269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2357 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_2357  hydrogenase accessory protein HypB  100 
 
 		 254 aa  518  1e-146  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0142835 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1079  hydrogenase accessory protein HypB  57.31 
 
 		 297 aa  288  7e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0788642  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3219  hydrogenase accessory protein HypB  63 
 
 		 261 aa  276  3e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4012  hydrogenase accessory protein HypB  51.42 
 
 		 225 aa  229  3e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.411512 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4608  hydrogenase accessory protein HypB  48.76 
 
 		 281 aa  226  3e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0044  hydrogenase accessory protein HypB  49.53 
 
 		 250 aa  224  9e-58  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2781  hydrogenase accessory protein HypB  55.45 
 
 		 276 aa  221  6e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0171  hydrogenase accessory protein HypB  45.52 
 
 		 303 aa  220  1.9999999999999999e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.452603  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5247  hydrogenase accessory protein HypB  51.36 
 
 		 224 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4096  hydrogenase accessory protein HypB  50.84 
 
 		 312 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0438  hydrogenase accessory protein HypB  46 
 
 		 284 aa  218  7.999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.408549 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4559  hydrogenase accessory protein HypB  54.38 
 
 		 301 aa  218  7.999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0427  hydrogenase accessory protein HypB  46 
 
 		 284 aa  218  8.999999999999998e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0802  hydrogenase accessory protein HypB  46.03 
 
 		 279 aa  218  1e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.287566  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3881  hydrogenase accessory protein HypB  46.18 
 
 		 267 aa  216  2e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.675088  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1933  hydrogenase nickel incorporation protein  47.2 
 
 		 223 aa  216  4e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.125072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1810  hydrogenase accessory protein HypB  47.15 
 
 		 292 aa  215  4e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3978  hydrogenase accessory protein HypB  45.56 
 
 		 352 aa  215  5.9999999999999996e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1949  hydrogenase accessory protein HypB  52.56 
 
 		 253 aa  215  7e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3214  hydrogenase accessory protein HypB  54.59 
 
 		 303 aa  214  9.999999999999999e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7255  hydrogenase accessory protein HypB  50.81 
 
 		 292 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.634166  normal  0.351792 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1893  hydrogenase accessory protein HypB  46.27 
 
 		 295 aa  213  1.9999999999999998e-54  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4493  hydrogenase accessory protein HypB  52.88 
 
 		 300 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.166702 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1096  hydrogenase accessory protein HypB  46.54 
 
 		 270 aa  213  2.9999999999999995e-54  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.445318  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3922  hydrogenase accessory protein HypB  49.58 
 
 		 322 aa  212  3.9999999999999995e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.320935  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2552  hydrogenase accessory protein HypB  51.17 
 
 		 242 aa  211  5.999999999999999e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.146085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0475  hydrogenase accessory protein HypB  48.29 
 
 		 288 aa  210  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.600099 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1129  hydrogenase accessory protein HypB  53.02 
 
 		 273 aa  210  2e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1563  hydrogenase accessory protein HypB  46.3 
 
 		 224 aa  209  2e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0444465  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3133  hydrogenase accessory protein HypB  52.27 
 
 		 282 aa  209  3e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0478  hydrogenase nickel incorporation  54.15 
 
 		 237 aa  209  3e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.278517  normal  0.249483 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0871  hydrogenase accessory protein HypB  43.28 
 
 		 283 aa  208  5e-53  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1274  hydrogenase accessory protein HypB  52.58 
 
 		 277 aa  208  5e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.388022  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0120  hydrogenase accessory protein HypB  52.8 
 
 		 244 aa  208  7e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000574081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0448  hydrogenase accessory protein HypB  50 
 
 		 220 aa  208  8e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3748  hydrogenase accessory protein HypB  42.81 
 
 		 319 aa  207  1e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3066  hydrogenase accessory protein HypB  47.08 
 
 		 286 aa  207  1e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.13732  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0933  hydrogenase accessory protein HypB  44.54 
 
 		 262 aa  207  1e-52  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1098  hydrogenase accessory protein HypB  47.2 
 
 		 278 aa  207  2e-52  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0506  NI2+-binding GTPase protein HypB  48.55 
 
 		 289 aa  207  2e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2886  hydrogenase accessory protein HypB  49.59 
 
 		 267 aa  206  2e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.896709  normal  0.39572 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3288  hydrogenase accessory protein HypB  49.59 
 
 		 266 aa  206  2e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2548  hydrogenase accessory protein HypB  48.42 
 
 		 264 aa  207  2e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0731217  normal  0.100325 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1536  hydrogenase accessory protein HypB  42.55 
 
 		 326 aa  206  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0107781  normal  0.0565242 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0652  hydrogenase accessory protein HypB  48.37 
 
 		 247 aa  206  3e-52  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1046  hydrogenase accessory protein HypB  48.37 
 
 		 246 aa  205  5e-52  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.432152  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0726  hydrogenase accessory protein HypB  48.13 
 
 		 247 aa  205  5e-52  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.932617  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2157  hydrogenase accessory protein HypB  48.13 
 
