294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1169 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1169  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 455 aa  890    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.968326  normal  0.245673 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2808  major facilitator superfamily MFS_1  68.28 
 
 		 456 aa  541  1e-153  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.018941 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2301  major facilitator superfamily MFS_1  64.53 
 
 		 518 aa  509  1e-143  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.298617  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0961  major facilitator transporter  59.96 
 
 		 463 aa  504  9.999999999999999e-143  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1045  major facilitator superfamily MFS_1  61.49 
 
 		 464 aa  502  1e-141  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4762  major facilitator superfamily MFS_1  62.03 
 
 		 471 aa  495  1e-139  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3185  major facilitator superfamily MFS_1  61.23 
 
 		 464 aa  484  1e-135  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.88619 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13430  nitrate/nitrite transporter  59.13 
 
 		 507 aa  471  1.0000000000000001e-131  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.0010455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1158  major facilitator superfamily MFS_1  59.96 
 
 		 448 aa  461  9.999999999999999e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.791207  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4689  major facilitator transporter  53.07 
 
 		 467 aa  432  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal  0.0558767 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6036  major facilitator superfamily MFS_1  52.64 
 
 		 467 aa  428  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.475953 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2270  major facilitator superfamily (MFS)oxalate/formate antiporter  52.86 
 
 		 467 aa  429  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.248871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4006  major facilitator transporter  47.76 
 
 		 550 aa  415  9.999999999999999e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2008  major facilitator transporter  52.19 
 
 		 467 aa  414  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4078  major facilitator superfamily oxalate/formate antiporter  51.97 
 
 		 475 aa  410  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.801255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3578  major facilitator transporter  50 
 
 		 553 aa  404  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4642  major facilitator transporter  47.63 
 
 		 548 aa  395  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0111  major facilitator superfamily MFS_1  50 
 
 		 546 aa  392  1e-108  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4093  MFS permease  48.88 
 
 		 552 aa  388  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.979947  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3633  major facilitator superfamily MFS_1  47.95 
 
 		 552 aa  383  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.364379 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0620  major facilitator transporter  47.72 
 
 		 549 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1307  major facilitator superfamily MFS_1  44.51 
 
 		 538 aa  384  1e-105  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3922  major facilitator superfamily MFS_1  48.15 
 
 		 552 aa  384  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.92025  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5340  MFS permease-like protein  45.6 
 
 		 553 aa  380  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4899  major facilitator transporter  45.81 
 
 		 553 aa  381  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0313  major facilitator transporter  47.13 
 
 		 553 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0322  major facilitator transporter  46.72 
 
 		 554 aa  381  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.41241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3829  major facilitator superfamily transporter  47.17 
 
 		 547 aa  379  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.257719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1334  major facilitator transporter  45.36 
 
 		 545 aa  379  1e-104  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0288  major facilitator superfamily MFS_1  46.93 
 
 		 553 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000241924 
 
 
-
 
NC_003296  RS02384  transporter transmembrane protein  46.34 
 
 		 549 aa  378  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.458603 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0808  major facilitator superfamily MFS_1  47.01 
 
 		 549 aa  375  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4920  major facilitator transporter  47.24 
 
 		 552 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0958503  hitchhiker  0.000474897 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4391  major facilitator superfamily MFS_1  45.53 
 
 		 575 aa  378  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344697  normal  0.796533 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4281  major facilitator superfamily MFS_1  45.53 
 
 		 575 aa  378  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0308  major facilitator transporter  47.13 
 
 		 553 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00531015 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3191  major facilitator superfamily MFS_1  44.38 
 
 		 545 aa  373  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3696  major facilitator superfamily MFS_1  44.19 
 
 		 545 aa  365  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.662162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1293  major facilitator transporter  47.31 
 
 		 566 aa  367  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6345  major facilitator superfamily permease  45.74 
 
 		 551 aa  365  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0404816  normal  0.0784492 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0490  major facilitator transporter  46.03 
 
 		 537 aa  364  2e-99  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.685431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5500  major facilitator superfamily MFS_1  43.98 
 
 		 545 aa  362  6e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00470  integral membrane transporter  44.95 
 
 		 558 aa  356  3.9999999999999996e-97  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0394066  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2386  major facilitator transporter  45.17 
 
 		 556 aa  353  2.9999999999999997e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0986  major facilitator transporter  45.1 
 
 		 556 aa  351  1e-95  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1386  major facilitator transporter  38.35 
 
 		 570 aa  326  5e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.863121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1036  major facilitator superfamily MFS_1  41.53 
 
 		 433 aa  295  1e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1344  major facilitator superfamily MFS_1  43.46 
 
