More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0943 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0943  Carboxymethylenebutenolidase  100 
 
 		 287 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00110752 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5221  putative carboxymethylenebutenolidase precursor (dienelactone hydrolase  62.59 
 
 		 270 aa  347  1e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0554108  normal  0.200336 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3285  Carboxymethylenebutenolidase  49.64 
 
 		 280 aa  287  1e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4024  twin-arginine translocation pathway signal  47.81 
 
 		 278 aa  281  9e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2140  Carboxymethylenebutenolidase  50.87 
 
 		 291 aa  277  1e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.324009 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1756  Carboxymethylenebutenolidase  50.87 
 
 		 291 aa  277  1e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0969  carboxymethylenebutenolidase  47.25 
 
 		 275 aa  276  2e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.35084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1951  dienelactone hydrolase  50.52 
 
 		 291 aa  275  5e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1804  carboxymethylenebutenolidase  50.17 
 
 		 291 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.692278  normal  0.911676 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0181  twin-arginine translocation pathway signal  51.09 
 
 		 291 aa  272  4.0000000000000004e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.972702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2042  carboxymethylenebutenolidase  49.65 
 
 		 291 aa  261  1e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000295478 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6786  Carboxymethylenebutenolidase  47.04 
 
 		 294 aa  260  2e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00592953  hitchhiker  0.00000947309 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3933  Carboxymethylenebutenolidase  49.42 
 
 		 275 aa  258  6e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0774  Carboxymethylenebutenolidase  48.91 
 
 		 300 aa  257  2e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.12147  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2832  dienelactone hydrolase  46.34 
 
 		 290 aa  255  7e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3586  carboxymethylenebutenolidase  49.28 
 
 		 295 aa  253  2.0000000000000002e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4421  carboxymethylenebutenolidase  44.95 
 
 		 290 aa  253  3e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.842964  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4070  Carboxymethylenebutenolidase  47.1 
 
 		 275 aa  252  5.000000000000001e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1943  carboxymethylenebutenolidase  48.43 
 
 		 302 aa  251  1e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0524201  normal  0.0241824 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0609  carboxymethylenebutenolidase  46.18 
 
 		 290 aa  249  5e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4353  Carboxymethylenebutenolidase  46.21 
 
 		 275 aa  246  3e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3963  carboxymethylenebutenolidase  48.43 
 
 		 268 aa  244  9e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.141261 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4351  dienelactone hydrolase family protein  46.33 
 
 		 271 aa  243  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03717  predicted hydrolase  46.36 
 
 		 269 aa  243  3e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0186  Carboxymethylenebutenolidase  46.92 
 
 		 275 aa  243  3e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03666  hypothetical protein  46.36 
 
 		 267 aa  243  3e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4149  Carboxymethylenebutenolidase  45.95 
 
 		 271 aa  242  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4054  dienelactone hydrolase family protein  45.95 
 
 		 271 aa  242  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0243  carboxymethylenebutenolidase  47.31 
 
 		 278 aa  242  6e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.110111 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4178  carboxymethylenebutenolidase  46.33 
 
 		 271 aa  242  7e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0221316 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4206  dienelactone hydrolase family protein  45.98 
 
 		 269 aa  241  9e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000877073 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3005  carboxymethylenebutenolidase  45.42 
 
 		 290 aa  241  1e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0541366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5271  dienelactone hydrolase family protein  46.33 
 
 		 271 aa  241  1e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.198587 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4626  Carboxymethylenebutenolidase  41.33 
 
 		 277 aa  240  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000529247 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2733  carboxymethylenebutenolidase  48.19 
 
 		 290 aa  239  5e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.193118 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2540  carboxymethylenebutenolidase  44.64 
 
 		 339 aa  238  9e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1506  carboxymethylenebutenolidase  44.64 
 
 		 291 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.893969  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0358  carboxymethylenebutenolidase  44.64 
 
 		 291 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1700  carboxymethylenebutenolidase  44.64 
 
 		 291 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2398  carboxymethylenebutenolidase  44.64 
 
 		 339 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0848  carboxymethylenebutenolidase  44.29 
 
 		 291 aa  236  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2622  twin-arginine translocation pathway signal  42.01 
 
 		 291 aa  237  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.626056 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0875  twin-arginine translocation pathway signal  45.33 
 
 		 291 aa  236  3e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0999257  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2040  Carboxymethylenebutenolidase  43.1 
 
 		 292 aa  236  3e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.143956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4302  dienelactone hydrolase family protein  45.17 
 
 		 270 aa  236  4e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2433  Carboxymethylenebutenolidase  43.1 
 
 		 292 aa  235  6e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3951  carboxymethylenebutenolidase  44.44 
 
 		 290 aa  235  8e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0265  dienelactone hydrolase family protein  44.44 
 
 		 290 aa  235  8e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2228  putative carboxymethylenebutenolidase (dienelactone hydrolase) protein  44.29 
 
 		 293 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5324  carboxymethylenebutenolidase  49.8 
 
