202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4986 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_4986  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
219 aa  409  1e-113  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1761  NAD-dependent epimerase/dehydratase  83.03 
 
 
221 aa  276  2e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.761689  normal  0.659727 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4424  NAD-dependent epimerase/dehydratase  72.81 
 
 
219 aa  245  4e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4511  NAD-dependent epimerase/dehydratase  72.81 
 
 
219 aa  245  4e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4805  NAD-dependent epimerase/dehydratase  72.81 
 
 
219 aa  245  4e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.638466  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0585  NAD-dependent epimerase/dehydratase  59.17 
 
 
218 aa  209  4e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2676  hypothetical protein  62.44 
 
 
229 aa  204  7e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4847  NmrA family protein  60.55 
 
 
216 aa  204  8e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00912445  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5510  hypothetical protein  55.71 
 
 
219 aa  202  4e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325809  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0029  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.48 
 
 
211 aa  188  4e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.825731  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4475  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.16 
 
 
220 aa  187  1e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2089  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.6 
 
 
227 aa  179  2.9999999999999997e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0760206  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1159  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.42 
 
 
218 aa  179  4e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5087  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.02 
 
 
222 aa  174  9e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.81673 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00500  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  54.95 
 
 
220 aa  171  5.999999999999999e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.39496  normal  0.546332 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1512  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.67 
 
 
230 aa  167  1e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.172242 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2748  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.47 
 
 
218 aa  157  1e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0203481 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32240  putative NADH-flavin reductase  48.13 
 
 
214 aa  155  5.0000000000000005e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.778097  normal  0.45843 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22130  putative NADH-flavin reductase  47.73 
 
 
221 aa  155  7e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3236  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.15 
 
 
216 aa  150  1e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.468435  normal  0.127341 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3536  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.95 
 
 
219 aa  148  6e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0675  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.19 
 
 
223 aa  147  8e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.523369  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0193  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.85 
 
 
216 aa  147  1.0000000000000001e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.296771  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1174  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.58 
 
 
213 aa  147  1.0000000000000001e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2944  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.27 
 
 
212 aa  144  8.000000000000001e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3052  hypothetical protein  56.62 
 
 
219 aa  142  4e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000885422  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3044  hypothetical protein  47.71 
 
 
219 aa  141  7e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000643211  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03900  putative NADH-flavin reductase  45.91 
 
 
215 aa  141  8e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0627666 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0474  hypothetical protein  41.86 
 
 
214 aa  133  1.9999999999999998e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.84085  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22830  putative NADH-flavin reductase  42.61 
 
 
227 aa  132  5e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.181005  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22250  putative NADH-flavin reductase  40.91 
 
 
215 aa  132  5e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2813  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.84 
 
 
214 aa  127  9.000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2308  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.91 
 
 
231 aa  122  5e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2657  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.12 
 
 
230 aa  121  9e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.352219  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1065  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.1 
 
 
215 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2180  hypothetical protein  31.51 
 
 
221 aa  115  5e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2218  hypothetical protein  31.51 
 
 
221 aa  115  5e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.864295  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1754  hypothetical protein  33.64 
 
 
218 aa  106  2e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.843314  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.1 
 
 
211 aa  105  6e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.146647  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2674  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.64 
 
 
211 aa  104  9e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.172224  normal  0.0331815 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09343  hypothetical protein  31.05 
 
 
212 aa  102  4e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0414979  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0293  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.64 
 
 
212 aa  100  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.572416  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2473  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.32 
 
 
211 aa  99  5e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.731616  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3079  hypothetical protein  34.1 
 
 
218 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0623  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.43 
 
 
218 aa  95.9  4e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1729  hypothetical protein  33.48 
 
 
232 aa  89  5e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5653  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.94 
 
 
222 aa  89  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.297602  normal  0.281198 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05989  conserved hypothetical protein  29.88 
 
 
280 aa  85.5  5e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.264873 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1226  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.94 
 
 
209 aa  85.9  5e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00720  conserved protein  30.9 
 
 
241 aa  84.7  0.000000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2936  hypothetical protein  30.73 
 
 
218 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6100  histidine triad (HIT) protein  37.32 
 
 
374 aa  84  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00945728  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0474  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  31.11 
 
 
210 aa  81.3  0.00000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000378302  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2360  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.02 
 
 
232 aa  77.4  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.236662  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2014  hypothetical protein  32.73 
 
 
231 aa  78.2  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.441743 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0208  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.48 
 
 
232 aa  77  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5484  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.82 
 
 
212 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.809178  normal  0.950879 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2869  YhfK-like protein  35.11 
 
 
209 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1498  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  32.98 
 
 
209 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1359  hypothetical protein  32.98 
 
 
209 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1365  hypothetical protein  32.98 
 
 
209 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.551315  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1882  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.52 
 
 
213 aa  69.7  0.00000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02326  hypothetical protein  32.46 
 
 
210 aa  68.6  0.00000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.544292  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0300  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.03 
 
 
212 aa  68.6  0.00000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.594091 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49844  predicted protein  30.56 
 
 
255 aa  67.8  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0501  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like  32.09 
 
 
216 aa  66.6  0.0000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.82125 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1211  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  28.51 
 
 
211 aa  66.6  0.0000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.858868  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1016  hypothetical protein  28.76 
 
 
231 aa  65.9  0.0000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.861732  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2766  NmrA family protein  31.28 
 
 
233 aa  65.5  0.0000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.814465  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26382  predicted protein  30.77 
 
 
267 aa  64.3  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0549744  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0227  NmrA family protein  32.09 
 
 
232 aa  63.5  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1086  hypothetical protein  35.71 
 
 
231 aa  63.2  0.000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.951647  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2296  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.82 
 
 
219 aa  63.2  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.432417 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0258  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.75 
 
 
233 aa  63.2  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.984722  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.77 
 
 
236 aa  60.1  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1891  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.76 
 
 
298 aa  60.8  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0168492  normal  0.486121 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1003  NmrA-like  26.36 
 
 
221 aa  60.5  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.95557 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2629  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.8 
 
 
309 aa  59.7  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0712  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.09 
 
 
209 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.976883  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.09 
 
 
209 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0563163 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02532  hypothetical protein  28.1 
 
 
210 aa  60.1  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1191  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.09 
 
 
209 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1211  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.12 
 
 
231 aa  59.7  0.00000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1655  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.49 
 
 
219 aa  58.9  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0652  hypothetical protein  26.82 
 
 
216 aa  58.5  0.00000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.216659 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3887  NmrA family protein  26.82 
 
 
216 aa  58.5  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00312575  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3799  NmrA family protein  26.82 
 
 
216 aa  58.5  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00787812  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4317  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  26.36 
 
 
218 aa  57.8  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.416594  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10747  predicted protein  32.76 
 
 
246 aa  58.2  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.095057  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08511  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  28.89 
 
 
320 aa  57  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47367  predicted protein  31.74 
 
 
366 aa  56.6  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.389479  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0393  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.39 
 
 
211 aa  56.6  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.682232 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2114  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.48 
 
 
209 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.63768  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.05 
 
 
291 aa  55.5  0.0000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0163  NmrA-like protein  33.01 
 
 
223 aa  55.5  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_7335  predicted protein  36.29 
 
 
126 aa  55.5  0.0000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.772508  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3700  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.91 
 
 
227 aa  53.5  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.942866  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2260  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.19 
 
 
321 aa  53.9  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000270425 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0382  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  27.75 
 
 
229 aa  53.9  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42659  predicted protein  30.77 
 
 
282 aa  54.3  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>