More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0397 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_0397  acyl-CoA synthetase  100 
 
 		 564 aa  1141    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.835434  normal  0.950858 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10274  acyl-CoA synthetase  75.89 
 
 		 560 aa  891    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0406036 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0350  acyl-CoA synthetase  78.93 
 
 		 574 aa  893    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0361  acyl-CoA synthetase  78.93 
 
 		 577 aa  892    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.171367  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0341  acyl-CoA synthetase  91.02 
 
 		 569 aa  1058    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0371  acyl-CoA synthetase  78.93 
 
 		 577 aa  892    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0339  AMP-dependent synthetase and ligase  55.06 
 
 		 542 aa  563  1.0000000000000001e-159  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00517119  normal  0.13941 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3694  AMP-dependent synthetase and ligase  48.58 
 
 		 532 aa  471  1.0000000000000001e-131  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.178139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13440  acyl-CoA synthetase  44.31 
 
 		 539 aa  426  1e-118  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1995  AMP-dependent synthetase and ligase  47.34 
 
 		 541 aa  423  1e-117  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3770  acyl-CoA synthetase  44.91 
 
 		 548 aa  413  1e-114  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3758  acyl-CoA synthetase  44.71 
 
 		 548 aa  412  1e-114  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.102214  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3831  acyl-CoA synthetase  44.71 
 
 		 548 aa  412  1e-114  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.948087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0553  AMP-dependent synthetase and ligase  43.19 
 
 		 527 aa  402  1e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2427  acyl-CoA synthetase  43.06 
 
 		 535 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.206901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1993  acyl-CoA synthetase  41.5 
 
 		 550 aa  397  1e-109  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4817  AMP-dependent synthetase and ligase  42.07 
 
 		 541 aa  395  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11456  acyl-CoA synthetase  42.61 
 
 		 535 aa  395  1e-108  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0248769 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4678  AMP-dependent synthetase and ligase  40.18 
 
 		 539 aa  389  1e-107  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4127  acyl-CoA synthetase  42.43 
 
 		 540 aa  391  1e-107  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4225  acyl-CoA synthetase  43.37 
 
 		 530 aa  386  1e-106  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4103  AMP-dependent synthetase and ligase  44.38 
 
 		 545 aa  385  1e-105  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0232  acyl-CoA synthetase  42.94 
 
 		 544 aa  382  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.253384  normal  0.171828 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4630  AMP-dependent synthetase and ligase  40.33 
 
 		 544 aa  379  1e-103  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0435  acyl-CoA synthetase  41.88 
 
 		 544 aa  371  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.232692 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3854  AMP-dependent synthetase and ligase  41.57 
 
 		 550 aa  367  1e-100  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2987  AMP-dependent synthetase and ligase  39.37 
 
 		 534 aa  359  8e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.734432  normal  0.0264415 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0051  AMP-dependent synthetase and ligase  39.33 
 
 		 546 aa  358  1.9999999999999998e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256371 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1066  AMP-dependent synthetase and ligase  39.15 
 
 		 560 aa  352  8e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2344  acyl-CoA synthetase  40.93 
 
 		 531 aa  350  4e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.657578  decreased coverage  0.0026015 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4816  AMP-dependent synthetase and ligase  36.95 
 
 		 562 aa  319  9e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1257  AMP-dependent synthetase and ligase  31.98 
 
 		 518 aa  279  1e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0001  AMP-dependent synthetase and ligase  30.6 
 
 		 516 aa  250  4e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.743652 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0943  AMP-dependent synthetase and ligase  31.4 
 
 		 511 aa  244  3e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6739  AMP-dependent synthetase and ligase  33.13 
 
 		 532 aa  242  1e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0799452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3874  AMP-dependent synthetase and ligase  33.6 
 
 		 510 aa  238  3e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0918503 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3839  AMP-dependent synthetase and ligase  34.21 
 
 		 508 aa  236  6e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0027  AMP-dependent synthetase and ligase  31.4 
 
 		 509 aa  234  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.141316  normal  0.236103 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4093  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.57 
 
 		 497 aa  231  2e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0327517  normal  0.151728 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3980  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.57 
 
 		 497 aa  231  2e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.310048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1871  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.45 
 
 		 524 aa  230  5e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.394568  normal  0.852293 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1465  acyl-CoA synthetase  31.47 
 
 		 487 aa  229  8e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.845905  normal  0.967698 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4238  AMP-dependent synthetase and ligase  33.4 
 
 		 527 aa  229  1e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3597  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.02 
 
 		 543 aa  229  1e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6823  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase I  31.53 
 
 		 492 aa  228  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1967  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.91 
 
 		 514 aa  228  3e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.595404  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  33.27 
 
 		 503 aa  225  1e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3057  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.5 
 
 		 499 aa  224  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.847241  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1905  AMP-dependent synthetase and ligase  32.04 
 
