More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0445 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_0445  protein tyrosine phosphatase  100 
 
 
186 aa  378  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.262607 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2341  protein-tyrosine-phosphatase  65.5 
 
 
171 aa  229  1e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0101078  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5736  protein tyrosine phosphatase  51.83 
 
 
158 aa  149  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.062216  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06930  protein-tyrosine-phosphatase  49.35 
 
 
166 aa  140  9.999999999999999e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.943825  normal  0.143784 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4517  protein tyrosine phosphatase  48.65 
 
 
196 aa  139  3e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.113878  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2932  protein tyrosine phosphatase  50 
 
 
152 aa  138  6e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.611647  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12263  phosphotyrosine protein phosphatase ptpA  45.45 
 
 
163 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3277  protein tyrosine phosphatase  45.81 
 
 
171 aa  127  8.000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000374545  hitchhiker  0.00508467 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1355  protein tyrosine phosphatase  44.1 
 
 
174 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4542  protein tyrosine phosphatase  44.17 
 
 
159 aa  125  5e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1142  protein tyrosine phosphatase  44.44 
 
 
160 aa  124  6e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0134152  normal  0.557378 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2145  protein tyrosine phosphatase  44.44 
 
 
160 aa  123  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.886119 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0047  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  42.94 
 
 
453 aa  123  2e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5949  protein tyrosine phosphatase  44.65 
 
 
160 aa  122  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.1373  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2128  protein tyrosine phosphatase  44.65 
 
 
160 aa  122  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1479  protein tyrosine phosphatase  45.4 
 
 
154 aa  119  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.14971  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3134  protein tyrosine phosphatase  44.65 
 
 
167 aa  119  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2165  protein tyrosine phosphatase  43.21 
 
 
160 aa  119  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.234598  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1590  protein tyrosine phosphatase  44.17 
 
 
162 aa  118  4.9999999999999996e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.199236  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1307  protein tyrosine phosphatase  42.41 
 
 
160 aa  117  7e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5434  protein tyrosine phosphatase  44.24 
 
 
160 aa  117  7e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0903732  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3589  protein tyrosine phosphatase  43.87 
 
 
164 aa  117  7e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.164977  hitchhiker  0.00146697 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1903  protein tyrosine phosphatase  42.01 
 
 
154 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000352137 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4172  protein tyrosine phosphatase  43.21 
 
 
154 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.207146  normal  0.309722 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3811  protein tyrosine phosphatase  42.01 
 
 
154 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00121262  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1514  protein tyrosine phosphatase  43.56 
 
 
154 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.284825  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22461  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  41.61 
 
 
159 aa  116  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3348  protein tyrosine phosphatase  40.85 
 
 
173 aa  115  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0078  protein tyrosine phosphatase  43.6 
 
 
178 aa  115  3e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1431  protein tyrosine phosphatase  43.04 
 
 
165 aa  114  7.999999999999999e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.430051  normal  0.53924 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3634  protein tyrosine phosphatase  39.51 
 
 
183 aa  113  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3409  protein tyrosine phosphatase  43.87 
 
 
165 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.198502  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3347  protein tyrosine phosphatase  43.87 
 
 
165 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.236586  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3358  protein tyrosine phosphatase  43.87 
 
 
165 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.603407  normal  0.299244 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2004  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  42.07 
 
 
160 aa  112  4.0000000000000004e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.704301  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2323  protein tyrosine phosphatase  38.89 
 
 
157 aa  112  4.0000000000000004e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0989989  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2888  protein tyrosine phosphatase  40.62 
 
 
164 aa  111  6e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0779863  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1022  protein tyrosine phosphatase  42.33 
 
 
159 aa  111  6e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.112265  normal  0.296416 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0775  protein tyrosine phosphatase  39.49 
 
 
166 aa  111  6e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00021336  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1617  protein tyrosine phosphatase  39.05 
 
 
154 aa  111  7.000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.11326  normal  0.164412 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3622  protein tyrosine phosphatase  40.99 
 
 
164 aa  110  9e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.27551  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0030  protein tyrosine phosphatase  39.26 
 
 
161 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1166  protein tyrosine phosphatase  36.08 
 
 
157 aa  108  3e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.654881  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0417  protein tyrosine phosphatase  41.67 
 
 
158 aa  108  3e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0349216  normal  0.0689798 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0875  protein tyrosine phosphatase  45 
 
 
152 aa  108  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.897131  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0115  protein tyrosine phosphatase  40.96 
 
 
164 aa  108  3e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0179  protein tyrosine phosphatase  40.94 
 
 
175 aa  108  4.0000000000000004e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4026  protein tyrosine phosphatase  35.4 
 
