More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0881 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_0881  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 
478 aa  938  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.426216  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1434  GntR family transcriptional regulator  58.44 
 
 
480 aa  512  1e-144  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.515471 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1922  GntR family transcriptional regulator  59.92 
 
 
470 aa  505  1e-142  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.664628  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0573  GntR family transcriptional regulator  60.34 
 
 
470 aa  508  1e-142  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1025  GntR family transcriptional regulator  47.13 
 
 
499 aa  355  9e-97  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.684124 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3547  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.05 
 
 
477 aa  344  2e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.224357  normal  0.0204741 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4138  GntR family transcriptional regulator  36.38 
 
 
470 aa  342  6e-93  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2235  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.66 
 
 
473 aa  340  4e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.71743 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4302  GntR family transcriptional regulator  43.25 
 
 
521 aa  338  1e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0559  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.88 
 
 
508 aa  332  8e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0043  GntR family transcriptional regulator  45.3 
 
 
492 aa  332  1e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6053  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37 
 
 
472 aa  329  6e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.137627  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0059  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  44.58 
 
 
487 aa  328  2e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.869186  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3314  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.89 
 
 
494 aa  324  3e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1191  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.92 
 
 
489 aa  323  4e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.419241  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0047  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  43.92 
 
 
482 aa  323  5e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.493151  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2637  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.26 
 
 
493 aa  317  3e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.750053 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7471  GntR family transcriptional regulator  40.09 
 
 
449 aa  313  5e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.650155 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2642  GntR family transcriptional regulator  39.32 
 
 
496 aa  305  1e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2148  GntR family transcriptional regulator  39.7 
 
 
498 aa  303  5e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2912  transcriptional regulator, GntR family  34.22 
 
 
485 aa  299  6e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.784119  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3187  transcriptional regulator  39.39 
 
 
487 aa  294  2e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.685376  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4437  GntR family transcriptional regulator  39.74 
 
 
469 aa  281  3e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.654603 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4623  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.33 
 
 
489 aa  277  3e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.609617  normal  0.250213 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2755  putative transcriptional regulator, GntR family  33.77 
 
 
456 aa  257  4e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.243959 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4822  GntR family transcriptional regulator  31.13 
 
 
496 aa  257  4e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.364543  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3373  transcriptional regulator  31.52 
 
 
484 aa  246  5e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.98747  normal  0.499869 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0346  GntR family transcriptional regulator  36.83 
 
 
476 aa  243  5e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1085  GntR family transcriptional regulator  34.32 
 
 
475 aa  241  2e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.350273 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3935  GntR family transcriptional regulator  30.33 
 
 
503 aa  241  3e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.558201  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03480  GntR family transcriptional regulator  35.17 
 
 
473 aa  234  3e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  1.29974e-15 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4324  transcriptional regulator  36.45 
 
 
495 aa  230  4e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.203783 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4100  GntR family transcriptional regulator  35.54 
 
 
494 aa  229  1e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.959861  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4266  GntR family transcriptional regulator  35.54 
 
 
494 aa  229  1e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.501313  normal  0.325137 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1688  GntR family transcriptional regulator  38.59 
 
 
491 aa  228  2e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.82306  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1740  GntR family transcriptional regulator  35.67 
 
 
494 aa  228  2e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.844969  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3251  transcriptional regulator  35.32 
 
 
494 aa  227  5e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6846  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  36.34 
 
 
476 aa  226  7e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1641  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.17 
 
 
488 aa  225  1e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.119637  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0192  GntR family regulatory protein  34.33 
 
 
570 aa  225  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3694  GntR family transcriptional regulator  34.82 
 
 
494 aa  224  3e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.385244  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4318  GntR family transcriptional regulator  37.21 
 
 
504 aa  224  4e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.632192  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1600  GntR family regulatory protein  35.28 
 
 
493 aa  223  9e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1682  transcriptional regulator  35.04 
 
 
493 aa  222  1e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4167  transcriptional regulator  34.66 
 
 
509 aa  220  4e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.117681  normal  0.924645 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1714  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.94 
 
 
488 aa  220  4e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0550689  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1208  GntR family transcriptional regulator  33.66 
 
 
574 aa  217  3e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2233  GntR family transcriptional regulator  39.06 
 
 
488 aa  217  5e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.420665  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1933  GntR family transcriptional regulator  30.28 
 
 
490 aa  216  6e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.100433  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4139  GntR family transcriptional regulator  32.14 
 
