More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_0188 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_0188  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 
624 aa  1226    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.261815  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4125  sodium/hydrogen exchanger  60.24 
 
 
584 aa  612  9.999999999999999e-175  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.688995  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0191  sodium/hydrogen exchanger  49.82 
 
 
577 aa  527  1e-148  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.912103  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0193  sodium/hydrogen exchanger  39.72 
 
 
598 aa  380  1e-104  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1145  sodium/hydrogen exchanger  27.22 
 
 
566 aa  230  7e-59  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.021897  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1795  sodium/hydrogen exchanger  26.69 
 
 
566 aa  227  4e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.315073  unclonable  0.0000000110445 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1221  sodium/hydrogen exchanger  26.67 
 
 
565 aa  224  3e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.082268  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0413  sodium/hydrogen exchanger  28.4 
 
 
566 aa  219  1e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.706339  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1863  sodium/hydrogen exchanger  29.6 
 
 
558 aa  209  2e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.683129  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2094  sodium/hydrogen exchanger  31.21 
 
 
541 aa  205  2e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2284  sodium/hydrogen exchanger  31.07 
 
 
572 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.608384  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0062  putative potassium/proton antiporter  28.17 
 
 
720 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000657168  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2771  sodium/hydrogen exchanger  27.92 
 
 
595 aa  197  6e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.135966  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4612  sodium/hydrogen exchanger  27.16 
 
 
548 aa  196  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.180321 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1095  sodium/hydrogen exchanger  27.42 
 
 
562 aa  194  4e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.129654  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2772  sodium/hydrogen exchanger  28.09 
 
 
571 aa  191  4e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.48581  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0835  sodium/hydrogen exchanger  27.84 
 
 
561 aa  189  9e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1997  sodium/hydrogen exchanger  28.64 
 
 
576 aa  190  9e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3552  sodium/hydrogen exchanger  27.91 
 
 
551 aa  187  4e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.341909  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1895  sodium/hydrogen exchanger  28.36 
 
 
574 aa  187  6e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.49823  normal  0.375408 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1614  sodium/hydrogen exchanger  27.32 
 
 
566 aa  186  1.0000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4016  sodium/hydrogen exchanger  27.39 
 
 
775 aa  185  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00920037  hitchhiker  0.000000797462 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1199  sodium/hydrogen exchanger  27.57 
 
 
546 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.399558  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3158  sodium/hydrogen exchanger  28.62 
 
 
547 aa  182  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.833464  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2938  sodium/hydrogen exchanger  28.62 
 
 
547 aa  182  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1420  sodium/hydrogen exchanger  28.22 
 
 
771 aa  182  2e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3569  Sodium/hydrogen exchanger  28.79 
 
 
592 aa  182  2e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.278233 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2967  sodium/hydrogen exchanger  25.76 
 
 
762 aa  180  8e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.619834 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3086  Sodium/hydrogen exchanger  27.92 
 
 
773 aa  180  8e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.982722  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4337  carbonic anhydrase  29.57 
 
 
572 aa  179  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0331967 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1178  putative potassium efflux transporter  25.57 
 
 
650 aa  179  1e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4527  sodium/hydrogen exchanger  30.62 
 
 
671 aa  177  4e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.436513  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0606  TrkA-N, Sodium/hydrogen exchanger  28.6 
 
 
574 aa  177  5e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0930  sodium/hydrogen exchanger  28.39 
 
 
575 aa  173  1e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4196  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein  27.02 
 
 
575 aa  171  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.731254  normal  0.373552 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2433  sodium/hydrogen exchanger  26.83 
 
 
578 aa  169  1e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1539  sodium/hydrogen exchanger  30.06 
 
 
662 aa  168  2.9999999999999998e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.183073  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3972  sodium/hydrogen exchanger  30.29 
 
 
424 aa  166  9e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.806764  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0023  sodium/hydrogen exchanger  28.4 
 
 
673 aa  166  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000486087 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0751  sodium/hydrogen exchanger  27.86 
 
 
581 aa  164  5.0000000000000005e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1076  sodium/hydrogen exchanger  26.36 
 
 
665 aa  163  8.000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.886506 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1047  sodium/hydrogen exchanger  26.36 
 
 
665 aa  163  8.000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1627  sodium/hydrogen exchanger family protein  27.49 
 
 
567 aa  162  2e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.510205  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0855  sodium/hydrogen exchanger  24.91 
 
 
674 aa  162  2e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0221534  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1372  sodium/hydrogen exchanger  27.33 
 
 
567 aa  162  3e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1509  sodium/hydrogen exchanger  27.24 
 
 
567 aa  161  4e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1651  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  24.87 
 
 
671 aa  155  2e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.899858  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0784  sodium/hydrogen exchanger  25.18 
 
