290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1902 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1902  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 287 aa  566  1e-161  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.392348  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3260  beta-lactamase domain-containing protein  41.58 
 
 		 275 aa  168  7e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3034  beta-lactamase domain-containing protein  42.29 
 
 		 275 aa  163  3e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.641137 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7059  beta-lactamase domain protein  36.81 
 
 		 295 aa  161  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1577  beta-lactamase domain protein  39.34 
 
 		 272 aa  152  5e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11942  hypothetical protein  36.17 
 
 		 250 aa  112  7.000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1653  beta-lactamase domain-containing protein  37.29 
 
 		 238 aa  109  5e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.139658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3402  beta-lactamase domain-containing protein  35.68 
 
 		 243 aa  99.8  5e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.433473  normal  0.430357 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3186  beta-lactamase domain-containing protein  31.27 
 
 		 271 aa  93.2  4e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3167  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 		 302 aa  91.7  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  30.93 
 
 		 299 aa  89.7  5e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  31.3 
 
 		 298 aa  89  9e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3131  beta-lactamase domain-containing protein  31.9 
 
 		 230 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.833456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0922  beta-lactamase-like  31.6 
 
 		 318 aa  83.6  0.000000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0292  beta-lactamase domain protein  33.18 
 
 		 319 aa  83.2  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.540358  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2765  beta-lactamase domain protein  35.27 
 
 		 304 aa  83.2  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00567584  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2893  beta-lactamase domain protein  30.42 
 
 		 271 aa  82.8  0.000000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4039  Beta-lactamase-like  31.87 
 
 		 337 aa  82.4  0.000000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1925  metallo-beta-lactamase family protein  30.15 
 
 		 318 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0966006  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3217  metallo-beta-lactamase family protein  30.15 
 
 		 318 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3178  metallo-beta-lactamase family protein  30.15 
 
 		 318 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2684  metallo-beta-lactamase family protein  30.15 
 
 		 318 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2060  metallo-beta-lactamase family protein  30.15 
 
 		 318 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3232  metallo-beta-lactamase family protein  30.15 
 
 		 318 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0852  metallo-beta-lactamase family protein  30.15 
 
 		 318 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1394  metallo-beta-lactamase family protein  31.65 
 
 		 318 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11890  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  35.27 
 
 		 252 aa  81.3  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.231237 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3770  beta-lactamase domain-containing protein  31.95 
 
 		 312 aa  80.1  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0906  Beta-lactamase-like  31.03 
 
 		 316 aa  79.7  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.681093  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5107  beta-lactamase domain protein  30.5 
 
 		 321 aa  79.3  0.00000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.065858  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0580  beta-lactamase domain-containing protein  28.36 
 
 		 321 aa  79.3  0.00000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0555  beta-lactamase domain protein  25.66 
 
 		 316 aa  79.3  0.00000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000575755  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2623  beta-lactamase-like  29.12 
 
 		 316 aa  79  0.00000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.533019 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1017  beta-lactamase-like  30.6 
 
 		 316 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.751913  normal  0.383116 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3306  beta-lactamase domain protein  30 
 
 		 315 aa  77  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4534  beta-lactamase-like  33.17 
 
 		 319 aa  77.4  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000147099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1435  beta-lactamase-like  31.05 
 
 		 316 aa  76.3  0.0000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.388274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3814  beta-lactamase domain-containing protein  32.21 
 
 		 316 aa  76.6  0.0000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.360876  normal  0.263273 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1300  beta-lactamase domain-containing protein  30.56 
 
 		 264 aa  75.9  0.0000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.862456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5154  beta-lactamase domain protein  31.47 
 
 		 317 aa  75.9  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.692962  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4551  beta-lactamase domain-containing protein  30.73 
 
 		 332 aa  75.5  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0890  beta-lactamase-like  29.82 
 
 		 317 aa  75.1  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.434485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0565  putative metallo-beta-lactamase family protein  29.44 
 
 		 318 aa  73.6  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.612107  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1125  beta-lactamase domain protein  30.4 
 
 		 315 aa  73.2  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.404195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1231  beta-lactamase domain protein  29.7 
 
 		 318 aa  73.2  0.000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0606732 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3492  beta-lactamase domain-containing protein  30 
 
 		 315 aa  72.4  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.520693  normal  0.202601 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1853  beta-lactamase domain-containing protein  29.1 
 
 		 356 aa  72.8  0.000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.113565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1041  beta lactamase precursor  29.89 
 
 		 318 aa  71.6  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215964  normal  0.327704 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4299  beta-lactamase domain-containing protein  30 
 
 		 321 aa  70.1  0.00000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0326  beta-lactamase domain protein  22.79 
 
 		 308 aa  69.7  0.00000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.315816  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2427  beta lactamase precursor  30.61 
 
