192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1974 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_1974  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 
283 aa  548  1e-155  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  2.69645e-06  unclonable  3.67636e-08 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1629  transcriptional regulator, MerR family  37.34 
 
 
306 aa  160  2e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0882685  normal  0.393491 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2305  transcriptional regulator, MerR family  35.53 
 
 
268 aa  116  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.643594 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20290  predicted transcriptional regulator  36.03 
 
 
277 aa  103  3e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0400625  normal  0.347976 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1424  MerR family transcriptional regulator  31.8 
 
 
279 aa  103  4e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.140644 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3833  MerR family transcriptional regulator  30.08 
 
 
270 aa  92.8  5e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  1.00059e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4810  transcription activator effector binding  31.79 
 
 
274 aa  90.9  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.858088  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3506  transcription activator, effector binding  31.9 
 
 
274 aa  81.6  1e-14  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.771694  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06160  serine/threonine protein phosphatase  47.62 
 
 
361 aa  72.8  6e-12  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2402  transcriptional regulator, MerR family  32.35 
 
 
272 aa  72.8  6e-12  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.290341  hitchhiker  0.00583984 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1820  MerR family transcriptional regulator  21.4 
 
 
270 aa  67.8  2e-10  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.404333  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2545  transcriptional regulator, MerR family  21.83 
 
 
269 aa  67  3e-10  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2630  transcriptional regulator, MerR family  22.22 
 
 
269 aa  66.6  4e-10  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00281071  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0385  transcription activator, effector binding  29.01 
 
 
286 aa  65.5  9e-10  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2780  transcriptional regulator, MerR family  21.51 
 
 
269 aa  65.1  1e-09  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  8.80145e-09 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19550  serine/threonine protein phosphatase  35.92 
 
 
361 aa  65.5  1e-09  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.17725  normal  0.381768 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2316  regulatory protein, MerR  35.93 
 
 
369 aa  64.3  2e-09  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.280801  normal  0.123157 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1993  transcriptional regulator, MerR family  31.61 
 
 
272 aa  64.3  2e-09  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2588  transcriptional regulator, MerR family  21.83 
 
 
269 aa  63.5  3e-09  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.40806e-18 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2354  MerR family transcriptional regulator  21.83 
 
 
269 aa  63.5  3e-09  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.03249e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2317  MerR family transcriptional regulator  21.43 
 
 
269 aa  63.5  4e-09  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0566035  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6982  MerR family transcriptional regulator  38.1 
 
 
270 aa  63.2  5e-09  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2401  MerR family transcriptional regulator  21.03 
 
 
269 aa  62.4  8e-09  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.908212  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2576  MerR family transcriptional regulator  21.03 
 
 
269 aa  62.4  8e-09  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.473387  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3560  MerR family transcriptional regulator  22.78 
 
 
287 aa  62.4  9e-09  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.453881 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0225  putative transcriptional regulator, MerR family  34.13 
 
 
262 aa  60.8  2e-08  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2159  MerR family transcriptional regulator  29.39 
 
 
265 aa  58.2  1e-07  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0684  MerR family transcriptional regulator  25.36 
 
 
279 aa  57.8  2e-07  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5047  MerR family transcriptional regulator  40.19 
 
 
276 aa  58.2  2e-07  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.574995  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2419  protein serine/threonine phosphatase  41.67 
 
 
355 aa  55.8  7e-07  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.111892 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2311  putative transcriptional regulator, MerR family  41.75 
 
 
399 aa  55.5  9e-07  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0479  MerR family transcriptional regulator  40.21 
 
 
354 aa  55.5  1e-06  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.369084 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2141  MerR family transcriptional regulator  40.3 
 
 
181 aa  55.1  1e-06  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0481912  normal  0.077667 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1008  MerR family transcriptional regulator  25.2 
 
 
253 aa  53.9  3e-06  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1617  putative transcriptional regulator, MerR family  42.42 
 
 
252 aa  53.9  3e-06  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.870774 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4623  transcriptional regulator, MerR family  47.83 
 
 
297 aa  53.5  4e-06  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1150  transcriptional regulator, MerR family  37.82 
 
 
135 aa  52.8  6e-06  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00496019 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7266  transcriptional regulator, MerR family  29.12 
 
 
274 aa  52.4  8e-06  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3503  transcriptional regulator, putative  23.35 
 
 
273 aa  51.6  1e-05  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.590051  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8866  putative transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 
279 aa  52  1e-05  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.249264  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1609  MerR family transcriptional regulator  26.42 
 
 
272 aa  51.6  1e-05  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.822901  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1357  MerR family transcriptional regulator  39.44 
 
 
342 aa  50.8  2e-05  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.744828  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0148  MerR family transcriptional regulator  32.41 
 
 
257 aa  50.8  2e-05  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.290112  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3507  MerR family transcriptional regulator  35.58 
 
 
292 aa  51.2  2e-05  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.401792  normal  0.0867153 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64500  putative transcriptional regulator  30.16 
 
 
270 aa  50.8  2e-05  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4799  transcriptional regulator, MerR family  31.54 
 
 
258 aa  51.2  2e-05  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2909  MerR family transcriptional regulator  46.55 
 
 
292 aa  50.8  2e-05  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2284  transcriptional regulator, MerR family  37.5 
 
