More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1041 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_1041  transport system permease protein  100 
 
 		 301 aa  592  1e-168  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1186  transport system permease protein  88.37 
 
 		 369 aa  520  1e-147  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0431  transport system permease protein  47.52 
 
 		 374 aa  279  4e-74  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0443  transport system permease protein  49.83 
 
 		 355 aa  278  6e-74  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1094  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  46.15 
 
 		 373 aa  270  1e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0044816  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2099  transport system permease protein  46.82 
 
 		 350 aa  268  8e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2616  transport system permease protein  45.49 
 
 		 367 aa  265  7e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0186  transport system permease protein  45.96 
 
 		 362 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129161  normal  0.828954 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1194  transport system permease protein  45.24 
 
 		 357 aa  256  2e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0734  transport system permease protein  43.73 
 
 		 344 aa  256  5e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000599785  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0758  transport system permease protein  43.49 
 
 		 344 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0240676  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1638  transport system permease protein  44.67 
 
 		 383 aa  250  2e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.250999  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1465  transport system permease protein  42.71 
 
 		 357 aa  245  4.9999999999999997e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1133  transport system permease protein  43.31 
 
 		 354 aa  244  9e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00204897  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0498  transport system permease protein  45.58 
 
 		 349 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0506043  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1491  transport system permease protein  45.1 
 
 		 348 aa  242  6e-63  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.105364  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0429  transport system permease protein  45.1 
 
 		 348 aa  241  1e-62  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0408  transport system permease protein  44.76 
 
 		 348 aa  241  1e-62  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.586002  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1089  hypothetical protein  41.52 
 
 		 355 aa  241  1e-62  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2330  transport system permease protein  43.6 
 
 		 370 aa  239  4e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.970298  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0250  transport system permease protein  43.73 
 
 		 340 aa  236  3e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0247  transport system permease protein  41.87 
 
 		 359 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0151644  normal  0.610007 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1318  transport system permease protein  42.01 
 
 		 360 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.398807  normal  0.0129823 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0274  transport system permease protein  42.91 
 
 		 358 aa  230  2e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00246015  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1217  transport system permease protein  43.33 
 
 		 362 aa  228  7e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00189959  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2398  hypothetical protein  42.76 
 
 		 361 aa  227  1e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.384157 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1353  transport system permease protein  44.37 
 
 		 363 aa  227  2e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1871  iron(III) dicitrate transport system permease protein  40.14 
 
 		 356 aa  224  1e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71238  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1048  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  44.86 
 
 		 336 aa  223  2e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.522195  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0466  Fe(III) dicitrate ABC transporter, permease  42.61 
 
 		 347 aa  223  3e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1153  hypothetical protein  42.43 
 
 		 375 aa  223  3e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1623  iron(III) dicitrate transport system permease protein  43.52 
 
 		 356 aa  218  8.999999999999998e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0877318  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0575  transport system permease protein  44.06 
 
 		 357 aa  217  2e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0026  transport system permease protein  36.99 
 
 		 331 aa  215  9e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0485  transport system permease protein  38.91 
 
 		 357 aa  212  7e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.644371  hitchhiker  0.000336075 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7623  ABC transporter membrane spanning protein (iron)  42.66 
 
 		 354 aa  211  9e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0220  transport system permease protein  44.52 
 
 		 356 aa  211  1e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0290  transport system permease protein  40.14 
 
 		 361 aa  211  1e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.602088  normal  0.107419 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3090  transport system permease protein  42.81 
 
 		 360 aa  211  2e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2250  transport system permease protein  43.77 
 
 		 356 aa  211  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.235988 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1822  transport system permease protein  41.95 
 
 		 350 aa  209  3e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2028  transport system permease protein  43.43 
 
 		 356 aa  207  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2425  transport system permease protein  38.95 
 
 		 356 aa  206  3e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0282  transport system permease protein  43.57 
 
 		 371 aa  206  5e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.669954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4419  transport system permease protein  41.75 
 
 		 355 aa  205  7e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.347706 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4371  transport system permease protein  41.52 
 
 		 358 aa  203  3e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3566  transport system permease protein  39.24 
 
 		 354 aa  202  4e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1652  transport system permease protein  45.51 
 
 		 357 aa  201  9e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2734  Fe(III) dicitrate ABC transporter, permease  38.75 
 
 		 347 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000167037  hitchhiker  0.000165993 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1219  ABC transporter membrane spanning protein (iron)  39.93 
 