 		 512 aa  223  9e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.97218  normal  0.26016 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0015  acyl-CoA synthetase  31.54 
 
 		 511 aa  221  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.323665 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2641  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.84 
 
 		 516 aa  219  1e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.517138  normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.54 
 
 		 512 aa  219  1e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2867  AMP-dependent synthetase and ligase  31.39 
 
 		 552 aa  219  1e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.533017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3266  AMP-dependent synthetase and ligase  31.99 
 
 		 511 aa  218  2.9999999999999998e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2787  AMP-dependent synthetase and ligase  30.26 
 
 		 518 aa  218  2.9999999999999998e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.296837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4096  AMP-dependent synthetase and ligase  30.91 
 
 		 508 aa  218  2.9999999999999998e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0377217  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3166  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.5 
 
 		 501 aa  217  5e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.130976  hitchhiker  0.0000354644 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0804  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.98 
 
 		 516 aa  216  7e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.48042 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2927  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.82 
 
 		 509 aa  216  8e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.686689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3215  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.52 
 
 		 500 aa  216  9e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5032  acyl-CoA synthetase  32.23 
 
 		 501 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.672582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5140  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.16 
 
 		 525 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.24744  normal  0.25513 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4161  acyl-CoA synthetase  30.37 
 
 		 517 aa  214  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2397  AMP-dependent synthetase and ligase  30.74 
 
 		 516 aa  213  5.999999999999999e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.264456  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0789  AMP-dependent synthetase and ligase  29.15 
 
 		 553 aa  213  5.999999999999999e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6618  AMP-dependent synthetase and ligase  33.07 
 
 		 493 aa  213  9e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.14 
 
 		 514 aa  213  1e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4649  acyl-CoA synthetase  32.03 
 
 		 501 aa  212  1e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4737  acyl-CoA synthetase  32.03 
 
 		 501 aa  212  1e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.987006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5309  AMP-dependent synthetase and ligase  30.77 
 
 		 517 aa  212  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2525  AMP-dependent synthetase and ligase  30.59 
 
 		 516 aa  211  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.695888 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2371  acyl-CoA synthetase  29.98 
 
 		 532 aa  211  2e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1666  AMP-dependent synthetase and ligase  30.88 
 
 		 518 aa  211  2e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.144653  normal  0.373713 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3767  AMP-dependent synthetase and ligase  32.41 
 
 		 512 aa  211  3e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0143855  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1650  AMP-binding domain protein  30.45 
 
 		 549 aa  211  3e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1124  AMP-dependent synthetase and ligase  32.56 
 
 		 509 aa  211  4e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.719867  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0571  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  32.99 
 
 		 490 aa  211  4e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6878  AMP-dependent synthetase and ligase  29.87 
 
 		 509 aa  210  5e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.615245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2707  AMP-dependent synthetase and ligase  31.74 
 
 		 519 aa  210  5e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0621527  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2440  AMP-binding domain protein  29.11 
 
 		 544 aa  210  6e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2068  AMP-binding domain protein  27.58 
 
 		 596 aa  210  6e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0449  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.59 
 
 		 516 aa  209  8e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.93416 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3426  AMP-binding protein  29.22 
 
 		 500 aa  209  9e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.473482  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1103  AMP-binding domain protein  28.79 
 
 		 552 aa  209  1e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  30.47 
 
 		 521 aa  209  1e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1821  AMP-binding protein  28.77 
 
 		 500 aa  209  1e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.133341 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2699  AMP-binding enzyme, putative long chain fatty acid Co-A ligase, acetyl-CoA synthetase  28.51 
 
 		 514 aa  209  1e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4472  AMP-dependent synthetase and ligase  29.9 
 
 		 517 aa  209  1e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2038  long-chain-fatty-acid--CoA ligase, putative  30.68 
 
 		 565 aa  208  2e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1159  O-succinylbenzoate-CoA ligase  32.93 
 
 		 486 aa  208  2e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.498459  hitchhiker  0.000208098 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01193  acyl-CoA synthase  30.51 
 
 		 544 aa  209  2e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0176178  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1029  AMP-dependent synthetase and ligase  31.78 
 
 		 499 aa  208  2e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2838  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.75 
 
 		 515 aa  207  3e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.153198 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  29.67 
 
 		 512 aa  207  4e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1502  acyl-CoA synthetase  30.77 
 
 		 515 aa  207  4e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1525  acyl-CoA synthetase  30.77 
 
 		 515 aa  207  4e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3704  AMP-dependent synthetase and ligase  29.88 
 
 		 515 aa  207  5e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0990866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3117  AMP-dependent synthetase and ligase  28.57 
 
 		 500 aa  207  6e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.012438  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0166  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.55 
 
 		 506 aa  206  7e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3127  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.63 
 
 		 500 aa  206  9e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>