234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2673 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2673  AFG1 family ATPase  100 
 
 
410 aa  824    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00261734  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0870  AFG1-family ATPase  80.1 
 
 
404 aa  613  9.999999999999999e-175  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0895  AFG1-family ATPase  78.55 
 
 
404 aa  584  1e-166  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.795804 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0934  AFG1 family ATPase  78.05 
 
 
404 aa  581  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.204607 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2159  AFG1 family ATPase  71.87 
 
 
397 aa  553  1e-156  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.54766 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1121  AFG1-family ATPase  72.89 
 
 
416 aa  546  1e-154  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0133658  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3602  AFG1 family ATPase  58.18 
 
 
390 aa  439  9.999999999999999e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.417048  normal  0.374924 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0391  AFG1 family ATPase  60.42 
 
 
393 aa  437  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.310283  normal  0.309124 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0534  AFG1-like ATPase  57.8 
 
 
393 aa  425  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2500  AFG1-family ATPase  57.55 
 
 
395 aa  425  1e-118  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.727024 
 
 
-
 
NC_004310  BR1929  hypothetical protein  56.84 
 
 
387 aa  419  1e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0282  AFG1-like ATPase  57.95 
 
 
393 aa  421  1e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0649883 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0474  AFG1 family ATPase  58.25 
 
 
395 aa  420  1e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.756994  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1857  hypothetical protein  56.57 
 
 
403 aa  418  1e-116  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0188  AFG1-family ATPase  55.1 
 
 
394 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.176309  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0929  AFG1 family ATPase  54.96 
 
 
387 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4130  hypothetical protein  56.95 
 
 
387 aa  404  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3975  AFG1-family ATPase  54.76 
 
 
387 aa  395  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.742054  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0195  AFG1-like ATPase  57.93 
 
 
397 aa  391  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0546  AFG1-like ATPase  58.27 
 
 
394 aa  391  1e-107  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.420567  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2945  AFG1 family ATPase  55.65 
 
 
409 aa  388  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0418  AFG1-like ATPase  56.38 
 
 
394 aa  386  1e-106  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0205439  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3686  AFG1-family ATPase  53.97 
 
 
386 aa  384  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.894577 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1448  AFG1 family ATPase  54.84 
 
 
373 aa  376  1e-103  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3394  AFG1-like ATPase  54.13 
 
 
392 aa  367  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0021  AFG1 family ATPase  46.48 
 
 
403 aa  338  9.999999999999999e-92  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2833  AFG1 family ATPase  51.93 
 
 
381 aa  320  3e-86  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1989  AFG1 family ATPase  47.97 
 
 
368 aa  315  7e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.120229  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4843  AFG1 family ATPase  48.01 
 
 
372 aa  305  1.0000000000000001e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.826609  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1302  AFG1 family ATPase  48 
 
 
372 aa  301  1e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0112  AFG1-family ATPase  47.8 
 
 
389 aa  298  1e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0056  AFG1-like ATPase  47.35 
 
 
358 aa  297  3e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2232  AFG1-like ATPase  48.69 
 
 
379 aa  296  6e-79  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.860244  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2673  AFG1-like ATPase  46.03 
 
 
354 aa  293  5e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0895  AFG1 family ATPase  44.39 
 
 
364 aa  292  7e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0017  AFG1 family ATPase  45.71 
 
 
358 aa  291  1e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.761776  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0007  AFG1 family ATPase  46.28 
 
 
358 aa  290  2e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000720762 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2541  AFG1-family ATPase  44.54 
 
 
371 aa  291  2e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.538898  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2697  AFG1 family ATPase  43.32 
 
 
377 aa  289  7e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115237  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1349  hypothetical protein  45.43 
 
 
358 aa  289  8e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.765478  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2665  hypothetical protein  40.59 
 
 
368 aa  286  2.9999999999999996e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00155012  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1312  AFG1-family ATPase  43.13 
 
 
364 aa  286  4e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4412  AFG1 family ATPase  43.13 
 
 
364 aa  286  4e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.744432  normal  0.254961 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2117  AFG1-family ATPase  44.68 
 
 
404 aa  286  5e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0551  AFG1-like ATPase  41.46 
 
 
368 aa  286  5e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000457757  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4122  AFG1-like ATPase  43.94 
 
 
364 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4537  AFG1 family ATPase  42.59 
 
 
364 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4428  ATPase, putative  43.85 
 
 
364 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.807531  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1208  AFG1-like ATPase  43.2 
 
 
382 aa  282  7.000000000000001e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00880  hypothetical protein  40.97 
 
 
367 aa  281  1e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2324  AFG1-like ATPase  45.48 
 
 
377 aa  281  1e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13020  hypothetical protein  42.22 
 
 
374 aa  281  2e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.643406  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4698  AFG1-like ATPase  42.59 
 
