More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1951 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_1951  FAD linked oxidase-like  100 
 
 
452 aa  934    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5790  FAD linked oxidase domain protein  45.96 
 
 
440 aa  386  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0812  FAD linked oxidase domain-containing protein  45.39 
 
 
454 aa  384  1e-105  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2461  putative oxidoreductase  44.84 
 
 
452 aa  377  1e-103  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.203738  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3327  FAD linked oxidase domain protein  42.54 
 
 
457 aa  373  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0142  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.99 
 
 
432 aa  374  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2790  FAD linked oxidase domain protein  42.54 
 
 
457 aa  373  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.302451 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2566  oxidoreductase, FAD-binding, putative  44.97 
 
 
433 aa  368  1e-100  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1027  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.3 
 
 
444 aa  362  9e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4051  FAD linked oxidase domain protein  42.19 
 
 
443 aa  361  1e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0277963  normal  0.0660181 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1596  FAD linked oxidase domain protein  45.39 
 
 
472 aa  360  3e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0268371  normal  0.128439 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5664  FAD linked oxidase domain protein  41.74 
 
 
468 aa  355  1e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.125635 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7179  hypothetical protein  43.86 
 
 
444 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.650101  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2163  FAD linked oxidase domain protein  44.59 
 
 
442 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3977  hypothetical protein  44.82 
 
 
442 aa  352  8.999999999999999e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.217761  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4213  FAD linked oxidase-like  41.48 
 
 
464 aa  346  4e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.82131 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6248  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.86 
 
 
433 aa  342  7e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.987377  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0499  FAD linked oxidase domain protein  42.63 
 
 
437 aa  340  2.9999999999999998e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.354457 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03330  hypothetical protein  42.09 
 
 
436 aa  340  2.9999999999999998e-92  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.141442  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0270  FAD linked oxidase domain protein  42.42 
 
 
455 aa  333  5e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.865067 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1740  FAD linked oxidase domain protein  41.35 
 
 
462 aa  330  4e-89  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1218  FAD linked oxidase-like  38.5 
 
 
430 aa  327  2.0000000000000001e-88  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2272  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.66 
 
 
440 aa  326  7e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.284272 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2831  FAD linked oxidase-like  41.72 
 
 
432 aa  323  5e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.104572  normal  0.14407 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2302  FAD linked oxidase, N-terminal  40.59 
 
 
438 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0365618  hitchhiker  0.00922553 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0802  oxidoreductase, FAD-binding  42.27 
 
 
444 aa  316  4e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.823765  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0897  FAD linked oxidase domain protein  42.73 
 
 
438 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.566652  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3785  hypothetical protein  42.01 
 
 
438 aa  311  2e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.498001 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1011  FAD linked oxidase domain protein  40.67 
 
 
432 aa  310  5e-83  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.765853 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4160  FAD linked oxidase domain protein  38.55 
 
 
481 aa  310  5e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0063  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.36 
 
 
435 aa  308  1.0000000000000001e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0172  hypothetical protein  40.32 
 
 
438 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.689653 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1709  FAD linked oxidase, N-terminal  38.55 
 
 
432 aa  303  4.0000000000000003e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.605726  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01400  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  38.58 
 
 
453 aa  300  3e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.276875  normal  0.198753 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5088  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.9 
 
 
456 aa  299  8e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.624215 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5000  FAD linked oxidase-like protein  36.9 
 
 
456 aa  299  8e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5381  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.9 
 
 
456 aa  299  8e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4797  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.91 
 
 
447 aa  298  1e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.902774 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1178  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.92 
 
 
472 aa  297  3e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.41593  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1647  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.58 
 
 
433 aa  291  2e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5627  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.03 
 
 
463 aa  290  3e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690428  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2965  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.47 
 
 
437 aa  290  3e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13824  oxidoreductase  36.46 
 
 
461 aa  282  7.000000000000001e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0328  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.77 
 
 
433 aa  281  1e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.382424  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0252  FAD linked oxidase domain protein  35.62 
 
 
474 aa  276  4e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.297265  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4210  FAD linked oxidase-like  37.63 
 
 
436 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.563711  normal  0.793995 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4119  FAD linked oxidase domain protein  34.33 
 
 
476 aa  257  2e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.998579  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0489  FAD linked oxidase domain protein  32.13 
 
