.71 
 
 		 177 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl138  50S ribosomal protein L6  46.86 
 
 		 180 aa  172  3.9999999999999995e-42  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2445  50S ribosomal protein L6  50.6 
 
 		 183 aa  172  3.9999999999999995e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.789382 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0606  50S ribosomal protein L6  48 
 
 		 177 aa  172  3.9999999999999995e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3691  ribosomal protein L6  47.46 
 
 		 178 aa  172  3.9999999999999995e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  unclonable  0.000000282439  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0214  50S ribosomal protein L6  49.71 
 
 		 177 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000010053  hitchhiker  0.00000000158568 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1856  50S ribosomal protein L6  47.43 
 
 		 177 aa  172  5e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.789542  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0334  50S ribosomal protein L6  49.71 
 
 		 176 aa  172  5e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000427572  unclonable  0.0000000488908 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3433  50S ribosomal protein L6  48 
 
 		 177 aa  171  5e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.286607  normal  0.347857 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0214  50S ribosomal protein L6  49.71 
 
 		 177 aa  172  5e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000958159  unclonable  0.0000000000152518 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0209  50S ribosomal protein L6  49.71 
 
 		 177 aa  172  5e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000225303  hitchhiker  0.00711343 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2218  50S ribosomal protein L6  51.98 
 
 		 179 aa  171  5.999999999999999e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.545954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3164  50S ribosomal protein L6  47.43 
 
 		 177 aa  171  6.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000424619  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1629  50S ribosomal protein L6  48 
 
 		 177 aa  171  6.999999999999999e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.415246  normal  0.285193 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4675  50S ribosomal protein L6  49.14 
 
 		 176 aa  171  6.999999999999999e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000105609  unclonable  0.00000000908127 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04130  LSU ribosomal protein L6P  48.31 
 
 		 179 aa  171  7.999999999999999e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3894  50S ribosomal protein L6  48 
 
 		 177 aa  171  9e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00000000149542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0396  50S ribosomal protein L6  48 
 
 		 177 aa  170  1e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0491976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6034  50S ribosomal protein L6  48.02 
 
 		 178 aa  171  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0065  50S ribosomal protein L6  46.86 
 
 		 177 aa  171  1e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000654167  hitchhiker  0.0000000000000139653 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0388  50S ribosomal protein L6  48 
 
 		 177 aa  170  1e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0000757352  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4228  50S ribosomal protein L6  51.52 
 
 		 177 aa  170  1e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00495937  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0269  50S ribosomal protein L6  48.57 
 
 		 177 aa  170  1e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0431444  normal  0.459215 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1445  50S ribosomal protein L6  48 
 
 		 177 aa  170  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.279932 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2824  50S ribosomal protein L6  48 
 
 		 176 aa  170  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0379678  normal  0.19351 
 
 
-
 
NC_004310  BR1218  50S ribosomal protein L6  46.86 
 
 		 177 aa  170  2e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>