 
364 aa  280  3e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00399589  normal  0.061499 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0919  AFG1 family ATPase  43.18 
 
 
339 aa  280  5e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.961251  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1626  AFG1 family ATPase  48.53 
 
 
371 aa  277  2e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.536704  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5010  hypothetical protein  43.73 
 
 
364 aa  276  3e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.991717  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3165  hypothetical protein  43.7 
 
 
393 aa  277  3e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.885121  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57650  hypothetical protein  43.47 
 
 
364 aa  275  9e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.994085 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004512  putative ATPase  40.43 
 
 
367 aa  275  1.0000000000000001e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000122216  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1591  AFG1 family ATPase  43.63 
 
 
360 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.594153  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0954  AFG1 family ATPase  44.47 
 
 
360 aa  271  1e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.31762  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2856  AFG1-like ATPase  42.93 
 
 
371 aa  271  2e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.555037  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3361  AFG1 family ATPase  40.59 
 
 
370 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000732022  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0334  AFG1 family ATPase  44.15 
 
 
372 aa  270  5e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0505  AFG1-like ATPase  40.86 
 
 
370 aa  268  2e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000013161  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0102  hypothetical protein  40.7 
 
 
367 aa  268  2e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000023398  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4344  AFG1 family ATPase  41.9 
 
 
371 aa  266  2.9999999999999995e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.659976  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3609  ATPase, AFG1 family  41.87 
 
 
374 aa  266  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000949089  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3644  ATPase  41.87 
 
 
374 aa  266  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0298166  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3295  AFG1 family ATPase  41.02 
 
 
368 aa  266  4e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000879421  hitchhiker  0.00125364 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03176  ATPase, AFG1 family protein  40.11 
 
 
365 aa  266  5e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0722  AFG1-family ATPase  41.98 
 
 
370 aa  266  5.999999999999999e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000182538  hitchhiker  0.000146709 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3706  AFG1 family ATPase  41.33 
 
 
374 aa  266  5.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00969037  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03092  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  41.18 
 
 
375 aa  264  2e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00364755  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3421  AFG1 family ATPase  41.18 
 
 
375 aa  264  2e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000090092  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0731  AFG1 family ATPase  41.71 
 
 
370 aa  264  2e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000798254  normal  0.0124574 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03043  hypothetical protein  41.18 
 
 
375 aa  264  2e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00168064  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3544  ATPase, AFG1 family  41.18 
 
 
375 aa  264  2e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306426  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4223  AFG1 family ATPase  39.42 
 
 
368 aa  264  2e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000201844  hitchhiker  0.000390213 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0474  AFG1 family ATPase  41.18 
 
 
375 aa  264  2e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000625697  normal  0.126668 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3072  hypothetical protein  41.76 
 
 
369 aa  264  2e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000740728  normal  0.206004 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3537  ATPase, AFG1 family  41.6 
 
 
374 aa  264  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000892623  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0701  AFG1 family ATPase  41.71 
 
 
370 aa  264  3e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000196074  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0743  AFG1 family ATPase  41.71 
 
 
370 aa  263  4e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000113229  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3270  AFG1 family ATPase  41.71 
 
 
386 aa  263  6e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000167889  hitchhiker  0.000173764 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0691  AFG1 family ATPase  41.71 
 
 
388 aa  263  6e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000890952  hitchhiker  0.0000137092 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3528  AFG1 family ATPase  40.53 
 
 
375 aa  262  8.999999999999999e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000142323  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3798  AFG1-family ATPase  42.77 
 
 
376 aa  261  1e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000375047  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0677  AFG1 family ATPase  41.71 
 
 
386 aa  262  1e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000859941  hitchhiker  0.00165359 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3653  AFG1 family ATPase  41.44 
 
 
370 aa  262  1e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000093907  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0474  AFG1-family ATPase  40.91 
 
 
375 aa  261  2e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000087327  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4350  AFG1 family ATPase  39.26 
 
 
376 aa  260  2e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000166753  hitchhiker  0.003638 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4549  ATPase, AFG1 family  40.91 
 
 
375 aa  261  2e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000104108  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3715  AFG1 family ATPase  40.91 
 
 
375 aa  261  2e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000708287  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0746  AFG1 family ATPase  39.89 
 
 
368 aa  260  3e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000022417  normal  0.0814032 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3941  hypothetical protein  41.18 
 
 
370 aa  258  1e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3538  ATPase, AFG1 family  41.87 
 
 
374 aa  258  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00595709  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3596  AFG1 family ATPase  40.62 
 
 
367 aa  258  1e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000179284  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2401  AFG1 family ATPase  40.86 
 
 
366 aa  258  2e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.125095 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1094  AFG1-like ATPase  36.86 
 
 
373 aa  256  4e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.432883 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>