More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1470 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1470  periplasmic solute binding protein  100 
 
 		 298 aa  607  1e-173  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0700113  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1999  periplasmic solute binding protein  61.9 
 
 		 292 aa  375  1e-103  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.870733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2836  periplasmic solute binding protein  54.61 
 
 		 299 aa  292  4e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0534  periplasmic solute binding protein  40.21 
 
 		 293 aa  192  7e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1532  periplasmic solute binding protein  36.52 
 
 		 346 aa  179  7e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2998  periplasmic solute binding protein  35.92 
 
 		 328 aa  175  7e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000688581  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1141  periplasmic solute binding protein  35.74 
 
 		 310 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3046  periplasmic solute binding protein  34.14 
 
 		 336 aa  154  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0205239  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2875  periplasmic solute binding protein  34 
 
 		 309 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3101  periplasmic solute binding protein  34 
 
 		 309 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  0.191751 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0224  periplasmic solute binding protein  31.15 
 
 		 368 aa  152  7e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2043  periplasmic solute binding protein  32.42 
 
 		 353 aa  150  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000010108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0928  periplasmic solute binding protein  31.9 
 
 		 305 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.664518  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3218  periplasmic solute binding protein  29.21 
 
 		 371 aa  147  2.0000000000000003e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0863891  normal  0.580114 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2064  periplasmic solute binding protein  33.56 
 
 		 325 aa  146  4.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5737  periplasmic solute binding protein  31.01 
 
 		 302 aa  144  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0220  periplasmic solute binding protein  33.58 
 
 		 333 aa  144  2e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.732372  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1232  periplasmic solute binding protein  31.18 
 
 		 347 aa  142  6e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3426  periplasmic solute binding protein  33.81 
 
 		 313 aa  141  9.999999999999999e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.525736  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2853  periplasmic solute binding protein  29.79 
 
 		 321 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1142  periplasmic solute binding protein  34.31 
 
 		 307 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.987303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0624  periplasmic solute binding protein  34.85 
 
 		 310 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.17894  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2656  periplasmic solute binding protein  32.62 
 
 		 301 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.149358 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0180  periplasmic solute binding protein  30.9 
 
 		 301 aa  139  4.999999999999999e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.946938  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3532  periplasmic solute binding protein  29.43 
 
 		 292 aa  137  2e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0653  periplasmic solute binding protein  30.12 
 
 		 292 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1601  periplasmic solute binding protein  31.18 
 
 		 325 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.298891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3704  periplasmic solute binding protein  31.07 
 
 		 316 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.474771  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2898  periplasmic solute binding protein  31.43 
 
 		 301 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.910422  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1972  periplasmic solute binding protein  27.36 
 
 		 303 aa  136  5e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0930  periplasmic solute binding protein  30.94 
 
 		 292 aa  135  9.999999999999999e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.933909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4709  periplasmic solute binding protein  30.03 
 
 		 321 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.150845 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2998  periplasmic solute binding protein  33.54 
 
 		 311 aa  134  3e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0528665  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0703  periplasmic solute binding protein  31.73 
 
 		 292 aa  134  3e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.326839  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3176  periplasmic solute binding protein  30.23 
 
 		 292 aa  133  3.9999999999999996e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0119  periplasmic solute binding protein  29.76 
 
 		 344 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.527461 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1397  periplasmic solute binding protein  27.92 
 
 		 299 aa  132  5e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.682117  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2846  periplasmic solute binding protein  30.86 
 
 		 335 aa  132  6e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3070  periplasmic solute binding protein  31.25 
 
 		 315 aa  132  6.999999999999999e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000101463  hitchhiker  0.00347584 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1915  periplasmic solute binding protein  30.67 
 
 		 365 aa  132  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.163703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0822  periplasmic solute binding protein  29.54 
 
 		 356 aa  132  9e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000237297  normal  0.0439411 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4830  periplasmic solute binding protein  29.1 
 
 		 294 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1725  periplasmic solute binding protein  33.09 
 
 		 335 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.432414 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3681  periplasmic solute binding protein  29.43 
 
 		 292 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0688  periplasmic solute binding protein  31.58 
 
 		 314 aa  130  2.0000000000000002e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000152738  normal  0.0354959 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1102  periplasmic solute binding protein  30.82 
 
 		 282 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0916  periplasmic solute binding protein  31.54 
 
 		 307 aa  130  3e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.357489  normal  0.451592 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7253  periplasmic solute binding protein  31.82 
 
 		 346 aa  130  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518447  normal  0.0520295 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0547  periplasmic solute binding protein  27.15 
 
 		 318 aa  130  3e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.624279  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0953  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  28.47 
 
 		 313 aa  129  4.0000000000000003e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0131  periplasmic solute binding protein  33.2 
 
