119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_5414 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_5414  ribonuclease P protein component  100 
 
 		 130 aa  237  2.9999999999999997e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31970  ribonuclease P protein component  57.26 
 
 		 122 aa  107  8.000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5412  ribonuclease P  52.14 
 
 		 118 aa  99.4  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0007  ribonuclease P  52.14 
 
 		 118 aa  99.4  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0873597  normal  0.0618314 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5788  ribonuclease P  52.14 
 
 		 118 aa  99.4  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.534341  normal  0.0163011 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5095  ribonuclease P protein component  50.83 
 
 		 127 aa  97.1  8e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4984  ribonuclease P protein component  50.83 
 
 		 122 aa  96.3  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9055  ribonuclease P protein  56.6 
 
 		 109 aa  89.4  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00175664  normal  0.592231 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3378  ribonuclease P protein component  46.56 
 
 		 125 aa  87.4  6e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4224  ribonuclease P protein component  51.67 
 
 		 119 aa  86.3  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0829  ribonuclease P  46.79 
 
 		 124 aa  84.7  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.861038 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4512  ribonuclease P protein component  48.18 
 
 		 120 aa  81.6  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00356165 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7099  ribonuclease P protein  61.11 
 
 		 81 aa  82  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.260789  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3595  ribonuclease P protein component  45.87 
 
 		 124 aa  81.3  0.000000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.183825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6077  ribonuclease P  44.95 
 
 		 119 aa  80.5  0.000000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0418194  normal  0.134211 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_38050  ribonuclease P protein component  53.26 
 
 		 91 aa  78.6  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7340  ribonuclease P protein component  54.13 
 
 		 121 aa  78.6  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.921062 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3729  ribonuclease P protein component  58.56 
 
 		 112 aa  76.3  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.468865 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39790  ribonuclease P protein component  54.33 
 
 		 122 aa  75.9  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.0000138929  normal  0.561767 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3116  ribonuclease P protein  45.13 
 
 		 147 aa  74.3  0.0000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134216  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3936  ribonuclease P protein component  44.35 
 
 		 136 aa  71.2  0.000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000442123 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6486  ribonuclease P protein  52.75 
 
 		 89 aa  70.9  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00207284  normal  0.0833987 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_27030  ribonuclease P protein component  59.7 
 
 		 93 aa  68.9  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4171  ribonuclease P protein component  41.74 
 
 		 136 aa  67  0.00000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00326173  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13958  ribonuclease P  37.1 
 
 		 125 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23470  ribonuclease P protein component  43.9 
 
 		 132 aa  64.7  0.0000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2557  ribonuclease P protein component  54.55 
 
 		 91 aa  62.8  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000049885  normal  0.280398 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3561  ribonuclease P  34.48 
 
 		 121 aa  62.8  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4027  ribonuclease P  31.48 
 
 		 115 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246151  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5638  ribonuclease P  32.38 
 
 		 115 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108517  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5340  ribonuclease P  32.38 
 
 		 119 aa  60.1  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000509102  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5168  ribonuclease P  32.38 
 
 		 119 aa  60.1  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000202449  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5184  ribonuclease P  32.38 
 
 		 119 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000560819  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5737  ribonuclease P  32.38 
 
 		 119 aa  60.1  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123315  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5280  ribonuclease P  32.69 
 
 		 115 aa  60.1  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00507948  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5674  ribonuclease P  32.38 
 
 		 115 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0640013  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5597  ribonuclease P  32.38 
 
 		 119 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2576  RNase P protein component  27.68 
 
 		 119 aa  59.3  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1438  RNase P protein component  36.21 
 
 		 119 aa  59.3  0.00000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5614  ribonuclease P  32.38 
 
 		 115 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.234038  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5321  ribonuclease P  32.38 
 
 		 115 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.852432 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4708  ribonuclease P  34.71 
 
 		 159 aa  58.2  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4547  ribonuclease P protein component  54.21 
 
 		 104 aa  57.8  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00136145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4699  ribonuclease P protein component  48.35 
 
 		 117 aa  57.8  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.259793  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3215  ribonuclease P protein component  38.46 
 
 		 114 aa  55.8  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5267  ribonuclease P  32 
 
 		 131 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.115584  normal  0.101846 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3433  ribonuclease P  35.24 
 
 		 116 aa  55.1  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000048083  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2949  ribonuclease P protein component  36.61 
 
 		 120 aa  55.5  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000512551  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3945  ribonuclease P  32.98 
 
