232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3646 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3646  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  100 
 
 		 519 aa  1081    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304877 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0204  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  86 
 
 		 522 aa  919    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.037885  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0396  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  82.33 
 
 		 527 aa  866    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.452553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5111  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  74.85 
 
 		 518 aa  810    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0111  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  83.56 
 
 		 520 aa  920    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.987458 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0959  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  76.23 
 
 		 518 aa  830    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.438509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4472  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  74.81 
 
 		 518 aa  808    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1446  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  72.5 
 
 		 531 aa  755    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00756004 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1063  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  75.44 
 
 		 519 aa  802    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1245  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  85.43 
 
 		 522 aa  914    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.720089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1404  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  72.97 
 
 		 529 aa  739    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1529  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  85.71 
 
 		 499 aa  906    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5904  nitrogenase FeMo cofactor biosynthesis protein NifB  86.07 
 
 		 520 aa  947    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1574  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  70.35 
 
 		 531 aa  737    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.274095  normal  0.786135 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7742  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  67.15 
 
 		 535 aa  696    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.379245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4244  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  64.15 
 
 		 484 aa  634  1e-180  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2361  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  64.58 
 
 		 495 aa  632  1e-180  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.968196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2124  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  63.58 
 
 		 483 aa  633  1e-180  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.477225 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4133  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  63.54 
 
 		 489 aa  629  1e-179  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.250662  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1358  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  63.04 
 
 		 479 aa  622  1e-177  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3912  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  62.85 
 
 		 475 aa  619  1e-176  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1780  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  61.36 
 
 		 491 aa  612  9.999999999999999e-175  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1808  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  61.36 
 
 		 491 aa  612  9.999999999999999e-175  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3602  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  64 
 
 		 498 aa  610  1e-173  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.95628  normal  0.038494 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4005  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  63.02 
 
 		 498 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1576  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  63.86 
 
 		 490 aa  603  1.0000000000000001e-171  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6871  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  62.99 
 
 		 655 aa  580  1e-164  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.181485 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4478  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  58.35 
 
 		 527 aa  577  1.0000000000000001e-163  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0277889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0994  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  56.93 
 
 		 503 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6233  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  59.77 
 
 		 490 aa  563  1.0000000000000001e-159  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51010  Nitrogenase cofactor biosynthesis protein  61.79 
 
 		 503 aa  564  1.0000000000000001e-159  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0231468  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2197  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  56.51 
 
 		 491 aa  562  1.0000000000000001e-159  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.157561  normal  0.878423 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0546  NifB family--FeMo cofactor biosynthesis protein  56.51 
 
 		 491 aa  561  1e-158  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.351769  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1241  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  57.2 
 
 		 491 aa  556  1e-157  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.420081  normal  0.870366 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1454  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  59.69 
 
 		 500 aa  545  1e-154  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0944  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  56.1 
 
 		 469 aa  538  9.999999999999999e-153  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0409704  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3202  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  57.7 
 
 		 482 aa  528  1e-149  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3024  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  53.43 
 
 		 495 aa  521  1e-146  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4924  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  54.95 
 
 		 490 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1206  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  55.02 
 
 		 464 aa  493  9.999999999999999e-139  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.65726  normal  0.0423889 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5043  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  58.06 
 
 		 363 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0411446  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0513  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  45.78 
 
 		 468 aa  410  1e-113  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0281  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  60.06 
 
 		 351 aa  409  1e-113  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.144373  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2814  radical SAM domain-containing protein  51.01 
 
 		 299 aa  315  9e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0843  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  40.63 
 
 		 418 aa  300  5e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2622  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  40 
 
 		 427 aa  298  2e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1268  radical SAM family Fe-S protein  50 
 
 		 312 aa  297  3e-79  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.45793  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1030  Radical SAM domain protein  48.81 
 
 		 304 aa  296  6e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0737  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  37.44 
 
 		 423 aa  290  5.0000000000000004e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0422  radical SAM domain-containing protein  46.15 
 
 		 299 aa  288  2e-76  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.2652  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0133  nitrogen fixation protein  45.63 
 
 		 321 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1251  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  37.83 
 
 		 423 aa  286  5e-76  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000233074  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1956  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  38.16 
 
 		 423 aa  286  9e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1634  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  37.68 
 