 		 285 aa  129  6e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2784  periplasmic solute binding protein  32.51 
 
 		 301 aa  129  6e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.199172  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1062  ABC transporter substrate binding protein  31.25 
 
 		 298 aa  129  8.000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.861783  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4557  periplasmic solute binding protein  30.14 
 
 		 304 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.667309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3553  periplasmic solute binding protein  29.87 
 
 		 306 aa  128  9.000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00157548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1123  periplasmic solute binding protein  31.28 
 
 		 292 aa  128  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000244311  unclonable  0.0000000116493 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2553  periplasmic solute binding protein  27.5 
 
 		 319 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3634  periplasmic solute binding protein  25.4 
 
 		 311 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1215  periplasmic solute binding protein  31.91 
 
 		 309 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0350  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  29.39 
 
 		 315 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2176  periplasmic solute binding protein  31.14 
 
 		 320 aa  128  1.0000000000000001e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3014  periplasmic chelated iron-binding protein YfeA  28.05 
 
 		 305 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0700149 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3050  periplasmic chelated iron-binding protein YfeA  28.05 
 
 		 305 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0195762 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3066  periplasmic chelated iron-binding protein YfeA  28.05 
 
 		 305 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.354258  normal  0.0719754 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3171  periplasmic chelated iron-binding protein YfeA  28.05 
 
 		 305 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.866924 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2983  periplasmic chelated iron-binding protein YfeA  28.05 
 
 		 305 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0843  periplasmic solute-binding protein  26.52 
 
 		 344 aa  126  3e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.620273  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1724  periplasmic solute binding protein  29.66 
 
 		 309 aa  127  3e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.147475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1258  periplasmic solute binding protein  39.56 
 
 		 494 aa  127  3e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00438687  decreased coverage  0.000164305 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0036  adhesion lipoprotein  26.45 
 
 		 311 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0129637  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1591  periplasmic solute binding protein  38.89 
 
 		 497 aa  126  5e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1311  iron chelate ABC transporter, periplasmic iron chelate-binding protein  28.14 
 
 		 302 aa  125  7e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5661  periplasmic solute binding protein  29.1 
 
 		 291 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203291 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2067  manganese ABC transporter substrate-binding lipoprotein  25.57 
 
 		 311 aa  125  9e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2103  adhesion lipoprotein  27.64 
 
 		 316 aa  124  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2051  periplasmic solute binding protein  28.47 
 
 		 303 aa  125  1e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0478383  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2136  putative adhesion lipoprotein  27.64 
 
 		 316 aa  125  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2781  periplasmic solute binding protein  30.56 
 
 		 318 aa  124  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2895  twin-arginine translocation pathway signal  31.39 
 
 		 310 aa  124  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0516  periplasmic solute binding protein  31.27 
 
 		 299 aa  124  2e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2368  periplasmic solute binding protein  29.58 
 
 		 298 aa  124  3e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000358992  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2575  Mn transporter MntC  27.08 
 
 		 313 aa  123  3e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4030  periplasmic solute binding protein  29.07 
 
 		 305 aa  124  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0298524  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2964  adhesion lipoprotein  25.57 
 
 		 311 aa  123  4e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00274739  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1851  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  26.51 
 
 		 316 aa  123  4e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.623587  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1841  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  27.37 
 
 		 316 aa  123  4e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.18542  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2317  periplasmic solute binding protein  30.18 
 
 		 300 aa  123  4e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3189  adhesion lipoprotein  25.57 
 
 		 311 aa  123  4e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2227  periplasmic solute binding protein  31.38 
 
 		 327 aa  123  4e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.82387 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3625  periplasmic solute binding protein  27.96 
 
 		 326 aa  123  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3698  periplasmic solute binding protein  28.04 
 
 		 300 aa  123  4e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3262  periplasmic solute binding protein  29.93 
 
 		 341 aa  123  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000710757  normal  0.410992 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1889  adhesion lipoprotein  27.37 
 
 		 316 aa  123  5e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.994637  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1207  periplasmic solute binding protein  29.39 
 
 		 324 aa  123  5e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.773922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2035  adhesion lipoprotein  27.37 
 
 		 316 aa  123  5e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3170  iron/manganese transport system periplasmic binding protein SitA  26.79 
 
 		 304 aa  122  5e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.857236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18691  ABC transporter substrate-binding protein  32.11 
 
 		 287 aa  122  6e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.349553 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2483  periplasmic solute binding protein  26.37 
 
 		 317 aa  122  6e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3600  periplasmic solute binding protein  28.57 
 
 		 304 aa  122  6e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1015  periplasmic solute binding protein  31.5 
 
 		 293 aa  122  6e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>