More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0698 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0698  SufS subfamily cysteine desulfurase  100 
 
 
414 aa  856  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13787  normal  0.199911 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5106  SufS subfamily cysteine desulfurase  84.99 
 
 
413 aa  736  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0201229 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4460  cysteine desulfurase, SufS subfamily  90.31 
 
 
426 aa  763  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.572328  normal  0.26876 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5845  cysteine desulfurase, SufS subfamily  86.92 
 
 
413 aa  751  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187018  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3980  SufS subfamily cysteine desulfurase  90.89 
 
 
418 aa  785  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.970806 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4348  cysteine desulfurase, SufS subfamily  90.65 
 
 
418 aa  784  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3969  cysteine desulfurase  72.1 
 
 
415 aa  612  1e-174  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0413583  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1778  SufS subfamily cysteine desulfurase  68.6 
 
 
413 aa  610  1e-173  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169204  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0101  SufS subfamily cysteine desulfurase  68.84 
 
 
414 aa  605  1e-172  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.724967 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2990  SufS subfamily cysteine desulfurase  69.14 
 
 
428 aa  598  1e-170  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.398941  normal  0.104458 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2459  SufS subfamily cysteine desulfurase  69.38 
 
 
415 aa  599  1e-170  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.117109  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2325  SufS subfamily cysteine desulfurase  69.21 
 
 
414 aa  597  1e-169  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.553712  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2745  cysteine desulfurase, SufS subfamily  68.89 
 
 
415 aa  597  1e-169  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2103  cysteine desulfurase, SufS subfamily  66.67 
 
 
413 aa  588  1e-167  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.105912 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  66.99 
 
 
413 aa  589  1e-167  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00682669 
 
 
-
 
NC_004310  BR0934  aminotransferase, class V  68.38 
 
 
414 aa  590  1e-167  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.603819  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0928  aminotransferase, class V  67.89 
 
 
414 aa  588  1e-167  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.870705  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2837  SufS subfamily cysteine desulfurase  68.97 
 
 
415 aa  585  1e-166  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00234776  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2252  SufS subfamily cysteine desulfurase  67.16 
 
 
414 aa  587  1e-166  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.766677  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1661  cysteine desulphurases, SufS  67.49 
 
 
414 aa  586  1e-166  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.278494  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5928  cysteine desulfurase  66.67 
 
 
413 aa  585  1e-166  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2440  aminotransferase  65.94 
 
 
416 aa  578  1e-164  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0087  SufS subfamily cysteine desulfurase  67.16 
 
 
420 aa  581  1e-164  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.595541  normal  0.828259 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3259  SufS subfamily cysteine desulfurase  66.67 
 
 
414 aa  576  1e-163  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.797453  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1465  SufS subfamily cysteine desulfurase  65.13 
 
 
413 aa  573  1e-162  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.204095  normal  0.0534707 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4466  SufS subfamily cysteine desulfurase  67.65 
 
 
419 aa  574  1e-162  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.523936 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2593  SufS subfamily cysteine desulfurase  63.46 
 
 
408 aa  529  1e-149  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.266337  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0813  cysteine desulfurase SufS  57.35 
 
 
414 aa  514  1e-145  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0265605  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1319  SufS subfamily cysteine desulfurase  56.89 
 
 
413 aa  478  1e-134  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0340803  normal  0.349427 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2356  SufS subfamily cysteine desulfurase  57.39 
 
 
406 aa  476  1e-133  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2487  cysteine desulphurases, SufS  54.32 
 
 
420 aa  474  1e-133  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1249  cysteine desulfurase  56.16 
 
 
406 aa  471  1e-132  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.491768  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2088  SufS subfamily cysteine desulfurase  56.4 
 
 
406 aa  469  1e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.519115 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2355  SufS subfamily cysteine desulfurase  57.25 
 
 
407 aa  466  1e-130  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.331891  normal  0.378457 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0431  putative selenocysteine lyase  56.16 
 
 
406 aa  466  1e-130  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2269  SufS subfamily cysteine desulfurase  53.62 
 
 
414 aa  462  1e-129  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.216373  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0989  selenocysteine lyase  53.14 
 
 
414 aa  462  1e-129  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4272  SufS subfamily cysteine desulfurase  54.48 
 
 
451 aa  460  1e-128  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3970  SufS subfamily cysteine desulfurase  54.81 
 
 
403 aa  459  1e-128  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.615432  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1623  cysteine desulfurase  54.43 
 
 
406 aa  454  1e-127  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0344832 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2570  cysteine desulfurase  53.71 
 
 
422 aa  453  1e-126  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0166  cysteine desulfurase, SufS subfamily  52.11 
 
 
412 aa  448  1e-125  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  3.85676e-08  unclonable  1.52095e-15 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0728  SufS subfamily cysteine desulfurase  54.43 
 
 
421 aa  445  1e-124  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.88575  normal  0.887973 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1512  cysteine desulfurase SufS  52.13 
 