 		 289 aa  205  5e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.126874  normal  0.122693 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0305  hydrogenase accessory protein HypB  53.27 
 
 		 254 aa  205  6e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3365  hydrogenase expression/synthesis, HypA  50.7 
 
 		 263 aa  204  8e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.186715 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1383  hydrogenase accessory protein HypB  48.05 
 
 		 268 aa  204  9e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0873622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3165  hydrogenase accessory protein HypB  47.64 
 
 		 218 aa  203  2e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0461052 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2744  hydrogenase accessory protein HypB  48.82 
 
 		 293 aa  204  2e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1080  hydrogenase accessory protein HypB  50.48 
 
 		 234 aa  203  2e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.130841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0298  hydrogenase accessory protein HypB  50 
 
 		 222 aa  203  2e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3108  hydrogenase accessory protein HypB  50.92 
 
 		 306 aa  203  2e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2829  hydrogenase accessory protein HypB  44.81 
 
 		 216 aa  203  3e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2180  hydrogenase accessory protein HypB  49.04 
 
 		 217 aa  202  4e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.352538 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2145  hydrogenase accessory protein HypB  51.15 
 
 		 261 aa  202  6e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2191  hydrogenase accessory protein HypB  51.15 
 
 		 261 aa  202  6e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.23017 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1497  hydrogenase accessory protein HypB  46.51 
 
 		 222 aa  201  8e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0637666  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3978  hydrogenase accessory protein HypB  50.23 
 
 		 283 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.83518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08010  hydrogenase accessory protein HypB  48.4 
 
 		 273 aa  200  1.9999999999999998e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2132  hydrogenase accessory protein HypB  50.23 
 
 		 263 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00364389 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11720  hydrogenase accessory protein HypB  46.7 
 
 		 217 aa  199  3e-50  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.708429  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1602  hydrogenase accessory protein HypB  48.64 
 
 		 283 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50480  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  54.15 
 
 		 303 aa  199  3.9999999999999996e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0494141  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2482  hydrogenase accessory protein HypB  50.72 
 
 		 239 aa  199  5e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2395  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  43.33 
 
 		 252 aa  198  7e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0756  hydrogenase accessory protein HypB  48.83 
 
 		 218 aa  197  9e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.901261  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0499  hydrogenase accessory protein HypB  47.93 
 
 		 284 aa  198  9e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.312614  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1431  hydrogenase accessory protein HypB  45.33 
 
 		 217 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1239  hydrogenase accessory protein HypB  44.86 
 
 		 217 aa  196  2.0000000000000003e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2052  hydrogenase accessory protein HypB  50.23 
 
 		 269 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.858375  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1213  hydrogenase accessory protein HypB  44.86 
 
 		 218 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0929883  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0929  hydrogenase accessory protein HypB  47.17 
 
 		 224 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.367308 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2093  hydrogenase accessory protein HypB  45.87 
 
 		 264 aa  196  3e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0471  hydrogenase accessory protein HypB  47.93 
 
 		 281 aa  196  3e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.881132  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4943  hydrogenase accessory protein HypB  44.91 
 
 		 225 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000345448  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1938  hydrogenase accessory protein HypB  47.79 
 
 		 283 aa  195  6e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.1209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3761  hydrogenase accessory protein HypB  48.02 
 
 		 307 aa  195  6e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2007  hydrogenase nickel incorporation  51.46 
 
 		 321 aa  195  7e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.300196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1786  hydrogenase accessory protein HypB  47.73 
 
 		 269 aa  194  8.000000000000001e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000796055  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2417  hydrogenase accessory protein HypB  50.23 
 
 		 267 aa  194  9e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0580161  normal  0.128777 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2540  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  42.08 
 
 		 252 aa  194  1e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0866  hydrogenase accessory protein HypB  49.29 
 
 		 305 aa  194  1e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2436  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  50.22 
 
 		 264 aa  194  1e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0718  hydrogenase accessory protein HypB  49.29 
 
 		 257 aa  193  2e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0302  hydrogenase accessory protein HypB  49.53 
 
 		 296 aa  192  3e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1644  hydrogenase accessory protein HypB  45.7 
 
 		 270 aa  192  3e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0534  hydrogenase accessory protein HypB  49.53 
 
 		 275 aa  192  4e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1902  hydrogenase accessory protein HypB  47.2 
 
 		 252 aa  192  4e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000389713 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1673  hydrogenase accessory protein HypB  48.37 
 
 		 258 aa  192  4e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3017  hydrogenase accessory protein HypB  43.12 
 
 		 217 aa  192  4e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3904  hydrogenase accessory protein HypB  47.8 
 
 		 284 aa  192  6e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0330  hydrogenase accessory protein HypB  50.23 
 
 		 294 aa  192  6e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0164285  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0504  hydrogenase accessory protein HypB  47.93 
 
 		 280 aa  191  1e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1458  hydrogenase accessory protein HypB  44.8 
 
 		 268 aa  190  1e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1169  hydrogenase accessory protein HypB  49.55 
 
 		 268 aa  190  2e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0580173  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2815  hydrogenase-3 accessory protein, assembly of metallocenter  44.49 
 
 		 345 aa  190  2e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>