 
425 aa  239  8e-62  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1064  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.05 
 
 
441 aa  238  1e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.57478  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1758  hypothetical protein  31 
 
 
431 aa  213  7e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1758  hypothetical protein  31 
 
 
431 aa  211  3e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1142  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.54 
 
 
445 aa  175  1.9999999999999998e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.125202  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0223  oxidoreductase, FAD-binding  22.42 
 
 
478 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.337071  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0859  L-gulonolactone oxidase  21.31 
 
 
481 aa  83.6  0.000000000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0199  oxidoreductase, FAD-binding  21.86 
 
 
468 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.411918  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5122  oxidoreductase, FAD-binding  22 
 
 
478 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.874515  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0203  oxidoreductase, FAD-binding  22.8 
 
 
478 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0199  oxidoreductase, FAD-binding  22.87 
 
 
478 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0167  oxidoreductase, FAD-binding  22.8 
 
 
471 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.395629  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0180  oxidoreductase, FAD-binding  21.09 
 
 
478 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0178  FAD-binding oxidoreductase  21.09 
 
 
471 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.394744  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0164  FAD linked oxidase domain-containing protein  21.67 
 
 
490 aa  76.6  0.0000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0170  oxidoreductase, FAD-binding  22.37 
 
 
478 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7369  FAD-linked oxidoreductase  21.77 
 
 
434 aa  75.9  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1829  FAD linked oxidase domain protein  31.21 
 
 
441 aa  74.7  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7235  FAD linked oxidase domain protein  29.61 
 
 
491 aa  73.6  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00836  D-Arabinono-1,4-lactone oxidase (Eurofung)  34.53 
 
 
574 aa  73.2  0.000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.764968  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0108  FAD linked oxidase domain protein  32.97 
 
 
457 aa  72  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1688  FAD-linked oxidoreductase  23.19 
 
 
441 aa  72.4  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00023644  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4261  FAD linked oxidase domain protein  32.16 
 
 
455 aa  72.4  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.371962  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1946  FAD-linked oxidoreductase  23.53 
 
 
433 aa  69.7  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1966  FAD linked oxidase domain protein  34.97 
 
 
378 aa  69.7  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00596955  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1732  FAD linked oxidase domain protein  21.55 
 
 
475 aa  68.2  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4703  FAD-linked oxidoreductase  22.95 
 
 
437 aa  67.4  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.553428 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4772  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.45 
 
 
483 aa  66.6  0.0000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0030  FAD-linked oxidoreductase  22.05 
 
 
425 aa  66.6  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2890  FAD-linked oxidoreductase  22.77 
 
 
432 aa  65.9  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.632681  normal  0.314064 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11799  oxidoreductase  20.77 
 
 
428 aa  65.1  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.983221  hitchhiker  0.000835629 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13140  FAD-linked oxidoreductase  27.07 
 
 
436 aa  64.3  0.000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.828349  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3577  FAD linked oxidase-like  22.61 
 
 
495 aa  63.2  0.000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.310441  normal  0.085604 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0095  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.89 
 
 
474 aa  61.6  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0064  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.79 
 
 
474 aa  61.2  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1899  FAD-linked oxidoreductase  20.68 
 
 
438 aa  60.8  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0587039  decreased coverage  0.00000156043 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0562  FAD linked oxidase domain protein  30.82 
 
 
466 aa  60.8  0.00000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1234  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.59 
 
 
459 aa  60.8  0.00000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2214  FAD linked oxidase domain protein  30.2 
 
 
464 aa  60.5  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.196928 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0651  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.73 
 
 
469 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0625  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.73 
 
 
469 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0307  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.57 
 
 
479 aa  59.7  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0025  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.81 
 
 
470 aa  59.7  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.43762  normal  0.732346 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4035  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.05 
 
 
457 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0703  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.73 
 
 
469 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.403494 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4464  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.8 
 
 
453 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3821  FAD linked oxidase-like  28.73 
 
 
469 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303246  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2651  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.73 
 
 
469 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0846115 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3975  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.05 
 
 
457 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153769  normal  0.0426559 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5003  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.06 
 
 
483 aa  58.5  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.62909  normal  0.277705 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3961  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.05 
 
 
457 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0052  FAD linked oxidase domain protein  26.84 
 
 
474 aa  58.5  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0735  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.73 
 
 
469 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>