 		 360 aa  200  3e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.11373  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0344  transport system permease protein  43.15 
 
 		 363 aa  200  3e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3530  transport system permease protein  39.72 
 
 		 365 aa  199  3e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3610  transport system permease protein  41.28 
 
 		 360 aa  199  5e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.137689 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2697  transport system permease protein  43.06 
 
 		 352 aa  199  6e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0794792  normal  0.633009 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3058  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  39.44 
 
 		 346 aa  198  9e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3036  transport system permease protein  44.41 
 
 		 360 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1099  transport system permease protein  45.02 
 
 		 360 aa  196  6e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.122873  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2148  transport system permease protein  41.25 
 
 		 356 aa  195  8.000000000000001e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.176717 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5707  transport system permease protein  38.98 
 
 		 344 aa  195  9e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2017  transport system permease protein  38.33 
 
 		 369 aa  193  3e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4241  transport system permease protein  38.75 
 
 		 381 aa  192  5e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.2131 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3271  transport system permease protein  40.07 
 
 		 370 aa  192  8e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00536194 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1239  transport system permease protein  44.41 
 
 		 360 aa  191  1e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7104  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  39.67 
 
 		 360 aa  191  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0297  transport system permease protein  39.02 
 
 		 330 aa  191  1e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2340  transport system permease protein  39.93 
 
 		 371 aa  190  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1703  heme/hemin ABC transporter, permease protein  36.08 
 
 		 352 aa  190  2.9999999999999997e-47  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2261  iron(III) ABC transporter, permease protein  38.36 
 
 		 343 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1173  iron ABC transporter, permease protein  35.42 
 
 		 356 aa  189  4e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1738  transport system permease protein  36.81 
 
 		 330 aa  189  5e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.922017  normal  0.205881 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1709  transport system permease protein  36.3 
 
 		 319 aa  189  5e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0990  transport system permease protein  38.19 
 
 		 378 aa  189  7e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00180  transport system permease protein  34.47 
 
 		 337 aa  189  7e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000507964  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1175  iron ABC transporter permease  40.5 
 
 		 359 aa  188  9e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2385  FecCD-family membrane transport protein  35.03 
 
 		 367 aa  187  1e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.567541  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1933  transport system permease protein  37.63 
 
 		 330 aa  188  1e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1748  transport system permease protein  37.98 
 
 		 347 aa  187  2e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3203  transport system permease protein  37.32 
 
 		 350 aa  187  2e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1594  transport system permease protein  36.93 
 
 		 344 aa  187  2e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.511685  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2756  transport system permease protein  44.76 
 
 		 360 aa  187  2e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00602737  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_589  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, permease component  38.38 
 
 		 363 aa  183  2.0000000000000003e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0262833  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1565  transport system permease protein  36.82 
 
 		 355 aa  184  2.0000000000000003e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.435862  normal  0.696259 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4830  transport system permease protein  41.05 
 
 		 341 aa  184  2.0000000000000003e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3791  transport system permease protein  36.86 
 
 		 361 aa  184  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0929474  normal  0.935471 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0815  transport system permease protein  40 
 
 		 346 aa  182  4.0000000000000006e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1695  transport system permease protein  37.15 
 
 		 354 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.347986  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0621  transport system permease protein  38.38 
 
 		 363 aa  182  4.0000000000000006e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.050627  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0076  transport system permease protein  36.82 
 
 		 452 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0881  corrinoid ABC transporter permease  37.85 
 
 		 380 aa  182  9.000000000000001e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1539  iron chelate ABC transporter permease  43.45 
 
 		 353 aa  181  1e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.337435 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2750  transport system permease protein  43.71 
 
 		 360 aa  181  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0447  transport system permease protein  37.02 
 
 		 340 aa  181  1e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.279756  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2668  iron chelate ABC transporter permease  43.71 
 
 		 360 aa  181  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0865  ABC transporter permease  41.7 
 
 		 359 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1316  transport system permease protein  38.01 
 
 		 338 aa  181  2e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0834  ABC transporter permease  41.7 
 
 		 359 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0806  ABC transporter permease  41.34 
 
 		 359 aa  180  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.129539  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0897  ABC transporter permease  41.7 
 
 		 359 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.660141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1121  transport system permease protein  37.85 
 
 		 372 aa  181  2e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0471477  hitchhiker  0.00000000101745 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0039  transport system permease protein  36.62 
 
 		 323 aa  181  2e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00831442  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>