 		 421 aa  290  4e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1890  major facilitator superfamily transporter  40.37 
 
 		 424 aa  277  3e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00250834  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0467  major facilitator superfamily MFS_1  41.98 
 
 		 424 aa  271  1e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000451235  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3728  major facilitator transporter  38.13 
 
 		 411 aa  268  2e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C10  major facilitator superfamily permease  41.01 
 
 		 413 aa  263  4.999999999999999e-69  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3923  major facilitator transporter  38.57 
 
 		 418 aa  262  1e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.768461  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1606  major facilitator transporter  36.78 
 
 		 412 aa  259  7e-68  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3733  major facilitator transporter  40.21 
 
 		 397 aa  258  1e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0256  major facilitator transporter  40.21 
 
 		 424 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.146977  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0769  oxalate:formate antiporter  39.01 
 
 		 406 aa  243  3.9999999999999997e-63  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00153428  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1416  major facilitator superfamily permease  37.02 
 
 		 401 aa  231  2e-59  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00145831  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0858  major facilitator transporter  36.91 
 
 		 442 aa  210  4e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.326759  normal  0.152741 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1405  putative permease  32.44 
 
 		 428 aa  196  7e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0872  major facilitator superfamily MFS_1  37.04 
 
 		 453 aa  195  1e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0593371  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0868  major facilitator superfamily MFS_1  36.54 
 
 		 453 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1744  major facilitator superfamily MFS_1  29.26 
 
 		 425 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.799326  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1424  transporter, putative  32.79 
 
 		 938 aa  147  3e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0936  major facilitator superfamily MFS_1  27.91 
 
 		 407 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0038  major facilitator transporter  30.97 
 
 		 432 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3406  major facilitator transporter  27.67 
 
 		 408 aa  138  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.913918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2958  major facilitator transporter  31.71 
 
 		 421 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.175452  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1705  major facilitator transporter  32.12 
 
 		 442 aa  134  3e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3154  major facilitator superfamily MFS_1  32.74 
 
 		 421 aa  134  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.328617  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1720  major facilitator transporter  28.72 
 
 		 419 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.127263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3046  major facilitator superfamily MFS_1  31.46 
 
 		 421 aa  134  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.548752  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2817  major facilitator family transporter  27.82 
 
 		 398 aa  133  7.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0448046  normal  0.764982 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2922  major facilitator superfamily MFS_1  27.68 
 
 		 416 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2356  major facilitator superfamily MFS_1  26.27 
 
 		 405 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2840  major facilitator family transporter  27.82 
 
 		 398 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.638107  normal  0.599456 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0515  major facilitator transporter  28.06 
 
 		 418 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2777  major facilitator family transporter  27.82 
 
 		 398 aa  131  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2952  major facilitator family transporter  27.82 
 
 		 398 aa  131  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2736  major facilitator family transporter  27.82 
 
 		 398 aa  131  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.601142  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24130  sugar phosphate permease  27.36 
 
 		 436 aa  130  4.0000000000000003e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0466  major facilitator superfamily MFS_1  28.28 
 
 		 415 aa  130  7.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2495  oxalate:formate antiporter  25.68 
 
 		 402 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116022  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2680  oxalate:formate antiporter  25.68 
 
 		 402 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3364  major facilitator transporter  28.15 
 
 		 412 aa  129  1.0000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3142  major facilitator superfamily MFS_1  27.11 
 
 		 434 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2456  oxalate/formate antiporter (permease)  26.08 
 
 		 402 aa  127  3e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.001991  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2746  putative oxalate:formate antiporter  26.08 
 
 		 402 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000311684  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2172  major facilitator superfamily MFS_1  27.85 
 
 		 407 aa  127  6e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00749383  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1924  major facilitator superfamily MFS_1  30.4 
 
 		 458 aa  126  7e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_32095  predicted protein  41.76 
 
 		 679 aa  126  9e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2703  putative oxalate:formate antiporter  25.45 
 
 		 402 aa  125  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2428  oxalate:formate antiporter (permease)  26.56 
 
 		 402 aa  125  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.739048  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03397  predicted transporter  25.45 
 
 		 402 aa  125  2e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03348  hypothetical protein  25.45 
 
 		 402 aa  125  2e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4923  inner membrane protein YhjX  25.45 
 
 		 400 aa  125  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2459  major facilitator transporter  25.51 
 
 		 402 aa  124  3e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0169362  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4042  major facilitator family transporter  25.45 
 
 		 402 aa  124  4e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2718  oxalate:formate antiporter, putative  25.23 
 
 		 402 aa  124  4e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00584048  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0169  oxalate/formate antiporter  25.19 
 
 		 402 aa  124  4e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.86802  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>