68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3216 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_3458  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  71.83 
 
 
687 aa  726    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.149528  normal  0.571411 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3216  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  100 
 
 
629 aa  1249    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7345  hypothetical protein  32.78 
 
 
531 aa  121  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.617386  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9183  hypothetical protein  30.18 
 
 
350 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2550  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  28.9 
 
 
321 aa  102  3e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.49777  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5637  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  32.07 
 
 
489 aa  99.4  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0515982 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1644  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  28.11 
 
 
519 aa  95.5  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.436987 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3187  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  29.75 
 
 
289 aa  92  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.280318  normal  0.0143084 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0968  hypothetical protein  28.09 
 
 
413 aa  87.4  7e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1440  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  31.91 
 
 
280 aa  84.3  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0855011  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1007  hypothetical protein  26.86 
 
 
394 aa  82.8  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.764535  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0975  hypothetical protein  28.52 
 
 
416 aa  80.9  0.00000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3392  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  29.76 
 
 
414 aa  79  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.595047  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1868  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.33 
 
 
304 aa  77.8  0.0000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.148816  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6789  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.6 
 
 
415 aa  76.3  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0417562 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6200  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.63 
 
 
413 aa  75.5  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4077  peptidase S15  33.56 
 
 
854 aa  75.5  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.122952  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0126  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.86 
 
 
279 aa  68.9  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1785  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.7 
 
 
574 aa  57.8  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3829  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.71 
 
 
312 aa  57.4  0.0000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.750718  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3594  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  35.48 
 
 
1056 aa  57.4  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.207597  normal  0.593254 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1217  Nucleotide diphosphatase  26.45 
 
 
417 aa  56.6  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.446386  normal  0.0486309 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29530  uncharacterized AP superfamily protein  28.42 
 
 
287 aa  56.2  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1994  hypothetical protein  34.13 
 
 
746 aa  56.2  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1244  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.9 
 
 
262 aa  54.7  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5057  hypothetical protein  37.9 
 
 
3378 aa  54.7  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0459  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  25.34 
 
 
437 aa  54.3  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000352443  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1181  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.27 
 
 
478 aa  54.3  0.000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0227784  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6162  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.7 
 
 
433 aa  53.9  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0270594 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0394  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  24.89 
 
 
437 aa  53.5  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.143254  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0368  type I phosphodiesterase  25 
 
 
437 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000500368  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0371  type I phosphodiesterase  24.89 
 
 
437 aa  53.1  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00015541  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0380  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  24.89 
 
 
437 aa  53.5  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0361814  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0508  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  24.89 
 
 
437 aa  53.5  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4744  putative outer membrane adhesin like protein  27.81 
 
 
666 aa  52.8  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.511214  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0438  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  25 
 
 
437 aa  52.8  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1707  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.48 
 
 
307 aa  51.6  0.00004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0947462  hitchhiker  4.53263e-17 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0508  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  24.43 
 
 
437 aa  52  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.350178  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0713  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.41 
 
 
496 aa  51.6  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3001  chitinase  33.77 
 
 
2310 aa  51.2  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426725  normal  0.0460481 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4865  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  24.43 
 
 
437 aa  50.8  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4286  hypothetical protein  25.52 
 
 
678 aa  50.1  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.119503  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0779  PKD domain-containing protein  52.83 
 
 
999 aa  50.4  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0794  PKD domain-containing protein  52.83 
 
 
999 aa  50.4  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.135837  normal  0.0870072 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0380  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.31 
 
 
437 aa  50.4  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000974575  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0775  PKD domain-containing protein  52.83 
 
 
999 aa  50.4  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.482876  normal  0.807579 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3195  hemopexin repeat-containing protein  25.7 
 
 
262 aa  49.3  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000696311  hitchhiker  0.000000000670294 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1497  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  29.37 
 
 
558 aa  49.7  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0276487 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2638  hypothetical protein  24.71 
 
 
676 aa  49.7  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.828392  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5243  hypothetical protein  26.07 
 
 
693 aa  48.5  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.751292  normal  0.524557 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0374  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.53 
 
 
437 aa  48.5  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00616587  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5004  hypothetical protein  30.89 
 
 
1039 aa  48.1  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.998418 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07550  nucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase family member (Eurofung)  20.96 
 
 
713 aa  47.4  0.0008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.934935  decreased coverage  0.0000816404 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3093  PA14 domain protein  23.94 
 
 
569 aa  47  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1041  peptidase S15  31.09 
 
 
778 aa  47  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0219  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.69 
 
 
964 aa  46.6  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.205054 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3048  hypothetical protein  25.66 
 
 
676 aa  46.2  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.489525  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4855  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  33.85 
 
 
2114 aa  45.4  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.656621  normal  0.707732 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2701  hypothetical protein  40.82 
 
 
680 aa  45.1  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2716  hypothetical protein  40.82 
 
 
676 aa  45.1  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.138659  normal  0.0803009 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2671  hypothetical protein  40.82 
 
 
676 aa  45.1  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0971052  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1658  nucleotide diphosphatase  22.95 
 
 
413 aa  44.7  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0294  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  22.77 
 
 
1967 aa  44.7  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.630839  hitchhiker  0.000980746 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1449  phosphodiesterase I  22.77 
 
 
417 aa  44.3  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.982314  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1698  hypothetical protein  45.9 
 
 
1046 aa  44.3  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.91163  normal  0.814773 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0170  hypothetical protein  24.79 
 
 
402 aa  43.9  0.008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.305358  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7531  hypothetical protein  23.31 
 
 
706 aa  43.9  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.691275  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0400  Phosphodiesterase I  24.69 
 
 
422 aa  43.9  0.009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0422651  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>