 
503 aa  216  9e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.5231  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3136  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.98 
 
 
496 aa  215  1e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6316  GntR family transcriptional regulator  33.4 
 
 
493 aa  214  2e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.910059  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0130  GntR family transcriptional regulator  37.93 
 
 
490 aa  214  2e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0136  GntR family transcriptional regulator  37.12 
 
 
496 aa  214  3e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4833  GntR family transcriptional regulator  37.99 
 
 
485 aa  213  4e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5015  transcriptional regulator  36.38 
 
 
502 aa  214  4e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.301985  normal  0.695664 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3109  GntR family transcriptional regulator  36.41 
 
 
502 aa  213  5e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10010  putative transcriptional regulator  35.07 
 
 
496 aa  213  5e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.287288  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5258  GntR family transcriptional regulator  36.41 
 
 
502 aa  213  5e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1143  GntR family transcriptional regulator  32.29 
 
 
496 aa  212  2e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5251  GntR family transcriptional regulator  32.52 
 
 
509 aa  211  3e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.519291 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2304  regulatory protein GntR, HTH  31.61 
 
 
475 aa  211  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7670  putative transcriptional regulator, GntR family  34.2 
 
 
496 aa  211  3e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2297  GntR family transcriptional regulator  35.83 
 
 
501 aa  210  4e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.35156  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4441  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  30.63 
 
 
490 aa  209  8e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.944559 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5145  transcriptional regulator  36.34 
 
 
516 aa  209  1e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4617  GntR family transcriptional regulator  36.57 
 
 
516 aa  209  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.814489  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5788  GntR family transcriptional regulator  32.67 
 
 
496 aa  209  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.520429 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71680  GntR family transcriptional regulator  40.95 
 
 
491 aa  209  1e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5559  transcriptional regulator  31.67 
 
 
498 aa  208  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1805  GntR family transcriptional regulator  35.54 
 
 
504 aa  207  3e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1162  transcriptional regulator, GntR family  31.4 
 
 
479 aa  207  3e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00200277  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5342  GntR family transcriptional regulator  32.78 
 
 
509 aa  207  4e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  7.22465e-07 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3364  transcriptional regulator  31.48 
 
 
498 aa  207  4e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0801  regulatory protein GntR, HTH  35 
 
 
508 aa  206  8e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0129569  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5633  GntR family transcriptional regulator  37.44 
 
 
517 aa  206  9e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  6.15538e-06  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2188  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  28.51 
 
 
483 aa  205  1e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0027297 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4245  GntR family transcriptional regulator  33.41 
 
 
493 aa  206  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0459012 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5076  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.04 
 
 
472 aa  206  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4121  GntR family transcriptional regulator  33.41 
 
 
493 aa  206  1e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.648363  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3074  GntR family transcriptional regulator  32.9 
 
 
470 aa  205  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5117  transcriptional regulator  31.87 
 
 
508 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  2.08159e-08  normal  0.0731219 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3062  GntR family transcriptional regulator  28.29 
 
 
480 aa  204  3e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2841  transcriptional regulator  28.07 
 
 
480 aa  204  3e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.171165  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3074  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  28.29 
 
 
480 aa  204  3e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2781  GntR family transcriptional regulator  28.29 
 
 
480 aa  204  3e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2847  GntR family transcriptional regulator  28.29 
 
 
480 aa  204  3e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0395  GntR family transcriptional regulator  36.16 
 
 
497 aa  204  4e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.382669 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5391  transcriptional regulator  31.94 
 
 
509 aa  204  4e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253395  normal  0.0145041 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3091  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  28.07 
 
 
480 aa  203  5e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0045104  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3272  transcriptional regulator  33.33 
 
 
493 aa  203  6e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.831292 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3058  transcriptional regulator, GntR family  28.07 
 
 
480 aa  203  6e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3093  GntR family transcriptional regulator  28.07 
 
 
480 aa  202  9e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0883302  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8097  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  36.72 
 
 
471 aa  202  1e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4617  GntR family transcriptional regulator  30.71 
 
 
480 aa  202  1e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1925  GntR family transcriptional regulator  36.31 
 
 
488 aa  202  1e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3719  transcriptional regulator  32.69 
 
 
476 aa  201  2e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2820  GntR family transcriptional regulator  28.07 
 
 
480 aa  201  2e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0348  GntR family transcriptional regulator  32.31 
 
 
495 aa  201  2e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4510  transcriptional regulator  31.71 
 
 
489 aa  201  2e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.111052  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>