 
405 aa  446  1e-124  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1445  cysteine desulfurase  52.13 
 
 
405 aa  446  1e-124  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21000  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  53.3 
 
 
604 aa  439  1e-122  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.382512  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16690  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  53.3 
 
 
604 aa  439  1e-122  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3312  cysteine desulfurase, SufS subfamily  52.58 
 
 
415 aa  441  1e-122  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0757647 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5780  cysteine desulfurase, SufS subfamily  51.12 
 
 
408 aa  438  1e-122  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.649929  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0846  SufS subfamily cysteine desulfurase  54.07 
 
 
429 aa  438  1e-122  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.411085  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1549  cysteine desulfurase, SufS subfamily  54.07 
 
 
673 aa  438  1e-122  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0186902 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1608  cysteine desulfurase, SufS subfamily  51.87 
 
 
657 aa  436  1e-121  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2025  cysteine desulfurase, SufS subfamily  52.48 
 
 
418 aa  435  1e-121  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1505  cysteine desulfurases, SufS subfamily protein  50.99 
 
 
425 aa  437  1e-121  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0740826  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0488  cysteine desulfurase, SufS subfamily  52.63 
 
 
774 aa  436  1e-121  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0582  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.65 
 
 
404 aa  435  1e-121  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0897789  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  53.09 
 
 
429 aa  434  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825531  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1232  SufS subfamily cysteine desulfurase  53.07 
 
 
629 aa  432  1e-120  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.153291  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3037  cysteine desulfurase, SufS subfamily  51.5 
 
 
404 aa  433  1e-120  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0138624 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3227  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.99 
 
 
662 aa  433  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.545837  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3281  cysteine desulfurase, SufS subfamily  51.97 
 
 
429 aa  434  1e-120  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.30955  normal  0.0478783 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0892  cysteine desulfurase, SufS subfamily  53.09 
 
 
429 aa  434  1e-120  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3154  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.97 
 
 
417 aa  431  1e-119  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0536  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.11 
 
 
416 aa  429  1e-119  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1427  SufS subfamily cysteine desulfurase  53.09 
 
 
664 aa  430  1e-119  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  7.69952e-06 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3637  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.82 
 
 
678 aa  431  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.51832  normal  0.140258 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2661  cysteine desulfurase  51.62 
 
 
626 aa  428  1e-119  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0591977  normal  0.463261 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1236  SufS subfamily cysteine desulfurase  53.06 
 
 
413 aa  428  1e-119  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.321654  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  53.65 
 
 
672 aa  425  1e-118  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0228689 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0699  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.73 
 
 
419 aa  427  1e-118  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1338  cysteine desulfurase, SufS subfamily  53.65 
 
 
674 aa  425  1e-118  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.986463 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0975  aminotransferase class 5 protein; selenocysteine lyase  49.38 
 
 
419 aa  428  1e-118  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.18075  normal  0.925491 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  47.28 
 
 
404 aa  423  1e-117  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99383  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1684  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.75 
 
 
444 aa  423  1e-117  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0735  aminotransferase, class V  50.5 
 
 
404 aa  422  1e-117  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0617  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.62 
 
 
621 aa  423  1e-117  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000358817  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3352  cysteine desulfurase, SufS subfamily  47.16 
 
 
415 aa  419  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.143815 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5792  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.52 
 
 
641 aa  419  1e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0152868 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2267  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50.61 
 
 
418 aa  420  1e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.53875 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1815  selenocysteine lyase  50.74 
 
 
665 aa  421  1e-116  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.653401  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  51.8 
 
 
427 aa  421  1e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3517  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.87 
 
 
650 aa  420  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1863  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.21 
 
 
416 aa  421  1e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2493  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.26 
 
 
605 aa  419  1e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2622  cysteine desulphurases, SufS  50.87 
 
 
666 aa  418  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.795615 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0306  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.31 
 
 
414 aa  416  1e-115  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0801844 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50.62 
 
 
406 aa  416  1e-115  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4001  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.37 
 
 
666 aa  417  1e-115  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.077192 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0754  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.15 
 
 
608 aa  415  1e-115  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.633954 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0124  cysteine desulphurases, SufS  50.62 
 
 
688 aa  416  1e-115  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2554  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.09 
 
 
428 aa  417  1e-115  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0995  hypothetical protein  49.37 
 
 
412 aa  414  1e-114  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.20271 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0409  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.73 
 
 
412 aa  413  1e-114  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0418  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50.25 
 
 
419 aa  412  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1195  cysteine desulfurase, SufS subfamily  51.36 
 
 
409 aa  412  1e-114  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.542201  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0710  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.95 
 
 
414 aa  412  1e-114  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.548374  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1552  cysteine desulphurases, SufS  50.12 
 
 
682 aa  414  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0023  putative cysteine desulfurase  50.89 
 
 
661 aa  409  1e-113  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.493291 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1968  cysteine desulfurase  50.12 
 
 
421 aa  411  1e-113  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0362  selenocysteine lyase  51.88 
 
 
685 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.556152  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>