164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5520 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4901  hypothetical protein  87.9 
 
 
408 aa  679    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4990  hypothetical protein  87.9 
 
 
408 aa  679    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5520  hypothetical protein  100 
 
 
425 aa  842    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33342  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5269  hypothetical protein  88.64 
 
 
408 aa  683    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.235064  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1291  hypothetical protein  93.52 
 
 
406 aa  661    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13744  ligase  84.77 
 
 
413 aa  632  1e-180  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00431951  normal  0.370504 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4002  domain of unknown function DUF1727  70.73 
 
 
412 aa  531  1e-150  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0442  domain of unknown function DUF1727  70.13 
 
 
425 aa  524  1e-147  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.624005  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1034  domain of unknown function DUF1727  51.9 
 
 
394 aa  348  1e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0648  domain of unknown function DUF1727  45.93 
 
 
412 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0468  hypothetical protein  45.22 
 
 
424 aa  318  1e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.748006 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0913  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase-like protein  43.5 
 
 
429 aa  312  5.999999999999999e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.323703  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2661  hypothetical protein  46.67 
 
 
410 aa  304  2.0000000000000002e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.857902  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3222  hypothetical protein  44.07 
 
 
415 aa  302  7.000000000000001e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0406463 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3448  hypothetical protein  44.55 
 
 
420 aa  302  7.000000000000001e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00766091 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4348  domain of unknown function DUF1727  41.99 
 
 
418 aa  292  7e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0229746  normal  0.964565 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2714  putative ligase  42.82 
 
 
418 aa  291  2e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0282  Mur ligase  42.68 
 
 
416 aa  279  5e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4298  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase-like protein  42.64 
 
 
411 aa  279  6e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6531  hypothetical protein  41.56 
 
 
417 aa  260  3e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.830465  normal  0.333233 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1706  hypothetical protein  45.81 
 
 
421 aa  258  1e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0418667  hitchhiker  0.00728652 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1442  domain of unknown function DUF1727  37.31 
 
 
408 aa  199  9e-50  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0884  mur ligase family protein  29.4 
 
 
447 aa  185  1.0000000000000001e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0450  hypothetical protein  30.28 
 
 
445 aa  182  7e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1627  domain of unknown function DUF1727  30.13 
 
 
462 aa  182  1e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1208  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  29.21 
 
 
449 aa  182  1e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.970096  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1250  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  28.97 
 
 
455 aa  181  2.9999999999999997e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000012325  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1788  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  29.31 
 
 
452 aa  180  2.9999999999999997e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1233  Mur ligase family protein  28.6 
 
 
441 aa  177  3e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.198792  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0008  hypothetical protein  27.96 
 
 
446 aa  172  1e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1392  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthetase MurC-like protein  29.36 
 
 
451 aa  170  4e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0524526  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1206  Mur ligase family protein  29.36 
 
 
451 aa  169  8e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0554717  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0985  domain of unknown function DUF1727  26.93 
 
 
443 aa  169  1e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000265712  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0500  hypothetical protein  32.78 
 
 
491 aa  167  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.496593  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3001  domain of unknown function DUF1727  31.72 
 
 
744 aa  164  3e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.954679 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3614  hypothetical protein  32.01 
 
 
463 aa  161  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.529006  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2069  domain of unknown function DUF1727  27.38 
 
 
467 aa  160  3e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0981076  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1153  domain of unknown function DUF1727  32.46 
 
 
474 aa  160  4e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1599  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  28.54 
 
 
445 aa  159  8e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.709076  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3270  domain of unknown function DUF1727  33.42 
 
 
458 aa  157  3e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.704416  normal  0.0775739 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0588  hypothetical protein  32.05 
 
 
469 aa  157  3e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.414158  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3016  hypothetical protein  32.71 
 
 
436 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0013  domain of unknown function DUF1727  25.17 
 
 
444 aa  152  1e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0440  hypothetical protein  28.28 
 
 
467 aa  151  3e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1345  domain of unknown function DUF1727  29.9 
 
 
476 aa  149  8e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000649333  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1430  Mur ligase family protein  28.76 
 
 
437 aa  149  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.67526  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4285  hypothetical protein  30.55 
 
 
447 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0514  hypothetical protein  28.77 
 
 
445 aa  148  2.0000000000000003e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.265585  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1255  hypothetical protein  30.92 
 
 
507 aa  148  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0996  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  29.25 
 
 
455 aa  146  8.000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00110541  normal  0.028804 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2009  hypothetical protein  29.5 
 
 
466 aa  145  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000964515  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1946  hypothetical protein  28.57 
 
 
437 aa  145  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.102068  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1980  hypothetical protein  28.57 
 
 
437 aa  145  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.270286  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3012  domain of unknown function DUF1727  28.44 
 
