More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0341 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0341  cysteine desulfurase  100 
 
 		 388 aa  793    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  49.47 
 
 		 392 aa  395  1e-109  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  50.13 
 
 		 382 aa  395  1e-109  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  50.26 
 
 		 384 aa  392  1e-108  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  49.74 
 
 		 384 aa  389  1e-107  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  49.09 
 
 		 394 aa  387  1e-106  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  48.28 
 
 		 382 aa  386  1e-106  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  48.45 
 
 		 394 aa  379  1e-104  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  47.52 
 
 		 396 aa  375  1e-103  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  46.58 
 
 		 399 aa  377  1e-103  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  47.92 
 
 		 394 aa  374  1e-102  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  47.92 
 
 		 398 aa  371  1e-102  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  45.95 
 
 		 414 aa  374  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  47.53 
 
 		 398 aa  369  1e-101  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  46.35 
 
 		 392 aa  370  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  46.88 
 
 		 403 aa  365  1e-100  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  46.74 
 
 		 404 aa  367  1e-100  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  46.48 
 
 		 402 aa  364  2e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  44.91 
 
 		 398 aa  363  3e-99  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  45.85 
 
 		 398 aa  361  1e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_70  aminotransferase, class V  46.83 
 
 		 383 aa  359  4e-98  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2431  aminotransferase, class V  44.36 
 
 		 390 aa  356  3.9999999999999996e-97  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  46.35 
 
 		 393 aa  355  6.999999999999999e-97  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_002936  DET0248  cysteine desulfurase  46.3 
 
 		 383 aa  355  8.999999999999999e-97  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0166722  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  44.53 
 
 		 388 aa  354  1e-96  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  44.1 
 
 		 400 aa  353  2e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  42.78 
 
 		 396 aa  352  7e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  48.2 
 
 		 392 aa  350  2e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  45.53 
 
 		 404 aa  350  2e-95  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  43.93 
 
 		 398 aa  349  6e-95  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  43.93 
 
 		 398 aa  349  6e-95  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3109  aminotransferase class V  46.26 
 
 		 381 aa  348  7e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00030249  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4480  aminotransferase, class V  46.68 
 
 		 381 aa  345  6e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.921351  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  43.59 
 
 		 396 aa  345  6e-94  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  44.68 
 
 		 379 aa  345  7e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1932  cysteine desulfurase NifS  46.34 
 
 		 393 aa  345  7e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000108248  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1783  cysteine desulfurase NifS  44.06 
 
 		 401 aa  345  8e-94  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4134  aminotransferase, class V  43.16 
 
 		 400 aa  345  8e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0486971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1811  cysteine desulfurase NifS  44.06 
 
 		 401 aa  345  8e-94  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1343  aminotransferase class V  44.16 
 
 		 389 aa  345  1e-93  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2498  aminotransferase class V  46.56 
 
 		 381 aa  344  2e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  43.59 
 
 		 409 aa  342  5.999999999999999e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4244  aminotransferase class V  46.15 
 
 		 381 aa  342  8e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00204023  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4129  aminotransferase, class V  46.15 
 
 		 381 aa  341  1e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00019108  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4477  aminotransferase, class V  46.15 
 
 		 381 aa  341  1e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.508200000000001e-19 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4530  aminotransferase, class V  46.15 
 
 		 381 aa  340  2e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000702151  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4292  aminotransferase, class V  46.15 
 
 		 381 aa  340  2e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000991667  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4626  aminotransferase, class V  46.15 
 
 		 381 aa  340  2e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.058165  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2243  aminotransferase class V  45.36 
 
 		 380 aa  339  5e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4140  aminotransferase, class V  45.89 
 
 		 381 aa  338  7e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000996508  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1551  aminotransferase class V  45.36 
 
 		 383 aa  338  9e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  41.99 
 
 		 400 aa  338  9.999999999999999e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0437  cysteine desulfurase NifS  45.31 
 
 		 386 aa  337  9.999999999999999e-92  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.361233 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0719  aminotransferase, class V  46.15 
 
 		 381 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000547846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2122  cysteine desulfurase NifS  43.8 
 
 		 401 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31758 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4517  aminotransferase, class V  45.89 
 
 		 381 aa  336  3.9999999999999995e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0024603  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2025  aminotransferase, class V  45.74 
 