 
665 aa  153  8.999999999999999e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0539  antiporter-2, CPA2 family monovalent cation/proton antiporter  26.23 
 
 
658 aa  152  2e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1776  sodium/hydrogen exchanger  23.87 
 
 
658 aa  151  3e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000381991  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3143  potassium efflux system protein  24.12 
 
 
649 aa  150  6e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0190825 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1159  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  25.53 
 
 
648 aa  150  6e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1611  sodium/hydrogen exchanger  26.82 
 
 
660 aa  147  6e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0754  sodium/hydrogen exchanger  27.02 
 
 
598 aa  147  8.000000000000001e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.835162  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2617  potassium efflux system protein  24.81 
 
 
649 aa  145  2e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0308  sodium/hydrogen exchanger  26.94 
 
 
674 aa  144  4e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.512225  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1119  sodium/hydrogen exchanger  23.52 
 
 
741 aa  144  4e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2090  sodium/hydrogen exchanger  25.79 
 
 
666 aa  144  5e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.236107  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1204  sodium/hydrogen exchanger family protein  25 
 
 
697 aa  143  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01391  Kef-type K+ transport system, membrane component  26.2 
 
 
720 aa  143  9.999999999999999e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2797  potassium efflux system protein  25.51 
 
 
648 aa  141  3e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.488143 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2614  potassium efflux system protein  24.79 
 
 
649 aa  141  3.9999999999999997e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2867  sodium/hydrogen exchanger  23.23 
 
 
649 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1906  potassium efflux system protein  26.02 
 
 
660 aa  140  7.999999999999999e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1424  sodium/hydrogen exchanger  26.49 
 
 
566 aa  139  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1293  potassium efflux system protein  25.35 
 
 
650 aa  139  1e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0727  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  26.85 
 
 
670 aa  139  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000025266  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1188  hypothetical protein  25.17 
 
 
682 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0275042 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1991  sodium/hydrogen exchanger  23.57 
 
 
666 aa  138  3.0000000000000003e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000714201 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2917  sodium/hydrogen exchanger  25.17 
 
 
561 aa  137  8e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.862337  hitchhiker  0.00347673 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0716  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  25.87 
 
 
617 aa  136  9.999999999999999e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.32849 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1368  potassium efflux system protein  22.76 
 
 
662 aa  136  9.999999999999999e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.164343  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1461  sodium/hydrogen exchanger  24.47 
 
 
636 aa  136  9.999999999999999e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.297602  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1270  sodium/hydrogen exchanger  23.67 
 
 
657 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1271  sodium/hydrogen exchanger  25.51 
 
 
457 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1463  potassium efflux system protein  24.3 
 
 
648 aa  135  3e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1132  hypothetical protein  24.29 
 
 
564 aa  135  3e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0505  sodium/hydrogen exchanger  24.11 
 
 
584 aa  135  3e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2884  potassium efflux system protein  24.12 
 
 
648 aa  134  5e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.76121  normal  0.0157932 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1499  potassium efflux system protein  24.49 
 
 
648 aa  134  5e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1468  potassium efflux system protein  24.12 
 
 
648 aa  134  6e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3140  potassium efflux system protein  23.46 
 
 
566 aa  134  6e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.138229  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2803  sodium/hydrogen exchanger  24.73 
 
 
656 aa  133  7.999999999999999e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.230483 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0360  TrkA-N:TrkA-C:Sodium/hydrogen exchanger  27.58 
 
 
659 aa  133  9e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852363  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4111  sodium/hydrogen exchanger  25.7 
 
 
528 aa  133  9e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000149336 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4813  sodium/hydrogen exchanger  26.24 
 
 
666 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0332  sodium/hydrogen exchanger  25.05 
 
 
667 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1647  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  24.77 
 
 
648 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2112  potassium efflux system protein  26.86 
 
 
624 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.521521  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0602  sodium/hydrogen exchanger  24.48 
 
 
667 aa  131  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.616152  normal  0.0415752 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1645  sodium/hydrogen exchanger  24.86 
 
 
586 aa  131  3e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4116  putative glutathione-regulated potassium efflux system protein  24.27 
 
 
666 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0904  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  24.38 
 
 
608 aa  130  6e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0492  potassium efflux system protein  26.62 
 
 
663 aa  130  6e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.491444  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3938  sodium/hydrogen exchanger  24.86 
 
 
652 aa  130  6e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2098  sodium/hydrogen exchanger  23.36 
 
 
584 aa  130  7.000000000000001e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0096  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  24.76 
 
 
620 aa  130  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.467251 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0261  sodium/hydrogen exchanger family protein  25.74 
 
 
588 aa  130  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0669  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  24.58 
 
 
663 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.842993 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1105  Sodium/hydrogen exchanger  23.36 
 
 
672 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107002  normal  0.0477197 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>