 		 298 aa  234  1.0000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4294  dienelactone hydrolase  45.17 
 
 		 291 aa  233  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4198  dienelactone hydrolase  45.17 
 
 		 291 aa  233  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4175  dienelactone hydrolase  45.17 
 
 		 291 aa  233  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4247  dienelactone hydrolase  45.17 
 
 		 291 aa  233  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.750594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3647  dienelactone hydrolase family protein  44.07 
 
 		 290 aa  233  3e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4825  carboxymethylenebutenolidase  42.56 
 
 		 291 aa  232  5e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00463404  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1548  Carboxymethylenebutenolidase  48.86 
 
 		 299 aa  231  9e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3316  carboxymethylenebutenolidase  48.43 
 
 		 297 aa  231  1e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0813595  normal  0.0640539 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2668  Carboxymethylenebutenolidase  48.43 
 
 		 297 aa  231  1e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.240942  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3653  carboxymethylenebutenolidase  41.52 
 
 		 291 aa  225  7e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4491  twin-arginine translocation pathway signal  41.52 
 
 		 291 aa  225  7e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3874  carboxymethylenebutenolidase  41.52 
 
 		 291 aa  225  7e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630972  normal  0.609004 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3245  carboxymethylenebutenolidase  41.87 
 
 		 291 aa  225  8e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0210034 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1733  carboxymethylenebutenolidase  45.49 
 
 		 307 aa  224  1e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.353507 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3771  carboxymethylenebutenolidase  42.21 
 
 		 291 aa  224  1e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0116114 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0324  carboxymethylenebutenolidase  45.67 
 
 		 256 aa  223  2e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2216  dienelactone hydrolase  40.14 
 
 		 291 aa  219  3e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.60917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1710  carboxymethylenebutenolidase  40.75 
 
 		 291 aa  211  7.999999999999999e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1865  Carboxymethylenebutenolidase  37.05 
 
 		 242 aa  133  3e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.613212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2210  carboxymethylenebutenolidase family protein  37.05 
 
 		 242 aa  133  3e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0949  Carboxymethylenebutenolidase  34.31 
 
 		 261 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00366545  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3405  Carboxymethylenebutenolidase  34.43 
 
 		 246 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4136  carboxymethylenebutenolidase  34.6 
 
 		 324 aa  123  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0536  carboxymethylenebutenolidase  33.33 
 
 		 239 aa  123  3e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.192606 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4152  dienelactone hydrolase  31.85 
 
 		 251 aa  121  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000773807  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1212  Carboxymethylenebutenolidase  33.19 
 
 		 248 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2055  dienelactone hydrolase  32.07 
 
 		 251 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1423  carboxymethylenebutenolidase  32.1 
 
 		 250 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.307098  normal  0.828639 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3733  dienelactone hydrolase  33.06 
 
 		 248 aa  119  3.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000974999  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0420  Carboxymethylenebutenolidase  34.04 
 
 		 247 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0431  dienelactone hydrolase  34.04 
 
 		 247 aa  116  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.850934 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0424  Carboxymethylenebutenolidase  38.33 
 
 		 313 aa  114  1.0000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0290099 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2787  carboxymethylenebutenolidase  33.62 
 
 		 254 aa  112  8.000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0298  Carboxymethylenebutenolidase  34.05 
 
 		 227 aa  107  3e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1491  carboxymethylenebutenolidase  31.8 
 
 		 261 aa  105  7e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0546343  normal  0.398934 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2800  Carboxymethylenebutenolidase  31.68 
 
 		 257 aa  104  1e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.637875  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2503  carboxymethylenebutenolidase  28.57 
 
 		 245 aa  103  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1199  Carboxymethylenebutenolidase  33.64 
 
 		 214 aa  104  2e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6096  carboxymethylenebutenolidase  33.18 
 
 		 238 aa  102  8e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0559809 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0185  dienelactone hydrolase  31.16 
 
 		 246 aa  102  9e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0089  carboxymethylenebutenolidase  30.47 
 
 		 244 aa  101  2e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1445  carboxymethylenebutenolidase  33.33 
 
 		 246 aa  101  2e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.80402  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2806  dienelactone hydrolase family protein  35.53 
 
 		 295 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.614525  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2614  carboxymethylenebutenolidase  32.89 
 
 		 262 aa  99.8  5e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0175902  normal  0.245657 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0896  Carboxymethylenebutenolidase  32.92 
 
 		 250 aa  99  7e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0078373  unclonable  0.000000019377 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4876  carboxymethylenebutenolidase  29.91 
 
 		 254 aa  99  8e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.21455 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1987  twin-arginine translocation pathway signal  32.86 
 
 		 291 aa  97.8  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2534  carboxymethylenebutenolidase  33.22 
 
 		 295 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.178351  normal  0.530004 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4930  Carboxymethylenebutenolidase  32.34 
 
 		 227 aa  96.7  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0665407  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0608  carboxymethylenebutenolidase  30.57 
 
 		 272 aa  95.5  9e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>