 		 383 aa  335  5.999999999999999e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4262  aminotransferase class V  42.56 
 
 		 395 aa  332  5e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0100  cysteine desulfurase NifS  42.63 
 
 		 400 aa  332  6e-90  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.873822 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0953  Cysteine desulfurase  45.87 
 
 		 380 aa  331  1e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2362  cysteine desulfurase NifS  41.69 
 
 		 399 aa  331  2e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0907  aminotransferase, class V  46.36 
 
 		 383 aa  330  2e-89  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000245321  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2570  cysteine desulfurase  39.89 
 
 		 394 aa  330  3e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  41.84 
 
 		 396 aa  329  4e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0484  aminotransferase, class V  45.1 
 
 		 417 aa  329  4e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0750137  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02508  cysteine desulfurase, alanine biosynthesis, putative (Eurofung)  44.44 
 
 		 507 aa  328  8e-89  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1356  cysteine desulfurase NifS  42.63 
 
 		 402 aa  328  1.0000000000000001e-88  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0199  aminotransferase, class V  45.26 
 
 		 382 aa  328  1.0000000000000001e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_45194  predicted protein  43.01 
 
 		 395 aa  325  8.000000000000001e-88  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0622302  normal  0.609433 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  43.31 
 
 		 384 aa  325  8.000000000000001e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2179  cysteine desulfurase  43.55 
 
 		 373 aa  324  1e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2275  aminotransferase, class V  43.19 
 
 		 386 aa  325  1e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2368  aminotransferase, class V  43.6 
 
 		 399 aa  324  1e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0313381  normal  0.503368 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4245  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  42.11 
 
 		 398 aa  323  2e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1649  aminotransferase, class V  42.13 
 
 		 385 aa  324  2e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.251188  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2004  aminotransferase, class V  43.6 
 
 		 399 aa  324  2e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0411095  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0688  cysteine desulfurase NifS  42.3 
 
 		 388 aa  323  3e-87  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0297222  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2115  aminotransferase class V  43.34 
 
 		 399 aa  323  4e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.903448  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1068  aminotransferase, class V  43.75 
 
 		 393 aa  322  9.000000000000001e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0344653  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2683  aminotransferase, class V  40.63 
 
 		 393 aa  321  9.999999999999999e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0397114 
 
 
-
 
NC_002978  WD0997  cysteine desulfurase  41.56 
 
 		 415 aa  320  1.9999999999999998e-86  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3416  aminotransferase class V  44.74 
 
 		 399 aa  320  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.425221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1939  aminotransferase class V  41.88 
 
 		 388 aa  320  1.9999999999999998e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024706 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0410  cysteine desulfurase  43.01 
 
 		 422 aa  320  3e-86  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  40.99 
 
 		 407 aa  320  3e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01055  cysteine desulfurase  43.7 
 
 		 404 aa  319  3.9999999999999996e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1833  aminotransferase, class V  39.43 
 
 		 389 aa  319  5e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0175075  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004360  cysteine desulfurase  43.19 
 
 		 404 aa  318  7.999999999999999e-86  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.591204  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2647  cysteine desulfurase NifS  40.47 
 
 		 389 aa  318  1e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00311085 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2262  cysteine desulfurase  43.41 
 
 		 406 aa  317  2e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.626751 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2808  aminotransferase, class V  44.09 
 
 		 379 aa  317  2e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1569  cysteine desulfurase NifS  40.21 
 
 		 389 aa  317  3e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00349258  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0992  cysteine desulfurase  41.3 
 
 		 391 aa  317  3e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00026474  normal  0.256714 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4044  aminotransferase, class V  42.41 
 
 		 389 aa  317  3e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.159236 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2296  aminotransferase, class V  43.16 
 
 		 394 aa  317  3e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2733  cysteine desulfurase  42.64 
 
 		 407 aa  316  5e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2655  cysteine desulfurase  42.38 
 
 		 407 aa  315  7e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2290  cysteine desulfurase IscS  42.89 
 
 		 405 aa  314  9.999999999999999e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00326388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4665  cysteine desulfurase IscS  42.27 
 
 		 436 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3698  cysteine desulfurase IscS  42.27 
 
 		 436 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.789582  normal  0.356633 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>