 		 116 aa  54.7  0.0000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0047  ribonuclease P protein component  44.26 
 
 		 135 aa  52.8  0.000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0035  ribonuclease P protein component  37.5 
 
 		 116 aa  53.1  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.816345  normal  0.309207 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0034  ribonuclease P protein component  37.5 
 
 		 116 aa  53.1  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4960  ribonuclease P protein component  33.04 
 
 		 111 aa  53.1  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000123477  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1969  ribonuclease P protein component  35.43 
 
 		 130 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.171336  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3759  ribonuclease P protein component  38 
 
 		 130 aa  52.4  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4516  ribonuclease P protein component  39.81 
 
 		 116 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2160  ribonuclease P protein component  53.76 
 
 		 120 aa  51.6  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4137  ribonuclease P protein component  28.75 
 
 		 107 aa  51.2  0.000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0213874  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1022  ribonuclease P  39.29 
 
 		 145 aa  50.8  0.000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.358481  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5949  ribonuclease P protein component  41.18 
 
 		 132 aa  50.8  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4060  ribonuclease P  38.1 
 
 		 116 aa  50.8  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000175953  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4062  ribonuclease P  35.23 
 
 		 127 aa  50.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2762  ribonuclease P protein component  31.25 
 
 		 119 aa  50.8  0.000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000158886  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0963  ribonuclease P  37.5 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4497  ribonuclease P protein component  38.83 
 
 		 116 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0081  ribonuclease P  39 
 
 		 133 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.284943 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0096  ribonuclease P  36.59 
 
 		 133 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4360  ribonuclease P protein component  40.22 
 
 		 116 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0006  ribonuclease P protein component  45.71 
 
 		 240 aa  48.9  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0503027 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4101  ribonuclease P  34.09 
 
 		 127 aa  49.7  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2141  ribonuclease P protein component  32.26 
 
 		 130 aa  48.1  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.154596 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1047  ribonuclease P  33.33 
 
 		 121 aa  48.1  0.00004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.012443  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4863  ribonuclease P protein component  36.57 
 
 		 132 aa  48.1  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4151  ribonuclease P  38.1 
 
 		 116 aa  48.1  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4592  ribonuclease P protein component  48.33 
 
 		 136 aa  47.4  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000331999  decreased coverage  0.0000978361 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0925  ribonuclease P protein component  34 
 
 		 126 aa  47.4  0.00007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000841875  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0641  ribonuclease P protein component  40.23 
 
 		 132 aa  47.4  0.00008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.116685  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4242  ribonuclease P protein component  36.76 
 
 		 142 aa  47  0.00008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.0023987  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0454  ribonuclease P  38.54 
 
 		 129 aa  47  0.00008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0715455  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0604  ribonuclease P protein component  25.64 
 
 		 118 aa  46.6  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00426381  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0896  ribonuclease P  28.7 
 
 		 129 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2996  ribonuclease P  30.97 
 
 		 125 aa  45.4  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000822394  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2673  ribonuclease P  30.97 
 
 		 125 aa  45.4  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00724132  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0080  ribonuclease P  40.24 
 
 		 132 aa  45.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2413  ribonuclease P  33.75 
 
 		 116 aa  45.8  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000205817  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2934  ribonuclease P protein component  34.15 
 
 		 115 aa  46.2  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0069  ribonuclease P protein component  50 
 
 		 137 aa  45.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0312  ribonuclease P protein component  51.02 
 
 		 145 aa  45.1  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3490  ribonuclease P  32.5 
 
 		 121 aa  44.7  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000922016  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3644  ribonuclease P protein component  37.66 
 
 		 123 aa  44.7  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00220014  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23600  ribonuclease P protein component  27.45 
 
 		 121 aa  44.3  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000731452  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1539  ribonuclease P protein component  48.75 
 
 		 98 aa  43.9  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000058475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5110  ribonuclease P protein component  50.41 
 
 		 134 aa  43.9  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0820058  unclonable  0.0000000144984 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4044  ribonuclease P protein component  34.65 
 
 		 152 aa  43.9  0.0008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.534814 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0408  ribonuclease P  29.07 
 
 		 109 aa  43.1  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2396  ribonuclease P protein component  36.78 
 
 		 125 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000000617506  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1790  ribonuclease P  29.73 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000276815  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2595  ribonuclease P protein component  32.67 
 
 		 119 aa  43.5  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0873  ribonuclease P protein component  40 
 
 		 149 aa  43.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0821  ribonuclease P protein component  27.91 
 
 		 108 aa  42.7  0.002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>