 
166 aa  108  4.0000000000000004e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.22537 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1460  protein tyrosine phosphatase  37.36 
 
 
175 aa  108  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0984651  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1913  protein tyrosine phosphatase  41.67 
 
 
159 aa  108  5e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12490  protein-tyrosine-phosphatase  39.1 
 
 
175 aa  107  8.000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.800681  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20411  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  35.44 
 
 
157 aa  107  9.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1469  protein tyrosine phosphatase  39.38 
 
 
164 aa  107  1e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.368051  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0949  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  38.75 
 
 
164 aa  106  2e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1551  protein tyrosine phosphatase  38.79 
 
 
165 aa  106  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0172729  normal  0.0349447 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1737  protein tyrosine phosphatase  42.33 
 
 
159 aa  106  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3099  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  40.62 
 
 
157 aa  106  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0468905  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1873  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  42.04 
 
 
159 aa  105  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.30876  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25540  phosphotyrosine protein phosphatase  40.12 
 
 
154 aa  105  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0818  protein tyrosine phosphatase  40.91 
 
 
157 aa  104  6e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.74944  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2001  protein tyrosine phosphatase  42.04 
 
 
175 aa  104  7e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2264  protein tyrosine phosphatase  40.59 
 
 
182 aa  104  7e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0034  protein tyrosine phosphatase  39.66 
 
 
182 aa  104  7e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.297427  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1683  protein tyrosine phosphatase  38.41 
 
 
157 aa  103  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1675  protein tyrosine phosphatase  40.13 
 
 
161 aa  103  1e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.040808  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2437  protein tyrosine phosphatase  38.27 
 
 
157 aa  103  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94576  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1565  protein tyrosine phosphatase  39.24 
 
 
165 aa  102  3e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.455451  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1352  protein tyrosine phosphatase  42.95 
 
 
158 aa  102  3e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0253204  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2183  phosphotyrosine protein phosphatase  39.75 
 
 
154 aa  102  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18001  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  38.31 
 
 
157 aa  101  6e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.756832  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2657  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  42.04 
 
 
164 aa  101  7e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14790  Low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  42.24 
 
 
154 aa  101  7e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3101  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  42.04 
 
 
164 aa  101  7e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0939667  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2601  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  42.04 
 
 
164 aa  101  7e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.196662  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1491  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  42.04 
 
 
164 aa  101  7e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2219  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  42.04 
 
 
164 aa  101  7e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17831  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  36.71 
 
 
157 aa  101  7e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.321428  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1710  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  42.04 
 
 
159 aa  100  8e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2735  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  42.04 
 
 
159 aa  100  8e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0776  protein tyrosine phosphatase  40.38 
 
 
152 aa  100  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.648722  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2581  protein tyrosine phosphatase  36.59 
 
 
165 aa  100  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.191101  hitchhiker  0.000439001 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0463  protein tyrosine phosphatase  40.76 
 
 
163 aa  100  1e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1189  protein tyrosine phosphatase  42.5 
 
 
164 aa  100  1e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.330824  normal  0.0337788 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1243  protein tyrosine phosphatase  38.04 
 
 
162 aa  99.8  2e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0657  protein tyrosine phosphatase  35.71 
 
 
188 aa  100  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2721  protein-tyrosine-phosphatase (low molecular weight phosphotyrosine protein)  35.53 
 
 
160 aa  99.8  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0625929  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00340  protein-tyrosine-phosphatase  40 
 
 
188 aa  99.4  3e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.662786 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17781  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  35.26 
 
 
157 aa  98.6  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.214222  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5051  protein tyrosine phosphatase  40.88 
 
 
165 aa  98.2  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.844894  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3156  protein tyrosine phosphatase  40.13 
 
 
159 aa  97.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2962  protein tyrosine phosphatase  40.13 
 
 
159 aa  97.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.502384 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0736  protein tyrosine phosphatase  37.13 
 
 
164 aa  97.1  1e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0397767 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3646  protein tyrosine phosphatase  38.89 
 
 
163 aa  97.1  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.778837  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2532  protein tyrosine phosphatase  41.33 
 
 
162 aa  97.1  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.513089 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2057  protein tyrosine phosphatase  37.89 
 
 
163 aa  97.1  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.323033 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2713  protein tyrosine phosphatase  40.76 
 
 
155 aa  97.4  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2075  protein tyrosine phosphatase  41.67 
 
 
172 aa  97.1  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.545305  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3847  protein tyrosine phosphatase  36.36 
 
 
182 aa  97.1  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1114  protein tyrosine phosphatase  38.75 
 
 
158 aa  96.3  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000797417  unclonable  0.0000000387087 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02300  protein-tyrosine-phosphatase  42.31 
 
 
167 aa  96.7  2e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>