 
215 aa  50.4  3e-05  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3639  putative transcriptional regulator, MerR family  39.81 
 
 
139 aa  50.8  3e-05  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2195  transcriptional regulator, MerR family  37.5 
 
 
214 aa  50.4  3e-05  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3767  transcriptional regulator, MerR family  41.3 
 
 
264 aa  50.4  3e-05  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.237591  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4179  transcriptional activator ligand binding domain protein  30 
 
 
279 aa  50.4  3e-05  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.803381 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2735  putative transcriptional regulator, MerR family  28.29 
 
 
264 aa  50.1  4e-05  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0721242  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2529  transcriptional regulator, MerR family  38.83 
 
 
270 aa  50.4  4e-05  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1662  MerR family transcriptional regulator  36.11 
 
 
215 aa  50.4  4e-05  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.727696  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4386  MerR family transcriptional regulator  34.85 
 
 
340 aa  50.1  4e-05  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0065  transcriptional regulator, MerR family  39.13 
 
 
252 aa  50.1  4e-05  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4163  transcriptional regulator, MerR family  29.13 
 
 
275 aa  50.1  5e-05  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3207  putative transcriptional regulator, MerR family  39.53 
 
 
143 aa  49.3  7e-05  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.789074  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1749  MerR family transcriptional regulator  29.11 
 
 
241 aa  49.3  7e-05  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.682518  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2806  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  33.98 
 
 
158 aa  48.5  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.37472  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4611  transcriptional regulator, MerR family  43.94 
 
 
151 aa  48.5  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1384  regulatory protein, MerR  46.77 
 
 
132 aa  48.5  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1562  transcriptional regulator  31.17 
 
 
160 aa  48.9  0.0001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2183  putative transcriptional regulator, MerR family  44.07 
 
 
242 aa  47.8  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0331  MerR family transcriptional regulator  18.46 
 
 
281 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3072  MerR family transcriptional regulator  37.1 
 
 
341 aa  48.1  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0969  MerR family transcriptional regulator  30 
 
 
252 aa  47.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00256708  hitchhiker  0.0060004 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2162  transcriptional regulator, MerR family  33.93 
 
 
338 aa  48.1  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0710491 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1241  MerR family transcriptional regulator  33.62 
 
 
144 aa  47.8  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1655  MerR family transcriptional regulator  31.75 
 
 
237 aa  47.4  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.112658  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2323  putative transcriptional regulator MerR  30.69 
 
 
144 aa  47  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3676  transcriptional regulator, MerR family  39.06 
 
 
143 aa  47.4  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.511555  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0437  MerR family transcriptional regulator  34.11 
 
 
161 aa  47  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3205  MerR family transcriptional regulator  22.66 
 
 
273 aa  47.4  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.208736  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5613  transcriptional regulator, MerR family  49.09 
 
 
283 aa  47.4  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.395167  normal  0.0913658 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1222  transcriptional regulator, MerR family  38.24 
 
 
254 aa  47.4  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.867665  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3662  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 
150 aa  47  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.293998  normal  0.202254 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0323  transcription regulator family  26.26 
 
 
253 aa  47  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1494  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  32.38 
 
 
165 aa  47  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.163233 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1790  transcriptional regulator  33.83 
 
 
141 aa  47  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.269282  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0535  transcriptional regulator, MerR family  25.84 
 
 
254 aa  47  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.438553  normal  0.258616 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0088  hypothetical protein  28.77 
 
 
253 aa  46.6  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2808  transcriptional regulator, MerR family  35.29 
 
 
276 aa  47  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.44001  normal  0.316047 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22770  predicted transcriptional regulator  51.79 
 
 
284 aa  46.6  0.0005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1079  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  30.61 
 
 
252 aa  46.6  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.23199 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1480  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  39.44 
 
 
148 aa  46.6  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00810919  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2916  MerR family transcriptional regulator  39.13 
 
 
154 aa  46.2  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.221684  normal  0.314176 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1215  transcriptional regulator, MerR family  33.67 
 
 
152 aa  46.2  0.0006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.460716  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1402  MerR family transcriptional regulator  29.82 
 
 
133 aa  46.2  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.87391  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3479  MerR family transcriptional regulator  35.05 
 
 
156 aa  46.2  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0101  putative transcriptional regulator MerR  29.7 
 
 
144 aa  46.2  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.656805  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5793  MerR family transcriptional regulator  35.48 
 
 
351 aa  45.8  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.998817  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15480  putative transcriptional regulator MerR  29.7 
 
 
144 aa  46.2  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  7.44936e-13  unclonable  4.3774e-22 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5067  MerR family transcriptional regulator  35.48 
 
 
351 aa  45.8  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.424066  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2341  putative transcriptional regulator MerR  29.7 
 
 
144 aa  46.2  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6498  putative transcriptional regulator MerR  29.7 
 
 
144 aa  46.2  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0239269  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6344  Hg(II) resistance regulatory protein MerR  29.7 
 
 
162 aa  46.2  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000851109  unclonable  5.37327e-08 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6171  putative transcriptional regulator MerR  29.7 
 
 
144 aa  46.2  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000597544  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4158  MerR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
135 aa  45.8  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.144769 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>