 
448 aa  143  5e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3108  domain of unknown function DUF1727  28.44 
 
 
448 aa  143  5e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2945  domain of unknown function DUF1727  33.19 
 
 
474 aa  142  9e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.833945  hitchhiker  0.00605856 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1559  domain of unknown function DUF1727  27.58 
 
 
445 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.181708 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1785  domain of unknown function DUF1727  24.72 
 
 
446 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0144804  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0966  hypothetical protein  28.19 
 
 
464 aa  134  5e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0443  domain of unknown function DUF1727  29.57 
 
 
463 aa  133  5e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0076  Mur ligase middle domain protein  29.59 
 
 
472 aa  124  4e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000585492 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1027  domain of unknown function DUF1727  32.41 
 
 
456 aa  117  5e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.964533  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17860  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  28.28 
 
 
445 aa  110  4.0000000000000004e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.934196  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2306  hypothetical protein  30.86 
 
 
429 aa  110  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0105732  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2036  domain of unknown function DUF1727  29.77 
 
 
430 aa  109  8.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000388378 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1231  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  41.42 
 
 
490 aa  94.4  3e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.661721  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1327  Mur ligase middle domain protein  23.97 
 
 
470 aa  83.6  0.000000000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000399076  decreased coverage  0.000242236 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2047  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  27.45 
 
 
477 aa  59.7  0.00000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00131729  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4538  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamate--2, 6-diaminopimelate ligase  29.33 
 
 
502 aa  55.1  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0149307 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3523  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamyl-2, 6-diaminopimelate--D-alanyl-D-alanyl ligase  25.2 
 
 
471 aa  54.3  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1968  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  26.67 
 
 
477 aa  54.3  0.000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0316215  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2613  UDP-N-acetylmuramate--alanine ligase  26.38 
 
 
473 aa  53.9  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00649562  unclonable  0.00000000000596507 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0643  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamate--2, 6-diaminopimelate ligase  32.67 
 
 
494 aa  52  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.973063  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6976  UDP-N-acetylmuramoylalanine/D-glutamate ligase  30.23 
 
 
446 aa  52  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.282447  hitchhiker  0.0000349353 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3543  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  27.09 
 
 
465 aa  51.2  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2502  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  23.32 
 
 
457 aa  51.6  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3291  UDP-N-acetylmuramoylalanine--D-glutamate ligase  24.89 
 
 
446 aa  51.2  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3524  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  27.09 
 
 
465 aa  51.2  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3549  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  27.09 
 
 
465 aa  51.2  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2550  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  27.09 
 
 
465 aa  50.8  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2816  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  23.32 
 
 
466 aa  50.8  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0471  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  27.09 
 
 
465 aa  50.8  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1330  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  27.09 
 
 
465 aa  50.8  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.837457  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09480  UDP-N-acetylmuramate--alanine ligase  28.47 
 
 
471 aa  51.2  0.00004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0452016  normal  0.0351394 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3233  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  27.09 
 
 
465 aa  50.8  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1335  UDP-N-acetylmuramoylalanine/D-glutamate ligase  28.57 
 
 
444 aa  50.4  0.00005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2401  UDP-N-acetylmuramate/alanine ligase  22.64 
 
 
455 aa  50.4  0.00006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16560  UDP-N-acetylmuramate--alanine ligase  33.33 
 
 
518 aa  50.1  0.00007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.351525  normal  0.0165029 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2153  UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate synthetase  23.58 
 
 
461 aa  50.1  0.00008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.136521 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0486  UDP-N-acetylmuramate/alanine ligase  29.73 
 
 
489 aa  50.1  0.00008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00092134  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08860  UDP-N-acetylmuramate--alanine ligase  27.37 
 
 
464 aa  50.1  0.00008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0311093  unclonable  0.00000000215103 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1231  hypothetical protein  22.87 
 
 
433 aa  50.1  0.00009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0464953 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1635  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamyl-2,6- diamin opimelate/D-alanyl-D-alanylligase  23.81 
 
 
455 aa  49.3  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1119  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  26.69 
 
 
465 aa  49.3  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3426  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  26.72 
 
 
471 aa  49.7  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.294637  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1410  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamate--2, 6-diaminopimelate ligase  25.73 
 
 
544 aa  48.9  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0279398  normal  0.017352 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2192  UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate synthetase  30 
 
 
466 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0349  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamate--2, 6-diaminopimelate ligase  24.92 
 
 
487 aa  48.9  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.593739  normal  0.1204 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03262  D-alanine:D-alanine-adding enzyme  24.1 
 
 
469 aa  48.1  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0179  UDP-N-acetylmuramoylalanine-D-glutamate ligase  24.64 
 
 
481 aa  47.8  0.0003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.036998  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>