 		 424 aa  284  3.0000000000000004e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00241084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0654  radical SAM domain-containing protein  47.65 
 
 		 303 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00641861  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0665  radical SAM domain-containing protein  46.57 
 
 		 297 aa  279  8e-74  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.513594 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0813  radical SAM family protein  46.4 
 
 		 298 aa  279  1e-73  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.152673  normal  0.316109 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0300  Radical SAM domain protein  46.57 
 
 		 303 aa  277  4e-73  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.308872 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0679  hypothetical protein  46.81 
 
 		 310 aa  276  5e-73  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0678  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  36.63 
 
 		 424 aa  275  2.0000000000000002e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0514333  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1758  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  36.71 
 
 		 424 aa  274  3e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0688077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1011  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  36.24 
 
 		 423 aa  265  1e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.930234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3098  radical SAM domain-containing protein  40.06 
 
 		 473 aa  262  1e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2083  Radical SAM domain protein  46.24 
 
 		 285 aa  260  4e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2135  Radical SAM domain protein  46.59 
 
 		 285 aa  260  5.0000000000000005e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000451795 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1972  radical SAM domain-containing protein  45.56 
 
 		 275 aa  257  4e-67  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.396519  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1209  radical SAM domain-containing protein  47.1 
 
 		 288 aa  256  6e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.279615  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0422  Radical SAM domain protein  46.74 
 
 		 273 aa  256  8e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0069051  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1535  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  36.78 
 
 		 420 aa  253  5.000000000000001e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2799  radical SAM domain-containing protein  44.77 
 
 		 290 aa  253  8.000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.180027  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0575  Radical SAM domain protein  46.89 
 
 		 296 aa  252  1e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0681  radical SAM family protein  45.13 
 
 		 290 aa  250  4e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.414867 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1056  Radical SAM domain protein  45.69 
 
 		 280 aa  250  5e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3463  radical SAM domain-containing protein  44.17 
 
 		 289 aa  248  1e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4042  radical SAM domain-containing protein  45.02 
 
 		 313 aa  241  2e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00822978 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1200  radical SAM domain-containing protein  43.91 
 
 		 313 aa  240  4e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3054  Radical SAM domain protein  46.97 
 
 		 325 aa  239  1e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.164409 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2107  MoaA/NifB/PqqE family nitrogen fixation protein  43.17 
 
 		 297 aa  237  4e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1148  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB, putative  42.44 
 
 		 276 aa  236  5.0000000000000005e-61  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1961  radical SAM domain-containing protein  43.38 
 
 		 293 aa  233  5e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0251824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0149  radical SAM domain-containing protein  42.96 
 
 		 285 aa  231  2e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1533  radical SAM domain-containing protein  39.11 
 
 		 297 aa  224  3e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1684  radical SAM domain-containing protein  40.07 
 
 		 297 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1568  radical SAM family protein  41.79 
 
 		 291 aa  220  5e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0917  radical SAM domain-containing protein  39.78 
 
 		 297 aa  220  5e-56  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.354984  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0229  radical SAM domain-containing protein  39.71 
 
 		 297 aa  219  1e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.819086  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2906  Radical SAM domain protein  39.73 
 
 		 296 aa  217  4e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0586  radical SAM domain-containing protein  38.36 
 
 		 318 aa  217  4e-55  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1360  Radical SAM domain protein  39.08 
 
 		 318 aa  209  1e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0796  radical SAM family protein  38.69 
 
 		 331 aa  206  1e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2598  Radical SAM domain protein  38.3 
 
 		 307 aa  192  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0138317  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1610  Radical SAM domain protein  33.46 
 
 		 269 aa  158  3e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2618  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  31.71 
 
 		 419 aa  109  1e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48700  Metallocluster binding protein of the NafY/NifY/NifX/VnfX family  39.17 
 
 		 120 aa  94  7e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3488  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  37.63 
 
 		 109 aa  66.6  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0673  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  34.68 
 
 		 109 aa  64.7  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.651625 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0235  nitrogenase molybdenum-iron protein NifX  43.68 
 
 		 141 aa  63.2  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00441901  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1204  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  34.78 
 
 		 109 aa  62  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000294477  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0326  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.13 
 
 		 318 aa  61.2  0.00000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4636  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.61 
 
 		 335 aa  59.3  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.886465  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>