 		 287 aa  69.7  0.00000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.662224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2278  Beta-lactamase-like  26.85 
 
 		 318 aa  69.7  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2819  beta-lactamase domain protein  32.11 
 
 		 342 aa  69.3  0.00000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1197  beta-lactamase domain protein  29.18 
 
 		 317 aa  69.3  0.00000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0849  beta-lactamase domain protein  30.58 
 
 		 321 aa  68.2  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0185105  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2257  metallo-beta-lactamase family protein  33.17 
 
 		 323 aa  67.8  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1240  beta-lactamase domain protein  32.92 
 
 		 313 aa  68.2  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0886366 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1597  beta-lactamase domain protein  26.46 
 
 		 318 aa  67.4  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.789295  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1673  beta-lactamase domain protein  26.46 
 
 		 318 aa  67  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0775  beta-lactamase domain-containing protein  28 
 
 		 319 aa  67  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.366597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0069  beta-lactamase-like  27.39 
 
 		 362 aa  66.6  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4537  beta-lactamase domain protein  31.53 
 
 		 314 aa  67  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.630097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2858  beta-lactamase domain protein  26.24 
 
 		 337 aa  66.2  0.0000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4217  Beta-lactamase-like  31.53 
 
 		 319 aa  66.2  0.0000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1709  beta-lactamase-like  26.83 
 
 		 353 aa  65.9  0.0000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.587452  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4051  beta-lactamase domain-containing protein  31.37 
 
 		 319 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00000219811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0095  beta-lactamase domain-containing protein  25.19 
 
 		 315 aa  65.5  0.0000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.631738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4097  beta-lactamase-like  34.76 
 
 		 310 aa  65.1  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3778  beta-lactamase domain-containing protein  30.6 
 
 		 319 aa  65.1  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616764 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10957  bifunctional 2-hydroxyhepta-2,4-diene-1,7-dioate isomerase/cyclase/dehydrase  29.33 
 
 		 644 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.761321 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0582  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 		 321 aa  65.1  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1614  Beta-lactamase-like  27.47 
 
 		 339 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.835771  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1888  hypothetical protein  27.73 
 
 		 321 aa  64.3  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.717917 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2056  Beta-lactamase-like  24.28 
 
 		 340 aa  64.7  0.000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000527783  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0338  beta-lactamase-like protein  31.25 
 
 		 319 aa  64.7  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.549324 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4160  SoxH protein-like  27.9 
 
 		 312 aa  63.9  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.671969  normal  0.539982 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1621  Beta-lactamase-like  24.66 
 
 		 334 aa  63.9  0.000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.683443  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0666  beta-lactamase-like  28.26 
 
 		 329 aa  63.5  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.257894  normal  0.323841 
 
 
-
 
NC_003296  RS01746  hypothetical protein  31.53 
 
 		 319 aa  63.5  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0583  beta-lactamase domain protein  27.07 
 
 		 297 aa  63.2  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000802552  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4197  beta-lactamase domain-containing protein  30.77 
 
 		 339 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216632  normal  0.10176 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4303  beta-lactamase domain-containing protein  30.29 
 
 		 319 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.491104 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0150  beta-lactamase domain-containing protein  29.61 
 
 		 332 aa  62.8  0.000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3721  beta-lactamase domain-containing protein  30.29 
 
 		 339 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.383554 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7214  beta-lactamase domain protein  31.58 
 
 		 319 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4962  beta-lactamase domain protein  27.57 
 
 		 417 aa  62.4  0.000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2305  beta-lactamase-like protein  25.93 
 
 		 314 aa  62.4  0.000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0142167 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0427  hypothetical protein  31.58 
 
 		 319 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000673109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4154  beta-lactamase domain-containing protein  29.54 
 
 		 317 aa  62.4  0.000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1711  Beta-lactamase-like  29.81 
 
 		 319 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04774  hypothetical protein  31.68 
 
 		 335 aa  62  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05663  hypothetical protein  31.68 
 
 		 335 aa  62  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1889  beta-lactamase domain protein  28.95 
 
 		 286 aa  61.6  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3125  beta-lactamase domain-containing protein  29.64 
 
 		 313 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.265077  normal  0.697397 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4528  beta-lactamase domain protein  30.54 
 
 		 319 aa  62  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256187  normal  0.560628 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4662  beta-lactamase domain protein  31.8 
 
 		 313 aa  61.6  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4660  beta-lactamase domain protein  30.54 
 
 		 319 aa  62  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413221  normal  0.152436 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3742  Zn-dependent hydrolases  25.31 
 
 		 318 aa  61.6  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.443834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1178  beta-lactamase domain-containing protein  29.46 
 
 		 290 aa  62  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2678  beta-lactamase domain protein  29.89 
 
 		 307 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.304007  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>